對放大的認識第一人
當伽利略*發明望遠鏡的時候，他充分認識到透鏡的一定排列也可用於放大物象。在某種意義上了也是顯微鏡的發明者。他的朋友克卜勒*以及他的年青助手托里拆利*進一步發展了顯微鏡的光學理論。十七世紀中葉，顯微鏡學風行一時，許多第一流的研究家都競相研究它。馬里皮基稍稍領先一步，因而被稱為顯微鏡學之父。他是一個訓練有素的醫生，在因其父去世一度輟學之後，於1653年獲得波洛尼亞大學的醫學學位。接著他在義大利的各個大學教課，主要是在波洛尼亞。1691年他終於到達羅馬，任波普·伊諾辛十二世的私人醫生。馬耳皮基在顯微鏡學方面的工作，是從十七世紀五十年代研究青蛙的肺開始的。1660年他指出，血液導致了重要的結論。首先它說明了呼吸過程中一個關鍵的步驟，因為它使人容易理解：空氣能順利地從肺部彌散到血管中去，繼而血流把空氣輸往身體的各個部分。不久斯旺丹*檢測了血流裡面的一些成分，後來終於發現它們輸送著空氣的重要部分，而婁厄*則是第一個對這個過程的真實詳情進行揣測的。馬耳皮基對蝙蝠翼膜的觀察，使他發現了最纖細的血管，最後被命名為毛細血管（“毛髮似的”）。這些血管用肉眼看不見，而在顯微鏡中卻清晰可見。它們把最小的可見動脈與最小的可見靜脈聯結起來。由於這個發現，馬耳皮基就提供了三十年前哈維*提出血循環理論時所缺乏的一個關鍵因素，哈維由於剛在幾年前死去以致不能目擊這個勝利。大約也在這個時候，魯德貝克*對循環系統也增添了他最後的點滴貢獻。他駁斥了這種印象：膽汁有黃的和黑的兩種，這便消除了一個溯源於兩千年前希波克拉底*學派的錯誤信念。馬耳皮基繼續研究了生命的其他微細方面，例如，小雞的胚胎以及昆蟲。他有一卷書，專門研究蠶的內部器官，這是第一個論述一種無脊椎動物的專論。他發現了雞胚胎有鰓的結構痕跡，這證明它是從魚一類的生物演化來的，雖然他當時對自己所發現的東西並沒有認識得十分清楚。（馬耳皮基的一位同代人格雷夫*在其研究中，不知不覺地甚至追溯到胚胎以前的東西。）馬耳皮基研究了昆蟲的呼吸器，這是布滿身體並經由腹部微孔通向外界的許多分枝的微管。在植物莖部的結構中，他發現微管具有一種螺旋形的結構。
小孔成像
由於這些微管與昆蟲的微管相似，他誤認為它們也是用來呼吸的。他描述了葉子下表面的小孔（氣孔），但未能猜出這些小孔的功能，它們正是施行呼吸的。比他年輕的同代人格魯*對植物的顯微鏡觀察也饒有興趣。
