創會緣起
佛教正覺同修會 最初成立之緣起，源於蕭平實最初宣揚念佛法門並流通書籍；而參與修行的學人都以念佛法門再入禪門。團體乃於1995年定名為“念佛三昧印經會”，以印書流通為主。蕭平實同時於另外三處宣講佛法，持續六年不輟，學人們逐漸增多；然而蕭平實聲帶、氣管嚴重受損。同修們意欲勝妙法門繼續弘揚推廣，併兼顧蕭平實身體狀況，遂私下積極尋覓共修道場，然後全體同修極力請求蕭平實應允成立“佛教正覺同修會”，將四處學員匯集於“正覺同修會”合併共修，乃應機設立共修團體﹔1997年7月6日，召開“正覺同修會”會員大會，並依法申請登記為“社團法人佛教正覺同修會”。
佛教正覺同修會經過多年的自然發展，在台北、桃園、新竹、台中、台南、高雄、香港、美國洛杉磯等各地設有共修處，分別開設禪淨班、進階班、增上班，開講初、中、高級的佛法課程；禪淨班初級結業之學員總計已有數千人之多。為了進一步將佛法普遍化，同修會於2010年起開始在電視節目中宣揚佛法。
創建人
蕭平實，或稱平實居士，追隨者尊稱其為平實導師。1944年生於台灣中部，世代務農，祖父以耕讀持家，父、祖皆為三寶弟子。13歲喪母，初識無常。少時即好打坐及方外之術，亦習金石、拳術、古文、針灸等。自小厭惡迷信，每斥神造世人之說，不信神能造人。兵役期滿後辭父離鄉，於台北市覓職﹔五年後成立事務所，執行業務﹔雖游於世務，而樂於暗助弱小。
歷練世間法18年後，於1985年皈依三寶，鼎力護法，勤修福德。自修持名念佛，精進二年之後自成無相念佛功夫。
1988年， 平實導師應邀在許居士家中佛堂開始講說基本佛法，先講五蘊、十八界法之緣起性空、四聖諦、十二因緣等阿含基本佛法，以《阿含經》中所說佛法為說法的主要內容。
1989年初， 平實導師轉進而改修體究念佛──參禪。從此開始常常住於見山不是山的境界中。十月初隨聖嚴法師前往天竺，作為期15天的朝禮聖地之旅，而中斷說法度眾之事。返國後，鑒於長時處於參禪狀態之“見山非山”境界中，不便繼續說法而暫停講課﹔並立即結束事務所業務，專心參禪。
因參禪始終沒有結果，後來觀世音菩薩開示：“開悟哪有那麽簡單？心肝那麽沒閒！”（台語）所以1990年11月， 平實導師中止了原來在某道場的許多義工事務，於家中開始閉關，摒絕一切外緣，專心苦參19天后，在第19天下午，終於驪龍頷下得珠──明心並且眼見佛性──發明智慧﹔因為無人可以印證故，嗣即深入經藏，以三乘法義印證無訛﹔不久又經 佛之召見，說明此世、往世因緣，給與印證。
有鑒於末法時期外道猖獗橫行於佛門中，正法日漸衰微，遂發悲勇，誓願度眾，隨即應允以前追隨 導師修學者之請求，乃於1991年仲夏復出弘法度眾。為免正法被如是常見外道法所取代，為護正法， 平實導師毅然揭竿而作獅子吼，開始效法玄奘菩薩之方式，以破斥邪說之方法來顯示正法的不同所在﹔如是弘傳了義正法，獨自面對諸方錯悟大師、各大道場之龐大勢力而無所畏懼。平易近人的 平實導師，卻作了這種大異常人的弘法志業。
1997年二月與諸同修成立“正覺講堂”，七月成立台北市“社團法人佛教正覺同修會”，八月成立“正智出版社”，著作一百多本，計有《無相念佛》、《念佛三昧修學次第》、《禪——悟前與悟後》上、下冊、《宗通與說通》、《禪淨圓融》、《狂密與真密》四輯、《禪門摩尼寶聚--公案拈提》七輯、《真實如來藏》、《楞伽經詳解》十輯、《楞嚴經講記》十五輯、《優婆塞戒經講記》八輯、《金剛經宗通》等，都由“正智出版社”出版。蕭平實著書立說所得收入，據其弟子所述，全部捐贈正覺同修會，作為弘法度眾、購置講堂之基金 。
