學說內容
“信號學說”是用來解釋細胞內的蛋白質如何各得其所、各就各位的。其基本內容是：各種蛋白質在細胞中的最終定位由多肽鏈本身所具有的特定胺基酸序列決定。這些特殊的胺基酸序列起著一種信號嚮導的作用，因此被稱為信號序列。在某種意義上，一個蛋白質分子上的信號序列相當於它特有的“分子郵政編碼”。如果一個蛋白質缺乏任何一種信號序列，則會留在其“默認”的位置——細胞液，如參與糖酵解和磷酸戊糖途徑的酶。
蛋白質分揀
注意有兩類指導蛋白質分揀的信號，需要將它們區分開來：
信號肽
其本質是一段在一級結構上連續的胺基酸序列，通常有15~60個胺基酸殘基，它們有的在N端，有的在C端，有的在多肽鏈的內部。還有的蛋白質不止一種信號序列。這類信號肽序列通常在蛋白質分揀完成以後被信號肽酶切除。引導蛋白質從細胞液進入內質網、高爾基體、胞外、細胞核、線粒體、葉綠體和過氧化物酶體的分揀信號屬於信號肽序列；
信號斑
存在於已摺疊的蛋白質中，是蛋白質在完成摺疊以後，在其表面形成的由來自不同區域的胺基酸序列組合在一起的三維分揀信號。例如，引導蛋白質定向運輸到溶酶體的就是信號斑，它是溶酶體酸性水解酶被高爾基體選擇性糖基化的標識。
