南京市城市排水監測站是隸屬於南京市排水管理處的二級獨立核算單位，能夠承擔第三方公正檢驗。
檢測能力：監測站主要開展水質、固體廢棄物、氣體三大類別的檢測（其中包括水質：城市污水、工業廢水、地表水、雜用水、飲用水、地下水；固體廢棄物：城鎮污水處理廠污泥泥質；農用污泥；氣體：環境空氣），已具有115個項目（按參數計、不含重複項）的檢測能力，其中水質81項、固體廢棄物22項、氣體12項。具備《城鎮污水處理廠污染物排放標準》GB18918-2002、《污水排入城鎮下水道水質標準》CJ343-2010、《污水再生利用 城市雜用水水質》 GB/T 18920-2002、《地表水環境質量標準》GB 3838-2002、《地下水質量標準》GB/T14848-1993、《城鎮污水處理廠污泥泥質》CJ247-2007、《生活垃圾填埋場污染控制標準》GB16889-1997、《環境空氣品質標準》GB3095-1996、《生活飲用水衛生標準》GB 5749-2006等標準中的項目檢測能力。
機構設定：本站共設四個部門，即：辦公室、質控室、分析室、業務室。
人員狀況：共有在職人員24人，其中研究生1人，本科生11人，大專4人，專科以上人員占職工總人數的67%。具有高級職稱的有3人，中級職稱5人，初級職稱5人。
設施設備狀況：監測站總面積1000平方米，現有儀器設備固定資產總值344萬元，檢測儀器設備82台套，採樣車4輛，擁有原子吸收儀、氣相色譜儀、離子色譜儀、雙道原子螢光儀、紅外測油儀等大型進口儀器設備。
其主要職責：(1)承擔對排入城市排水設施的企事業單位排放水水質檢測工作，(2) 城市污水處理廠產業化運營監督檢測(3) 城市排水設施、河道、泵站水質檢測及效果評價 (4)污水處理廠污水、污泥檢測(5)垃圾填埋場水質、氣體檢測(6)參與排水事故現狀調查，提供水質分析報告（7）提供污水處理檢測人員上崗培訓及業務指導等（8）參與行業、省市標準及檢測方法、相關課題分析研究。
1995年以來，監測站開展了南京市排水許可管理、市區主要河湖、污水泵站、引水沖洗、污水處理廠等水質監測工作，累計獲取檢測數據五十多萬個，為政府強化排水管理、制定相關政策法規提供了可靠依據。監測站參加了國家城市排水建設部《污水水質檢驗方法標準》（CJ/T51-2004）、《城鎮污水處理廠污泥檢驗方法》（CJ/T221-2005）、《城鎮排水設施氣體的檢測方法》（CJ/T307-2009）等標準的參編工作，參加《城鎮排水自動監測系統技術要求》、《城鎮污水處理廠污泥處置制磚用泥質》（CJ/T289-2008）的行業準編制工作，參與了江蘇省、南京市下達的科研項目，其中《金川河現狀調查及整治對策》和《引水沖洗效果評價》，先後獲得南京市科技技術進步三等獎，在專業刊物上發表論文30篇。