理念
佛教正覺同修會由蕭平實與其弟子成立，在1990弘法初期，蕭平實依據經典以如來藏為弘法主旨，將世尊釋迦牟尼佛所親傳佛法真義—第一義諦—重現於這個末法時代。弘法及辨正初期，正信佛教界迴響極大，也曾引起激烈討論。但隨著佛教正覺同修會在陸續一百多本著作中，針對如來藏、禪宗、淨土、密宗、阿含、中觀、唯識等佛法重要領域，以“宗門”和“教門”的角度詳細說明，到2014年7月，在正統的佛教界中已經沒有法師公開指稱正覺的法義有誤。
關於如來藏
正覺的理念是世尊在三乘經典法教中的核心是不生不滅、離見聞覺知(六識)的第八識如來藏。任何以“有生有滅”的第六識意識心作為修行的目標，或是要將意識心修成經典中不生不滅的金剛心，或是“誤認”意識心本身就是如來藏，乃至假藉佛法名相而修的外道法等，“都背離”世尊的原始經教；不生不滅、離見聞覺知的如來藏才是法界之實相，而不是有生有滅的意識心(第六識)。 從此詩 [菩提本無樹，明鏡亦非台；本來無一物，何處惹塵埃？] 可以驗證。少數歷史上的修行者可以驗證此法，可從文學作品而觀。
關於藏傳佛教
於2003年開始，正覺同修會開始舉證佛陀教典，推出多本著作，揭示藏傳佛教的法義“嚴重脫離佛法”，更定案指出藏傳佛教僅是附佛外道喇嘛教，而非佛教。 正覺同修會於著作《狂密與真密》中，舉出種種密宗修行者的書籍、法器及雙修人像，明確證明：藏傳佛教之譚崔(Tantra)密續教義無上瑜伽續，是以雙身法(行房術)修行做為最究竟成佛法門，嚴重誤導廣大學人，違背世尊在三乘經典“解脫道”與“佛菩提道”中所一再開示的清淨離欲修行內涵。當代佛法淨土宗著名法師也證實早知藏傳密宗修雙身法一事，更勸告此法非一般佛子所當修習，應該遠離。故辨正密宗錯誤的法義不是正覺同修會單方面無根誹謗。正覺認為藏傳佛教僅是西藏之喇嘛教套用佛教之名稱及法義名相，“是附佛外道，不是正信佛教”。
茲舉示藏傳佛教之部分法義教導：2013年 11月，藏傳佛教之高層法王，夏瑪仁波切(Shamar Rinpoche)的公開聲明： “在金剛乘的修行，當你達到高條件的金剛修行者，像帝洛巴、那洛之流，接著要與夠條件的女修行人閉關性交雙修是實際上能達成開悟的樞紐……”
蕭平實認為藏傳佛教將“觀想本尊合而為一”就是“即身成佛”，"是錯解成佛定義"；他認為密宗祖師蓮花生之《亥母甚深引導》中所傳之“雙身法”不是佛教，他認為蓮花生及後世傳承之藏密四大派表面用許多佛法名相來掩飾其“雙身法”的主軸，因此認為西藏密宗傳教方式，是以外道法取代真正佛法之“李代桃僵”，故以維護佛教不被外道法取代，進行舉示辨正。除此，蕭平實認為藏密密續中名相定義，“女人性器官名為蓮花，男人性器官稱為金剛杵”為藏密鮮為人知之密，因此認為藏密以“雙身法”為本質，流於“下流色情與淫亂”。
主張如來藏妙法，如來藏乃第八識---阿賴耶識，遵從正法經典開示。
蕭平實居士與其弟子在1990年至2010年，以佛教大乘經典為依據，評辨各種不合經教的論述，其著作均由支持佛教正覺同修會的正智出版社所出版，而正智出版社每年的盈餘也捐獻給佛教正覺同修會。
法義辨證
