藥師經有五個譯本：1、東晉帛屍梨密多羅（317-322）所譯《佛說灌頂拔除過罪生死得度經》，為《大灌頂神咒經》之第十二卷，此本也被稱為《藥師琉璃光經》或俗稱的《灌頂經》。2.、南北朝劉宋孝武帝大明元年（457），慧簡於秣陵鹿野寺譯《藥師琉璃光經》，已佚。3、隋煬帝大業十一年（615）時，於東都洛水南上林園翻經館，由達摩笈多(即法行)重譯之《佛說藥師如來本願經》。4、唐永徽元年（650），玄奘於長安大慈恩寺所譯之《藥師琉璃光如來本願功德經》。5、唐中宗神龍三年（707）義淨於佛光寺所譯之《藥師琉璃光七佛本願功德經》。
五版本中較流行的是玄奘法師的譯本，但玄奘譯本中只翻譯了藥師琉璃光如來佛的那部分，沒有譯到其他六佛本願功德。簡潔而較易流布普及，從這方面來講有積極作用。但對於立志現世濟世度生之修行者，更應廣大普及七佛法門，蓋因七佛各有殊勝不共之微妙大願功德，與娑婆眾生之根器各各相契爾，故應廣宣七佛而非一佛。若欲專念一佛或二三佛，量自根器而取即可。義淨法師的譯本為藥師經的最完整譯本，其中廣宣七佛微妙大願功德，堪為娑婆眾生之無上法寶矣。以下為義淨法師所譯藥師經全文。
藥師琉璃光七佛本願功德經（卷上）
大唐三藏沙門義淨奉召譯
如是我聞。一時薄伽梵游化諸國至廣嚴城，在樂音樹下，與大比丘眾八千人俱，菩薩摩訶薩三萬六千，其名曰：曼殊室利菩薩、觀自在菩薩、慈氏菩薩、善現菩薩、大慧菩薩、明慧菩薩、山峰菩薩、辯峰菩薩、持妙高峰菩薩、不空超越菩薩、微妙音菩薩、常思惟菩薩、執金剛菩薩，如是等諸大菩薩而為上首。及諸國王大臣，婆羅門、居士，天龍八部，人非人等無量大眾，恭敬圍繞，而為說法。國中後善，文義巧妙，純一圓滿，清淨鮮白梵行之相，示教利喜，皆令具足，微妙行願，趣大菩提。
爾時曼殊室利法王子菩薩摩訶薩，承佛威神從座而起，偏袒右肩，右膝著地，合掌恭敬而白佛言：世尊，今有無量人天大眾，為聽法故，皆已雲集。唯佛世尊，從初發意乃至於今，所有無量塵沙數劫諸佛剎土，無不知見。願為我等及未來世像法眾生，慈悲演說諸佛名號本願功德、國土莊嚴、善巧方便差別之相，令諸聞者業障消除，乃至菩提得不退轉。
爾時世尊贊曼殊室利菩薩言：善哉善哉！曼殊室利，汝以大悲愍念無量業障有情，種種疾病憂悲苦惱得安樂故，勸請我說諸佛名號本願功德、國土莊嚴，此由如來威神之力令發斯問。汝今諦聽，善思惟之，當為汝說。曼殊室利言：唯願為說，我等樂聞。
佛告曼殊室利：東方去此過四殑伽河沙佛土，有世界名曰無勝，佛號善名稱吉祥王如來應正等覺、明行圓滿、善逝、世間解、無上丈夫、調御士、天人師、佛、世尊，有無量億眾不退菩薩之所圍繞，安住七寶勝妙莊嚴獅子之座，現在說法。曼殊室利，彼佛國土清淨嚴飾，縱廣正等百千逾繕那，以贍部金而為其地，平正柔軟，氣如天香。無諸惡趣及女人名，亦無瓦礫沙石棘刺。寶樹行列，華果滋繁。多有浴池，皆以金銀真珠雜寶而為砌飾。曼殊室利，彼國菩薩皆於七寶蓮花化生。是故淨信善男子、善女人，皆當願生彼佛國土。曼殊室利，彼佛如來應正等覺，從初發心行菩薩道時發八大願，云何為八？
第一大願：願我來世得無上菩提時，若有眾生為諸病苦逼切其身，熱病諸瘧、蠱道魘魅、起屍鬼等之所惱害。若能至心稱我名者，由是力故，所有病苦悉皆消滅，乃至證得無上菩提。
第二大願：願我來世得菩提時，若有眾生盲聾喑啞，白癩癲狂，眾病所困。若能至心稱我名者，由是力故諸根具足，眾病消滅，乃至菩提。
第三大願：願我來世得菩提時，若有眾生為貪瞋痴之所纏逼，造無間罪及諸惡行，誹謗正法，不修眾善，當墮地獄受諸苦痛。若能至心稱我名者，由是力故，令無間罪及諸業障悉皆消滅，無有眾生墮惡趣者，常受人天殊勝安樂，乃至菩提。
第四大願：願我來世得菩提時，若有眾生少乏衣食、瓔珞、臥具、財貨、珍寶、香花、伎樂，若能至心稱我名者，由是力故，所乏資生皆得充足，乃至菩提。
第五大願：願我來世得菩提時，若有眾生或被枷鎖系縛其身，及以鞭撻，受諸苦惱，若能至心稱我名者，由是力故，所有苦惱皆得解脫，乃至菩提。
第六大願：願我來世得菩提時，若有眾生於險難處，為諸惡獸熊羆獅子、虎豹豺狼、蚖蛇蝮蠍之所侵惱，欲斷其命，發聲大叫，受大苦時，若能至心稱我名者，由是力故，所有恐怖皆得解脫，諸惡獸等悉起慈心，常得安樂，乃至菩提。
第七大願：願我來世得菩提時，若有眾生斗諍言訟，因生憂惱，若能至心稱我名者，由是力故，斗訟解散慈心相向，乃至菩提。
