上海醫工院醫藥股份有限公司（以下簡稱“股份公司”）系國務院國資委直屬的上海醫藥工業研究院（中國醫藥工業系統中科研實力最強的綜合性研究開發機構之一，以下稱“醫工院”）結合其整體發展戰略和規劃，將原醫工院下屬的上海現代醫藥銷售有限公司、上海醫南藥業有限公司、上海數圖醫藥科技有限公司（即國家發改委醫藥信息中心）、上海醫藥工業研究院亞東藥業公司、上海浦力膜製劑輔料科技合作公司和上海秀龍中藥有限公司，經過資產重組並經國務院國資委國資改革[2005]929號批覆，於2005年9月創立的股份制企業。股份公司現有員工400餘人，其中科技人員占33%以上，註冊資金達6240餘萬元。公司從1994年～2003年連續10年被認定為“上海市高新技術企業”，2005年又通過“上海市高新技術企業”複審。股份公司是集藥品生產（GMP）、藥品銷售(GSP)於一體並涵蓋內外貿、醫藥諮詢及製劑輔料生產和銷售的高新技術企業。公司與全國各地醫藥行業建立了緊密的商業合作聯盟，共享網路，優勢互補。
股份公司現有壬苯醇醚栓（愛侶栓）、甲硝唑栓、克霉唑栓、苦參鹼栓（婦炎栓）、硝酸咪康唑栓、雙唑泰栓、醋酸氯己啶栓、複方次沒食子酸鉍栓II（痔瘡栓）、吲哚美辛栓、對乙醯氨基酚栓（小兒退熱栓）等多種栓劑產品，成為上海地區唯一的栓劑專業生產廠家，在全國也享有極高的知名度。甲硝唑栓於2004年被評為上海市名優產品。除栓劑外，股份公司還專業生產消毒劑系列產品，有2％、20％戊二醛消毒劑、衛爾康消毒清潔劑、寶威典溶液等。股份公司大部分產品具有較高的創新性和先進性，尤以戊二醛消毒劑、愛侶栓等五種產品的技術水平達到國際先進或國內領先，獲得2000年度上海市級新產品證書。戊二醛消毒劑1999年獲國家重點新產品證書，並獲上海市高新技術成果轉化項目。“婦科消炎栓劑”項目1999年列入上海市火炬計畫。股份公司還生產用於治療風寒濕痹症劑型比較獨特的風寒砂熨劑等中藥產品，同時還生產對燒燙傷、創傷、手術切口、瘢痕及對硬皮病、澱粉樣變性等皮膚病有特效的積雪苷片（膚康片）、積雪苷霜（膚康霜），另外還經銷口服抗糖尿病藥物等產品。
股份公司依託醫工院的技術平台，先後開發了非注射給藥途徑的多肽類藥物及一系列具有自主智慧財產權、擁有高技術含量的產品，均已進入臨床試驗階段；治療婦科疾病的抗真菌新藥特康唑栓、防止術後粘連的膜劑新藥，不久即可面市。上述新藥項目多被評為2005年上海市高新技術成果轉化項目。
股份公司以新技術、高品質的產品服務於社會，旨在提高人類的健康和生活質量，實施以知識行銷為特點的行銷策略，強調學術領域的專業背景，及時提供完善的銷售服務。股份公司按現代企業制度進行管理並將一如既往地奉行“團結、敬業、創新、發展”的創業精神，開拓創新，不斷推出新藥，努力把公司建成具有鮮明專業特色的一流製藥企業，為中國的醫藥事業和人類健康做出新的貢獻。
