案發
經過
2009年11月23日，武裝人員將被劫持人員帶往南部棉蘭老島馬京達瑙省山區。菲律賓軍方派士兵前往事發地，維持治安，解救被劫持人員，避免暴力事件升級。
事件示意圖當地地區軍方士兵抵達出事地點發現36具屍體，搜救行動仍在繼續。當時還無法確定這起劫持事件的幕後主使。
遭劫持人員中包括馬京達瑙省布盧安鎮鎮長埃斯梅爾·曼古達達圖的妻子、助手和一些支持者。曼古達達圖說，妻子、姐姐和兄弟當天前往位於謝里夫阿瓜克的選舉委員會，為他競選下屆馬京達瑙省省長遞送選舉材料，但途中遭武裝人員劫持。按照曼古達達圖的說法，一同隨行的還有2名女律師和34名當地媒體記者，所有人失蹤了，手機聯繫不上。
按照當地警方說法，曼古達達圖家族與馬京達瑙省省長安達爾·安帕圖安家族有世仇，安帕圖安在當地擁有私人武裝。大約100名武裝人員參與劫持，大部分受僱於安帕圖安政府擔任警衛。他們在中午時分圍住了受害者乘坐的三輛舊汽車，並將人質帶到附近的山村。這群武裝人員頭目是安帕圖安的一個兒子。在馬京達瑙省等地區，政治對頭家族間衝突不斷，仇殺事件時有發生。菲律賓定於2010年5月舉行總統選舉，各地上周展開競選人登記工作。除參選總統外，各競選人還角逐1.8萬個全國和地方職位。 菲律賓選舉活動經常受暴力襲擊事件干擾。在反政府武裝勢力盤踞的南部地區，暴力衝突尤為嚴重。
死亡慘重
2009年11月24日，菲律賓軍方宣布屠殺事件死亡人數為46人。死者中包括至少23名記者，如果他們的身份確認無誤，這將是歷史上對記者最大規模的一次集體屠殺。 次日又發現11具屍體,死亡人數上升到57人。
據法新社報導，掌控馬京達瑙省司法權的總警司加塔盧納(Josefino Cataluna)透露，25日早上，警方在一些淺的墳墓中發現了6具屍體。 天黑前，在同一地區的的墳墓中，又發現了5具屍體。
有同時數十名當地政界人士和記者在菲律賓南部馬京達瑙省遭劫持。目前，有關被劫持人員的具體數字說法不一，最初有報導說40人被劫持，現在也有報導說有50人，或50多人被劫持。涉嫌參與劫持事件的是現任馬京達瑙省省長安達爾·安帕圖安的私人民兵部隊，這支部隊大約有100人，為首者是安帕圖安的兒子。
在事件現場，菲軍警用熱帶特有的芭蕉葉暫時遮蓋死者的屍體，場面慘不忍睹。隨著挖掘工作的繼續，這場大屠殺的內幕和背後主使逐漸浮現。妻子及多位親人在屠殺中遇害的布盧安鎮鎮長托托·曼古達達圖向媒體透露，有4位倖存者在屠殺過程中聽到了“帶頭大哥”小安達爾·安姆帕圖安親口宣稱，此次“行動”的命令是他父親馬省省長安達爾·安姆帕圖安和哥哥“棉蘭老穆斯林自治區”行政長官扎爾迪·安姆帕圖安下達的。 此間媒體認為，就憑敢在馬京達瑙出動百餘名武裝分子，以及屠殺和埋屍地點位於安達爾·安姆帕圖安的老家安姆帕圖安鎮這兩點，就足以判定屠殺真兇系安姆帕圖安家族。除了這個在馬省一手遮天的家族，還沒有第二股勢力有膽量如此作為。然而，與23日事件發生當天相比，菲軍警當局的立場已變得謹慎起來。菲律賓國家警察發言人埃斯皮納表示：“關於誰是嫌疑人的猜測甚囂塵上，但我們必須要找到證據，只有找到證據才能提出指控。”
各方反應
嫌疑人沉默