佛教正覺同修會在弘揚大乘佛法的同時，又以著書的方式辨證各種佛門內外不合佛典經教的論述與說法(法義辨證)。不論法師或居士，如其開示法義是否定如來藏、以有生有滅的第六識意識心做為修行的目標，或是要將意識無念心修轉成經典中不生不滅的金剛心，或是誤認意識心本身就是如來藏，又或是將附佛外道法冒充佛法歪曲宣揚等，佛教正覺同修會都一一出書辨證，期望使現今及未來廣大佛子獲益。始終未見有任何家喻戶曉的大法師出面公開辨正佛教正覺同修會的佛經說法。
密宗
依據印光大師所言，一直未完全肯定密宗，也未敢否定密宗。印光大師為了避免一般的修行人走入流弊（妄評僧寶），所以提出以較為穩當的觀點。這是大師為了保護一般修行者的慈悲之言。今傳密宗之人，已失佛教之宗。印光大師對未知之法不加贊毀，實屬當今及未來各佛子的學習榜樣。印光大師以身作則，以知見破邪行，辨正訓斥密宗學人，不應“鼓吹神通及欣然食肉”，這不是正確的法義。如今喇嘛及學密人各各出書出文，光明正大推行邪淫行房密術，偽裝成最上乘佛子模樣，更不是正確的法義。“如是發大菩提心佛子們，理應捨身出力，破邪說歸正法” 。
侵犯著作權被提起公訴，原告撤訴後法院不受理
正覺同修會出版的正覺電子報，於2006年7月10日、8月10日出版之33期、34期，未經昭慧法師同意，重製昭慧法師1997年11月3日、12月17日、12月26日寄給被告蕭平實之書信全文，及2000年7月13日寄給詹達霖之書信全文，觸犯著作權法第91條第1項之擅自以重製之方法侵害他人之著作財產權罪嫌，遭台北地方法院檢察署檢察官提起公訴。後來昭慧法師當庭撤回告訴，因這是告訴乃論之罪，法院不受理公訴。
講堂掛爭議布條
正覺講堂在其所在的台北市承德路三段“美源統帥企業天下辦公大樓”外牆掛上大幅廣告，上面文字聳動，引發附近居民譁然。正覺同修會表示，廣告所述內容“都是事實”，有中英文書本及網站可搜尋，為了保護社會大眾，他們不會撤除。居民向台北市市民熱線1999陳情，但還未獲市府回復。該棟大樓管理委員會召開會議討論，主張在外牆懸掛廣告看板須經管委會同意；但正覺代表發律師函給管委會，指若未經同意拆除，將違反《刑法》毀損罪，正覺也要依《民法》請求侵權行為損害賠償；管委會因而未進一步處理。
對佛教歷史精研的前台大哲學系楊惠南教授則說，早期瑜伽修行在印度的確是一種宗教行為，後來有部分藏傳佛教支派吸納了印度教的做法，將所謂“性交修行”也納入，這與釋迦佛所強調的傳統佛教精義確有極大出入，正覺的提醒及批判並不意外。
正覺同修會在宣揚世尊如來藏法教及修行之餘，也量力回饋社會，參與包含921大地震、莫拉克風災賑災活動、中國四川大地震、清寒獎助學金等社會福利及公益活動。修行不限於打坐參禪、抄經念佛，行善也是修行的一種，累積福德資糧，種善根。
2014年代電視《發現新台灣》節目報導“正覺同修會”雪中送炭之敦親睦鄰義舉。
2017~2018年度，正覺教育基金會隨同全國孝行天下主題系列活動組委，先後走入大同、渭南、上蔡、定陶、西安、原陽、烏蘭察布、菏澤等地，進行“傳播孝文化、踐行孝文化”等主題活動。
講解經論
