kozak序列

Kozak序列是位於真核生物mRNA5’端帽子結構後面的一段核酸序列，通常是ACCACCATGG，它可以與翻譯起始因子結合而介導含有5’帽子結構的mRNA翻譯起始。對應於原核生物的SD序列。

基本信息

• 中文名：kozak序列

• 位置：真核生物mRNA 5’端帽子結構後面
• 性質：一段核酸序列
• 通常是：GCCACCAUGG

簡介

人類起始密碼子周圍的序列

kozak序列： Kozak consensus sequence, Kozak consensus or Kozak sequence

存在於真核生物mRNA的一段序列，其在翻譯的起始中有重要作用。
核糖體能夠識別mRNA上的這段序列，並把它作為翻譯起始位點。注意這段序列並不是ribosomal binding site (RBS)核糖體結合位點，而是帽子結構。
真核生物基因中起始密碼子上下游的最佳序列為，-3位為嘌呤鹼基；+4位為G，起始密碼子AUG中的A處於+1位。A/GCCAUGG被稱為kozak序列或掃描序列。
KOZAK是一個女科學家，她研究過起始密碼子ATG周邊鹼基定點突變後對轉錄和翻譯所造成的影響，並總結出在真核生物中，起始密碼子兩端序列為：—— G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG時，轉錄和翻譯效率最高，特別是-3位的A對翻譯效率非常重要。該序列被後人稱為Kozak序列，並被套用於表達載體的構建中。

規則

所謂Kozak規則，即第一個ATG側翼序列的鹼基分布所滿足的統計規律，若將第一個ATG中的鹼基A，T，G分別標為1，2，3位，則Kozak規則可描述如下：
(1)第4位的偏好鹼基為G；
(2)ATG的5’端約15bp範圍的側翼序列內不含鹼基T；
(3)在-3，-6和-9位置，G是偏好鹼基；
(4)除-3，-6和-9位，在整個側翼序列區，C是偏好鹼基。
Kozak規則是基於已知數據的統計結果，不見得必須全部滿足，一般來說，滿足前兩項即可。
真核引物設計需在ATG前加上GCCACC
不論全長還是部分，在做真核表達時，一般都要帶上kozak序列，用部分cDNA時，還要加上ATG。多加一些上游序列對你有利，因為一些上游序列自帶KOZAK序列；或其他促進表達的序列。.有利於引物設計，因為從ATG開始設計引物，不是每個基因都可以的。引物擴增時頭幾個容易錯，在上游序序列就沒關係了。
加Kozark sequence(GCCACC),kozak sequence是用來增強真核基因的翻譯效率的。是最最佳化的ATG環境，避免ribosome出現leaky scan