安達爾·安姆帕圖安及其家族繼續保持詭異的沉默，對所有的指控一律不予回應，小安達爾目前的行蹤也無人知曉。倒是被目擊者指控協助小安達爾組織綁架和屠殺的馬省首府沙里夫阿瓜克警長迪凱，已被菲警方宣布解職並接受調查，有可能最終成為替罪羊。
安達爾·安姆帕圖安與阿羅約是政治密友。安達爾近年來不僅在反對穆斯林分裂主義這一原則性問題上堅定支持中央政府，而且屢屢動用其影響力使馬省成為阿羅約和執政陣營的“鐵票倉”，2004年菲總統大選中阿羅約的對手在安姆帕圖安鎮得票為零，2007年議會選舉執政陣營的12名候選人在馬省贏得全勝，都是再鮮明不過的例子。
菲憲法明令禁止私人擁有武裝，而阿羅約於2006年發布了一紙政令，允許地方政府和警察發展“多樣化的力量”以打擊叛軍，並冠之以“民間志願組織”的名頭，這為安達爾合法擁有200人的私人武裝鋪平了道路。在此情況下，菲律賓各界已將緝拿真兇的壓力集中到了總統阿羅約身上。第一個站出來“提醒”阿羅約的恰恰是她所支持的2010年執政陣營總統候選人特奧多羅。他建議阿羅約不要受政治聯盟的局限，應毫不猶豫地嚴懲兇手。埃斯特拉達等其他總統候選人紛紛呼應特奧多羅，要求阿羅約秉公行事，給死難者一個交待。
阿羅約發令
2009年11月24日的內閣會議上連發三令：宣布馬京達瑙省及其附近兩個地區進入緊急狀態，設定臨時檢查站進行隨機搜查；由菲總統棉蘭老事務顧問杜雷扎領銜成立危機委員會，負責處理大屠殺事件；責令菲國家警察總監維爾羅沙立即飛赴馬京達瑙，在一線督查案件偵破和捉拿兇手的行動。阿羅約宣稱，政府將盡一切努力還死難者以公道，將兇手繩之以法。她意味深長地表示，在對事件的調查過程中，沒有人是“不可觸動的”。 主要反對黨“國民主義黨”發言人塔馬諾對此評論認為，阿羅約總統所宣布的緊急狀態還不夠嚴厲，應該“補鈣”，政府當前的第一要務是盡全力解除作案兇徒的武裝。總統任期已近尾聲的阿羅約願不願、敢不敢對盟友安達爾動真格，也許將成為決定“馬京達瑙大屠殺”事態發展的關鍵。
全國哀悼
阿羅約的發言人25日稱，阿羅約對發生在南部地區的屠殺人質事件非常生氣，“總統非常清楚哪些人負有責任，但不管他們是誰，都將接受正義的審判。”
阿羅約並宣布今天為全國哀悼日，哀悼在南部政治屠殺事件中的遇害者，她同時誓言全力追捕行兇者。
初步調查
2009年11月26日，阿羅約在一份聲明中說：“馬京達瑙省的殘忍屠殺構成一種滔天罪行。由於受害者有律師、新聞工作者和其他手無寸鐵的無辜平民使這更為殘忍。和許多人一樣，我感到憤怒，我和大家一起譴責這種惡行。” 她說，這次屠殺不是“敵對家族之間簡單的選舉仇殺，這是一種非人道殘暴行為，那是我們國家的禍害，犯罪分子一定逃脫不了司法制裁。”
2009年11月24日，阿羅約派她的棉蘭老島事務顧問杜萊扎去與安帕圖恩家族會面，以取得該家族承諾在調查中合作，而不是下令立即逮捕被指涉案的小安帕圖恩，引起各界抨擊。 總統府文官長埃爾迷塔昨晚呼籲屠殺案嫌疑犯自首。他說：“如果那些覺得他們已被認為是嫌疑犯的人能自首，並與執法機關合作，那肯定很有幫助。” 馬京達瑙省布盧安鎮副鎮長埃斯梅爾·曼古達達圖的夫人傑娜琳、兩個姐妹、律師、支持者以及新聞工作者50多人，本周一在前往另一個鎮的選舉委員會遞交競選馬京達瑙省省長的證書路上遇害，有些死者遭強姦和斬首，然後被掩埋。