僧格林沁和勝保企圖殲滅北伐軍於撤退途中，率領馬隊緊追不捨，當天就追到束城。不久，大隊清軍趕到，對北伐軍繼續實行包圍。清軍在四周挖掘深壕，設定鹿砦、木柵，防止太平軍突圍，並不時發起進攻。太平軍憑壘固守，一俟清軍接近，便施放槍炮，投擲火罐、火球，大量殺傷敵人。
束城是個小鎮，糧彈給養難以補充，因此，太平軍北伐軍在這裡駐守一個月後，又於3月7日乘著大霧再次突圍，途經獻縣，於3月9日抵達阜城。
阜城也是一個小邑，城內積水很多，房屋甚少。太平軍除據有全城外，還占領城北的連村、對村、杜家場和城西南的塔露頭村、紅葉屯等村落，周圍密布鹿砦、樹柵，有的地方多達五六層，準備堅守。
北伐軍到阜城後，很快又被三萬多清軍包圍。不久，城北各村落入敵手。在3月25日的戰鬥中，吉文元受傷犧牲，北伐軍的處境更加嚴酷。幸好這時北伐援軍已過黃河北上，清廷為不使其與北伐軍會合，即命勝保帶領萬餘清軍（內有馬隊二千），趕往山東防堵。這就減輕了對阜城的壓力，使北伐軍得以在此堅守兩個月之久。
