故事介紹
《蒼穹之法芙娜》是XEBEC製作的日本電視動畫作品。2004年7月至12月，在東京電視台播出。2005年，製作了TV特別篇《蒼穹之法芙娜 RIGHT OF LEFT》。2010年製作了劇場版《蒼穹之法芙娜 HEAVEN AND EARTH》。2015年播出了TV第二季《蒼穹之法芙娜 EXODUS》。
該系列作品以“島、機器人、群像劇、少年少女”為關鍵字，作為原創動畫而企劃製作。在近未來，由於未知的生命體菲斯特姆（FESTUM）的侵略而陷入人類存亡危機的地球上，以南半球的孤島“龍宮島”為主要舞台，少年少女們駕駛著巨大機器人“法芙娜”守護著島。
《蒼穹之法芙娜》（通稱無印、TV一期）
2004年7月~12月間播出的全26集TV動畫。
蒼穹之戰神人物圖西曆2146年。在主人公真壁一騎和皆城總士居住的平靜小島“龍宮島”，有一天突然響起了“你在那裡嗎？”的聲音，未知生命體菲斯特姆的侵略開始了。終於，一騎等人得知29年前由於菲斯特姆的侵略，日本已經不復存在的事實。而龍宮島，實際上是為了救贖人類建造的人工要塞島，島上的居住的人，都是曾經受到特殊訓練的組織——Alv is的成員。
得知自己深以為生活在和平年代的幻想遭到毀滅性打擊的一騎等人，被捲入了人類和菲斯特姆的生死存亡之戰。
少年少女們為了保護島嶼乘上法芙娜開始戰鬥。法芙娜是人類為了防禦菲斯特姆的讀心能力而開發的最終兵器，而駕駛法芙娜的孩子們從出生時就被注入了特殊因子。在與菲斯特姆戰鬥的過程中，體內的染色體會發生變化，變成接近於菲斯特姆的形態，而自己則緩慢的走向死亡。法芙娜就是如此恐怖的非人道的兵器。
在淒絕的戰鬥中，駕駛員們或死或傷，不斷倒下。而此時，在一騎年幼時過世的母親——真壁紅音出現在了他面前，並為他指出了另一條道路……人類和菲斯特姆，可以共存於這個地球嗎？
TV一期動畫結尾較為開放，留給觀眾以想像的空間。
2005年由台灣勝利國際多媒體股份有限公司代理DVD、VCD、CD等商品，並在同年7月4日於台灣超級電視台播放。
《蒼穹之法芙娜 RIGHT OF LEFT》（OVA前傳，通稱ROL）
2005年12月29日作為TV特別篇播出，並在之後發售了OVA。作為TV的前傳，講述了TV版的主角們的前輩——將陵僚和生駒祐未等人的故事。在知道了島的秘密和危機後，將陵僚和生駒祐未作為龍宮島的第一批駕駛員，參加了祐未父親制定的“L計畫”。然而駕駛員們卻不斷死於染色體的同化現象。雖然僚和祐未成為了最後的倖存者，但二人最終為了島的位置不被暴露，而放棄了生的希望。
其中TV的主角一騎、總士、翔子等人，在OVA里作為學校里的學弟學妹也有登場。
《蒼穹之法芙娜 HEAVEN AND EARTH》（劇場版，通稱HAE）
2010年12月25日在日本上映，並於2011年9月21日發售BD/DVD。
時間設定在西曆2148年，即TV一期的蒼穹作戰結束後2年。講述了擁有人類外表的菲斯特姆——來主操與龍宮島的邂逅。在故事的結尾處，皆城總士歸來。
《蒼穹之法芙娜 EXODUS》（通稱EXODUS、TV二期）
2015年1月~3月、10月~12月間分割為兩季播出的全26集TV動畫。
時間設定在西曆2151年，即劇場版的2年後。前作的主角真壁一騎、皆城總士、遠見真矢等人也將會繼續在續篇中登場，並且還誕生了第二代乙姬——皆城織姬。相關內容請參蒼穹之法芙娜EXODUS詞條。
《蒼穹之法芙娜 ADOLESCENCE》（小說）
2005年1月25日，由電擊文庫出版了由沖方丁編寫的日版同名小說《蒼穹之法芙娜》，內容為第9話之前的劇情，和TV有些許不同。2013年2月22日，由早川書房推出文庫版時增加了副標題，正式定名為《蒼穹之法芙娜 ADOLESCENCE》，意指角色們無垢的青春。
製作群
原作：XEBEC
企畫：大月俊倫、下地誌直
文藝統括：沖方丁
系列構成：山野邊一記→沖方丁(16話～）
基礎設定協力：山野邊一記(16話～）
腳本：山野邊一記(1話～11話）、山野邊一記?宸蕉?12話～15話）、沖方丁(16話～）
人物設定：平井久司
機械設定：鷲尾直廣
色彩設定：關本美津子
音響監督：三間雅文
美術監督：小山俊久
攝影監督：廣瀬勝利
3D監督：本間潤樹
螢幕設計：中野剛
蒼穹之戰神音樂：齊藤恆芳、華沙管弦樂團
製作人：中西豪、千野孝敏、能戸隆
助監督：山岡信一
監督：羽原信義
製作：竜宮島役場
中文譯名
由於當初在台灣超視播放前，網友習慣以FAFNER之來源，也就是“尼伯龍根之歌”或“費爾森家族之薩加”中登場的守護寶藏的惡龍“法夫尼爾(Fafnir/Fafner)”來翻譯此作並翻為“蒼穹的巨龍”，因此超視播放時將之定名為“蒼穹之戰神”引起網友一片譁然，紛紛指責台灣翻譯不妥，只是超視與相關單位全面解釋都是以“此為日方之要求”輕描淡寫帶過，在無法求證的情況之下，之後這問題也漸漸消失了。
現有譯名還包括《蒼穹的法芙娜》《蒼穹之戰神》《蒼穹之巨龍》《蒼穹之fafner》等。
角色介紹
主角群