第八大願：願我來世得菩提時，若有眾生入於江海遭大惡風，吹其船舫，無有洲渚而作歸依，極生憂怖，若能至心稱我名者，由是力故皆得隨心，至安隱處，受諸快樂，乃至菩提。
曼殊室利，是謂彼佛如來應正等覺行菩薩道時所發八種微妙大願。又彼世尊從初發心，常以定力成就眾生，供養諸佛，嚴淨佛土，菩薩眷屬悉皆圓滿。此之福德不可思議。一切聲聞及諸獨覺，縱經多劫，說不能盡，唯除如來補處菩薩。曼殊室利，若有淨信男子女人，若王、大臣、長者、居士，心希福德，斷諸煩惱，稱彼佛名，讀斯經典，於彼如來至心尊重，恭敬供養，所有一切罪惡業障及諸病苦，悉皆消滅。諸有願求無不隨意，得不退轉乃至菩提。
複次曼殊室利，東方去此過五殑伽河沙佛土，有世界名曰妙寶，佛號寶月智嚴光音自在王如來應正等覺，有無量億菩薩圍繞，現在說法，皆演大乘微妙深義。曼殊室利，彼佛如來從初發心行菩薩道時發八大願，云何為八？
第一大願：願我來世得菩提時，若有眾生為營農業及商賈事，令心擾亂，廢修菩提殊勝善法，於生死中不能出離，各各備受無邊苦惱。若能至心稱我名者，由是力故，衣服飲食資生之具，金銀珍寶，隨願充足。所有善根皆得增長，亦不捨離菩提之心。諸惡道苦鹹蒙解脫，乃至菩提。
第二大願：願我來世得菩提時，於十方界所有眾生若為寒熱饑渴逼身，受大苦惱，若能至心稱我名者，由是力故先世罪業悉皆消滅，舍諸苦惱，受人天樂，乃至菩提。
第三大願：願我來世得菩提時，於十方界若有女人貪淫煩惱常覆其心，相續有娠，深可厭惡，臨當產時受大苦惱，若我名字暫經其耳，或復稱念，由是力故眾苦皆除。舍此身已常為男子，乃至菩提。
第四大願：願我來世得菩提時，若有眾生或與父母兄弟姊妹妻子眷屬，及諸親友行險難處，為賊所侵受諸苦惱，暫聞我名，或復稱念，由是力故解脫眾難，乃至菩提。
第五大願：願我來世得菩提時，若有眾生行於暗夜作諸事業，被惡鬼神之所惱亂，極生憂苦，暫聞我名或復稱念，由是力故，從暗遇明。諸惡鬼神起慈悲意，乃至菩提。
第六大願：願我來世得菩提時，若有眾生行鄙惡事不信三寶，智慧鮮少不修善法，根力覺道念定總持皆不修習，若能至心稱我名者，由是力故智慧漸增，三十七品悉皆修學，深信三寶乃至菩提。
第七大願：願我來世得菩提時，若有眾生意樂鄙劣，於二乘道修行而住，棄背無上勝妙菩提。若能至心稱我名者，舍二乘見，於無上覺得不退轉，乃至菩提。
第八大願：願我來世得菩提時，若有眾生見劫將盡，火欲起時生大憂怖，苦惱悲泣，由彼前身惡業力故受斯眾苦，無所歸依，若能至心稱我名者，所有憂苦悉皆消滅，受清涼樂。從此命終，於我佛土蓮花化生，常修善法，乃至菩提。
曼殊室利，是為彼佛如來應正等覺行菩薩道時所發八種微妙大願。又彼如來所居佛土，廣博嚴淨，地平如掌，天妙香樹而為行列。天華遍覆，天樂常鳴。天妙鈴鐸，隨處懸布。天寶莊嚴獅子之座，天寶砌飾諸妙浴池。其地柔軟無諸瓦礫，亦無女人及諸煩惱，皆是不退諸菩薩眾，蓮花化生。若起念時，飲食衣服及諸資具隨意現前，是故名為妙寶世界。
曼殊室利，若有淨信男子女人、國王王子、大臣輔相、中宮婇女，晝夜六時殷重至心，恭敬供養彼佛世尊及稱名號，並造形像，香花、音樂、燒香、末香、塗香而為奉獻，清淨嚴潔，於七日中，持八戒齋，於諸眾生起慈悲意，願生彼土，彼佛世尊及諸菩薩護念是人，一切罪業悉皆消滅，無上菩提得不退轉，於貪恚痴漸得微薄，無諸病苦增益壽命，隨有希求悉皆如意，斗諍怨家鹹生歡喜，舍此身已往彼剎土蓮花化生。當生之時，念定總持悉皆明了。曼殊室利，如是當知彼佛名號無量功德，若得聞者，所願皆成。
複次曼殊室利，東方去此過六殑伽河沙佛土，有世界名曰圓滿香積，佛號金色寶光妙行成就如來應正等覺，有無量億萬菩薩圍繞，現在說法。曼殊室利，彼佛如來從初發心行菩薩道時發四大願，云何為四？
第一大願：願我來世得菩提時，若有眾生造作種種屠害之業，斷諸生命，由斯惡業受地獄苦。設得為人，短壽多病，或遭水火刀毒所傷，當受死苦，若聞我名至心稱念，由是力故所有惡業悉皆消滅，無病長壽，不遭橫死，乃至菩提。
第二大願：願我來世得菩提時，若有眾生作諸惡業盜他財物，當墮惡趣。設得為人，生貧窮家乏少衣食，常受諸苦。若聞我名至心稱念，由是力故，所有惡業悉皆消滅，衣服飲食無所乏少，乃至菩提。
第三大願：願我來世得菩提時，若有眾生更相陵慢共為讎隙。若聞我名，至心稱念，由是力故各起慈心猶如父母，乃至菩提。
