發展歷史
成立背景
1979年元旦，全國人大常委會發表《告台灣同胞書》，祖國大陸對台方針政策出現重大轉變，中央有關部門開始考慮籌設專門從事台灣研究的學術機構。經過了解，廈門大學已有十幾位教授已經或正在從事台灣研究，因此決定在廈門大學設立台灣研究所。
1980年7月9日，經過中央對台領導小組組長鄧穎超、中共福建省委書記項南、教育部長蔣南翔等領導的批示，廈門大學台灣研究所經教育部批准正式成立。
艱難創業
1981年，台灣研究所開始招收台灣歷史、台灣經濟方向的碩士研究生。
1983年，創辦《台灣研究集刊》，是中國大陸第一份專門研究台灣的學術刊物。
1985年，由台灣研究所所牽頭成立了“廈門台灣學會”，這是中國大陸第一個專門研究台灣的民間學術機構。
新辦公大樓建設1993年，在國務院台辦、福建省及廈門市政府的支持下，台灣研究所建造了面積約為1700平方米的新辦公大樓。
邁向卓越
1997年，台灣研究所的台灣研究項目被列為國家“211工程”的重點建設學科。
兩岸協創中心成立2001年，以台灣研究所為母體組建的廈門大學台灣研究中心，入選“教育部人文社會科學百所重點研究基地”。
2004年2月19日，經廈門大學批准，台灣研究所改制為廈門大學台灣研究院。同年11月，研究院入選國家“985”工程二期哲學社會科學創新基地。
2014年，由廈門大學牽頭且以台灣研究院為核心力量成立的“兩岸關係和平發展協同創新中心”入選國家級“2011計畫”。
2017年9月，廈門大學台灣研究院入選國家高端智庫培育單位，並成為教育部高校高端智庫聯盟單位。
科研條件
人員編制
根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院有教授13人，副教授12人，有福建省哲學社科學術諮詢專家2人，福建省第六屆優秀青年社會科學專家1人。
福建省哲學社科學術諮詢專家：劉國深、李非
福建省第六屆優秀青年社會科學專家：唐永紅
科研部門
研究所根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院設6個 研究所，6個跨學科研究機構，有國家級“2011計畫”1個，教育部人文社科重點研究基地1個，教育部區域與國別研究培育基地1個。
國家級“2011計畫”：兩岸關係和平發展協同創新中心
教育部人文社科重點研究基地：廈門大學台灣研究中心
教育部區域與國別研究培育基地：廈門大學港澳台研究中心
研究所：政治研究所、經濟研究所、歷史研究所、文學研究所、法律研究所、兩岸關係研究所
跨學科研究機構：民進黨研究中心、兩岸青年研究中心、大數據與民調研究中心、涉台外交研究中心（籌）
學術資源
根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院文獻信息中心入藏的圖書以台版為主，有館藏台版圖書近5萬冊，其中外文圖書6千餘冊；200多種過刊裝訂本1.6萬冊、20多種往年報紙裝訂本0.9萬冊。每年訂購台灣地區出版的圖書近千冊，期刊120多種，報紙5種。有聯合百科系列資料庫4種、漢珍數位台灣研究系列14種、台港澳資源檢索系統（期刊1700多種，全文近50萬篇，學位論文近10萬篇，每年更新）、台灣研究基礎資料庫（台灣統計數據、選舉數據）、《台灣研究集刊》檢索光碟等電子資源20餘種。
科研成就
科研成果
《台灣研究集刊》根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院學者出版學術專著300多部，發表學術論文3000多篇；共承擔國家社會科學基金重大項目、教育部重大攻關項目及其他國家級重大項目10多項，國家社會科學基金、國家自然科學基金、教育部的重點項目和一般項目50多項；在國家以及教育部、省、市社會科學成果的各項評比中，研究院撰寫的著作、論文共獲得優秀科研成果獎300多項，整理出版《康熙統一台灣檔案史料選輯》、《鄭成功檔案史料選輯》等資料檔案專輯。