| 真壁一騎 (Makabe Kazuki) CV：石井真/台灣：鄭仁君 生日：2131年9月21日 星座：處女座 TV正篇年齡：14歲 血型：O型 身高：（14歲）169cm/（19歲）174cm 體重：56kg 喜歡的東西：安靜的地方、美食 角色歌：【無印】Flügel（Fluegel）【EXODUS】Fighting、CHAIN OF LIFE Alvis的Fafner搭乘者中擁有最高的適應性；一開始由於自我否定太強烈，上機後沒產生變性意識。 是真壁史彥與真壁紅音的孩子，於人工子宮出生。家經營陶器屋，由於小時候紅音戰死，因此負責家中所有家務（漫畫中是與父親各自分擔一半家務）。 據小說所寫，於人工子宮出生的孩子均植入Mir因子——由於基因操作，龍宮島的孩子們都具有各自的天才綜合症候群（又稱學者綜合症候群），一騎的表現為為驚人的運動能力、反射神經和耐力。 與總士是髮小，在收音機事件中劃傷企圖同化自己的總士的左眼，因罪疚感而疏遠總士並自我厭惡。恢復關係後，是唯一會直說總士“不器用”的人。 而真矢對於一騎則是可信賴的存在。 所駕駛機體為Mark Elf（德語中的"11"），但在駕駛Mark Elf私自出島被新聯合國捕獲，核心被取出，機體本身下落不明。 在新聯合國基地被Festum攻下前從妙尼爾手上接下裝置了Mark Elf核心的Mark Sein（德語意為“存在”），及時回島解救了島的危機，也與總士冰釋前嫌。 在動畫第一部（無印）完結時因為過重的同化現象而令視力嚴重受損，回島後昏迷一年後醒來，從HAE開始一直是咖啡店[樂園]主廚（每個島民都有各自的第二任務），被溝口稱為“店的招牌（最有名為一騎咖喱）”，在HAE結尾恢復視力。到第二部動畫（EXODUS）開篇時，經過漫長的治療，當時的身體狀況穩定在余命3年。 根據第二代島核-皆城織姬的說法，是與總士成二位一體之力的存在。 |  真壁一騎 |
| 皆城總士 (Minashiro Soushi) CV：喜安浩平/台灣：于正昌 生日：2131年12月27 星座：摩羯座 TV正篇年齡：14歲 血型：A型 身高：（14歲）173cm/（19歲）179cm 體重：61kg 喜歡的東西：咖啡、西洋棋、古典音樂 角色歌：【無印】Terra【EXODUS】Licht、philosophia 特徵是左眼上有一道貫通的傷痕。天才綜合症候群表現為大腦多線並行處理。 本是皆城公藏與皆城鞘（舊名芳村鞘）自然受孕的孩子，但由於要植入Mir因子，因此在人工子宮出生。有個妹妹叫皆城乙姬，在故事前段於女神的岩窟中沉睡。自小就已知有Alvis等組織及各種被穩藏的事實，本身因子的植入程度比其他孩子都要厲害，在收音機事件中差點就被體內的因子同化，期間還企圖同化一騎，但由於一騎本能的自衛而失敗。 從此左眼幾乎失去視力，亦因此傷口而未能駕駛Fafner(ROL劇情：在測試Mark Ein因左眼痛楚而測試失敗）。 最後被自己的父親、也就是當時的司令任命為齊格飛系統的操作者，負責指揮和協助駕駛員作戰，並承受於各人戰鬥時所受的痛楚（除了受攻擊時的痛楚，過後還有 flashback，即“閃回效果”)，因此宿舍內常備大量止痛藥。 在小說和漫畫中被真矢比喻為兔子。 動畫第一部中最後是被同化而失去了肉體，但已經與一騎展開全天候Crossing的他向一騎承諾會回來。 劇場版HAE結束時，以Festum體質駕駛Mark Nicht（德語意為“虛無”）回歸。 EXODUS開篇時的第二任務是研究員，在到[樂園]幫忙時還親自製作了名為[皆城燉菜]的料理。 根據第二代島核-皆城織姬的說法，是與一騎成二位一體之力的存在。 |  皆城總士 |
| 遠見真矢 (Toomi Maya) CV：松本まりか/台灣：雷碧文 生日：2131年11月11日 星座：天蠍座 是光弘巴特藍和遠見千鶴的孩子，有一親姐（遠見弓子，婚後改姓日野）。由於他們性格不合分開，因此用母親的姓氏。 她的興趣是徒手攀石，曾因手滑而分別被一騎及總士幫助過。她亦是於人工子宮出生，天才綜合症候群的表現為超強洞察力。 駕駛的法芙娜是Mark Sieben（德語的"7"），變性意識為透徹如機器的冷靜。 在小說和漫畫中，曾經在一騎面前，把總士比喻成兔子——如果小兔子沾上別人的氣味，由於不想小兔子被搶走，兔媽媽會出於守護最重要之物的心情而搶先把小兔子吃掉——當時的真矢直覺認為總士會把一騎吃掉；後來認為不僅是一騎，應該是大家都會因為這個理由而被吃掉。 在故事開始時因為其姐私下更改資料，成為“身體”不適合乘坐Fafner"而沒被選上為駕駛員。後被其母發現，改回資料後成為遠距離攻擊空戰機種Mark Sieben的駕駛員。擁有讓總士和一騎還有溝口都驚嘆的精準槍法。 對一騎抱有特殊感情，在小說表現比動畫更明顯。在動畫EXODUS中已經變為更類似於守護的心情，是EXODUS開篇中唯一在一線服役的第一期法芙娜駕駛員，第二任務是剛瑠島部隊空戰員+[樂園]服務生。 |  遠見真矢 |
| 羽佐間翔子 (Hazama Syouko) CV：松來未佑/台灣：郭馨雅 生日：2131年9月20日 被羽佐間 容子收養的孩子。是個有遺傳性肝病、身體虛弱、經常無法上學、但成績是年級第一名的孩子。天才綜合症候群表現為超強架空能力。 駕駛的法芙娜為Mark Sechs（德語的“6”），變性意識為愛。 真矢是其好友，因此亦會經常於課前去探望她。由於之前一騎幫助她回到學校而漸漸對一騎產生愛慕。 對於自己也能進Alvis擔任前線人員感到高興。 最後為了島不被破壞而駕駛空戰機種Mark Sechs作戰，後來因為同化嚴重而不得不選擇使用魔狼與敵人同歸於盡（自爆）。 |  蒼穹之戰神 |
