學科帶頭人為著名普通外科專家，醫學教育家黎介壽院士。副所長為李寧、任建安教授。學科是南京大學博士、碩士研究生授權學科，第二軍醫大學、南方醫科大學博士、碩士研究生聯合招生點，2001年國家人事部批准建立博士後研究工作流動站。
研究所現有軍人57人，主任醫師、教授18人，副主任醫師、副教授15人；博士後聯繫導師3人，博士研究生導師6人，碩士研究生導師12人。45歲以下的副主任醫師都具有博士學位。有省部級“突出貢獻的中青年專家”4人。
研究所以臨床需要為研究方向，在腸外瘺的治療、危重病人的營養支持、同種異體人小腸移植、胃腸腫瘤的總體化療、門靜脈高壓症、膽道、甲狀腺、乳腺等疾病的治療進行了系列化的研究，展開床位250張，年門診量63000餘人次、門診手術2100餘台，病區收容7800餘人次、手術4100餘人次。
研究所年發表學術論文約150篇，其中20篇左右為SCI。近年主編13卷巨著《手術學全集》、《腸外瘺》、《臨床腸外及腸內營養支持》、《圍手術期處理》等專著10部，參與黃家駟外科學等31部著作的撰寫工作。獲國家科技進步一等獎1項、二等獎2項，軍隊省部級醫、教、研成果一等獎13項、二等獎15項。先後有10 餘人次榮獲“何梁何利獎勵基金”醫學與藥學獎、國家科學大會獎、中國人民解放軍專業技術重大貢獻獎、總後勤部與南京軍區有突出貢獻的醫學專家、培養人才先進個人等稱號。
