劇情變化
初始精靈必定為皮卡丘,而小茂則必定會在一開始選擇伊布,小茂的伊布會依遊戲中與主角對戰之記錄進化為不同型態。
根據劇情的展開可以得到妙蛙種子、小火龍與傑尼龜。
道館館主使用的精靈參考了動畫,且等級均有提升。
與火箭隊戰鬥的部分場合的對手變為了武藏、小次郎與喵喵。
系統變化
與動畫中一樣,作為初始精靈的皮卡丘不願進入精靈球,而喜歡跟在主人公身後。在後續的遊戲《口袋妖怪心金魂銀》中也加入了可以將首位精靈跟在主人公身後的系統。
與該皮卡丘對話時,遊戲會通過愛心數來顯示它對訓練師的好感度。這是親密度系統的雛形。
此外它還拒絕使用雷之石進化,並在戰鬥中有特殊的叫聲。
攜帶會衝浪的皮卡丘時,在19號路的民宅可以玩“皮卡丘的沙灘”的小遊戲。
精靈變化
•部分怪獸的可學技能有所調整,例如皮卡丘追加了十萬伏特,噴火龍追加了飛空。
•野生怪獸的分布有所調整,例如皮卡丘不再野生出現,而常磐森林出現了比比鳥。
獨角蟲 | 鐵殼昆 | 大針蜂 | 阿柏蛇 | 阿柏怪 | 雷丘 | 喵喵 | 貓老大 | 瓦斯彈 |
雙彈瓦斯 | 迷唇姐 | 電擊獸 | 鴨嘴火龍 |