| 春日井甲洋 (Kasugai Kouyou) CV：入野自由/台灣：吳文民 和翔子一樣是被收養的孩子，但待遇相差很大。暗戀翔子。養了一隻叫Chocolate的狗(CV：白石涼子），因為Chocolate讀音與翔子名字的發音近似。 駕駛的法芙娜為Mark Vier（德語的“4”），變性意識為真心。 父母雖然因他被選上成為駕駛員而感到興奮，但實際上只是單純存在利用之心。本人則畏懼戰鬥。天才綜合症候群表現為超強邏輯（尤其擅長數學）。 喜歡翔子。對於翔子的死，他認為是總士和一騎的責任，亦因此抱開畏懼面對戰鬥。但於初戰時的救出行動被Festum同化。Mark Vier的核心後來被真矢的父親取出，用作Mark Nicht的核心。 小說版中他對一騎的仇恨變的更深。 後來以Slave型的Festum覺醒，之後轉化為Master型。 HAE中自身化為MarkVier的核心參與保護龍宮島的作戰。EXODUS中以人類的形態回歸龍宮島並駕駛MarkVier。 |  春日井甲洋 |
| 要咲良 (Kaname Sakura) CV：新井里美/台灣：楊凱凱 要誠一郎與澄美的孩子。家中開道場，因此也練得一身好功夫，表明喜歡比自己強的男孩子，同年的只一騎能打嬴她。 是班上的大姊頭。因父親於第一集被 Festum殺死，故立志消滅所有來襲的Festum。 駕駛的法芙娜為Mark Drei（德語的“3”），變性意識為憤怒。 經常與劍司及衛一組與Festum戰鬥。最後因同化問題惡化而昏迷。 劇場版HAE中恢復，現身體除有所虛弱、腿部不靈外已無大礙，亦可自由操控Mark Drei與支援機進行空戰。 從劍司身上看到了父親影子的她，對劍司抱有好感。 |  蒼穹之戰神 |
| 近藤劍司 (Kondou kenji) CV：白石稔/台灣：黃天佑 近藤彩乃的胎生的孩子，並非於島上出生，口甜舌滑又不可靠的學生會會長。 由於喜歡咲良，因此常找一騎比試，小說更提及當時學生們更有人下注賭誰勝誰負，但通常 失敗而回。 是Mark Acht的駕駛員，曾因咲良被同化及母親之死而閉門不出，但最後亦重返戰場。 本編最後他寄養於要家。對咲良抱有好感。 |  蒼穹之戰神 |
| 小楯衛 (Kodate Mamoru) CV：齋賀觀月/台灣：郭馨雅 小楯 保與千沙都的孩子，經營浴場。 從小喜歡看漫畫，他最喜歡的漫畫是一套名叫高拜因（譯音）的機器人漫畫，而漫畫作畫者為其父親。 是防護型的Mark Funf的駕駛員，於第2次脫下面具戰鬥時，被Festum消滅時的爆炸波及身亡。 |  蒼穹之戰神 |
| 皆城乙姬 (Minashiro Tsubaki) CV：仲西環/台灣：楊凱凱 總士的妹妹，是Core型的Festum與人的融合體，保留人性並負責全島所有機能。 在未離開女神的岩窟時，曾以幻影出現帶領一騎到女神的岩窟中。島上所受到的攻擊，亦會反映於她身上。 於最後由於離開女神的岩窟後不能活得很久而返回女神的岩窟，與島同化成一體，化成全島的Mir。 女神的岩窟中亦因 Core型Festum學會了生存，而重生出一個和乙姬擁有相同基因的胚胎。 |  皆城乙姬 |
| 日野道生 (Hino Michio) CV：堀秀行 由於父親離島而離開的駕駛員。喜歡弓子。 在背叛要炸毀龍宮島的新聯合國後，在Alvis擔任Mark Eins的駕駛員，最後與伊敦戰鬥，自爆而死。 本編結局前與弓子同居，並未知道自己有了孩子。 |  蒼穹之戰神 |
| 卡農·梅芬絲 (羽佐間卡農Hazama Kanon）（Canon Memphis) CV：小林沙苗 在戰事中被道生救回，成為新聯合國一員。 在新聯合國中是紅衣魔女型的駕駛員，後來注射了Festum中提取的因子，使自己能駕駛Fafner而成為Mark Drei駕駛員並參與蒼穹作戰。 HAE中成為羽佐間容子的養女，改姓為羽佐間並駕駛MarkDrizehn戰鬥。 對一騎抱有特殊感情。 |  無印時期的卡農 |
前傳主角
將陵僚
CV：宮野真守
將陵僚父母雙亡，和狗poku雙依為命。
是ROL時期的學生會會長，但幾乎所有事都交由其他幹部去做。
患有同翔子一樣的肝病，命不久矣的少年。
於母親死後開始解除認識限制號碼，得知Alvis存在，並加入了Plan L。
一直喜歡著 祐未，並在祐未同化前道出了自己的心意。最後於作戰留下了給龍宮島人們的錄音，自爆而死。
生駒祐未CV：甲斐田裕子
蒼穹之戰神母親已死，獨自一人照顧有身體殘障的父親。是ROL時期的學生會副會長，對僚有特殊感情。
曾因父親的死而怪罪約她去游水的僚。
在父親死後開始解除認識限制號碼，得知阿爾維斯存在，亦加入了Plan L。
最後因同化而死，臨死前也確認了自己對僚的感情。
阿爾維斯
真壁史彥 (Makabe Humihiko)CV：田中正彥/台灣：黃天佑
主角真壁一騎的父親，在皆城公藏死後接替指揮官一職。
皆城公藏(Minashiro Kouzou)CV：中田讓治/台灣：吳文民
遠見千鶴 (Toomi Chizuru)CV：筱原惠美/台灣：楊凱凱
遠見弓子(Toomi Yumiko)CV：野上尤加奈/台灣：郭馨雅
羽佐間容子(Hazama Youko)CV：葛城七穗/台灣：雷碧文
要澄美(Kaname Kiyomi)CV：石川靜/台灣：鄭仁君
要誠一郎 (Kaname Seiichirou)CV：小山力也
近藤彩乃 (Kondou Ayano)CV：玉川紗己子/台灣：楊凱凱
小楯保 (Kodate tamotsu)CV：高瀬右光/台灣：于正昌
小楯千沙都 (Kodate Chisato)CV：さとうあい
溝口恭介 (Mizoguchi Kyousuke)CV：土師孝也
