U.C.0087年3月2日夏亞駕駛RMS-99力克?迪亞斯在青色諾亞2的平民少年——卡繆?維丹的協助下奪取了泰坦斯秘密開發的RX-178 GUNDAM Mk-II的2號機和3號機。8月16日夏亞與布列格斯?弗拉（Bilsikus Forla）準將一起出席由聯邦政府召開的會議，翌日凌晨布列格斯?弗拉準將遭到泰坦斯暗殺，夏亞成為奧古最高領導人。同時，在地球降落作戰行動中夏亞又遇到了昔日的宿敵阿姆羅，但這時他們卻是一起反抗泰坦斯的同志而不是敵人。
10月12日阿克西斯回歸地球圈，與交戰中的希洛克艦隊和阿伽瑪戰艦遭遇，並協助阿伽瑪擊退希洛克艦隊。隨後夏亞與布萊德等人登上阿克西斯旗艦格瓦丹號上進行交涉。當夏亞看到年幼的米涅瓦成為哈曼專政的傀儡時，平常十分冷靜的夏亞也失去理智對哈曼大打出手。14日，交涉最終以破裂收場。隨後在15日阿克西斯與泰坦斯聯合，奧古的形勢急轉直下。同時泰坦斯在聯邦議會中的勢力日益增強。為了扭轉不利的形勢，奧古在11月16日占領位於達喀爾的聯邦議會會場，夏亞公開了自己是吉恩?戴肯之子身份的秘密，同時發表演說向全世界批評了想依附地球的愚蠢想法並闡述了泰坦斯的暴行。
U.C.0088年2月22日奧古、泰坦斯和阿克西斯的部隊展開艦隊戰，泰坦斯艦隊遭受殖民地雷射炮攻擊，最終以全滅收場。奧古與阿克西斯的部隊傷亡慘重，夏亞駕駛MSN-00100百式與哈曼的卡碧尼交戰，機體被重創大破，夏亞隨即行蹤不明，赤色彗星又一次消失在宇宙中；格利普斯戰爭亦宣告結束（失蹤後，在0088的結尾出現過，將捷多的妹妹送回新阿伽瑪號後，再次失蹤。）
經歷了格利普斯戰爭、目睹拉拉的NT悲劇在卡繆的身上重演，夏亞更加堅定在戰亂時代的NT命運注定是悲慘的。他意識到要拯救人類、要實現全人類的革新只有把一切戰爭的禍端消除；而這個禍端就是地球聯邦政府和那些久居地球的腐敗分子；於是新的作戰計畫開始在赤色彗星的心中醞釀。
