尹瓘出生於坡平尹氏家族，通過科舉考試進入高麗軍隊。 高麗第一次入侵女真
曷懶甸位於金曷懶路南,今朝鮮鹹興一帶 12世紀初，以完顏部為核心的女真部落聯盟要統一曷懶甸的女真部落，“曷懶甸諸部盡欲來附”，這是民族發展中由分散變為一體的趨同運動。對此，高麗不安，“恐近於己而不利也，使人邀止之”，高麗則要向曷懶甸“拓土開邊” ，雙方的衝突勢難避免。
高麗對女真進行武力干涉。1104年二月，林乾等率兵由定州出關侵入曷懶甸，當即遭到女真聯盟軍的迎頭痛擊，林乾等戰敗，損兵折將， 被迫罷官。高麗改派尹灌為東北面行營都統，再次率兵入侵曷懶甸，同樣遭到女真軍的頑強抗擊。高麗軍“ 陷沒死傷者過半，勢不能振，遂卑辭講和，結盟而還”。 高麗擴軍備戰
高麗雖然“講和結盟”，但並無放棄占領曷懶甸的企圖。高麗戰敗請和，乃緩兵之計，實則擴軍備戰， 以圖反撲。
尹瓘感到高麗缺乏一支精銳的部隊，於是向肅宗請命重組高麗軍隊並培訓一支精銳部隊。《高麗史·尹璀傳》載，尹璀敗歸後，即向高麗肅宗建議“ 臣觀賊勢倔強難測，宜休徒養士以待後日......始立別武班，自文武散官吏青至於商賈仆隸及州府郡縣，凡有馬者為神騎，無馬者為神步、跳蕩、梗弓、精弩、發火等軍，年二十以上男子，非舉子皆神步。西班與諸鎮府軍人，四時訓練，又選僧徒為降魔軍，遂練兵畜谷，以圖再舉” 。
1107年，高麗任命尹瓘、吳延寵為正副元帥，率17萬大軍，號20萬，由陸地、水面分五路對曷懶甸發動全面進擊。由於是突然襲擊，女真人沒有準備，其酋長人先被誘殺，於是更加被動。是役斬女真軍6000餘人，俘虜1000餘人，攻破村莊130餘座。第二年，高麗在這一地區強築鹹州、英州、雄州、福州、吉州、公峻鎮、通泰鎮、崇寧鎮、真陽鎮九座城，大體相當於今朝鮮鹹鏡南道和兩江道南端一帶，準備長期固守。
1108年，高麗宮廷大臣爭鬥。高麗睿宗令尹瓘撤兵。高麗反對派甚至要尹瓘將九城歸還女真。
塞斡領導的女真軍與高麗軍在曷懶甸展開一年多的爭奪戰，雖互有勝敗，但高麗軍敗多勝少，消耗特大，高麗的交通線和通訊網常為設伏的女真軍抄掠。其國內，因廣泛徵兵和連續戰爭而飢懂、疾疫，“邊患窘迫，軍民勞苦”，“軍馬疲斃”，上下騷然是其具體寫照。1109年“高麗復請和”，康宗曰“事若酌中，則與之和。”在高麗王主持下，經百官會議研究，答應並履踐女真的要求：撤離九城，歸還亡民，退出所占故地……於是曷懶甸回歸女真。長白山三十部女真正式加入女真民族中，從而壯大該共同體力量。
1109年秋，高麗從曷懶甸撤軍，尹瓘後被撤職併入獄。不過尹瓘很快在1110年被釋放，並給予復職。但被尹瓘拒絕了復職邀請。一年後，尹瓘去世。
對於尹瓘所建九城的位置存在一些爭議。一般的觀點認為是在今朝鮮的鹹興市((Hangul:동북 9성, Hanja:東北 九城))。但是今天鹹興市從1019年第3次遼國高麗戰爭後作為進攻和控制朝鮮半島的軍事重鎮理應被遼國控制，故而尹瓘所建九城可能在鹹興市西部的平安南道。但韓國民族主義者單方面以韓文漢字中稱為“東北九城”而說是在今中國東北。
家族紛爭由於朝鮮半島常年戰亂，尹瓘墓地位置直到18世紀才為人知曉。由於尹瓘墓地與沈氏家族墓地很近，引發了沈氏和尹氏家族長達300年的紛爭。