西尾行美(Nishio Yukimi)CV：京田尚子/台灣：楊凱凱
日野惠 (Hino Megumi)CV：小宮和枝
手冢一平 (Tezuka Kazuhei)CV：新垣樽助
堂馬量平 (Douma Ryouhei)CV：鈴木清信
早乙女柄鎖CV：大川透
龍宮島
藏前果林 (Kuramae Karin)CV：白石涼子/Right of Left：木村亞希子
立上芹 (Tachigami Seri)CV：福圓美里
西尾里奈 (Nishio Rina)CV：白石涼子
堂馬廣登 (Douma Hiroto)CV：佐佐木望
亡者
真壁紅音 (Makabe Akane)CV：豐口惠美
皆城鞘 (Minashiro Saya)CV：無
新聯合國
狩谷由紀惠 (Kariya Yukie)
CV：澤海陽子/台灣：鄭仁君
在被發現是臥底之前，她擔任學校的老師，也受一騎們的愛戴，但最後於春日井夫妻被逐出島上後，她說服一騎，以MarkElf和火龍飛翼外掛裝備帶她逃離龍宮島，最後被派為MarkNicht(Nicht=德文中的無存）的駕駛員，卻因為伊登的侵入而被同化死亡。
春日井正浩 (Kasugai Masahiro)CV：河相智哉
春日井諒子 (Kasugai Ryouko)CV：津田匠子
日野洋治 (Hino Youji)CV：小杉十郎太
光弘·巴特藍 (Mitsuhiro Bertrand)CV：森功至
赫絲特·蓋洛普 (Hettie Galop)CV：藤田淑子/台灣：郭馨雅
達德利·巴恩茲 (Dudley Burns)CV：內田直哉
陳晶晶CV：雪乃五月（雪野五月）
貝拉·狄紐尼CV：無
奧路加·卡緹娜·貝特連可CV：無
菲斯特姆
台譯“異界體”。
伊 登 (Idun)
CV：真殿光昭
名字來自於北歐神話中的青春女神，在異界體中是厭惡人類，並試圖消滅人類的一派，雖然同化了狩谷由紀惠，取得了MarkNicht的控制權，但最後仍然遭到一騎以MarkSein同化消滅。
妙尼爾 (Mjollnir)
CV：豐口惠
名字來自於北歐神話的“雷神之錘”，在異界體中代表試圖了解人類、並與之共存的一派，他同化了真壁紅音，也在最後保護了龍宮島，並且給予了阿爾維斯異界體的相關資訊。
製作人員
| 話數 | 小標題 | 腳本 | 繪畫 | 演出 | 作畫監督 |
| 1 | 楽園～はじまり | 山野辺一記 | 羽原信義 | 孫承希 | 羽原信義 山岡信一 |
| 2 | 告知～いのち | 榎本明広 | 高橋晃 | ||
| 3 | 迷宮～しんじつ | 鈴木吉男 | 吉川浩司 | 北郷通 | |
| 4 | 逃航～ふなで | うえだしげる | 高橋晃 | ||
| 5 | 約束～ちかい | 二瓶勇一 | 高見明男 | ||
| 6 | 翔空～ぎせい | 榎本明広 | 山岡信一 前田明壽 | ||
| 7 | 家賊～おやこ | 西沢晉 | 中津環 | 本橋秀之 大浪太 | |
| 8 | 確執～こうよう | 大冢健 | うえだしげる | 高橋晃 | |
| 9 | 同化～わかれ | 鈴木利正 | 高見明男 前田明壽 | ||
| 10 | 分解～すれちがい | 榎本明広 | 堀たえ子 山岡信一 | ||
| 11 | 舊新～じんるいぐん | 二瓶勇一 | 高橋晃 | ||
| 12 | 不在～あせり | 山野辺一記 沖方丁 | 菱川直樹 | ||
| 13 | 侵蝕～フェストゥム | 羽原久美子 | うえだしげる | 高見明男 松村拓哉 | |
| 14 | 覚醒～せんりょう | 西沢晉 榎本明広 | 中津環 | 本橋秀之 大浪太 | |
| 15 | 記憶～さけび | 大冢健 | 菱川直樹 | 高橋晃 | |
| 16 | 朋友～おかえり | 沖方丁 | 羽原信義 二瓶勇一 | 孫承希 | 山岡信一 前田明壽 |
| 17 | 生存～しかけ | 榎本明広 | 高見明男 松村拓哉 | ||
| 18 | 父親～おもいで | 菱川直樹 | 高橋晃 | ||
| 19 | 真矢～まなざし | うえだしげる | 近藤源一郎 松村拓哉 | ||
| 20 | 燈火～ともしび | 羽原久美子 羽原信義 | 孫承希 | 高見明男 | |
| 21 | 咲良～みらい | 大森英敏 | 菱川直樹 | 高橋晃 | |
| 22 | 守護～ちから | 二瓶勇一 | 山岡信一 前田明壽 | ||
| 23 | 劫掠～おとり | 榎本明広 | 高見明男 松村拓哉 | ||
| 24 | 対話～ミール | 菱川直樹 | 菊池聡延 汐見直 長谷部敦志 | ||
| 25 | 決戦～きょうせい | 榎本明広 | 高橋晃 | ||
| 26 | 蒼穹～そら | 羽原信義 鷲尾直広 | 羽原信義 | 羽原信義 山岡信一 前田明壽 | |
分集劇情
第1話【樂園◎開端】所羅門預言實現，菲斯特姆來襲，龍宮島的和平遭遇嚴重危機。皆城司令犧牲，能拯救大家的只有戰鬥。“總士，我們會到哪裡去”“樂園”總士的一句話使一騎從此踏上了駕駛法芙娜的征途……
第2話【告知◎生命】一騎在總士幫助下成功消滅菲斯特姆。然而一騎的身體卻因為駕駛法芙娜而發生了變化，潛藏的危機圍繞著一騎。戰鬥結束後無法歸來的人帶給生者巨大的傷痛，以一騎為首的一群少年和少女的命運也面臨著改變……
第3話【迷宮◎真相】生命是迷惘還是歡欣，人們都有自己的答案。繼一騎後有資質的少年和少女們也開始了戰鬥訓練。沉眠中的乙姬出現覺醒的先兆，給龍宮島的未來帶來未知的變數……
