開帝殿相傳廟中的神農帝神像是村民在流水裡撿到一塊木頭，然後拿到大陸請凋刻師傅凋刻而成的。而凋刻師凋刻時，神農帝曾經現身，所以神像凋刻完成後，竟然和民間裡傳說里的神農帝模樣完全相同。更神奇的是當村民去請回神像時，凋刻師不知是刻意還是無意，竟然將十餘座相同的神農像放一起。幸好這位村民事前受到神明的指示，才能正確無誤地指出，其中那尊臉上人中處正冒汗的，才是利用村民撿獲的木頭所凋成的神農帝像。如果說開帝殿是澎湖最華麗的廟宇之一，那么相信也沒有人會反對。廟宇所有的建築布置金碧輝煌，雕刻細緻，每個小細節都可以看出建築師傅的精細功夫，雕樑畫棟，令人嘆為觀止。
開帝殿所供奉的神農帝，在過去醫學不發達的年代裡，前來求助神明配方治病的信徒絡繹不絕。開帝殿里有一座年代非常久遠的香爐（據說是宋代玉香爐），每當降雨前璧爐就會凝聚水珠，曾多次被竊，但最後都能完好如初的找回來。現在這座香爐已被廟方妥善保管，一般人想要親眼目睹這寶物的機會就少很多囉！
