流傳版本
現存南宋末年建安環溪書院刊本、明代朱崇正附遺黃鍍刻本、明代書林熊鹹初刻本，以及多種抄本，另有日本、朝鮮刻本。1949年後有排印本出版。
作者簡介
楊士瀛，南宋醫學家。字登父，號仁齋。三山（一作懷安，今福建省福州市）人。世業醫。因惡庸醫誤人，遂苦讀醫籍，精研脈法。景定元年（1260）著《仁齋小兒方論》（一名《嬰兒指要》)，分門列症，論治析方。又本仲景、朱肱之書，撰《傷寒類書活人總括》七卷。據證定方，間附己見，編為歌括貫於各條之前。並以《脈訣》為本，參百家之言，撰成《醫學真經》一卷(1262年)，訂誤擷精，簡要明了，多有新見，為時人所重。其脈學著作尚有《醫脈真經》(或疑即《醫學真經》)一卷、《仁齋直指方脈論》、《察脈總括》，書佚失考。景定五年復撰《仁齋直指方》二十六卷，主述內科雜病證治。摘諸家效方，參家傳經驗，辨證施方，示人規矩。書名“直指”，取“明白易曉之謂直；發蹤以示之謂指”。後世合《傷寒類書活人總括》、《仁齋小兒方論》、《仁齋直指方》為《楊仁齋著作三種》。另撰《醫學真詮》二十卷，今佚。
書評、序言
《仁齋直指》序
余始撰《活人總括》、《嬰兒指要》，俗皆以沽名譏。及《脈書》一行，於是斂肅而相告曰：誠不易也。誰肯傾囊竭廩，以徇人哉？余曰：爾亦知有天乎？天將寓其濟人利物之心，故資我以心通意曉之學。既得於天，還以事之，是蓋造物初心之所期也。或者隙光自耀，藏諸己而不溥諸人，政恐玉毀櫝中，草木俱腐矣。雖然人有四百四病，或出於前三冊之外者，可不原證擇方，揭為直指之捷徑乎！明白易曉之謂直，發蹤以示之謂指。剖前哲未言之蘊，摘諸家已效之方，濟以家傳，參之《肘後》，使讀者心目瞭然，對病識證，因證得藥，猶繩墨誠陳之不可欺，庶幾仁意周流，相續，非深願歟？余嘗慨而作曰：天之予人以是物，必使之有以用是物，有是物而不能用，非惟拂天，抑亦自棄其天者也。並書此為同志勉。
景定甲子良月朔 三山楊士瀛登父序
內容簡介
楊氏在本書中剖析病源十分精細，而且在醫學理論上多有闡發創新，尤善於總結自己遣方用藥心得和運用家傳經驗。本書採摭既富，選擇亦精，內容頗切實際，對後世多有啟發。
1.精研覃思，闡發醫理
1.1氣為血帥，氣行血行 氣血同源，本書“血論”開篇即指出:“人具此陰陽，即有此血氣。氣，陽也；血，陰也。”楊氏以陰陽分彆氣血，表明氣血互相依存、相互為用的生理特點。“血榮氣衛論”篇中明確提出:“蓋氣者，血之帥也，氣行則血行，氣止則血止，氣溫則血滑，氣寒則血凝，氣有一息之不運，則血有一息之不行。”同時，卷五之“諸氣方論”篇進一步指出:“人以氣為主，一息不運則機緘窮，一毫不續則穹壤判”，“血脈之所以流行者，亦氣也”，從而明確了氣為血液循行的動力，對血起主導和統帥作用。
基於對氣血關係的認識，楊氏倡導“調氣為上，調血次之”。如“血榮氣衛論”篇中雲:“病出於血，調其氣猶可導達病原。於氣，區區調血何加焉？故人之一身，調氣為上，調血次之，是亦先陽後陰之意也。”在此原則下，楊氏亦主張因病制宜，“又不可不通其變也”。