第4話【逃航◎出航】新國聯偵察機和菲斯特姆一同出現，龍宮島要如何應付？一騎不聽命令堅持救人使得龍宮島終於暴露在了新國聯的視線里。龍宮島的先進技術結晶引起了新國聯的覬覦……
第5話【約定◎誓約】一騎在遠處和菲斯特姆戰鬥，失去了法芙娜保護的龍宮島遭受到菲斯特姆的嚴重破壞。和一騎約定要保護好島嶼的翔子，決定戰鬥……
第6話【翔空◎犧牲】翔子為了遵守和一騎的約定不顧病弱的身體，毅然駕駛六號機和菲斯特姆戰鬥。然而不諳操作Fafner的她卻被菲斯特姆纏住無法脫身，她只好選擇與敵同歸於盡……
第7話【家賊◎親子】消失在天空中的少女，繼續戰鬥著的少年。露出憤怒的表情是大人們，然後留下淚水的也是大人們，大家感受到的不是戰鬥中生還的喜悅，而是必須犧牲某人的無奈，僅是承受這些就已經讓大家筋疲力盡……
第8話【執著◎甲洋】固執地認為是一騎和總士放棄了翔子的甲洋，奮力營救救生艇。在成功救援之後，迎接他的卻是菲斯特姆侵蝕心靈的同化……
第9話【同化◎分別】沉沒的法芙娜，似乎象徵著甲洋冰封的心，他是否將不再醒來？看著被同化後的他，大家不斷自責。只有總士，卻說出了冷酷的話。一騎忍不住問總士“對你來說，法芙娜和我們哪一個更重要？”“法芙娜”總士的回答讓他震驚……
第10話【分解◎錯過】感覺到總士似乎不再是他所熟悉的總士，一騎迷惘了。心的距離似乎難以逾越，一騎想要為總士做些什麼卻無從入手。而駕駛法芙娜之前的他有誰會記住么……
第11話【舊◎新人類軍】迷失方向的一騎聽從了狩谷由紀恵的安排，帶著法芙娜離開了島嶼。只是希望看見外面世界的他，沒想到迎接他的竟然是新國聯的監禁……
第12話【不在◎焦急】在戰鬥時，通過Fafner和Siegfried系統的同步，曾經多少次分享彼此的感受，痛苦和傷痕也是一騎和總士之間的一種強烈羈絆。然而，太想了解自己的一騎，是否已經忘記了總士的存在，甚至連如何能挽回都已弄不明白……
第13話【侵蝕◎異界體】“靠機器偷看別人的內心就算是了解么？”總士被真矢這樣質問，他是真的不了解一騎么，還是只是不善於表達。另一方面，新國聯的軍事基地遭到了Festum的狂襲，一騎是否能平安無事……
第14話【覺醒◎占領】新國聯軍隊來襲，乙姬覺醒後自己走出了島嶼的基地。而在新國聯基地為了讓一騎繼承迷失的意志，真壁茜將最新型的法芙娜交給了他……
第15話【記憶◎叫喊】一騎在戰鬥中面臨被Festum同化的危機，而執著想見總士的信念拯救了他。因為尋找一騎而去了新國聯的真矢在硝煙漸漸消退的戰場發現了一騎的身影……
第16話【朋友◎歡迎歸來】本已失去的龍宮島控制權，在乙姬幫助下重回大家手中。新國聯面對Festom的攻擊一籌莫展，一騎及時歸來為保護島嶼而戰……
第17話【生存◎手法】總士和一騎終於能夠坦白的面對彼此，曾經的隔膜消失。未來等待他們還是戰鬥……
第18話【父親◎回憶】真矢父親的造訪，使得真矢的未來發生巨變。即將步入戰鬥行列的她卻為此感到欣慰……
第19話【真矢◎視線】真矢瞳眸里映出的是名為戰爭的地方，第一次戰鬥的她意外地表現出色。一直失去意識的甲洋竟然醒了……
第20話【燈火◎靈火】因節日而熱鬧非凡的龍宮島由於甲洋的出現而蒙上了不安的色彩，曾經一起的夥伴們執意保護他不被射殺。終於，在總士技巧的幫助和一騎的努力下圓滿解決……
第21話【咲良◎未來】正在成為回憶的現在和正悄悄逝去的生命，在咲良措手不及的時候另一種形式的結束方式悄然來到。終於打敗一騎的劍司卻再也看不見心上人的微笑……
第22話【守護◎力量】失去的光芒，憤然挺身的心情，隨著咲良的倒下大家的命運再一次發生變化。一向怯懦的衛因為想要保護大家而變得無比堅強……
第23話【奪取◎誘餌】被奪走的力量，正被奪走的希望，厄運在大家還不適應的時候再一次降臨。“總士，總士~~~”眼睜睜看著總士被Festom帶走，一騎只能悲痛欲絕地呼喊……
第24話【對話◎星核】為了尋求人類和Festom共存的未來，真壁紅音、乙姬和真壁史彥在山頂對話。而一騎得知總士還活著的訊息後欣喜萬分。最終的決戰即將展開，一騎、真矢、劍司、卡諾相約帶著總士一起回來……
第25話【決戰◎共生】紅音找到了駕駛員不被同化的方法，就在大家為之慶賀的時候，史彥為大家帶來了兩個不好的訊息：一是一人出事，全員相位操作就會損壞；二是一人需要承擔所有人的痛苦。為了找到大氣圈之外的出口，史彥決定把這個計畫定為“蒼穹計畫”。而與此同時，乙姬也決定與島同化。作為主力先鋒的法芙娜隊，能不能在北極找到新的曙光……
第26話【蒼穹◎天空】人類和菲斯特姆的最終決戰終於到來，投身戰場的一騎和大家秉承著一定要活著回來的信念而戰鬥。乙姬為了龍宮島選擇了消失，然而在她消失的盡處又產生了新的生命。最終為人類贏得勝利的一騎卻失去了總士，即使緊緊抓住還是只能失去。“總士……我就在這裡……在這裡……等你……永遠……”一騎忍不住流下了眼淚，“只要你依然相信……有朝一日我定會回來……回到有你的地方……”蒼穹的盡頭傳來的是總士的聲音，一騎能夠等到總士的歸來么……
法芙娜
神劍型
龍宮島上的法夫那皆為此類型，設定上總共開發13機，小說版內容提及龍宮島製造12機，TV動畫版實際出場僅9機，直到劇場版HEAVEN AND EARTH中，才完整呈現出未曾登場之機體(9號西尾里奈、10號西尾暉、12號立上芹、13號羽佐間卡農、Zero西尾里奈+西尾暉共五架)。神劍型法芙娜部分於EXODUS中被改造成英靈型法芙娜。