第四大願：願我來世得菩提時，若有眾生貪慾瞋恚愚痴所纏，若出家在家男女七眾，毀犯如來所制學處，造諸惡業，當墮地獄受諸苦報。若聞我名至心稱念，由是力故，所有惡業悉皆消滅，斷諸煩惱，敬奉屍羅。於身語心，善能防護。永不退轉，乃至菩提。
曼殊室利，是為彼佛如來應正等覺行菩薩道時所發四種微妙大願。曼殊室利，又彼如來所居佛土廣博嚴淨，地平如掌，皆以寶成。常有香氣，如妙栴檀。復以香樹而為行列，天妙珠瓔摩尼等寶，處處垂下。多有浴池，天寶嚴飾，香水盈滿，眾德皆具。於其四邊，懸妙繒彩。街衢八道，隨處莊嚴。所有眾生無諸煩惱及憂悲苦，亦無女人，多是住地諸菩薩眾。勝妙音樂，不鼓自鳴，演說大乘微妙深法。若有眾生聞此音者，得不退轉無上菩提。
曼殊室利，彼佛如來由昔願力善巧方便成就佛土，圓滿莊嚴。坐菩提座，作如是念：於未來世，若有眾生為貪瞋痴之所纏繞，眾病所逼，怨家得便，或時橫死，復由惡業墮地獄中，受大劇苦。彼佛見此苦惱眾生，為除業障，說此神咒，令彼受持。於現世中得大利益，遠離眾苦，住菩提故。即說咒曰：
達侄拖悉弟悉弟蘇悉弟莫折你木叉你目帝皮目帝
安末麗皮末麗忙揭例司蘭若揭皮和拉達娜節皮薩婆厄拖
婆達你波拉摩厄拖娑達你末奈細莫訶末奈細厄步帝
厄制步帝皮多婆葉蘇巴你巴拉韓摩屈式巴拉韓摩
柱使帝薩婆厄剃術阿波拉式帝薩巴達拉阿波拉底些帝
折度沙色致博陀巨知婆使帝那摩薩婆達拖節多喃娑訶
爾時世尊說此大力大明咒時，眾中所有諸大菩薩、四大天王、釋梵王等贊言：善哉善哉！大悲世尊，能說如是過去如來大力神咒，為欲饒益無量眾生，竭煩惱海，登涅槃岸，除去疾病，所願皆滿。
佛告大眾：若有淨信男子女人、國王王子，及以大臣輔相、中宮婇女，情希福德，於此神咒起敬信心，若讀若誦，若為他人演說其義，於諸含識起大悲心，晝夜六時香華燈燭，殷重供養，清淨澡浴，持八戒齋，至誠念誦。所有極重無邊業障悉皆消滅，於現身中離諸煩惱，命欲終時諸佛護念，即於彼國蓮花化生。
複次曼殊室利，東方去此過七殑伽河沙佛土有世界名曰無憂，佛號無憂最勝吉祥如來應正等覺，今現在彼為眾說法。又彼如來所居佛土廣博嚴淨，地平如掌，皆以寶成，細滑柔軟，常有香氣。無憂苦聲，離諸煩惱，亦無惡趣及女人名。處處皆有金砌浴池，香水盈滿。寶樹行列，華果滋茂。勝妙音樂，不鼓自鳴。譬如西方極樂世界無量壽國功德莊嚴。曼殊室利，彼佛世尊行菩薩道時發四大願，云何為四？
第一大願：願我來世得菩提時，若有眾生常為憂苦之所纏逼，若聞我名至心稱念，由是力故，所有憂悲及諸苦惱悉皆消滅，長壽安隱，乃至菩提。
第二大願：願我來世得菩提時，若有眾生造諸惡業，生在無間黑暗之處，大地獄中，受諸苦惱。由彼前身聞我名字，我於爾時身出光明，照受苦者。由是力故，彼見光時所有業障悉皆消滅，解脫眾苦，生人天中，隨意受樂，乃至菩提。
第三大願：願我來世得菩提時，若有眾生造諸惡業殺盜邪淫，於其現身受刀杖苦，當墮惡趣。設得人身，短壽多病，生貧賤家，衣服飲食悉皆乏少，常受寒熱饑渴等苦，身無光色，所感眷屬皆不賢良。若聞我名至心稱念，由是力故隨所願求，飲食衣服悉皆充足，如彼諸天身光可愛，得善眷屬，乃至菩提。
第四大願：願我來世得菩提時，若有眾生常為藥叉諸惡鬼神之所嬈亂，奪其精氣，受諸苦惱。若聞我名至心稱念，由是力故，諸藥叉等悉皆退散，各起慈心，解脫眾苦，乃至菩提。
曼殊室利，是為彼佛如來應正等覺所發四種微妙大願。若有眾生聞彼佛名，晝夜六時稱名禮敬，至心供養，於眾生處起慈悲心，業障消滅，解脫憂苦，無病長壽，得宿命智，於彼佛土蓮花化生，常為諸天之所衛護。曼殊室利，稱彼佛名，能生如是無量福業。而彼佛土願力莊嚴殊勝功德，聲聞、獨覺所不能知，唯除如來應正等覺。
複次曼殊室利，東方去此過八殑伽河沙佛土，有世界名曰法幢，佛號法海雷音如來應正等覺，今現說法。曼殊室利，彼佛世尊所居國土清淨無穢，其地平正，玻璃所成。常有光明，香氣芬馥。以帝青寶而為城郭，有八街道，砌以金銀。樓閣殿堂，飛甍戶牖，欄楯莊飾，皆眾寶成。天香寶樹隨處行列，於其枝上掛以天繒，復有寶鈴處處垂下，微風吹動出妙音聲，演暢無常、苦、空、無我，眾生聞者舍離欲纏，習氣漸除，證甚深定。天妙香花，繽紛而下。於其四面有八浴池，底布金沙，香水彌滿。曼殊室利，於彼佛土無諸惡趣，亦無女人。蓮花化生，無復煩惱。彼佛如來行菩薩道時發四大願，云何為四？