2018年，研究院唐樺副教授申報的項目《常住大陸台胞群體的社會融入問題與對策研究》獲得國家社科基金一般項目立項，張寶蓉教授申報的項目《兩岸青年交流中的群際接觸與融合發展問題研究》獲得教育部人文社科規劃基金項目立項，陳超助理教授申報的項目《台灣青年在大陸社會融入狀況研究》獲2017年度教育部人文社科規劃青年基金項目立項。
| 著作 | 出版社 | 出版年 |
| 台灣歷史故事（反侵略篇） | 福建人民出版社 | 1980.11 |
| 台灣經濟問題 | 福建人民出版社 | 1981.6 |
| 先王實錄校注 | 福建人民出版社 | 1981.12 |
| 台灣地方史 | 福建人民出版社 | 1982.8 |
| 鄭成功收復台灣史料選編 | 福建人民出版社 | 1982.3 |
| 台灣鄭成功研究論文集 | 福建人民出版社 | 1982.6 |
| 台灣懷鄉思親詩詞選 | 上海人民出版社 | 1982 |
| 康熙統一台灣檔案史料選輯 | 福建人民出版社 | 1983.3 |
| 台灣外紀 | 福建人民出版社 | 1983.8 |
| 台灣中篇小說選（第一、二集） | 福建人民出版社 | 1984.8 |
| 台灣作家創作談 | 海峽文藝出版社 | 1985.5 |
| 台灣省經濟關係研究 | 江西人民出版社 | 1985.10 |
| 鄭成功檔案史料選輯 | 福建人民出版社 | 1985.6 |
| 台灣特產風味指南 | 福建科技出版社 | 1985.7 |
| 蔣毓英台灣府志校注 | 廈門大學出版社 | 1985.11 |
| 清代台灣史研究 | 廈門大學出版社 | 1986.4 |
| 台灣當代大學生散文選 | 中國青年出版社 | 1986.6 |
| 台灣新文學概觀（上下冊） | 鷺江出版社 | 上冊1986.7下冊1991.7 |
| 近代台灣地方對外貿易 | 江西人民出版社 | 1986.8 |
| 台灣電影劇本選 | 中國電影出版社 | 1986 |
| 台灣中篇小說選（第三集） | 海峽文藝出版社 | 1987.3 |
| 台灣中學生作文編評（高中版） | 江西教育出版社 | 1987.6 |
| 台灣中學生作文編評（國中版） | 江西教育出版社 | 1987.6 |
| 鄭成功滿文檔案史料選譯 | 福建人民出版社 | 1987.9 |
| 台灣當代小說藝術採光 | 鷺江出版社 | 1987.11 |
| 台灣大學生詩選 | 湖南教育出版社 | 1988.3 |
| 台灣大學生小說選 | 湖南教育出版社 | 1988.4 |
| 今日台灣100問 | 福建人民出版社 | 1988.5 |
| 紅塵劫——台灣中篇小說選之四 | 海峽文藝出版社 | 1988.8 |
| 隔海說文——台灣當代散文十家 | 廈門大學出版社 | 1988.12 |
| 台灣電影史話 | 中國電影出版社 | 1988.12 |
| 戰後台灣經濟 | 中國社會科學出版社 | 1989.8 |
| 鄭成功研究國際學術會議論文集 | 江西人民出版社 | 1989.8 |
| 海峽兩岸用語差異 | 福建人民出版社 | 1989.11 |
| 台灣長篇小說創作論 | 海峽文藝出版社 | 1990.6 |
| 《台灣通史》辨誤 | 江西人民出版社 | 1990.4 |
| 台灣研究十年 | 廈門大學出版社1990.7 | |
| 海峽兩岸首次台灣史學術交流論文集 | 廈門大學出版社 | 1990.7 |
| 戰後台灣四十年 | 光明日報出版社 | 1990.7 |
| 台灣百部小說大展 | 海峽文藝出版社 | 1990.7 |
| 中華人民共和國地名辭典·台灣省 | 商務印書館 | 1990.5 |
| 戰後台灣經濟分析 | 廈門大學出版社 | 1990.5 |