全高約35米，利用駕駛員之身體及帶有Festum因子基因與機體結合，透過“尼伯龍根（Niebelungen，德文）系統”以精神控制進行操作。機體編號使用德文數字命名，以羅馬數字的方式漆於左膝以及背部：
（機體編號 駕駛員）：
MarkEin（初號機） ：皆城總士（於OVA中測試失敗）→日野道生（無印中因巨獸型嚴重受損無法使用，換乘MKEin，於MKNicht的戰鬥中為了保護島而自爆）
MarkZwei（二號機） ：藏前果林（OVA，TV中MKElf嚴重損壞，MKZwei被拆作MKElf的零件）
機體（圖源自貼吧MarkDrei（三號機） ：要咲良（無印，被同化）→卡農 梅芬斯（無印，因紅衣魔女嚴重損壞換乘MKDrei）→羽佐間卡農（劇場版初駕駛迎擊Festum）→要咲良（劇場版，治療好後重新駕駛法芙娜作戰）→要咲良（近藤咲良）（EXODUS，後被改造為英靈型）
MarkVier （四號機）：春日井甲洋（遭到同化，放棄機體，後被人類軍打撈提取核到MarkNicht)→ 春日井甲洋（劇場版因為機體內部沒有核，以核的身份再度出現並直接對機體發出控制信息，於釋放被MKNicht封印的MKSein時被MKNicht擊墜）→春日井甲洋（EXODUS，以人類形態駕駛，被改造為英靈型）
MarkFunf（五號機） ：小楯衛（脫出後駕駛艙受到MKNicht的攻擊波及，死亡）→堂馬廣登（劇場版）→堂馬廣登（EXODUS，被新國聯分解，核被提取作為MKRaison的核）
MarkSechs（六號機） ：羽佐間翔子（無印，自爆）
MarkSieben（七號機） ：遠見真矢（無印，劇場版，EXODUS，被改造為英靈型）
MarkAcht（八號機） ：近藤劍司（TV，劇場版，於EXODUS為搭載齊格飛系統的指揮官機，並被改造為英靈型）
MarkNeun（九號機） ：西尾里奈（劇場版，於EXODUS中被改造為英靈型）
MarkZehn（十號機） ：西尾暉（劇場版，EXODUS）
MarkElf（十一號機） ：真壁一騎（無印，初戰大破，用Zwei的零件修理，顏色與ZweI一樣編號不變。後被俘虜，核被提取到MarkSein)
MarkZwoelf（十二號機）：立上芹（劇場版，EXODUS中改造為英靈型）
MarkDreizehn（十三號機） ：羽佐間卡農（劇場版，EXODUS）→來主操（EXODUS， 搭載了卡農式引擎，但外觀沒有較大變化）
Zero Fafner （零式法芙娜）：西尾里奈+西尾暉（劇場版，EXODUS，抵抗mir時西尾暉被同化）→西尾里奈+鏑木彗（EXODUS）
MarkFunf改ツクヨミ（五號機改 月讀）：水鏡美三香（EXODUS，後被改造為英靈型）
MarkSechs改アマテラス（六號機改 天照）：鏑木彗（EXODUS，後被改造為英靈型）
MarkElf改スサノオ（十一號機改 須佐之男）：御門零央（EXODUS，後被改造為英靈型）
量產型
此類為新聯合國所生產之機型。
巨獸型(Megatherion Type)
紅衣魔女型(Babalon Type)
靈知型(Gnosis Type)
前兩者具有與亞爾維斯所擁有的“神劍型”相互抗衡的戰鬥力。
巨人型（Titan Model）：出現於OVA，只有4台。
救世主型
日野洋治，光弘巴特蘭，妙尼爾一起設計的法夫那（Raison為新國聯用留下的救世主型數據所設計），擁有同化機能，搭載的芬里爾系統的炸藥量也增加（此處為新聯合國所生產之終極機體，其技術水平遠優於亞爾維斯所生產之機體）
MarkSein（存在）：真壁一騎（無印，劇場版，EXODUS）
MarkNicht（無存）：狩谷由紀惠（無印，測試啟動時被伊登同化）→伊登（無印，最終boss，被MKSein封印）→來主操（劇場版，在星核的控制下於龍宮島戰鬥）→皆城總士（劇場版，EXODUS）
MarkRaison（因果）：遠見真矢（EXODUS，測試駕駛）→喬納森·光弘·巴特蘭（EXODUS）
已登場機體
截至EXODUS為止
•十三架神劍型Fafner(除1號6號啟動芬里爾、2號僅出現於前傳，其餘機體皆有在劇場版HEAVEN AND EARTH登場)，三架神劍型改，其中Drei，Vier，Sieben，Acht，Neun，Zwoelf，Funf改，Sechs改，Elf改已被改造為英靈型
•三架救世主型Fafner：Mark.Sein、Mark.Nicht、MarkRaison
•一架Zero.Fafner。
•四架Fafner Titan-model僅出現於前傳
名詞解釋
慶樹島：Fafner的格納庫，駕駛員的訓練地。
CDC：藍鯨系統，掌控島嶼一切情況的大型智慧型電腦。
burugiri部隊：空中迎擊部隊。
法芙娜十一號機：一騎駕駛的Fafner MarkElf的全稱。
雷擊槍：Fafner的武器。
Vaferraden：戰鬥時為保護建築物從地下升起隔壁的防禦機構。
Night helle：島上的各個fafner出擊口。
Nibelung：通過套上十個指環與fafner一體化。是令fafner啟動系統與人類的神經接續以及完成一體化的系統。
ArcadianProject（台譯：桃花源計畫）
在人類軍與Festum的戰鬥過程中，由日本獨自立案的計畫，其後由日本的倖存者執行。Arcadian指的是“樂園”。以“從Festum手中保護人類，且將文化和和平傳給下一代”為目的，主要內容為以下數點：
