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賽岐作業區由上岐頭至賽岐客運碼頭;下白石作業區由賽下小港至岐後鼻。陸域面積共2.74萬平方米。水域自賽江糖廠起至白馬門的白馬角止,全長30公里,自然岸線長60公里,面積5508萬平方米。
賽岐是閩東水陸交通樞紐,閩東物資的主要集散地,歷史悠久。
唐末開港,設稅課司;明設巡檢司,開辦鹽運;清設鹽務局。
鴉片戰爭後,福州、三都闢為商港,賽岐港隨之漸趨興盛,民國時期,海運業發展,與上海、溫州、福州、台灣、香港等地均通航,國內外商人多在賽岐開行設鋪。
民國27年(1938年)設海關。但港口長期無建設,多利用自然岸坡或在江中作業。
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中華人民共和國成立後,一直是福建沿海五個主要港口之一,1961年,建水泥框架客運碼頭。
隨著經濟發展,港口建設漸趨完善,特別是改革開放後,1982年闢為外貿物資起運點,1984年闢為國輪外貿物資裝卸點,1985年正式通航香港。1989年底,全港有碼頭泊位19個,5000噸輪可乘潮抵下白石,500噸輪可達賽岐。擁有倉庫4120平方米,堆場2.98萬平方米,各種裝卸機械14台、運輸車30輛、港作船8艘。