| 清代台灣移民社會研究 | 廈門大學出版社 | 1990.10 |
| 大陸與台灣的歷史淵源 | 文匯出版社 | 1991.3 |
| 台灣政治機構概覽 | 武漢出版社 | 1991.9 |
| 台灣文學史（上下卷） | 海峽文藝出版社 | 上卷1991.5下卷1993.1 |
| 台灣幽默散文選 | 百花文藝出版社 | 1991 |
| 戰後台灣金融 | 鷺江出版社 | 1992.2 |
| 李萬居評傳 | 廈門大學出版社 | 1992.8 |
| 戰後台灣經濟發展史 | 鷺江出版社 | 1992.10 |
| 台灣女作家愛情散文選 | 百花文藝出版社 | 1992.10 |
| 戰後台灣財政 | 鷺江出版社 | 1992.11 |
| 戰後台灣企業集團 | 鷺江出版社 | 1992.12 |
| 台胞探親旅遊用語手冊 | 四川辭書出版社 | 1992.7 |
| 戰後台灣交通經濟 | 鷺江出版社 | 1993.10 |
| 海峽兩岸經貿關係 | 對外貿易教育出版社 | 1993.12 |
| 台灣民間信仰 | 鷺江出版社 | 1993.12 |
| 台灣電視發展史 | 海風出版社 | 1994.7 |
| 台灣當代散文綜論 | 海峽文藝出版社 | 1994.10 |
| 台灣經濟現代化模式 | 鷺江出版社 | 1995.3 |
| 中國自然資源叢書·台灣卷 | 中國環境科學出版社 | 1995.6 |
| 台灣歷史綱要 | 九洲圖書出版社 | 1996.4 |
| 台灣女性散文選 | 廣東花城出版社 | 1996.4 |
| 媽祖與中國的民間信仰 | 日本東京平河出版社 | 1996.8 |
| 戰後台灣農業 | 鷺江出版社 | 1996.8 |
| 彼岸的繆斯——台灣詩歌論 | 百花洲文藝出版社 | 1996.12 |
| 台港幽默散文精品鑑賞 | 河南文藝出版社 | 1996.12 |
| 台灣農業發展概論 | 廈門大學出版社 | 1997.9 |
| 閩台文化交融史 | 福建教育出版社 | 1997.11 |
| 台灣兩才女——李昂、施叔青小說精粹 | 廣東花城出版社 | 1997.11 |
| 台灣兩才女——施叔青、李昂散文精粹 | 廣東花城出版社 | 1997.11 |
| 簡明台灣史 | 九洲圖書出版社 | 1998.1 |
| 台港澳文學作品精選(小說卷） | 廣東高教出版社 | 1998.10 |
| 台港澳文學作品精選（詩歌散文卷） | 廣東高教出版社 | 1998.10 |
| 《認識台灣》教科書評析 | 九洲圖書出版社 | 1999.3 |
| 台灣歷史與兩岸關係 | 台海出版社 | 1999.6 |
| 祖國的寶島台灣（中學讀本） | 鷺江出版社 | 1999.6 |
| 近二十年台灣文學流脈 | 廈門大學出版社 | 1999.8 |
| 陸島網路——台灣海港的興起 | 江西高校出版社 | 1999.12 |
| 鄭成功與明鄭台灣史研究 | 台海出版社 | 2000.3 |
| 台灣研究論文集 | 廈門大學出版社 | 2000.6 |
| 海峽兩岸經濟合作問題研究 | 九州出版社 | 2000.7 |
| 鄭成功歷史研究 | 九州出版社 | 2000.8 |
| 台灣海疆史研究 | 廈門大學出版社 | 2001.3 |
| 台灣社會經濟史研究 | 廈門大學出版社 | 2001.3 |
| 戰後美台經濟關係概論 | 九州出版社 | 2001.6 |
| 震懾“台獨” | 華文出版社 | 2001.9 |
| 當代台灣政治分析 | 九州出版社 | 2002.6 |
| 21世紀初期海峽兩岸經濟關係走向與對策 | 九州出版社 | 2002.10 |
| 火中龍吟：余光中評傳 | 花城出版社 | 2002.5 |
| 台灣新聞事業史 | 中國時政經濟出版社 | 2002.9 |
