分類
鹼基切除修復切除修復有兩種形式：一種是鹼基切除修復，它是在DNA糖基化酶的作用下從DNA中除去特定類型的損傷或者不合適的鹼基。另一種是核苷酸切除修復(Nucleotide excision repair, NER)，它是一個識別廣譜DNA損傷的系統，這些損傷被一個多功能的酶複合物除去，產生一個能被DNA聚合酶和DNA連線酶修復的缺口。
主要過程
（1） 核苷酸切除修復(Nucleotide excision repair, NER)
主要修復那些影響區域性染色體結構的DNA損傷，包括由紫外線所導致的雙嘧啶二聚體(purimidine dimer),化學分子或蛋白質與DNA間的DNA附加物(DNA adduct)，或者DNA與DNA形成的交聯(cross-link)等。這些損害的形式若沒有適時的排除，DNA聚合酶將無法辨識而滯留在損害的位置，這時細胞就會活化細胞周期檢查點以全面停止細胞周期的進行。主要包含全基因組的核苷酸切除修復和轉錄偶聯的核苷酸切除修復 。
大致過程為：損傷識別---蛋白複合體結合到損傷位點----在錯配位點上下游幾個鹼基的位置上（上游5’端和下游3’端）將DNA鏈切開----將兩個切口間的寡核苷酸序列清除 ----DNA聚合酶合成新的片段填補缺口----連線酶將新合成片段與原DNA鏈連線起來
（2） 鹼基切除修復(base-excision repair, BER)
所有細胞中都帶有不同類型、能識別受損核酸位點的糖苷水解酶，它能夠特異性切除受損核苷酸上的N-β-糖苷鍵，在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點，統稱為AP位點。
一類DNA糖苷水解酶一般只對應於某一特定類型的損傷，如尿嘧啶糖苷水解酶就特異性識別DNA中胞嘧啶自發脫氨形成的尿嘧啶，而不會水解RNA分子中尿嘧啶上的N-β-糖苷鍵。DNA分子中一旦產生了AP位點，AP核酸內切酶就會把受損核苷酸的糖苷-磷酸鍵切開，並移去包括AP位點核苷酸在內的小片段DNA，由DNA聚合酶Ⅰ合成新的片斷，最終由DNA連線酶把兩者連成新的被修復的DNA鏈 。