第一大願：願我來世得菩提時，若有眾生生邪見家，於佛法僧不生淨信，遠離無上菩提之心，若聞我名至心稱念，由是力故，無明邪慧日夜消除。於三寶所，深生正信，不復退轉，乃至菩提。
第二大願：願我來世得菩提時，若有眾生生在邊地，由近惡友造眾罪業不修善品，三寶名字曾不經耳，命終之後墮三惡趣，彼諸眾生暫聞我名者，由是力故，業障消除，遇善知識。不墮惡趣，乃至菩提。
第三大願：願我來世得菩提時，若有眾生衣服飲食臥具醫藥，資生所須悉皆乏少。由此因緣生大憂苦，為求覓故，造眾惡業，若聞我名至心稱念，由是力故，有所乏少隨念皆得，乃至菩提。
第四大願：願我來世得菩提時，若有眾生由先惡業共相鬥諍，作不饒益，弓箭刀仗互為傷損，若聞我名至心稱念，由是力故，各起慈心不相傷害。不善之念尚自不生，況於前人慾斷其命。常行喜舍，乃至菩提。
曼殊室利，是為彼佛如來應正等覺行菩薩道時所發四種微妙大願。若有淨信男子女人，聞彼佛名至心禮敬，殷勤供養，受持念誦，業障消滅，得不退轉菩提之心，具宿命智。所生之處常得見佛，無病長壽。命終之後生彼國中，衣服飲食資生之具隨念皆至，無所乏少。曼殊室利，彼佛世尊具足如是無量功德，是故眾生常當憶念，勿令忘失。
複次曼殊室利，東方去此過九殑伽河沙佛土有世界名曰善住寶海，佛號法海勝慧遊戲神通如來應正等覺，現在說法。曼殊室利，彼佛如來行菩薩道時發四大願，云何為四？
第一大願：願我來世得菩提時，若有眾生造眾惡業，種植耕耘，損諸生命。或復興易，欺誑他人。戰陣兵戈，常為殺害。若聞我名至心稱念，由是力故，資生之具不假營求，隨心滿足。常修眾善，乃至菩提。
第二大願：願我來世得菩提時，若有眾生造十惡業殺生等罪，由此因緣，當墮地獄。若聞我名至心稱念，於十善道，皆得成就，不墮惡趣，乃至菩提。
第三大願：願我來世得菩提時，若有眾生不得自在，系屬於他，或被禁系杻械枷鎖，鞭杖苦楚乃至極刑。若聞我名至心稱念，由是力故，所有厄難皆得解脫，乃至菩提。
第四大願：願我來世得菩提時，若有眾生造眾惡業，不信三寶，隨虛妄見。棄背正理，愛樂邪徒。謗毀佛經，言非聖說。外道典籍，恭敬受持。自作教人，俱生迷惑。當墮地獄，無有出期。設得為人，生八難處。遠離正道，盲無慧目。如是之人，若聞我名至心稱念，由是力故，臨命終時正念現前，解脫眾難，常生中國，受勝妙樂，乃至菩提。
曼殊室利，是為彼佛如來應正等覺行菩薩道時所發四種微妙大願。曼殊室利，彼佛國土功德莊嚴，與上妙寶如來世界，等無有異。
複次曼殊室利，東方去此過十殑伽河沙佛土有世界名淨琉璃，佛號藥師琉璃光如來應正等覺。曼殊室利，彼佛世尊從初發心行菩薩道時，發十二大願，云何十二？
第一大願：願我來世得佛菩提時，自身光明，照無邊界。三十二相、八十隨好莊嚴其身。令諸有情，如我無異。
第二大願：願我來世得菩提時，身如琉璃，內外清徹。光明廣大，遍滿諸方。焰網莊嚴，過於日月。鐵圍中間，幽冥之處，互得相見。或於此界暗夜遊行，斯等眾生見我光明，悉蒙開曉，隨作眾事。
第三大願：願我來世得菩提時，以無量無邊智慧方便，令諸有情所受用物，皆得無盡。
第四大願：願我來世得菩提時，若諸有情行邪道者，悉令游履菩提正路。若行聲聞、獨覺乘者，亦令安住大乘法中。
第五大願：願我來世得菩提時，若諸有情，於我法中修行梵行，一切皆令得不缺戒，善防三業，無有毀犯墮惡趣者。設有毀犯，聞我名已，專念受持，至心發露，還得清淨，乃至菩提。
第六大願：願我來世得菩提時，若諸有情諸根不具，醜陋頑愚，聾盲喑啞，攣躄背傴，白癩癲狂，種種病苦之所纏逼。若聞我名至心稱念，皆得端嚴，眾病除愈。
第七大願：願我來世得菩提時，若諸有情貧窮困苦無有歸趣，眾病所逼，無藥無醫。暫聞我名，眾病消散，眷屬增盛，資財無乏，身心安樂，乃至菩提。
第八大願：願我來世得菩提時，若有女人為女眾苦之所逼切，極生厭離，願舍女身。若聞我名至心稱念，即於現身轉成男子，具丈夫相，乃至菩提。
第九大願：願我來世得菩提時，令諸有情出魔羅網。復有種種邪見之徒，皆當攝受令生正見，漸令修習諸菩薩行，乃至菩提。
第十大願：願我來世得菩提時，若諸有情王法所拘，幽禁牢獄，枷鎖鞭撻，乃至極刑。復有眾多苦楚之事逼切憂惱，無暫樂時。若聞我名，以我福德威神力故，皆得解脫一切憂苦，乃至菩提。
第十一大願：願我來世得菩提時，若諸有情飢火所惱，為求食故造諸惡業。若聞我名至心稱念，我當先與上妙飲食隨意飽滿，復以法味令住安樂，乃至菩提。