蕭平實講法近20年，每周免費講經說法未曾間斷，為弘揚佛法，在台中，台南，新竹，高雄，香港，美國洛山基等地成立共修講堂，分設禪淨班、進階班和增上班，蕭平實為增上班學員詳細講解彌勒菩薩《瑜伽師地論》，為提升國人佛學，同修會2010年開始電視弘法。蕭平實在其多本著作中，對印順法師推崇的中觀應成派見解，加以一一舉示、辯證，認為：“印順法師自身閱已，其實亦已自知邪謬，然而無力自圓其說，...又不能承認《妙雲集》等著作所說邪謬，只得默然以對，不復有所能為，舍壽時亦將悔恨以終，後世長受苦報。”印順法師在1994年後不再寫作，至2005年舍壽之前，引順或其門徒，無人回應蕭平實多年來於種種著作中對其佛法法義的公開評議。
摘錄
雖然！索達吉喇嘛曾寫出了一本《真假邪說論》，指稱我的法義是邪說；但也不敢針對《狂密與真密》書中的法義作出辨正，只是講一些門面話，顧左右而言他，扯一些與他們宣稱最勝妙雙身法無關的事相。大陸很多的學者們讀了以後，當時都有個疑問：「蕭平實為什麼不回應他？」而大陸有些真懂佛學的、專門教授佛學的佛學院教授們說：「因為他們二人不是同一個層次的，層次落差太大了，所以蕭平實不會回響他的。」後來就是由正安法師寫書來辨正回應他，也就是《真假邪說》。辨正清楚以後，大家才發覺：「原來索達吉的說法才是真正的邪說，原來是藏密邪說在誣賴正法為邪說。」結果，想辨正別人是邪說的索達吉，自己倒反而被證明為邪說了！但是藏密的修行者何嘗知道這些內幕呢？他們是根本都不讀雙方辨正法義書籍的，都成了迷信盲從者，是很難救護他們回歸正道的。而這種狀況的存在，是因為他們有著錯誤的隨緣心態，就繼續隨順於惡法緣，才造成難以救護的狀況。我們知道真相，設法去幫助他們；可是他們那些人大部分是不願去讀《狂密與真密》的，都只因為先入為主的觀念，所以不隨順善法緣，反而隨緣於惡法 。
問題二：六祖曰：「不識本心、學法無益」這句話是什麼意思？要如何識本心呢？
答：「不識本心，學法無益」出自《六祖壇經》，是五祖對六祖說的。五祖弘忍告訴六祖慧能說：「如果沒有認識本心所在（沒有親證本心）的話，修學佛法都將落於玄想與空談，所以學法無益。」古今所有的證悟祖師們都同樣會這樣講的。這是因為禪宗是依如來藏的清淨、涅盤、自性而說般若，不是依意識心想像或思惟的認知境界來說般若的；因為中觀是以如來藏不落斷常、垢淨、來去、一異……等兩邊而說中觀的，不是意識覺知心依佛法知見起心作意離開兩邊的中觀，也不是覺知心在事相上離兩邊的中觀，所以如來藏是法界實相心。法界萬法的根源既然是他，那么佛法的修證就必然是依著、繞著法界實相的這個根本心來修證的。這才是般若正確而且唯一的修證標的，禪宗正是這樣修證的；若離開對如來藏的修證，就沒有般若的證悟可說了！般若的修證是如此，第三轉法輪的方廣諸經講的「唯識增上慧學」，也仍然是如此修證的，都是以如來藏為根本才有可能進修方廣唯識增上慧學的。
成佛是靠一切種智，一切種智則是實證如來藏所含藏的一切種子，而這一切種子智慧的親證，是到佛地才具足的；未到佛地之前，從等覺到初地都稱為道種智，不稱為一切種智；可是既然都是牽涉到種子，而種子存在哪裡呢？存在如來藏中。在如來藏心體中的一切種子，你親證而且圓滿具足了，那就是一切種智圓滿，就是成佛。但是想要修學一切種智──發起道種智以前，必須先證得如來藏心體，把如來藏的心性都體驗清楚了，就有般若中觀的智慧生起了，然後才有能力進修諸地的道種智，道種智圓滿時就是究竟成佛時。這就是三賢位菩薩應該悟後起修的地方。這部分的觀行完成了，就是十回向位滿心了，就是般若中觀的見地具足圓滿了！這時已成就如夢觀了，能知道過去世的很多事情，卻不是由宿命通來了知的。但若沒有證得如來藏心體的所在，就不能體驗他，就無法具足般若中觀的見地，無法自己修證一切種智，也無法進入初地心！更別說是成佛了！