1.2痰涎水飲，論治分明 隋唐以前，痰與飲無明顯區分，故丹波元堅曰:“蓋古方詳於飲而略於痰，後世詳於痰而略於飲，諸家唯楊仁齋書析二門，其他淄澠無別。”楊氏將痰涎、水飲與嘔吐三者共列為卷七，對後世區分痰與飲多有啟迪。
對於水飲所致諸疾，楊氏曰:“能以表里虛實訂之斯得矣。表有水者……青龍湯汗之而愈；里有水者……十棗湯下之而安。”並雲:“虛者以安腎圓為主，實者以青木香圓為主。”可見楊氏對水飲之區別表里虛實，方證明確。“痰涎方論”篇中指出:“療痰之法，理氣為上，和胃次之。”書中給出橘皮湯等14首治痰方劑，除常用化痰植物藥如南星、半夏、桔梗之外，還使用辰砂、白礬等礦物藥，為後世提供了寶貴經驗。
1.3重視脾胃，不落東垣 脾胃學說源於《內經》，成於金元。生活於南宋中晚期的楊士瀛，幾乎與當時深入闡發脾胃學說的金元四大家之一李東垣同時，也對有關脾胃理論進行了論述，並在其醫學實踐中加以發揮套用。本書開篇“五臟所主論”曰:“在天之濕，在地為土，在人為脾，惟脾則主濕。”“血榮氣衛論”篇雲:“人受谷氣於胃，胃為水谷之海，灌溉經絡，長養百骸，而五臟六腑皆取其氣。”“泄瀉方論”篇中又雲:“雖然脾胃合氣，以消水谷，水谷既分，安有所謂泄？”闡明了脾胃的生理功能，又強調了脾胃合氣的重要性。
楊氏認識到脾胃運化失常，五臟六腑失其所養，乃至疾病叢生，故“水飲方論”篇曰:“人惟脾土有虧，故平日所飲水漿不能傳化……往往因此而致病矣。”“中濕方論”篇中更明確:“況夫濕能傷脾，脾土一虧，百病根源發韌於此矣。”基於此，楊氏針對脾胃失調，詳辨其證，對證立方，據方施治。如“血榮氣衛論”篇中的和調胃氣法、“諸氣方論”篇中的益脾順氣法、“論崩中帶下”篇中的固衛厚脾法。
2.辨證問病，審證求因
2.1強調問診求因 楊氏尤重問診，針對當時一些患者“多秘所患以求診，以此驗醫者之能否”，以及醫者“亦不屑下問，孟浪一診，以自挾其所長”之時弊，特於卷一總論中設一專篇“問病論”加以強調。篇中以蘇軾為例，“至於有疾，必先盡告以所患而後診視，使醫者瞭然，知厥疾之所在”，同時告誡醫者:“問證以參脈，所謂醫者意也是爾。烏可舉一而廢一哉？”並在卷二首篇“得病有因”曰:“治病活法雖貴於辨受病之證，尤貴於問得病之因”，並連舉兩例說明問病的重要性。
2.2重視脈病逆順 楊氏重視脈診，“脈病逆順論”篇雲:“脈病逆順之不可不早辨也。蓋人有強弱盛衰之不等，而脈實應焉；脈有陰陽虛實之不同，而病實應焉。脈病形證相應而不相反，每萬舉而萬全，少有乖張，良工不能施其巧矣。”楊氏條陳縷析近百種症狀或疾病、五臟及奇經八脈的病變所出現的逆順變化，詳細論述脈與證複雜的臨床關係，尤其重視在疾病中脈象的變化，這對於疾病的診斷、治療及預後具有很強的指導意義。
2.3突出究源條析 “心疼方論”篇中楊氏指出:“紫之奪朱，相去一間耳，而毫釐疑似，實霄壤焉。”“水飲方論”篇又雲:“據病驗證，可不究其病之原乎？”楊氏重視深究病源，對病證則常採用分類條析的方式，既系統又明確，為因證施治奠定基礎。如“泄瀉方論”篇論述泄瀉諸證雲:“挾風者……傷暑者……傷濕者……冷則腸鳴肚冷而手足清；熱則煩燥肚熱而手足溫；冷熱不調者。”並在隨後再次強調:“治法當究其感受之源，然後為之固實。”楊氏之究源條析，分類詳辨，目的是“決之對病之劑”。