曼古達達圖說，他讓婦女替他提交候選人證書，因為在回教文化中是不會傷害婦女的。 他稱其妻子受到酷刑。他說：“我妻子的私處被劃了四次，然後他們向裡面開了一槍……他們戳她的雙眼，向她的雙乳開槍，砍斷她的雙腿，向她嘴裡開槍。我無法形容他們虐待她的方式。” 政府當天解僱和扣押3名涉案警官，包括被指當時在屠殺現場的馬京達瑙省一名警察局長。 菲律賓人權組織委員會昨天對屠殺慘案表示強烈憤慨，呼籲政府對此事進行“迅速干涉”，“迅速判決”，給受害者及時的公道。 人權組織主席萊拉利馬說，考慮到幕後黑手——安帕圖安家族的勢力強大，如果對此事的干涉不夠及時迅猛，更多的暴力血腥事件還會繼續發生。 她要求阿羅約展示其政治意願，不要庇護其政治盟友、被警方點名的布魯安市長小安帕圖安。 曾擔任選舉律師的萊拉利馬指出，阿羅約在2004年總統選舉中，因安帕圖安家族的協助而在馬京達瑙省大獲全勝，因此阿羅約欠了這個家族一筆債。 分析員指出，這起事件可能是明年5月全國和地方選舉前一連串政治仇殺的開端。2004年選舉有148人遇害。
當地學者稱，在菲律賓，殺死一個政敵的成本要比通過競選擊敗對方的少得多，因此與選舉相關的暴力事件屢見不鮮。摩洛專業青年領袖古托說：“只要有選舉，就有這類的暴力事件。棉蘭老的政治，就是權力的擁有。公職被視為個人、門閥的囊中物，也是與生俱來的權利。他們將不惜流血而爭得你死我活。”
菲律賓警方昨天指總統阿羅約的政治盟友，為南部馬京達瑙省發生政治屠殺事件的主嫌，不過尚未發出逮捕令，因為目前仍在蒐集有關安帕圖恩家族涉案的證據。儘管如此，執政黨昨晚宣布開除涉案主謀父子三人的黨籍，而菲媒體昨天譴責政府對屠殺案反應緩慢，在事發3天后仍未逮捕行兇者。 總統府顧問克羅迪奧發表聲明說，父子三人都被逐出執政聯盟。“全國執行委員會今晚召開緊急會議，並一致通過黨主席吉爾柏所提出的動議，把省長老安帕圖恩、拿督溫塞鎮長小安沓爾·安帕圖恩及扎爾迪·安帕圖恩開除黨籍。”
當局昨天再發現6具屍體，使這場屠殺死亡人數增至52人；警方在長滿野草的山頂附近一處淺坑挖掘出這些屍體、一輛電視台車子和貨車。 這相信是菲律賓歷來最殘酷的屠殺案，也是全球歷來最多記者被殺的單一慘案。 警方發言人埃斯比那說：“根據初步報告，遇害者當時被以拿督溫塞鎮長安帕圖恩為首的武裝男子攔截。” 拿督溫塞鎮長小安沓爾·安帕圖恩是執政黨力量——自由菲人並肩黨的黨員，也是馬京達瑙省極有權勢的省長老安帕圖恩的兒子。軍方之前指涉案的武裝男子為安帕圖恩家族所雇用的保鏢。
詢及警方是否準備傳喚安帕圖恩父子，埃斯比那說：“我們仍在蒐集針對與事件有關人士的證據。” 他反駁有關阿羅約優待安帕圖恩家族的指控。他說，警方目前正在努力蒐集針對被指於案發時在現場的安帕圖恩涉案的證據。 軍方已解散由馬京達瑙地方官員控制的一支有200人的準軍事部隊。調查員說，他們將調查一些準軍事部隊成員參與屠殺事件的指控。
2009年11月26日，菲法務部正式向桑托斯將軍市地區法院提出小安帕圖安犯有多項謀殺罪的刑事指控。在首席國家檢察官霍文西托˙蘇諾的主持下，檢察人員對小安帕圖安進行了訊問。
菲法務部已成立一個由14名成員組成的法律團，負責處理馬京達瑙屠殺案。法律團分為2組，一組負責問訊工作和先期調查，另一組負責與屠殺案相關的案件。