所以，想要修學佛道，想要邁向成佛之路，當然是要先見道明心；而見道明心的內容，就是如來藏心體。而如來藏心體中所含藏的一切種子，你具足圓滿的親證了，你就成佛了。如果沒有親證如來藏，你將無法現觀如來藏本身的功能差別，那么般若中觀就不能成就，一定會落在意識心上面去思惟想像般若中觀。那就像宗喀巴的《菩提道次第廣論》所講的那樣。但是，在成佛之道的過程當中，其實最重要的是一切種智的修證。因為，一切種智是成佛的依憑：由一切種智的圓滿具足，而發起成所作智及大圓鏡智，也使平等性智及妙觀察智得以圓滿。
可是一切種子都含藏於如來藏心體中，所以必須先找到如來藏心體，才能去體會他所含藏的一切種子；如果沒有找到如來藏，般若中觀是絕對不可能成就的，而一切種智也跟著不可能成就。所以五祖才會告訴六祖說：「不識本心，學法無益。」你如果沒有識知本心如來藏的所在，學大乘法是學不上去的，永遠都是在外門不斷的運作、修行。就算號稱學佛學了三十年、五十年以後，仍然是意識的境界，無法跳脫於意識境界之外。因此，五祖才會向六祖說：「不識本心，學法無益。」
這意思講清楚之後，剛才這位菩薩問：「要如何識本心呢？」那很容易，你來參加共修兩年半；共修兩年半以後，你的知見建立了，你要找如來藏就有個方向了，參禪的方向就不會再錯誤了。也許不必去禪三，你就會找到如來藏了！同修會中一直都有這種人。如果你已經來修學兩年半了，可是還沒有找到如來藏，那時還有一個辦法，就是去參加禪三。參加禪三時，我們每天三次過堂時會有許多機鋒，晚上普說時也會有許多的因緣來幫助你們，那么你要識得本心，就不會很困難。所以，如何識本心？那就請你來參加共修。
附錄：公案拈提四則。
第三四三則 蒙溪無念
馬祖法嗣蒙溪和尚 僧問：「一念不生時如何？」師良久，僧禮拜；師云：「汝且作么生會？」僧云：「某甲終不無慚愧。」師云：「汝卻信得及。」
僧問：「本分事，如何體悉？」師云：「爾何不問？」僧云：「請師答話。」師云：「爾卻問得好。」其僧大笑而出。師云：「只有遮師僧伶俐。」
達賴喇嘛云：《在夢中射精的研究可能很重要。以明光升起的觀點看，只有在一種情況下─在死亡的一刻─才是圓滿地產生。不過，有其它四種情況，明光會以粗略的形式出現：打呵欠、打噴嚏、進入睡眠或昏厥、性高潮的時刻。……而最強的感受是在性高潮的時候。這是大樂的修習之所以包含在瑜伽密續中的原因之一。一般人對於無上瑜伽密續中，關於性以及其它的象喻存有諸多誤解。性的象喻真正的理由，完全是因為在四種明光出現的狀況當中，性高潮時最為強烈。因此這種象喻才用在靜坐中，以延長明光出現的經驗，或使之更清晰鮮明─目的就在於此。在性高潮時，因為明光出現的經驗較持久，因此你較有機會加以利用。》（摘自眾生出版社《揭開心智的奧秘》頁一四六─一四八）
平實云：陳履安先生曾在電話中，對余否認密宗之男女雙身修法，謂無此事。今者彼陳先生之眾生出版社為達賴喇嘛出版之書中，卻又明言有此修法。
所謂性高潮之明光，並非佛法，乃是印度教性力派修法，以之為 雌雄等至之一心樂境，以一心不亂之樂觸境界為證悟，名為「以淫慾為道」，是外道法。
