壇城，源於古代印度的密宗修法活動，那時的人們為了防止"魔眾"的入侵，修密法時就在修法場地修築起一個圓形或者方形的土壇，在土壇上修法，邀請過去、現在、未來諸佛親臨作證，並在土壇上繪出他們的圖像，由此構成了後世壇城的基本框架，演變出多種形式和類別。壇城作為象徵宇宙世界結構的本源，是變化多樣的本尊神及眷屬眾神聚居處的模型縮影。
藥師壇城是藥師佛文化的信仰中心和藥師法門以及“藥師禪”的修持地，是具有勝境加持力的“道場”。
《藥師經》中有八大菩薩，八佛本尊，十二藥叉大將，八萬眷屬，壇城具足啊，威德具足。世尊是這個壇城的教化之主，藥師琉璃光如來是本尊之主，十二藥叉大將是攝護之主，八大菩薩是衛護之主，這八萬四千藥叉是執行之主。藥師法門的守護者，就是十二藥叉大將，及其八萬四千眷屬。若想在藥師法門上欲得世間的方便威德和健康自在，一定要和這十二藥叉大將和其八萬四千眷屬結一個很好的因緣。
藥師佛心咒：得雅他嗡貝堪則貝堪則瑪哈貝堪則惹雜薩目嘎喋梭哈！
《日光菩薩陀羅尼》ná mó bó tuó qú nà mí南無勃陀瞿那迷 ná mó dá mó mò hē dī南無達摩莫訶低 ná mó sēng qié duō yè ní南無僧伽多夜泥 dǐ li bù bì sà duō dá nà mó底哩部畢薩咄檐納摩。
《月光菩薩陀羅尼》shēn dī dì tú sū zhà深低帝屠蘇吒 ā ruò mì dì wū dū zhà阿若蜜帝烏都吒 shēn qí zhà深耆吒 bō lài dì波賴帝 yē mí ruò zhà wū dū zhà耶彌若吒烏都吒 jū luó dì zhà qí mó zhà拘羅帝吒耆摩吒 suō pó hē沙婆訶。
修藥師法門就能得到藥師佛加持：經過修煉可以與藥師佛的信息交流感通，因為藥師佛發了十二大願，有十二藥叉大將在十二時辰中值日，正合人體十二經脈，通過念誦“咒”觀想久而久之就能產生一種光。這是練精化氣，練氣化光的一種方法，也是藥師琉璃光佛法的特色，經過修煉都可以達到用光來治療與預防疾病的目的。
藥師十二神將：
1.宮毗羅，又作金毗羅，意譯為極畏。身呈黃色，手持寶杵，以彌勒菩薩為本地。
2.伐折羅，又作跋折羅、和耆羅，意譯為金剛。身呈白色，手持寶劍，以大勢至菩薩為本地。
3.迷企羅，又作彌佉羅，意譯為執嚴。身呈黃色，手持寶棒或獨鈷，以阿彌陀佛為本地。
4.安底羅，又作頞你羅、安捺羅、安陀羅，意譯為執星。身呈綠色，手持寶錘或寶珠，以觀音菩薩為本地。
5.頞爾羅，又作末爾羅、摩尼羅，意譯為執風。身呈紅色，手持寶叉或矢，以摩利支菩薩為本地。
6.珊底羅，又作娑你羅、素藍羅，意譯為居處。身呈煙色，手持寶劍或螺貝，以虛空藏菩薩為本地。
7.因達羅，又作因陀羅，意譯為執力。身呈紅色，手持寶棍或鉾，以地藏菩薩為本地。
8.波夷羅，又作婆耶羅，意譯為執飲。身呈紅色，手持寶錘或弓矢，以文殊菩薩為本地。
9.摩虎羅，又作薄呼羅、摩休羅，意譯為執言。身呈白色，手持寶斧，以藥師佛為本地。
10.真達羅，又作真持羅，意譯為執想。身呈黃色，手持罥索或寶棒，以普賢菩薩為本地。
11.招度羅，又作朱杜羅、照頭羅，意譯為執動。身呈青色，手持寶錘，以金剛手菩薩為本地。
12.毗羯羅，又作毗伽羅，意譯為圓作。身呈紅色，手持寶輪或三鈷，以釋迦牟尼佛為本地。