第十二大願：願我來世得菩提時，若諸有情身無衣服，蚊虻寒熱之所逼惱。若聞我名至心稱念，隨其所好，即得種種上妙衣服。寶莊嚴具、伎樂香華，皆令豐足，無諸苦惱，乃至菩提。
曼殊室利，是為藥師琉璃光如來應正等覺行菩薩道時所發十二微妙上願。
藥師琉璃光如來本願功德經（卷下）
爾時佛告曼殊室利：彼藥師琉璃光如來行菩薩道時所發大願，及彼佛土功德莊嚴，我於一劫、若過一劫說不能盡。然彼佛土純一清淨無諸欲染，亦無女人及三惡趣苦惱之聲。以淨琉璃而為其地，城闕宮殿及諸廊宇、軒窗羅網，皆七寶成，亦如西方極樂世界功德莊嚴。於彼國中有二菩薩，一名日光遍照，二名月光遍照，於彼無量菩薩眾中而為上首，能持彼佛正法寶藏。是故曼殊室利，若有淨信男子女人，應當願生彼佛世界。
複次曼殊室利，若有眾生不識善惡，唯懷貪惜，不知惠施及施果報，愚痴少智無有信心，多蓄珍財勤勞守護，見乞者來心生不喜，設不獲已行惠施時，如割身肉深生吝惜，復有無量慳貪有情，積集資財，然於自身尚不能用，況當供給父母妻子、奴婢僕使，及來乞者，彼諸有情從此命終，生餓鬼中，或傍生趣。由昔人間曾聞藥師琉璃光如來名故，雖在惡趣，還得憶念彼如來名，即於彼沒生在人中，得宿命智念，畏惡趣苦，不樂欲樂，好行惠施，讚嘆施者，所有財物無慳吝心，漸次尚能以頭目手足、血肉身分施來求者，況余財物。
複次曼殊室利，若復有人歸依世尊，受諸學處而破戒破威儀及壞正見，設有持戒正見不求多聞，於佛所說契經深義不能解了，雖有多聞而懷驕慢，由慢心故自是非他，嫌謗正法為魔伴黨，如是愚人自行邪見，復令無量百千俱胝有情墮大險坑，此諸有情，墮於地獄、傍生、鬼趣。若曾聞此藥師琉璃光如來名號，由彼如來本願威力，於地獄中憶佛名號，從彼命盡，還生人間。正見精進，意樂調善，舍俗出家，於佛法中受持學處，無有毀犯。正見多聞，解甚深義，離於驕慢，不謗正法，不為魔伴。漸次修行諸菩薩行，乃至菩提。
複次曼殊室利，若諸有情慳貪嫉妒，造諸惡業，自贊毀他，命終當墮三惡趣中，無量千歲受諸劇苦。從彼終已，來生人間，或作牛馬駝驢之屬，恆被鞭撻，饑渴纏心，身常負重，困苦疲極。若得為人，生居下賤，奴婢僕使，被他驅役，恆不自在。由昔人中曾聞藥師琉璃光如來名號彼善根力，今復憶念，至心歸依。以佛神力，眾苦解脫，諸根聰利，智慧多聞，恆求勝法，常遇善友，永斷魔罥，破無明殼，竭煩惱河。解脫一切生老病死、憂悲苦惱，乃至菩提。
複次曼殊室利，若諸有情好喜乖離更相鬥訟，惱亂自他，以身語意造諸惡業，展轉常為不饒益事，互相謀害，告召山林樹冢等神，殺諸眾生，取其血肉，祭祀藥叉、羅剎神等；書怨人名，或作形像，以惡咒術而咒詛之；魘魅蠱道，咒起死屍，令斷彼命及壞其身。是諸有情，若得聞此藥師琉璃光如來名號，彼諸惡緣，悉不能害。一切展轉皆起慈悲，利益安樂，無損惱意及嫌恨心。於自所有，常生喜足。
複次曼殊室利，若有四眾，比丘、比丘尼、近事男、近事女，及余淨信男子女人，若能受持八支齋戒，或經一年，或復三月，受持學處。以此善根願生西方極樂世界見無量壽佛，若聞藥師琉璃光如來名號，臨命終時，有八菩薩乘神通來，示其去處，即於彼界種種雜色眾寶華中自然化生，或有因此生於天上。雖生天中，而昔善根亦不窮盡，不復更生諸餘惡趣。天上壽盡，還生人間，或為輪王，統攝四洲，威德自在，勸化無量百千有情，於十善道，令其修習。或生剎帝利婆羅門居士貴族，多饒財寶，倉庫盈溢，形相端嚴，眷屬隆盛，聰明智慧，勇健盛猛，有大身力。若是女人得聞藥師琉璃光如來名號，至心受持，於後不復更受女身。
複次曼殊室利，彼藥師琉璃光如來得菩提時，由本願力，觀諸有情遇眾病苦，瘦瘧乾消黃熱等病，或被魘魅蠱道所中，或復短命，或時橫死。欲令是等病苦消除，所求願滿。時彼世尊入三摩地，名曰滅除一切眾生苦惱。既入定已，於肉髻中出大光明，光中演說大陀羅尼咒曰：
南無波切伐帝碧沙社巨嚕碧琉璃
波拉婆訶拉舍也達拖節多也
阿拉訶帝 三藐三勃陀耶達侄拖
唵 碧殺逝碧殺逝碧殺社三么節帝娑訶
爾時光中說此咒已，大地震動，放大光明，一切眾生病苦皆除，受安隱樂。
曼殊室利，若見男子女人有病苦者，應當一心為彼病人，清淨澡漱，或食或藥，或無蟲水，咒一百八遍，與彼服食，所有病苦，悉皆消滅。若有所求，至心念誦皆得如意，無病延年。命終之後生彼世界，得不退轉，乃至菩提。是故曼殊室利，若有男子女人，於彼藥師琉璃光如來至心殷重恭敬供養者，常持此咒，勿令廢忘。
