個人經歷
主要學習工作經歷:浙江大學本科生、北京大學研究生、加拿大滑鐵盧大學博士生。曾任美國陸軍傳染病醫學研究院(USAMRIID)研究員,美國Stratagene公司研究員,美國加州大學洛杉磯分校生物晶片研究中心主任,美國國立衛生研究院(NIH)資深研究員、生物晶片中心主任。現任浙江大學求是特聘教授、博士生導師、傳染病診治國家重點實驗室副主任;國家973計畫首席科學家。兼任美國J. Craig Venter研究院傳染病學系項目負責人(PI),生物晶片研究室主任。《中華臨床感染病雜誌》編輯委員會委員、國際《Microbial Ecology》雜誌編輯委員會委員、國際人類微生物組學聯盟(IHMC)委員、NIH人類微生物組學計畫(HMP)菌株工作組成員;Nature Biotechnology, Nucleic Acids Research,BMC Genomics, BioTechniques等著名期刊審稿人。中國科學院上海生命科學研究院生物化學和細胞生物學研究所兼職教授、中國科學院微生物研究所客座教授、武漢大學客座教授。
研究方向
傳染病學、感染基因組學及幹細胞誘導分化。
研究內容
1)宿主-微生物相互作用研究,在研課題包括美國國防部基金項目子課題“宿主對Burkholderia感染的免疫應答反應研究”,國家973項目子課題“腸道微生態宿主感染基因組學研究”,傳染病診治國家重點實驗室自主課題“陰道微生態菌群多樣性變化與細菌性陰道病發病機制研究”;2)病毒性腫瘤的流行病學和致病機制研究,在研課題包括傳染病診治國家重點實驗室自主課題“HPV與直腸癌發病機理研究”,十一五傳染病重大專項課題“B肝(肝癌)新型免疫療法及藥物靶位點的研究”;3)傳染病病原體診斷新技術研究,在研課題有美國NIH生物防禦(Biodefense)專項課題“基於納米材料和DNA晶片技術的高通量多種病菌診斷方法”,十一五傳染病重大專項課題“傳染病檢測技術研究-傳染病病原體診斷和組合檢測技術”和“呼吸系統和中樞神經系統病毒DNA微陣列的研製”;4)幹細胞定向分化的機制研究。
主要成果
最早開展病毒全基因組晶片的研製,率先把DNA晶片技術套用於病毒基因調控和致病機理的研究。發明了獨特的cDNA探針標記、RNA線性擴增、LCM組織樣本固定等技術,從而極大地促進了晶片技術在生物和醫學各領域的套用。最早在NIH主持研發了高通量人和鼠類全基因組DNA晶片,並用全基因組晶片技術在LPS誘導的DC細胞分化過程中篩選出一個重要的基因,新的免疫負性調控因子Trim30 alpha,揭示了炎症抑制方面一個新的免疫機制。這一發現對人們深入了解免疫系統的調控網路具有重要意義,研究成果發表在世界頂尖雜誌《自然:免疫學》。首次結合全基因組cDNA晶片技術和代謝組學技術揭示脂肪組織代謝的動力學變化,初步闡明異常基因表達和脂肪因子失調與導致胰島素抗拒的相互關係。通過對細菌Burkholderia感染後宿主應答反應的研究,首次發現了十多個特異性生物標記物。在NIH基金資助下,主持研發了基於DNA晶片技術的高通量多種病菌診斷方法和多種靶點檢測技術。最近在國際免疫學專業期刊《免疫學雜誌》發表的研究中,採用DNA晶片技術篩選出新的轉錄調控因子Dec2,並揭示了Th2細胞分化的調控網路,有助於了解Th2細胞介導的過敏性疾病的發病機制,還為過敏性疾病的治療提供了一個新的藥物靶點。曾獲美國NRC科學研究獎和多項NIH特殊貢獻獎。近幾年來在國際SCI雜誌發表多篇學術論文,其中包括Nature Biotechnology, Nature Immunology, Nature Methods, Journal of Immunology, Nucleic Acids Research, Diabetologia,Endocrinology等權威學術期刊,獲得過多項科學研究基金,包括NIH生物防禦重大專項經費、美國國防部基金和國家973項目支持(項目首席科學家)等。所發表的論文影響因子累計100多點,他引次數200以上。獲科研經費總額超過600萬美元和1500萬人民幣。
科研項目
1)Brain molecular anatomy project
美國NIH研究項目(共同主持人)75萬美元,2000-2003
2)New technology development for functional genomics studies
美國NIH研究項目(主持人)100萬美元, 2001-2005
3)Development of diagnostic chips for rapid detection of Category A List pathogens
美國NIH/FDA生物防禦專項(主持人)50萬美元, 2002-2005
4)Nanoparticle based BCA assay for sensitive detection of category A and B pathogens
美國NIH/FDA生物防禦專項(共同主持人)40萬美元, 2005-2009
5)Quorom sensing in pathogenic Burkholderia: host responses to bacterial infections
美國國防部基金項目(共同主持人)總經費500萬美元, 2005-2010
6)腸道微生態與感染的基礎研究
國家973項目(首席科學家和第一子課題負責人)總經費3760萬人民幣,2007-2011
7)B肝(肝癌)新型免疫療法及藥物靶位點的研究
十一五傳染病重大專項(子課題負責人)100萬人民幣,2008-2011
8)傳染病檢測技術研究-傳染病病原體診斷和組合檢測技術
十一五傳染病重大專項(子課題負責人)200萬人民幣,2008-2011