南澳在明朝就有“海上互市”之稱,說明當時南澳港海上貿易之活躍。但是南澳港灣資源卻未得到開發利用,建國後,特別是到了改革開放的年代,港口、碼頭建設才有較大進展。先後建成前江碼頭、鹿仔坑碼頭、長山尾碼頭及其它碼頭。1992年,南澳被廣東省政府定為海島開發試驗區,1994年被國務院批准為一類開放口岸。
南澳港港口資源豐富,岸線長而曲折,主島岸線長達77千米,岸線係數為0.714,擁有港灣66處,天然深水良港有7處,這7處港灣水域總面積為35平方千米。目前已建成或在建的碼頭情況是:以南澳港務所碼頭泊位為主,有輪渡碼頭、鹿仔坑油氣碼頭、後江水泥廠碼頭、布袋澳油氣碼頭等,共有50000噸級泊位1個,5000噸級泊位3個,1000噸級泊位3個,300~500噸級泊位5個。前江碼頭庫房面積為2284平方米,鹿仔坑碼頭庫房面積為200平方米,前江碼頭堆場面積為13674平方米,所有建成及在建碼頭堆場總面積共66609平方米。布袋澳5萬噸級冷凍式石油氣庫是目前國內最大最現代化的液化石油氣庫。