馬京達瑙屠殺案的主要嫌疑人小安帕圖安26日在其兄長的陪同下前往當局接受調查，但拒絕認罪。
談判
當地時間26日上午11時30分左右，小安達爾·安帕圖安在哥哥的陪同下在馬京達瑙省首府沙立夫阿瓜克市向菲總統棉蘭老事務顧問赫蘇斯·杜熱查自首。他隨後被直升機送往桑托斯將軍城機場，在那裡轉機前往首都馬尼拉接受調查。
杜熱查在事件發生後代表政府與安帕圖安家族談判，希望說服他們交出小安達爾·安帕圖安。 菲律賓內政部長羅納爾多·普諾曾警告，安帕圖安家族必須在26日中午前交人，否則部隊可能會採取行動。 馬京達瑙省布盧安市副市長埃斯梅爾·曼古達達圖的家人和支持者23日乘車前往沙立夫阿瓜克，向選舉委員會遞交曼古達達圖競選下屆省長的材料，車隊中有媒體記者隨行。大約100名武裝人員在安帕圖安市截擊車隊，將他們綁架並實施屠殺。菲軍方眼下已發現57具屍體。這起事件仍在調查之中。
菲律賓新聞部長兼總統府新聞發言人塞爾赫·雷蒙德25日說，總統格洛麗亞·馬卡帕加爾·阿羅約已要求安帕圖安家族不要妨礙調查。
2009年11月27日，菲律賓警方說，聯合國兒童基金會一名工作人員在發生人質事件的菲律賓南部馬京達瑙省被槍殺，後證實身亡。
聯合國兒童基金會駐菲律賓發言人在聲明中稱，這名被擊中的工作人員是菲律賓當地人。事件發生時，這名工作人員並非在執行公務，相信襲擊是針對個人的。
進一步調查
調查和處理
11月28日，菲律賓法務部長阿格尼絲·德瓦納蒂拉27日對南部馬京達瑙省綁架屠殺案首要嫌疑人正式以謀殺罪提出指控。 她說，部分嫌疑人受良心譴責，站出來指控省長之子小安達爾·安帕圖安為主謀。調查發現，這一案件中，警察、士兵和私人武裝以侮辱性方式槍殺女性。這些女受害者是否遭強姦還有待調查。
她當天早些時候對當地電視台說，根據證人供詞，馬京達瑙省達都溫賽市市長小安達爾·安帕圖安指揮這場屠殺並親手開槍殺人。 “（他們得到的）命令是殺掉所有人．．．．．．這看上去是有預謀的行動，”一名目擊者說，“他（小安達爾·安帕圖安）就是下命令的人。”另一名目擊者看見小安達爾·安帕圖安親手開槍。 德瓦納蒂拉說，證人供認，參與屠殺的人中包括士兵、警察。 她說，包括小安達爾·安帕圖安父親在內的另外8名安帕圖安家族成員也被列為嫌疑人。他們現在雖未遭拘捕，但菲律賓移民部門已經接到命令防止他們出逃。
小安達爾·安帕圖安26日向當局主動歸案，同意配合調查但拒絕承認與這一案件有關。他眼下關押在首都馬尼拉國家調查局的看守所內。 他26日在看守所接受媒體短暫採訪時說，事發時自己在辦公，這起事件是菲律賓反政府武裝摩洛伊斯蘭解放陣線（摩伊）的一名首領溫布拉·卡托所策劃。“指責別人很容易，但必須要有證據。我是無辜的。案犯是溫布拉·卡托的摩洛伊斯蘭解放陣線的人，他們是恐怖分子。”
11月30日，大約有1000名包括記者在內的示威人群在馬尼拉街頭遊行，抗議菲律賓南部11月23日發生的暴力流血事件，該事件造成57名平民死亡，其中至少30人是記者。
摩伊發言人也否認其組織與這一“野蠻行徑”有關，因為他們根本不在事發地一帶活動。
