基本特徵
反轉錄病毒的最基本特徵是在生命過程活動中,有一個從RNA到DNA的逆轉錄過程,即病毒在逆轉錄酶的作用下,以病毒RNA為模板,合成互補的負鏈DNA後,形成RNA-DNA中間體。中間體的RNA被RNA酶水解,進而在DNA聚合酶的作用下,由DNA複製成雙鏈DNA。
特點
1)病毒為球形,衣殼20面體立體對稱,有包膜;
2)基因組為兩個相同+ssRNA;
3)含有逆轉錄酶和整合酶;
4)複製通過DNA中間體,並與宿主細胞的染色體整合;
5)具有gag、pol、env編碼基因;
6)成熟病毒以芽生方式釋放。
LTR的分析
LTR對病毒DNA整合進宿主細胞基因組和控制病毒RNA合成均有重要作用。同時,它具有真核生物基因表達時所需的基本功能,例如,啟動作用、起始作用和轉錄物的多聚腺嘌呤加尾作用等。LTR的DNA序列已經測定,不同種的病毒的LTR長度不同,變動範圍在250~1,400 bp之間,LTR的長度變化主要取決於U3的長度,它的變動範圍在170—1,260bp之間。
在LTR的兩端各有一個反向重複序列。所有LTR的兩端都是以TG...CA和AC…GT為標誌。在未整合進宿主細胞基因組中的LTR的兩端還各有兩個鹼基對,即AATG…CATT和TTAC…GTAA,這兩個鹼基對在LTR整合進宿主細胞基因組時會丟失。LTR在U3區內有同"TATAA"框十分相似的序列。TATAA框是真核生物中使用RNA多聚酶Ⅱ的轉錄單位所特有的序列。真核類基因轉錄時大部分用RNA多聚酶Ⅱ,TATAA框就是這類酶的接觸位點。所以LTR很可能利用宿主細胞的RNA多聚酶Ⅱ來啟動基因的轉錄。LTR的R—U5分界線上游20bp處還有AAG TAAA序列,這是真核生物都有的腺嘌呤核苷酸聚合作用的信號。
在U5區內,距離R區10~25 bp處有TTGT或類似序列,這是病毒RNA合成的終止信號,這對終止病毒RNA的合成可能起重要作用。在U3—R分界線處還常有一個反向重複序列,這對終止病毒RNA的合成可能也有重要作用。除此之外,左邊LTR的U3區啟動子負責啟動前病毒的轉錄,右邊LTR的U3區啟動子有時能啟動位於前病毒插入位點下游的宿主DNA序列的轉錄,不過這種情況很少發生。LTR中還有增強子序列,可以增強病毒RNA的轉錄能力,或對前病毒DNA兩側的宿主DNA的轉錄活性起調控作用。
LTR序列比較分析的結果表明,同種病毒株的LTR核苷酸序列相同或相似,不同種病毒的LTR序列可以各不相同。但各種病毒株的LTR都有同源的核苷酸序列。主要如上面提到的那些序列,這對完成病毒的生命周期是不可缺少的。當病毒DNA整合在生殖細胞的基因組中時,就成為宿主的“內源前病毒”而傳給子代。一般情況下,內源前病毒是不表達的,除非有其他因子的作用才會被激活而表達,如感染了另一種病毒等。
常見種類
亞科名 —— 代表病毒
(1)RNA腫瘤病毒亞科
(禽類)rous肉瘤病毒(RSV),rous 相關病毒(RAV),其他雞肉瘤病毒,禽白血病病毒(ALV)
(哺乳類)鼠肉瘤病毒(MSV),鼠白血病毒(MLV),鼠內源性病毒,豬肉瘤病毒,牛白血病病毒,豬白血病病毒,鼠乳腺瘤病毒
(靈長類)靈長類肉瘤病毒,猴白血病病毒,狒C型腫瘤病毒,mason-pfizer猴病毒(MPMV),langur病毒
(人)人類嗜T細胞病毒Ⅰ型,Ⅱ型,Ⅴ型(HTLV-Ⅰ,Ⅱ,Ⅴ)
(2)慢病毒亞科
人類免疫缺陷病毒(HIV),綿羊脫髓鞘性腦白質炎病毒(visnavirus),綿羊肺腺瘤病毒(maedi virus),馬傳染性貧血病毒(EIAV)
(3)泡沫病毒亞科
靈長類泡沫病毒,貓,牛,人泡沫病毒(human foamy virus)
此外,注意:SARS冠狀病毒不是逆轉錄病毒 ,是RNA病毒。
PC遊戲
遊戲信息
遊戲名稱:逆轉錄病毒
英文名稱:Retrovirus
遊戲類型:即時戰略類(RTS)遊戲
遊戲製作:Cadenza Interactive
遊戲發行:Cadenza Interactive
遊戲平台:PC
發售時間:2013年2月1日
遊戲介紹
Retrovirus是一款360度視覺的第一人稱射擊遊戲。遊戲模擬了電腦系統中的環境,玩家扮演反病毒程式,去消滅各種各樣的病毒。玩家可以自定義自己的程式,就跟定義其他遊戲的人物角色一樣,可以選擇力量、速度和武器精通等等。除了單機戰役,還可以雙人合作玩同樣的戰役,另外也有對戰模式。