辦學思想
近年，雖然受教育資源整合等因素影響，學校辦學條件相對落後，但該校秉承“文明、好學、團結、開拓”的辦學理念。特別是為進一步在全社會營造尊師重教的良好氛圍，斗門區以“三個代表”重要思想為指導，深入學習實踐科學發展觀，全面推進“科教興區”戰略，創新尊師重教機制。斗門區採取領導到學校掛點，相關部門齊抓共管等方式，用實際行動踐行教育優先發展的戰略地位。其中區委書記、區人大常委會主任焦蘭生同志親自到斗門區最偏僻的初級中學（蓮溪中學）掛點。焦書記堅持每學期在開學之際，他均親臨該校。2009年9月2日，在全國第25個教師節來臨之際，焦書記率先垂範，親臨該校與教師們進行了親切的座談，並發表了重要講話。焦書記向教師們提出了三點要求。一是責任、二是榜樣、三是愛心。焦書記還提出了三點希望來勉勵全體學生。一要勤奮、二要自信、三要感恩。我們以此為契機，在該校內掀起“內強素質教書育人，外樹形象為人師表，奮發有為爭當先進”的熱潮。克服困難，真抓實幹，大力推進素質教育，加強校本教研、師資隊伍、養成教育、校園文化等建設，積極創建平安和諧新校園、辦好人民滿意學校，為我區“打造三大平台”，建設現代生態農業基地努力工作。。
辦學成績
在上級領導的關懷和支持下，通過全體教職員工的共同努力，學校樹立“文明、好學、團結、開拓”的辦學理念，教風學風日漸濃厚，教育教學質量穩步提高。近年來，師生的違法犯罪率為零，多年獲得區德育工作先進單位獎和區教學質量進步獎。2009年；2010年該校參加中學生廣播體操比賽分別榮獲區級團體一等獎；市級團體三等獎。2009年；2010年中考成績總平均分、及格率分別居全區13所國中第四名；第三名。控制差生率效果最顯著，連續兩年居全區第一名。學校管理規範有序，制度建設日臻完善。2003學年度學校檔案綜合管理升為省一級單位。2004年、2006年、2009年該校分別被區教育工會授予校務公開先進單位。2008年，該校檔案工作管理被區教育局評為先進集體。2010年該校黨支部被評為區級先進基層黨支部。2009學年度和2010學年度被評為區級德育工作先進單位和教學質量先進單位。僅2010年度，該校教師科研成果獎：省級二等獎、市級二等獎各1人、市三等獎2人、區級獎10人。學生比賽獲獎：市級獎1人、區級特等獎、一等獎各2人、二等獎7人、三等獎17人。
教育規劃
蓮洲鎮蓮溪中學根據市政府常務會議紀要第31期《研究推進全市中國小校舍安全工程》及《關於進一步做好我市中國小校舍安全工程工作的通知》（珠校安辦[2009]5號）的要求，實施中國小校舍安全工程，直接關係到廣大師生的生命安全，關係到社會和諧與穩定，是一項重大的政治任務和民生工程。經蓮洲鎮鎮委鎮府及區教育局的調查研究論證，同意切實解決好農村地區教育設施落後，綜合抗災能力差的狀況，擬在蓮洲鎮蓮溪中學校內拆除8棟危舊教學樓及6棟宿舍樓，興建新的教學樓、綜合樓。該項目建設概況如下：擬建築面積7900平方米；項目總投資第一期估算為1936．7萬元。按照省、市、區的要求，充分運用教學資源，最佳化教育結構，調整布局，不斷提高辦學效益，計畫於2012年9月將蓮溪中學和蓮溪中心國小校合併一所九年義務教育的學校，建設規模為20個班，可容納1000名學生。