菲律賓政府27日繼續就這一事件處理當地政府和軍警官員，撤銷兩名軍方高官職務。軍方發言人羅密歐·布勞納說，軍方當天解除一名少將師長和一名上校旅長職務。不過，他指出，兩人遭撤併非因為直接參與屠殺案。 布勞納說，政府收到投訴，當地軍隊拒絕為曼谷達達圖親屬的車隊提供保護。另外，那名旅長據說是安帕圖安家族的支持者。
屠殺事件發生後，多名當地警方高官已遭解職和調查，其中包括馬京達瑙省警察局局長阿武薩納·馬吉德。安帕圖安市警局所有警員作為嫌疑人正受到調查。 菲律賓總統格洛麗亞·馬卡帕加爾·阿羅約的發言人當天說，阿羅約已經授命內政部長羅納爾多·普諾全權處理對當地軍政官員的調查，有權將馬京達瑙省和棉蘭老穆斯林自治區任何政府、警察和軍隊官員暫時停職。 曼谷達達圖27日在軍隊護送下前往首府向選舉委員會遞交競選材料。他的車隊由50多輛車組成，沿著與23日同樣的路線到達沙里夫阿瓜克。 “只有死亡能阻止我參加競選，”他對支持者說。
證人現身
11月30日，菲律賓法務部長德法那德拉昨天表示，一名新的證人現身，並聲稱南部馬京達瑙省安帕圖恩家族的其他成員幫助策劃大屠殺事件。她說：“我們有一名證人可以證實，在這（大屠殺）發生之前，他在安帕圖恩家族成員下達指示（要如何執行大屠殺）的場所。”
她指出，新證人加強另外至少20名證人對安帕圖恩家族的指控。被指涉案者除了已經自首的馬京達瑙省拿督溫塞鎮長小安達爾·安帕圖恩外，還包括擔任回教棉蘭老自治區總督的扎爾迪·安帕圖恩和擔任馬京達瑙省長的家族長老，老安達爾·安帕圖恩。移民局已經把他們列入監視名單中，防止他們潛逃出境。德法那德拉說，小安帕圖恩直接指揮這次大屠殺案，暗示將對其他人提出更多控告。她說，提出控告的程式才剛剛開始。
來自南部三個省份支持安帕圖恩家族的至少20名地方官員，昨天聚集在扎爾迪·安帕圖恩的別墅，以示對安帕圖恩家族的支持，和抗議政府要將擔任地方官員的安帕圖恩家族成員停職的計畫。有大約900人，包括兒童則在別墅外面集會，並高呼“安帕圖恩萬歲”。集會者持著的標語牌上寫著“不要把安帕圖恩撤職”、“安帕圖恩無罪”等。在接近中午時分，以地方官員為首，來自南蘭老省的一個由60多輛車組成的車隊加入了集會。
扎爾迪·安帕圖恩昨天發表一份聲明，誓言要還大屠殺案遇害者公道，但堅稱他的家族無辜。他指控他們受到政治迫害，並指馬尼拉政府甚至阻止他的政治盟友向他伸出援手。他說：“安帕圖恩家族受到圍攻。這是非法的迫害，迫害我們的人為了挽救他們下挫的形象，正試圖利用這個事件。”不過他沒有指明迫害他們的人是誰。他表示，安帕圖恩家族聘請至少40名律師，為小安帕圖恩辯護。律師團同時正在準備挑戰總統府要將他們停職的計畫。
交火
菲律賓多名政府官員7日說，涉嫌製造政治屠殺案的安帕圖安家族武裝人員和菲律賓安全部隊6日晚發生交火。這是政府對馬京達瑙省實施軍管以來，當地發生的首起衝突。
確認嫌疑人
截止2009年12月9日，菲律賓警方已確認有161人直接參與了馬京達瑙省政治屠殺案。 當天，菲律賓國家警察總長赫蘇斯·貝爾索薩在向全國進行直播的新聞發布會上說，這161人大多是屠殺事件的首要犯罪嫌疑人、馬京達瑙省達都溫賽市市長小安達爾·安帕圖安的私人安全部隊成員，另有一些是當地的準軍事部隊人員，還有警察和軍人。
貝爾索薩說，這仍為不完全統計數字，有報導說一些嫌疑人已加入在馬京達瑙省進行反叛活動的組織，菲律賓警方將提議對提供逮捕犯罪嫌疑人情報的人給予獎勵。