佛法遍一切時、一切處、一切界，性高潮中所起明光境界，乃是意識境界；意識不遍一切處、一切時、一切界，故明光不遍一切處、一切時、一切界，如是焉得名為佛法？譬如明光唯在意識界相應，不與眼等五識界相應；假饒樂觸最強之正受時，身識仍不與明光相應，唯意識相應。複次，意識不遍六根，與五識俱而不在五識中存在，與意根俱而不在意根中存在，亦不在五色根中存在，是故不遍十二處，非是遍一切處者；意識既不遍一切處，依意識而生之明光焉能遍一切處？爾諸密宗法王、活佛，何妨於「無上瑜伽密續」之雙身修法過程中，審詳觀察？方知余語不虛也。三者，意識不遍一切時在，於眠熟等五位中必斷滅故；意識既斷滅已，明光則亦不存，何能於睡眠及悶絕位起明光境？而言於彼位中住明光境？如是妄想，有智之人所不信受，而汝法王竟自肯定，何其荒謬！
意識於眠熟、悶絕、正死位中必斷，不能遍一切時，此是世俗常識，爾等密宗法王學人等，可以自行證實之，云何作是妄想？不應正理。
若於性高潮中，住於一心不亂之明光境界，即是證悟聖境者，則應女人悟境高於男人──女弟子悟境高於男上師；亦應男弟子悟境永遠低於女上師。男上師若至性高潮時必致射精；精出已，高潮隨過，無復有最高潮之樂觸，則其明光境隨之不能久住；反之，女弟子則可保持樂境較久，則可久住明光境中，則其「悟境」應勝男上師。亦應男弟子之「悟境」永遠不及女上師，理必如是故，無二理故。如是「悟境」非平等法，非平等法即非佛法也。
假使爾等法王、活佛，真能淨持「三昧耶戒」，不貪異性弟子色身供養，專以「雙身禪定」之一心不亂而入明光境界，亦是意識境界，無關佛法也。假饒如是修得禪定，乃至能入四空定中明光之境，仍是凡夫外道，與解脫道及佛菩提道無涉故；何況爾等四大派古今一切法王、活佛，未見有能偶一敘述所證禪定境界淺如初禪者，何況無覺無觀三昧？何足論哉！
如是，密宗四大派古今法王之誤解佛法，極為普遍，古今如出一轍，咎在唯依密續，不依經典，是故久住邪謬見中，代代相傳而不能揀擇。顯宗不然，俱依經典；若有所悟，其法同一──所證之如來藏遍十二處、遍十八界，遍一切時而恆存不滅，乃至悶絕、正死、二無心定中，亦猶運行不輟。一切證悟者，悟後智慧容有深淺廣狹差別，所悟如來藏境界，等無差別，悉同一心，如是名「等」，方可謂為遍一切處、遍十八界、遍一切時之佛法也。
然而錯悟之人普天匝地，古今同調──悉墮意識境界，悉認意識住於一念不生之輕安光明境界為悟境，便自以為成賢入聖，嘲笑羅漢、辟支，輕他十地、法王，悉墮凡夫妄想情解之中，苦於不自知爾，如今更勞平實點破。古時蒙溪和尚亦復如是，錯以無念之覺知心為實相心，以一念不生為悟。
有僧問：「一念不生時如何？」蒙溪和尚便住一念不生之中，良久默然；彼僧亦以如是為悟，便禮拜；蒙溪問云：「你到底如何體會呢？」彼僧云：「我終究不敢無慚無愧。」此是意識心行，蒙溪不知自他俱錯，卻印證云：「你卻是信得過我。」與密宗四大派古今法王無少差異。
復有僧問：「向上本分事，應如何體究明白？」蒙溪云：「你為什麼不問我？」僧云：「請師父回答我的話。」蒙溪云：「你卻是問得不錯。」這僧早勘破他手腳，大笑而出；蒙溪卻故作大家，贊云：「只有這個師僧伶俐。」早是鷂過新羅，他卻還向中土放箭，今日不免平實檢點也！
頌曰：
上師弟子同聚會，目光才交已生貪；
更雲無上瑜伽密，妄說菩提是明光；
羞！羞！家中良人若見問，意旨如何頒？
一念不生蒙溪境，嬲亂道場禍學人；
古今活佛悉踵隨，至今猶未解無為。
十方賢聖現觀無上密，其中真如遍處不曾藏，
諸方佛母、活佛還有知者么？
喚來雙修無上密與鬼神賞！