值得一提的是，楊氏在本書卷二十二之“發癌方論”篇中明確記載了癌症的特徵，較之《衛濟寶書》(該書將“癌、癝、疽、痼、癰”共稱“癰疽五發”)所載有本質區別，且楊氏對癌的病理形態特徵也有了初步的認識，對癌的病因亦首次提出了毒的概念，為後世苦寒解毒法治療癌症提供了理論依據。
3.廣擷名方，參以己效
3.1師法仲景，靈活化裁 楊氏十分推崇張仲景學說，深得其精髓，對臨床各科病證多以張仲景方藥為施治準則。據統計，書中所列46種內科病證中，37種運用了經方。楊氏在臨證時常靈活運用，不完全囿於張仲景原方。如《傷寒論》中的人參理中湯，楊氏根據其主治寒嘔腹痛、中寒霍亂的特點，以其治療因脾胃虛寒所致的多種病證，如“肺胃俱寒咳嗽”、“寒濕眩運”等，既宗張仲景原意，又能隨機通變。
同時，楊氏在利用經方時也常進行靈活化裁。如用於治療腎陽虛衰、水氣內停的玄武湯，楊氏加溫肺化飲斂氣之細辛、生乾薑、五味子等，以治年高氣弱久嗽之證，體現其尊經而又靈活的特點。
3.2廣擷名方，對證施用 楊氏善於學習前賢經驗，然並不限於張仲景一家。書中除收載經方外，還引用《千金方》、《聖惠方》等多種方書，其所論述的40多個病證，幾乎都選擇了前賢醫方並用諸臨床。如“諸風證治”篇中選用廬江劉寶的歸荊湯治療“風痓昏迷，吐沫抽掣，背脊強直、產後中痓”，因效驗良好，楊氏稱為“治痓良方”。
楊氏選用時方亦非照本宣科，如出自《太平惠民和劑局方》的四君子湯。楊氏在卷十六之“五疸證治”篇中，以之加黃芪、白芍藥、白扁豆，為加劑四君子湯，治療色疸。再如“薑茶治痢法”篇中，楊氏引用蘇東坡為名相文彥博治腹瀉之法，為後世李時珍讚賞並載入《本草綱目》中。可見，楊氏遣方用藥，只要對證、有效，不分經方、時方皆廣為採擷，且不拘泥原方，臨床為己所用。
3.3注重總結，參以己效 除經方、時方外，楊氏在書中以大量篇幅載錄自家臨證經驗。卷二證治提綱共53篇，絕大部分為其臨證用藥經驗。如“柴胡退熱不及黃芩”、“腎熱用五苓散”、“酒家有病勿用溫藥”等，僅從篇名即可看出是楊氏之經驗總結。
再以“治痢”為例，卷二有“治痢要訣”“簡徑治痢”“薑茶治痢法”“禁口痢”等篇。“治痢要訣”篇中楊氏曰:“痢出於積滯。積，物積也；滯，氣滯也”，雖然皆以通利，但要加以區分。對於物積“用巴豆、大黃輩”，而氣滯“用枳殼、桔梗、青皮、蓬術輩”，並告知“二者兼濟，必能收功。其間佐以黃連阿膠丸，效驗尤著”。“簡徑治痢”篇中，楊氏又雲“蜜最治痢”。對於禁口痢，楊氏認為:“下痢禁口不食……惟真料參苓白朮散加石菖蒲末，以道地粳米飲乘熱調下”或“用人參、茯苓、石蓮子肉入些菖蒲與之”，“胸次一開，自然思食”，足見楊氏注重經驗總結，考究臨床用藥。
影響評價
本書是我國現存較早的方論緊密結合的醫著之一，對後世有較大參考價值，並流傳至朝鮮、日本，產生了較大影響。