2009年11月23日，馬京達瑙省發生多名當地政界人士和記者遭劫持和屠殺的惡性暴力事件，迄今公布的遇害人數達57人。 菲律賓當局指控馬京達瑙省省長安達爾·安帕圖安的兒子、達都溫賽市市長小安達爾·安帕圖安是政治屠殺案的主要犯罪嫌疑人。檢方於2009年12月月1日正式起訴小安帕圖安犯有25項謀殺罪。
2009年12月9日，菲律賓人權委員會主席德利馬透露，被指涉及大屠殺案的安帕圖恩家族，在南部馬京達瑙省統治10年期間，至少殺死另外200人，並把他們埋葬在集體墓穴中。
這個官方委員會的領導人昨天在菲律賓外國記者會的早餐會上說：“我們正在尋找至少200具屍體。他們是同個家族和私人軍隊的受害者。”德利馬說，2009年7月，監察署轉發了一封匿名信函，“投訴安帕圖恩家族的暴行”。 政府檢察官昨天正式控告老安帕圖恩等7名安帕圖恩家族成員和另外17人叛亂罪，指他們試圖公開發動叛亂，對菲律賓共和國進行武裝活動。
初步審判
首次開庭
受審的嫌疑犯2010年1月5日首次開庭審判，涉案安帕圖安家族的繼承人小安帕安拒絕認罪。
原告稱，他們有目擊證人證明小安帕圖安帶領100多名荷槍實彈的武裝人員與警察，在安檢站截住了一個競選車隊。武裝分子用槍口逼使人質走到山頂一個空地，然後在那裡將人質開槍射殺，最後把屍體集體掩埋。小安帕圖安的父親，即該家族族長，同時也是前省政府官員，以及幾位親屬也被指控參與了此次屠殺案，但是他們還未遭到起訴。他們同樣否認涉入了此次人質屠殺案。菲律賓警方指控小安帕圖安及其100名槍手涉嫌屠殺其競選馬京達瑙省省長對手的親屬，以及大量記者。檢方對小安帕圖安施加了25項殺人罪名。
後續
2010年1月12日，菲律賓法務部門對馬京達瑙省政治屠殺案的主嫌兇小安帕圖安的審判繼續進行。第一名證人稱，他親眼看到，當被害人跪下求饒時，被告及其家人親手開槍將人質打死。 安帕圖安家族所在市的副市長桑基（Rasul Sangki）在馬尼拉警察總部內的法庭供證說，當小安帕圖安（Andal Ampatuan Jr.1953—）把他叫到一個公路檢查站後，他親眼目睹了整個屠殺的悲慘經過。當地警察就是在這裡設立檢查站，叫停了被害人質所乘坐的車隊。桑基說：“我非常害怕，因此不得不聽從擺布。如果我不跟他走，他就會遷怒於我的全家。在我們的省，沒有人不怕他的。” 他說，安帕圖安家族的打手拿槍逼人質趴下，然後搶走了他們身上的錢、手機與照相機。然後，人質被帶到了幾公里外一個山頂的空地上。 他說，他聽到小安帕圖安通過無線電說，“爸爸，他們已經在這裡。”另一頭回答說：“你知道應該怎么辦。” 隨著槍聲響過，人質開始紛紛求饒，女人質則高聲尖叫。然而，小安帕圖安絲毫沒有手軟，他親自拿槍把其政敵布盧安鎮副鎮長曼古達達圖的妻子與兩個姐姐打死。他說，即使人質紛紛倒下死了，但槍手還是朝屍體掃射，確保無人生還。不過，小安帕圖安的律師在為他抗辯時，指責桑基為何沒有馬上報警。桑基回答說：“我對司法沒有信心。軍警都是他們（安帕圖安家族）的人。”他也說，小安帕圖安還警告他說：“告訴你的人就當作沒有看見或聽見。”法庭將在下星期續審。小安帕圖恩面對41項謀殺控狀，在死亡證書的簽發工作完成後，他面對的謀殺罪預料會增加至57項。
逮捕