複次曼殊室利，若有淨信男子女人得聞如上七佛如來應正等覺所有名號，聞已誦持，晨嚼齒木，澡漱清淨，以諸香華、末香、燒香、塗香，作眾伎樂供養形像，於此經典，若自書，若教人書，一心受持，聽聞其義。於彼法師，應修供養，一切所有資身之具，悉皆施與，勿令乏少。如是便蒙諸佛護念，所求願滿，乃至菩提。
爾時曼殊室利童子白佛言：世尊，我於末法之時，誓以種種方便令諸淨信男子女人得聞七佛如來名號。乃至睡中，亦以佛名令其覺悟。世尊，若於此經受持讀誦，或復為他演說開示，若自書，若教人書，恭敬尊重，以種種華香、塗香、末香、燒香、華鬘、瓔珞、幡蓋、伎樂而為供養。以五色繒彩而裹袠之，灑掃淨處，置高座上。是時四大天王與其眷屬及與無量百千天眾，皆詣其所，供養守護。世尊，若此經寶流行之處，及受持者，以彼七佛如來本願功德，及聞名號威神之力，當知是處無復橫死，亦復不為諸惡鬼神奪其精氣。設已奪者，還得如故，身心安樂。
佛告曼殊室利：如是如是，如汝所說。曼殊室利，若有淨信男子女人，欲供養彼七如來者，應先敬造七佛形像，安在清淨上妙之座。散花燒香，以諸幢幡莊嚴其處。七日七夜受八戒齋，食清淨食，澡浴身體，著新淨衣。心無垢濁，亦無恚害。於諸有情常起利樂慈悲喜舍平等之心。鼓樂弦歌稱讚功德，右繞佛像。念彼如來，所有本願，讀誦此經，思惟其義，演說開示，隨其所願。求長壽得長壽，求富饒得富饒，求官位得官位，求男女得男女，一切皆遂。若復有人忽得惡夢見諸惡相，或怪鳥來集，或於其家百怪出現。此人若以眾妙資具恭敬供養彼諸佛者，惡夢惡相諸不吉祥悉皆隱沒，不能為患。或有水火刀毒，懸崖險道，惡象獅子，虎狼熊羆，蛇蠍蜈蚣如是等怖，若能至心憶念彼佛，恭敬供養，一切怖畏皆得解脫。若他國侵擾，盜賊反亂，憶念恭敬彼如來者，所有怨敵，悉皆退散。
複次曼殊室利，若有淨信男子女人等，乃至盡形不事余天，唯當一心歸佛法僧，受持禁戒，若五戒、十戒、菩薩二十四戒、比丘二百五十戒、比丘尼五百戒，於諸戒中或有毀犯怖墮惡趣，若能專念彼佛名號恭敬供養者，必定不生三惡趣中。或有女人臨當產時受於極苦，若能至心稱名禮讚、恭敬供養七佛如來，眾苦皆除。所生之子顏貌端正見者歡喜，利根聰明少病安樂，無有非人奪其精氣。
爾時世尊告阿難言：如我稱揚彼七如來名號功德，此是諸佛甚深境界難可了知，汝勿生疑。
阿難白言：世尊，我於如來所說契經深義不生疑惑。所以者何？一切如來身語意業皆無虛妄。世尊，此日月輪可使墮落，妙高山王可使傾動，諸佛所言，終無有異。世尊，然有眾生信根不具，聞說諸佛甚深境界作是思惟：云何但念七佛名號，便獲爾所功德勝利？由此不信便生誹謗。彼於長夜，失大利樂，墮諸惡趣。
佛告阿難：彼諸有情，若得耳聞諸佛名號墮惡趣者，無有是處，唯除定業不可轉者。阿難，此是諸佛甚深境界難可信解。汝能信受，當知皆是如來威力。阿難，一切聲聞及獨覺等皆不能知，唯除一生補處菩薩。阿難，人身難得，於三寶中信敬尊重亦難可得。得聞七佛如來名號，復難於是。阿難，彼諸如來無量菩薩行、無量巧方便、無量廣大願，如是行願善巧方便，我若一劫，若過一劫說不能盡。
爾時眾中有一菩薩摩訶薩名曰救脫，即從座起，偏袒右肩，右膝著地，合掌向佛，白言：世尊，於後末世像法起時，若有眾生為諸病苦之所逼惱，身形羸瘦，不能飲食，喉唇乾燥，目視皆暗，死相現前，父母親屬朋友知識啼泣圍繞，身臥本處，見彼琰魔法王之使，引其神識將至王所，然諸有情有俱生神，隨其所作善惡之業，悉皆記錄，授與彼王。王即依法問其所作，隨彼罪福而處斷之。是時病人親屬知識，若能為彼歸依諸佛，種種莊嚴如法供養，而彼神識，或經七日，或二七日，乃至七七日，如從夢覺，複本精神，皆自憶知善不善業所得果報。由自證見業報不虛，乃至命難，亦不造惡。是故淨信男子女人，皆應受持七佛名號，隨力所能，恭敬供養。
爾時具壽阿難問救脫菩薩曰：善男子，恭敬供養彼七如來，其法云何？
救脫菩薩言：大德，若有病人及余災厄欲令脫者，當為其人，七日七夜持八戒齋。應以飲食及余資具，隨其所有供佛及僧。晝夜六時，恭敬禮拜七佛如來，讀誦此經四十九遍。燃四十九燈，造彼如來形像七軀，一一像前各置七燈，其七燈狀圓若車輪，乃至四十九夜光明不絕。造雜彩幡四十九首，並一長幡四十九尺。放四十九生。如是即能離諸厄難，不為諸橫惡鬼所持。大德阿難，是為供養如來法式。若有於此七佛之中隨其一佛稱名供養者，皆得如是無量功德，所求願滿，何況盡能具足供養。
