主要職責
1、貫徹執行《中華人民共和國環境保護法》及有關環境保護和環境監測的法律、法規、標準、技術規範和管理制度。
2、負責廣西近岸海域環境質量監測，廣西入海污染源的常規監測以及事故應急監測。
3、負責組織南海西部近岸海域和北部灣近岸海域環境質量監測、入海污染源的常規監測以及事故應急監測。
4、負責“廣西近岸海域環境質量報告書”、 “廣西區環境質量報告書（海洋部分）”“南海近岸海域環境質量報告書” 等技術報告及 “廣西近岸海域環境監測報表”、“廣西近岸海域入海污染源監測報表”等的編制工作，及時向廣西區環境保護廳和上級有關部門上報各類環境監測報表或報告。
5、負責南海環境監測數據的收集、匯總和上報工作。
6.參與海洋環境標準、技術規範、監測方法的研究、制訂和驗收工作。
7.承擔中國環境監測總站安排的其他海域環境監測和科研任務。
8.參與環境影響評價現狀調查監測、環境影響分析現狀調查監測、環境背景值調查監測；科研課題調查監測；新建、擴建、改建項目及限期治理工程“三同時”的竣工驗收監測等。
能力建設
1、制度
建站二十年來，已形成監測業務管理、監測工作質量管理、網路管理、後勤管理、人員獎懲制度等一系列完整的制度體系。
2、人員
全站共有在職職工52人，專業技術人員占87%，其中高級工程師15人，工程師14人。有3人獲得“北海市優秀拔尖人才”榮譽稱號，有9人獲得“北海市優秀青年科技人才”榮譽稱號。
3、實驗室
有固定資產700多萬元，儀器設備100多台（套），標準實驗室面積1350平方米。擁有先進的進口大型儀器：氣相色譜儀、氣-質聯用儀、原子螢光分光光度計、應急監測車等。
經計量認證的監測項目有包括水、廢水；環境空氣、廢氣；土壤、沉積物、生物殘留體、固體廢物；生物；噪聲等共五類120項。