2010年3月25日，菲律賓法院發出逮捕令，指示警方加緊追捕涉及去年57人大屠殺案的196個嫌犯，遭逮捕令對付的也包括安帕圖安家族族長老安帕圖安。
這起發生在去年11月的大屠殺是菲律賓歷來最嚴重的政治暴力事件。一名候選人的7個家人、30個記者和20個平民被殺害。菲律賓軍警至今扣留了55名嫌犯，仍有142個嫌犯在逃。
刑事調查總警司蒙特內格羅說，在逃的嫌犯包括18名帕圖安家族成員和100多個槍手。 他說：“我們將繼續追捕他們和搜查可能被用來殺害那57人的武器。我們也在蒐集更多證據，務必證明他們乾下這起大屠殺。”
涉嫌策劃大屠殺的安帕圖安家族族長老安帕圖安、他的三個兒子和一個兄弟，將在馬尼拉的奎松市區域法庭面對審訊。這5人已被警方拘留。
最高法院基於安全考量，決定不讓棉蘭老島的法庭審理此案，而交由奎松市區域法庭審理。
老安帕圖安的第四個兒子小安帕圖安已在1月13日受審。小安帕圖安是這起案件的主謀。 蒙特內格羅說，針對那些已被拘留嫌犯的逮捕令已生效。
老安帕圖安目前被關押在棉蘭老島達沃市一家保衛森嚴的軍事醫院，他的兄弟和三個兒子則被拘留在另一個南部市鎮的警隊基地。
進一步審判
撤銷指控
2010年4月19日，菲撤銷政治屠殺案嫌犯控狀。
菲律賓政府周六撤銷對政治屠殺案兩名嫌兇的控狀，屠殺案受害者家屬誓言將提出抗訴。 代表一些家屬的私人檢察官羅克說：“我們將在法庭反對該命令。我們會提出抗訴。” 他也說：“他們（家屬）感到憤怒，感覺被政府出賣了，並相信這是政治妥協。” 法務部長阿格拉周六下令撤銷對安帕圖恩家族的兩個成員、扎爾迪和阿克馬德的控狀，原因是兩人提供了證據和證人，能夠證明去年11月的屠殺事件期間，他們並不在現場。該屠殺事件導致57人喪命，當中包括多個記者。兇手的目的是為了阻止敵對的曼古達達圖家族，派人在5月10日的全國大選中，與小安帕圖恩爭奪馬京達瑙省省長之位。
安帕圖恩家族一直是菲律賓總統阿羅約的盟友，屠殺事件發生後，阿羅約在國際輿論的壓力下，與該家族劃清界限。 美國人權觀察組織也抨擊菲律賓政府撤銷對兩名嫌兇的控狀的做法。該組織的亞洲地區副總監皮爾遜說：“阿羅約承諾為屠殺事件受害者討回公道，只不過是說說而已。”
拒絕認罪
2010年4月21日，涉及菲律賓南部馬京達瑙省政治大屠殺案的9名警察和兩名軍人在法庭上表示不認罪。 當法庭把謀殺控狀一一念出時，所有被告都不認罪。另外還有4名要求撤銷控狀的警察並未受到法庭提審，但其中一名法官下令他們到了下周才提出抗訴。 上周末，法務部代部長阿格拉下令撤銷對安帕圖恩家族兩個成員扎爾迪和阿克馬德涉嫌參與屠殺案的控狀。阿格拉以他們提供了不在場的證據為理由，撤銷了他們的控狀。 由於安帕圖恩家族向來是阿羅約總統的政治盟友，而菲律賓即將在三個星期後舉行大選，此舉讓人質疑當局的決定是否基於政治考量。受害者家屬更是針對總統阿羅約和她的部下大發雷霆。 阿格拉聲稱，撤銷扎爾迪和阿克馬德的控狀是他個人的決定。但其中一名受害者的遺孀雷布蘭多表示，這不可能是在阿羅約不知情的情況下而做出的決定。其中一些受害者家屬的代表律師羅格昨天告訴記者，他已向法庭提出申請，將審訊展延至7月。因為到時候阿羅約應該已經下台，而新政府也將委任一名新的法務部長。羅格說：”這是否意味著我們無法在阿羅約執政期間得到正義？這答案是肯定的。”他還說，他的一些當事人已要求法庭將更換所有負責此案件的檢察官。