| 台灣志略 | 九州出版社 | 2003.3 |
| 閩台文學的文化親緣 | 福建人民出版社 | 2003.7 |
| 加入WTO與兩岸經貿發展 | 廈門大學出版社 | 2003.8 |
| 清代台灣移民社會研究 | 九州出版社 | 2003.8 |
| 觀察台灣 | 華藝出版社 | 2003.9 |
| 經濟全球化、WTO與中國特殊經濟區再發展 | 廈門大學出版社 | 2003.9 |
| 資料來源： | ||
學術刊物
《台灣研究集刊》主要發表關於台灣問題的前沿研究成果，包括台灣政治、經濟、法律、歷史、文學、宗教、社會、教育以及兩岸關係等方面的論文、書刊評介、學術綜述等，已加入《中國學術期刊全文資料庫》、《中國學術期刊綜合評價資料庫》、《中國人文社會科學引文資料庫》、《中國核心期刊（遴選）資料庫》、中國期刊網、萬方資料庫等全文資料庫。
在影響因子方面，《台灣研究集刊》排在港澳台問題類刊物的第一位。從2010年第1期起，《台灣研究集刊》正式從季刊改為雙月刊。
人才培養
學科建設
根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院有二級學科博士點7個，二級學科碩士點10個，福建省“雙一流”建設高峰學科1個。
福建省“雙一流”建設高峰學科：兩岸關係和平發展
二級學科博士點：區域經濟學、經濟法學、台灣研究、政治學理論、國際關係、中國現當代文學、中國史
二級學科碩士點：政治學理論、中外政治制度、國際關係、區域經濟學、專門史、中國近現代史、中國現當代文學、憲法學與行政法學、經濟法學、台灣研究
教學建設
根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院共招收博碩士研究生約600人，其中台灣學生50多人。截至2017年6月，畢業博士研究生53名，碩士研究生216名。
合作交流
根據2018年11月研究院官網信息顯示，研究院共有120多人次赴美、日、歐等國家或地區進行講學、短期研究和參加研討會，與哈佛大學、麻省理工學院、芝加哥大學、哥倫比亞大學、約翰·霍普金斯大學、馬里蘭大學、首爾大學、新加坡國立大學、倫敦政經學院、柏林洪堡大學、東京大學，以及布魯金斯學會、戰略與國際研究中心、蘭德公司、卡內基國際和平基金會、史汀生中心、美國進步中心、英國皇家國際問題研究院、韓國統一研究院等國際知名高校和智庫建立起學術交流關係，在台北、台中、高雄、金門設立四個駐點研究室。
文化傳統
•院徽
院徽台灣研究院院徽整體設計風格與廈門大學校徽保持一致，色調為深藍色。
院徽主體是由大寫英文字母“TW”構成的“翻開的書本”，契合本院從事台灣研究、教書育人的內涵。
書頁圖案為大陸和台灣的輪廓，意為“兩岸一家”，中間的圓點即為本院所在地廈門。
“GIfTS”為研究院英文名稱的縮寫；外圈為研究院院名的中英文表述。
機構領導
現任領導
| 職務 | 姓名 |
| 黨委書記 | 曾坤瑜 |
| 院長兼黨委副書記 | 李鵬 |
| 黨委副書記 | 陳文 |
| 副院長 | 彭莉 |
| 副院長兼黨委委員 | 張羽、張文生 |
| 黨委委員兼工會主席 | 葉宏明 |
| 黨委委員 | 王華 |
歷任領導
| 任期 | 職務及姓名 |
| 1980年7月 — 1984年12月 1984年12月 — 1987年3月 1987年3月 — 1996年4月 1996年4月 — 2001年11月 2001年12月 — 2004年3月 2004年3月 - 2012年11月 2012年11月-2017年11月 | 所長：陳碧笙、袁鎮岳，黨支部書記：朱天順 所長：朱天順、陳在正，黨支部書記：蘇淑瓊 韓清海 所長：陳孔立，黨支部書記：韓清海 所長：范希周，黨支部書記：何天華 所長：劉國深，黨支部書記：何天華 院長：劉國深，黨總支書記：游澤民 院長：劉國深，黨委書記：曾坤瑜 |