複次大德阿難，若剎帝利灌頂王等災難起時，所謂人眾疾疫難、他國侵逼難、自界叛逆難、星宿變怪難、日月薄蝕難、非時風雨難、過時不雨難。彼剎帝利灌頂王等，爾時當於一切有情起慈悲心，放大恩赦，脫諸幽厄苦惱眾生，如前法式供養諸佛。由此善根及彼如來本願力故，令其國界即得安隱。風雨順時，谷稼成熟，國內眾生無病安樂，又無暴惡藥叉等神共相惱亂。一切惡相悉皆隱沒。而剎帝利灌頂王等，皆得增益壽命色力，無病自在。大德阿難，若帝后妃主，儲君王子，大臣輔相，宮中婇女，百官黎庶為病所苦及余厄難，亦應敬造七佛形像，讀誦此經，燃燈造幡，放諸生命，至誠供養，燒香散花，即得病苦消除，解脫眾難。
爾時具壽阿難問救脫菩薩言：善男子，云何已盡之命而可增益？救脫菩薩言：大德，仁豈不聞如來說有九橫死耶？由是世尊為說咒藥，隨事救療，燃燈造幡修諸福業，以修福故，得延壽命。阿難問言：九橫云何？
救脫菩薩言：一者，若諸有情得病雖輕，然無醫藥及看病者，設復遇醫不授其藥，實不應死而便橫死。又信世間邪魔外道妖孽之師，妄說禍福，便生恐動，心不自正，卜問吉凶，殺諸眾生，求神解奏，呼召魍魎，請福祈恩，欲冀延年，終不能得。愚迷倒見，遂令橫死，入於地獄，無有出期。二者橫為王法之所誅戮。三者畋獵嬉戲，耽淫嗜酒，放逸無度，橫為非人奪其精氣。四者橫為火焚。五者橫為水溺。六者橫為種種惡獸所啖。七者橫墮山崖。八者橫為毒藥、魘禱、咒詛、起屍鬼等之所中害。九者饑渴所困不得飲食而便橫死。是為如來略說橫死有此九種。其餘復有無量諸橫，難可具說。
複次阿難，彼琰魔王簿錄世間所有名籍。若諸有情不孝五逆，毀辱三寶，壞君臣法，破于禁戒。琰魔法王，隨罪輕重考而罰之。是故我今勸諸有情，燃燈造幡，放生修福，令度苦厄，不遭眾難。
爾時眾中有十二藥叉大將俱在會坐，其名曰：
宮毗羅大將、跋折羅大將、迷企羅大將
頞你羅大將、末你羅大將、娑你羅大將
因陀羅大將、波夷羅大將、簿呼羅大將
真達羅大將、朱社羅大將、毗羯羅大將
此十二藥叉大將一一各有七千藥叉以為眷屬，同時舉聲白佛言：世尊，我等今者蒙佛威力得聞七佛如來名號，於諸惡趣無復怖畏。我等相率，皆同一心，乃至盡形，歸佛法僧。誓當荷負一切有情，為作義利，饒益安樂。隨於何處城邑聚落，空閒林中，若有此經流布讀誦，或復受持七佛名號恭敬供養者，我等眷屬衛護是人令脫眾難，所有願求悉令滿足。或有疾厄求度脫者，亦應讀誦此經，以五色縷結我名字，得如願已，然後解結。爾時世尊贊諸藥叉大將言：善哉善哉！大藥叉將，汝等念報七佛如來恩德者，常應如是利益安樂一切有情。
爾時會中有多天眾，智慧鮮少作如是念：云何過是殑伽河沙諸佛世界現在如來，暫聞名者便獲無邊殊勝功德？
爾時釋迦牟尼如來，知諸天眾心之所念，即入警召一切如來甚深妙定。才入定已，一切三千大千世界六種震動，雨天妙花，及天香末。彼七如來見是相已，各從其國來至娑婆世界，與釋迦如來共相問訊。時佛世尊由其先世本願力故，各各自於天寶莊嚴獅子座上隨處安坐。諸菩薩眾，天龍八部人非人等，國王王子中宮妃主，並諸大臣，婆羅門，長者，居士，前後圍繞，而為說法。
時諸天眾見彼如來皆已雲集，生大希有，疑惑便除。時諸大眾嘆未曾有，同聲贊言：善哉善哉！釋迦如來饒益我等，為除疑念，令彼如來皆至於此。時諸大眾各隨自力，以妙香花及眾瓔珞、諸天伎樂，供養如來。右繞七匝，合掌禮敬，贊言：希有希有！諸佛如來甚深境界不可思議。由先願力善巧方便，共現如是奇異之相。爾時大眾各各發願，願諸眾生皆得如是如來勝定。
爾時曼殊室利即從座起，合掌恭敬，繞佛七匝，禮雙足已，白言：世尊，善哉善哉！如來定力不可思議，由本願力，方便善巧成就眾生。唯願為說大力神咒，能令來世薄福眾生，病惱所纏，日月星辰所有厄難，疾疫怨惡，及行險道遭諸恐怖，為作歸依，令得安隱。彼諸眾生於此神咒，若自書，教人書，受持讀誦，廣為他說，常蒙諸佛之所護念。佛自現身，令願滿足，不墮惡趣，亦無橫死。
時諸如來贊曼殊室利言：善哉善哉！此是我等威神之力，令汝勸請，哀愍眾生，離諸苦難，為說神咒。汝應諦聽，善思念之，我當為說。曼殊室利，有大神咒，名曰如來定力琉璃光。若有男子女人書寫讀誦，恭敬供養，於諸含識起大悲心，所有願求，皆得滿足。諸佛現身而為護念，離眾障惱，當生佛國。
時七如來以一音聲，即說咒曰：
達侄拖具謎具謎衣尼謎你斯末底末底薩多達拖
節多三摩地厄提色尺帝厄帝末帝波里波波輸達你
薩婆波波那世也波替波圖溫答謎烏謎巨謎