恢復指控
2010年5月6日，菲律賓法務部長阿格拉推翻了自己在三個星期前的決定，恢復對涉及政治屠殺案的安帕圖安家族兩名嫌兇的控狀。但他否認是因為輿論壓力才這么做。 阿格拉告訴法新社，之所以決定維持對扎爾迪和阿克馬德的指控，是因為出現了新的證據顯示兩人確實參與了馬京達瑙省大屠殺的陰謀。 他說：“新證人、新證據及新的論點，這一切都讓我重新考慮原本撤銷控狀的決定。” 阿格拉透露，現在找到了新的證人可以證明這兩名嫌兇確實陰謀策劃這場令人震驚的政治屠殺案。
由於安帕圖安家族向來是阿羅約總統的政治盟友，而菲律賓即將舉行大選，因此當阿格拉在上月17日以證據不足為理由，撤銷對兩名嫌兇的控狀時，許多人都質疑有關決定是否基於政治考量。
菲律賓檢察官過後籲請政府重新考慮，人權及媒體組織更是炮轟這個決定，屠殺案受害者家屬也誓言提出抗訴。
阿格拉堅稱並非基於廣大的輿論壓力而改變初衷，並表示司法官員改變主意是很正常的事。他說：“所有法庭都有重新考慮判決的選擇和權利，包括最高法院、抗訴庭和初庭法官。”
他說，兩名擔任安帕圖安族私人武裝軍人的新證人證實，兩名嫌兇曾出席策劃屠殺案陰謀的會議。
他表示，如果早知道這個訊息，之前就絕不會撤銷對他們的指控。
政治後果
受害方選舉獲勝
2010年5月17日，菲律賓馬京達瑙省政治屠殺事件主謀、安帕圖安家族在省長選舉中落敗，失去了對該省的控制，當選省長的是在屠殺事件中失去妻子和兩個姐妹的曼古達達圖，曼古達達圖的親人是在為他遞交競選省長檔案的路上遭到殺害的，同時遇害的還有另外54人。
曼古達達圖說：“過程是痛苦的，但我很高興，因為我達成了變革的夢想……惡勢力已被擊敗，我們擁有了自由。”
馬京達瑙省的安全局勢仍然受到關注。當局擔心他可能會尋仇，導致局勢緊張。曼古達達圖則堅持自己不會對安帕圖安家族尋仇。
加害者家族開始外遷
安全人員對他的說法持審慎態度。安帕圖安家族男丁已開始把家人遷出馬京達瑙省。一位匿名的情報官員認為：這些回教徒家族以血腥復仇出名，這次應該也不例外。曼古達達圖家族開始對付安帕圖安家族是遲早的事。
嫌犯死亡
2015年7月17日，菲律賓馬京達瑙大屠殺案主要嫌犯之一、前馬京達瑙省省長安達爾·安帕圖安(老安帕圖安)17日深夜病死，針對他的多項犯罪指控終將不了了之。
代表遇害者曼古達達圖家族的律師桑托斯說，儘管老安帕圖安死了，針對其他被告的犯罪指控仍會繼續審理。代表多名遇害者家屬的律師哈里·羅格則表示，如果在老安帕圖安死前，法院就做出判決，對家人和被告本人都會更好。他強調，會繼續堅持不懈地代表遇難者家人討取公道。
馬京達瑙大屠殺案審判至今沒有進展，已引發菲國社會強烈質疑。菲國民間團體和遇害者家屬此前一直譴責該案審理進展過於緩慢，呼籲菲政府加快行動，終結有罪不罰的文化。律師哈里·羅格之前曾建議，該案審判應效仿二戰後對德國納粹戰犯的紐倫堡審判，集中審判安帕圖安家族及參與策劃和殺戮的30多名兇嫌。
另據菲國媒體報導，2015年5月，馬京達瑙大屠殺案嫌犯之一、老安帕圖安的兒子薩吉德·安帕圖安獲得保釋，許多涉案嫌犯至今在逃。人權組織和遇害者家屬指控，陸續有證人遭到殺害或受到威脅。
