1937年12月南京淪陷前夕,武漢成為全國抗日運動的中心。為了統一領導南方各省黨的工作,發展長江流域和南方各省的抗日運動,中共中央決定在武漢設立中共中央長江局。同時組成中共代表團,負責與國民黨的聯繫和談判,繼續推動國民黨的改革和進步。不久,兩個組織合併,對內稱長江局,對外稱中共代表團。
1937年12月23日,中共中央長江局在武漢正式成立,由王明、周恩來、項英、秦邦憲、葉劍英、董必武、林伯渠等7人組成,王明任書記,博古負責組織工作,周恩來負責統戰和軍事工作,董必武負責民運工作,葉劍英負責軍事工作,鄧穎超負責婦女工作,李克農任秘書長。長江局負責管轄雲南、貴州、四川、湖北、湖南、河南、江西、安徽、江蘇、浙江、福建、廣東、廣西等省,並領導中共中央東南分局和新四軍的工作。
由於長江局及所屬組織的努力工作,國共兩黨高層談判連續舉行,抗日民族統一戰線不斷發展,南方各省黨的組織迅速恢復建立,新四軍改編及東進抗日任務圓滿完成,以武漢為中心的湖北抗日救亡民眾運動掀起高潮。在不到一年的時間裡,長江局不僅為這一時期抗戰新局面的開創作出了歷史性貢獻,而且為以後黨在國統區的工作奠定了紮實基礎,對後來國統區愛國民主運動的發展產生了深遠影響。
1938年10月,中共擴大的六屆六中全會決定撤銷長江局。