foldit

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與其他BOINC項目一樣,Rosetta@home使用志願者的計算機中空閒的 除了疾病相關研究,Rosetta@home網路還是 應用程式,例如RosettaDock和人類蛋白質組摺疊項目。

簡介

遊戲畫面
Foldit就是這樣一個程式,它打算用人類的解謎思維來代替計算機算法中的一部分決策,把確定蛋白質的最佳三維形狀設計成一個遊戲,使得人們在遊戲過程中也能對生物科學做出貢獻。在這個遊戲中你可以不斷調整蛋白質的三維形狀,上傳最高分和所得的三維體,參與世界排名,並且還能與遊戲參與者進行 即時聊天

詳細介紹

Rosetta@home是一個基於 伯克利開放式網路計算平台(BOINC)的 分散式計算項目。該項目由 華盛頓大學貝克實驗室開發和維護,用於蛋白質結構預測、蛋白質-蛋白質對接和蛋白質設計的研究。截至 2009年12月9日,全球共有8.2萬台 計算機是這一項目的活躍志願者,平均執行速度達99萬億 FLOPS。Rosetta@Home還開發了一款 電子遊戲Foldit,目的是通過 眾包(crowdsourcing)途徑來實現上述研究目標。儘管這個項目很大程度上側重於進行提高 蛋白質組學方法的精確性和穩固性的 基礎研究,它也進行一些關於 愛滋病瘧疾癌症阿茲海默病以及其他疾病的 病理學的套用研究。
與其他BOINC項目一樣,Rosetta@home使用志願者的計算機中空閒的 進程資源來執行單獨的 單元計算。計算結果會被傳送到項目的中央 伺服器,經驗證後存入 資料庫中。這個項目是 跨平台的,支持多種不同的 軟體硬體環境。用戶可通過Rosetta@home的 螢幕保護程式觀看正在自己計算機上進行的蛋白質結構預測的情況。
除了疾病相關研究,Rosetta@home網路還是 結構生物信息學中新方法的一個測試框架。這些新方法經Rosetta@home龐大且多樣的用戶群體使用後,若運行效果穩定,將會被用於其他基於Rosetta的 應用程式,例如RosettaDock和人類蛋白質組摺疊項目。新方法測試中的兩個重要項目是蛋白質結構預測技術的關鍵測試(CASP)和互動作用預測的關鍵測試(CAPRI)。這兩項測試實驗分別用於評估蛋白質結構預測和蛋白質-蛋白質對接預測的最前沿技術。Rosetta@home穩居最重要的對接預測器之一,並且是現有最好的蛋白質 三級結構預測器之一。

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