佛奪器達落波里輸達你壇謎你壇謎謎嚕謎嚕
謎盧詩切麗薩婆哥羅蜜栗度尼婆拉你波替蘇波替
佛陀厄替色叉尼娜和落叉度迷薩婆提婆
三謎厄三謎三曼挪漢蘭度謎薩婆佛陀菩提薩多
山謎山謎波拉山曼度謎薩婆伊底烏波達婆
薩婆皮何大也薩婆薩多遮普蘭你普蘭尼普蘭也謎
薩婆阿舍碧琉璃也波拉底婆細薩婆波波叉揚節麗
娑訶
爾時七佛說此咒時，光明普照，大地震動。種種神變，一時俱現。時諸大眾見此事已，各各隨力，以天香花、塗香、末香，奉上彼佛。鹹唱善哉，右繞七匝。
彼佛世尊同聲唱言：汝等一切人天大眾，應如是知，若有善男子、善女人，若王、王子、妃後、大臣、寮庶之類，若於此咒受持讀誦，聽聞演說，以妙香花供養經卷，著新淨衣在清淨處持八戒齋，於諸含識常生慈愍，如是供養，得無量福。若復有人有所祈願，應當造此七佛形像，可於靜處，以諸香花，懸繒幡蓋，上妙飲食，及諸伎樂而為供養，並復供養菩薩、諸天，在佛像前，端坐誦咒，於七日中，持八戒齋，誦滿一千八遍。彼諸如來，及諸菩薩，悉皆護念。執金剛菩薩並諸釋梵、四天王等，亦來擁衛。此人所有五無間罪，一切業障悉皆消滅，無病延年，亦無橫死及諸疾疫。他方賊盜欲來侵境，斗諍戰陣，言訟讎隙，飢儉旱澇，如是等怖，一切皆除。共起慈心，猶如父母。有所願求，無不遂意。
爾時執金剛菩薩、釋、梵、四天王，從座而起，合掌恭敬，禮釋迦牟尼佛足，白言：世尊，我等大眾皆已得聞諸佛本願殊勝功德，及見諸佛慈悲至此，令我眾生親承供養。世尊，若於其處有此經典，及七佛名、陀羅尼法，流通供養，乃至書寫。我等悉皆承佛威力，即往其處擁護，於彼國王、大臣、城邑聚落、男子女人，勿令眾苦及諸疾病之所惱亂，常得安隱，財食豐足，我等即是報諸佛恩。世尊，我等親於佛前，自立要誓。若有淨信男子女人，憶念我者，應誦此咒。即說咒曰：
達侄拖厄具莫具達拉具么么具具麗訶護戲
末拉末拉末拉緊樹麗布麗娑訶
若有淨信男子女人、國王王子、大臣輔相、中宮婇女，誦七佛名及此神咒，讀誦書寫，恭敬供養。現世皆得無病長壽，離眾苦惱，不墮三途。得不退轉，乃至菩提。彼諸佛土，隨意受生。常見諸佛，得宿命智。念定總持，無不具足。若患鬼瘧等病，當書此咒系之肘後，病若瘥已，置清淨處。
爾時執金剛菩薩詣七佛所，右繞三匝，各申禮敬，白言：世尊，唯願慈悲，護念於我。我今為欲饒益未來男子女人持是經者，我更為說陀羅尼咒。時彼七佛贊執金剛言：善哉善哉！執金剛，我加護汝，可說神咒，為護未來持經之人，令無眾惱，所求滿足。時執金剛菩薩即說咒曰：
南無薩多喃三藐三佛陀喃南么薩婆巴折拉達拉喃
達直拖唵巴折麗巴折麗莫訶巴折麗巴折拉波舍
陀拉你三么三么三曼多阿波拉底訶多巴折麗
山么山么波拉山曼度迷薩婆皮阿大也巨嚕巨嚕
薩婆節么阿伐拉拿你叉也三么也末奴三末拉
薄伽畔巴折拉波你薩婆舍迷波你普拉也娑訶
世尊，若復有人持七佛名，憶念彼佛本願功德，並持此咒，讀誦演說。我令彼人所願滿足，無所乏少。若欲見我問善惡者，應當書寫此經，造七佛像，並執金剛菩薩像。皆於像身，安佛舍利。於此像前，如上所說種種供養，禮拜旋繞。於眾生處，起慈悲心。受八戒齋，日別三時，澡浴清淨，三時衣別。從白月八日至十五日，每日誦咒一百八遍，心無散亂。我於夢中，即自現身，共為言說，隨所求者皆令滿足。
時大會中有諸菩薩皆悉唱言：善哉善哉！執金剛，此陀羅尼不可思議，實為善說。
時七如來作如是語：我等護汝所說神咒，為欲饒益一切眾生皆得安樂、所求願滿，不令此咒隱沒於世。爾時七佛告諸菩薩、釋、梵、四天王曰：我今以此神咒，付囑汝等，並此經卷。於未來世，後五百歲，法欲滅時，汝等皆應護持是經。此經威神利益甚多，能除眾罪，善願皆遂。勿於薄福眾生，誹謗正法、毀賢聖者授與斯經，令法速滅。爾時東方七佛世尊，見此大眾所作已辦，機緣滿足，無復疑心，各還本土。於其座上，忽然不現。
爾時具壽阿難陀即從座起，禮佛雙足，右膝著地，合掌恭敬，而白佛言：世尊，當何名此經？我等云何受持？佛告阿難陀：此經名為《七佛如來應正等覺本願功德殊勝莊嚴》，亦名《曼殊室利所問》，亦名《藥師琉璃光如來本願功德》，亦名《執金剛菩薩發願要期》，亦名《淨除一切業障》，亦名《所有願求皆得圓滿》，亦名《十二大將發願護持》，如是名字，汝當奉持。
時薄伽梵說是經已，諸大菩薩及聲聞眾，天龍藥叉，健闥婆，阿蘇羅，揭路荼，緊那羅，莫呼洛伽，人非人等一切大眾，聞佛所說，皆大歡喜，信受奉行。
