廣西海洋環境監測中心站的主要職責是:負責廣西近岸海域的環境質量監測、廣西入海污染源的常規監測、事故應急監測;負責組織南海西部近岸海域和北部灣近岸海域環境質量監測、入海污染源的常規監測、事故應急監測;參與海洋環境標準、技術規範、監測方法的研究、制訂和環保竣工驗收工作。
自1987年起,廣西海洋環境監測中心站已開展了近22年的廣西近岸海域水質、沉積物監測和入海污染源監測。至2010年,廣西近岸海域監測站位已達48個,監測項目32項。2006年廣西海洋環境監測中心站實驗室通過國家級計量認證,目前通過的認證項目包括:水、氣、(土壤、底質、植物、生物殘留體、固體廢物)、噪聲、生物、海水、海洋沉積物和生物體 、海洋生物等八大類共208項。
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