· 通過操作遺傳因子來發現協同代碼（SynergisticCode）
· 兒童的催眠學習（從小開始被無意識灌輸的各種知識）
· 對Festum兵器（包括法芙娜及其作業系統，以及芬里爾系統）的開發、製造
· 人工要塞島的建造
亞爾維斯（Alvis）
以龍宮島為據點，並以執行“ArcadianProject”為目標的組織。由龍宮島的大人以及發現被催眠學習的記憶的年輕人組成。而並未發現的人則繼續享受和平的日子。
此外，在龍宮島以外亦存在著複數因“ArcadianProject”而被製作出來的亞爾維斯，其中一處為第1季第7～9話的舞台。
法芙娜（Fafner）
由人類所制、用以對抗Festum的兵器。名稱來自法夫納，有著龍的意味。機體最大特徵是能防禦Festum的讀心能力。
本作中的法芙娜大致可分為亞爾維斯制及人類軍制。亞爾維斯制的法芙娜皆擁有核心，但因龍宮島只有少量核心的關係，機體無法大量生產。而人類軍則擁有複數種類的法芙娜且持續開發新的機體，但除救世主型外，其他的法芙娜皆沒有安裝核心。
尼伯龍根系統（ニーベルング・システム）
指環狀的操縱桿。法芙娜駕駛者需將兩手十指插入被紅色膠狀液體所覆蓋的十個指環中，以便與法芙娜進行精神同步。使用後手指會出現使用指環後的痕跡。名稱來自“尼伯龍根的指環”。
協同代碼（SynergisticCode）
法芙娜與駕駛員的精神連結時必須形成的一種大腦狀態。在駕駛神劍型法芙娜時至為重要。因為成人的代碼較難形成，以致大多數的法芙娜駕駛者必然是少男少女。
Festum因子/真壁因子（フェストム因子/マカベ因子）
亞爾維斯的兒童自出生其遺傳因子便含有Festum因子，其效果能使他們駕駛神劍型法芙娜。因其影響，部份人會出現天才綜合徵的徵兆。另一方面，Festum因子的植入伴隨著極大的危險，可能會出現Festum的同化現象。
因真壁一騎於第1季時前往人類軍基地協助開發法芙娜時，曾被提取基因製作的特效藥，而令該特效藥被命名為“真壁因子”。該特效藥能令不夠資質的人也能駕駛法芙娜。
龍宮島相關
龍宮島（竜宮島）
表面上是在日本外海的數個平常的島嶼。實際上是為了執行“ArcadianProject”而製作的人工要塞島的其中之一，內部的一切機能都由“星核”來操作。主機關為氘反應核融合爐，移動時會使用電磁推進系統。
島民原本都是日本人，島上人口大概2千人。在故事開始以前，Festum出現在日本造成國家滅亡，日後僅存的日本人全部移民到龍宮島上。日本這個國家已不存在（島嶼是否還存在不明）。Festum奪去日本人的生殖能力，島上的孩子幾乎全部是由人工子宮創造，然後分配給島上的居民扶養，因此有些小孩和雙親並沒有血緣關係。
島內星核為“瀨戶內海星核”，在與皆城乙姬同化後於島內的大氣中存在，並保護島上的環境。
於第2季“EXODUS”中被人類軍稱為“DIsland”。
防衛裝置
偽裝鏡面（偽裝鏡面）
以光學迷彩將龍宮島全島以球狀覆蓋的高度低可偵測性裝置。偽裝鏡面啟動後便無法在外部看見，而因音波及電磁波皆被遮斷的關係，其他人亦無法在外部完全把握島內的狀況。龍宮島平常會開啟裝置以避免被新聯合國和Festum發現。此外，裝置在開啟時會遮斷外部的景色，以致在裝置開啟時島內太陽的位置會與實際的不同，而島嶼周邊的風景亦是由偽裝鏡面所映照出的偽物。
裝置需要龐大的能量供給，而島嶼的偽裝鏡面防禦機構和WelleShield的並用會出現供電高負荷，因此在Festum來襲時會關閉偽裝鏡面。
WelleShield（ヴェルシールド）
覆蓋龍宮島全島的強力重力波屏障裝置。能遮斷及擴散除強力伽瑪射線以外的紅外線及電磁波。由於重力波具有波長，一旦波長被共嗚便會令屏障消失，因此重力波的波長會經常隨機變化。
由於同時使用偽裝鏡面和WelleShield會消耗巨大的能量，因此使用時只能二擇其一。
諾恩（ノルン）
小型無人機動兵器，於島上配備了大量。機體配備有光束炮與防護罩生成裝置支援法芙娜。
內部裝置
布倫希爾德系統（ブリュンヒルデ・システム）
主要統一島內防衛裝置的系統，不過亦會影響島上的其他系統，例如是航行系統。為對抗Festum的讀心能力而與皆城乙姫一體化，並由其控制。名稱來自“尼伯龍根的指環”中登場的女武神布倫希爾德。
女神的岩窟（ワルキューレの岩戸）
皆城乙姫所沉睡的人工子宮，是為了其能與布倫希爾德系統一體化而設的裝置，亦即是島的中樞。
所羅門（ソロモン）
能依靠雷達的反應來得知Festum等矽生命體接近，並判定其類別的系統。故事開始時，亞爾維斯的人皆稱系統的反應為“所羅門的預言（ソロモンの預言）”，其後便改稱為“所羅門出現反應”。
烏爾德之泉（ウルドの泉）
位於龍骨區域的液體型電腦。以往用作進行星核的分析，現時則用作所羅門系統的主伺服器。在蒼穹作戰時所獲得的與Festum共存的資料便是由此接收。
亞瑟之室（アーサーズ・ルーム）
正式名稱為“並列一體型亞瑟之室”。最初被建做為司令室，擁有特化戰略機能的構造，但其後因無法支援島的防衛系統及管理系統，以及系統的負荷增加，最終被封鎖。操作員會在圓桌型的控制台面板上進行操作。
在人類軍占領龍宮島、與Festum的戰鬥導致第一司令室崩壞之際，由皆城乙姫再次啟動。
尼德赫勒之門（ナイトヘーレの門）
法芙娜出擊的其中一個出口。機體會處於超空蝕效應的狀態，于海中高速射出。名稱來自“尼伯龍根的指環”中法夫納所守護的寶藏洞穴的名稱。
齊格飛系統（ジークフリード・システム）
皆城總士所操控、分離統括型全法芙娜指揮管理系統。名稱來自“尼伯龍根的指環”中登場的英雄齊格菲。
本體設於亞爾維斯內。在法芙娜與齊格菲系統同步的情況下，系統會展開思考防壁以防止被Festum讀心，而系統操作者與法芙娜的操縱者的腦部皮膜神經會被直接接續（交叉連線），系統操作者能憑藉此系統與法芙娜的操縱者進行精神交流與下達指令，並隨時準備提供武器等協助。但假若其中一架機體受到損傷，系統的操作者亦會同時受到傷害。
在系統無法使用時則是在法芙娜上裝備CrossingSystem，讓法芙娜的駕駛員彼此共享意識。但因為其中一架機體受損就會反饋給其他同步的駕駛員，外加技術因素影響，而直接限制成必須四機一組。
在EXODUS中由近藤劍司操控
畢業禮（卒業式）
與本來的意思不同，是龍宮島的其中一項風俗。以直系親屬的死亡為契機，解放在催眠學習時所獲得的情報，並為了令得知亞爾維斯的存在的少年少女們從事島嶼的防衛活動，而以中學畢業後離島的形式來讓他們加入亞爾維斯。由於在一年內的不同時段都會出現得知亞爾維斯的存在的年輕人，因此“畢業禮”會於一年內舉行數次。
在第1季中因Festum得知了島的存在並發動攻擊，使包括年輕人在內的全島民得知事實，因此而沒有再進行“畢業禮”。
蒼穹作戰（蒼穹作戦）
在人類軍實行“天堂之門作戰”後，由亞爾維斯獨自進行的作戰。與“天堂之門作戰”不同，此作戰是以真壁紅音的共鳴核開放以及奪回皆城總士為目的。
L計畫（L計畫，PlanL）
由生駒正幸所草擬，並於前傳“RIGHTOFLEFT”中實施的計畫，時間在第一季的一年前。由於當時龍宮島即將被異界體（Festum）發現，奈何島嶼尚未準備做好戰鬥準備，於是將島的一部份、亞爾維斯的左翼部份“L區域（Lボート）”分離，按照事前設定的航線並偽裝成龍宮島展開遠航，以引開向著本島而來的Festum。在作戰結束後，L區域會被放棄以及消滅。計畫的生還率被評估為很低。
計畫的成員由指揮官、操作員、機械師、醫生以及8名“FafnerTitan-model”駕駛者，合共40人組成。為防止被Festum讀心，計畫的參加者對計畫的內容一無所知。
作戰期為2個月，L區域會在航行期間分段打開船內被封鎖的區域並供應補給。在L區域內只有4部“FafnerTitan-model”並有8名駕駛者，即一部機體由兩人使用，在對抗Festum時共能使用15分鐘（因機體的操作時間限制為15分鐘，1人只能操作450秒，即7分30秒）。在計畫的最終階段便會打開收藏著可令全部成員逃生的潛艇的最後一個區域，且會啟動“芬里爾”系統。在故事最終，計畫的所有參加者皆陣亡，而在四個月後所發現的僚的錄音成為了重要的資料。
新聯合國相關
新聯合國（新國連）
於2115年時因聯合國本部崩壞而重新成立，設立並擁有軍隊“人類軍”，是人類之中最大的組織。於2116年（第1季的30年前）因瀨戶內海星核開始增殖，而在之後的一年命令人類軍使用核武器將日本連同星核一同破壞，使日本國土有80%因核攻擊而被消滅。現時則將ArcadianProject的內容視為問題，並打算奪取擁有強大力量的神劍型法芙娜而狙擊亞爾維斯。
於第1季尾部，為殲滅Festum而展開“天堂之門作戰”。
天堂之門作戰（ヘヴンズドア作戦）
由新聯合國的研究者光弘·巴特藍所草擬、以殲滅Festum為目的的戰鬥行動。作戰將人類軍的所有戰力分為兩份，針對北極星核及大氣圈外的小型星核同時進行攻擊，同時為了防止被Festum讀心，各支部隊需依靠獨自的判斷戰鬥。
交戰規定Alpha（交戦規定アルファ）
於第2季“EXODUS”中登場，由新聯合國總部所發出的戰鬥命令。規定需絕對嚴格遵守，即使是將軍級別的指揮官亦無法覆蓋命令。以殲滅Festum為最優先事項，即使在遍布友軍及平民的戰鬥地區亦會使用戰略武器。姑勿論是平民的避難，甚至是友軍要求時間撤退亦不會被理會，因此被認為是非人道的作戰。
Festum相關
星核（ミール）(Mir)
作為Festum的腦及中
樞的存在，高密度集積情報的光子結晶體。全宇宙存在著無數的星核，本來只是將知識記憶化的存在，會對吸收的情報有所反應的是非常罕見。於本編內只有北極星核及瀨戶內海星核登場。而在公式的設定內，在太古時代時有一顆其他系統的星核（超古代星核）來到地球，而其是使人類由類人猿進化至人的主要原因，後來因人類的大幅進化而極度縮小。之後與人類的染色體同化並共同遺傳，導致Festum能讀取人類內心。
北極星核（北極ミール）
於西元2114年飛往北極，製造了大量且統一遍布全地球的Festum，以“同化全地球的生命體”為目的的星核。在西元2113年從宇宙發出“你，在那裡嗎？”的問題，之後因接收到地球人類以電波信號所傳送的回答而飛往地球，且斷續地製造Festum並指派它們進行侵略。往各地派遣質問者（人面獅身型）並將每一個情報進行收集、解析及學習，然後送出作相應進化的新型Festum。最終派遣主宰型（伊敦）以間諜的形式潛入人類軍中樞。同時定期對龍宮島進行攻擊，以解析法芙娜。其後在發現齊格飛系統時命令伊敦奪取，並在之後由人類所發動的總攻擊中作王牌使用。在月球背面中擁有大量北極星核的分身（小型星核），而人類軍的“天堂之門作戰”便是為了摧毀此網路。
在“蒼穹作戰”時開始行動，外表如同一個巨大的金字塔，而核心則包覆其中，並不斷朝宇宙上升，企圖與外太空的Festum共同將地球完全覆蓋，但最後被一騎和真矢擊落。
第2季“EXODUS”中其碎片誕生阿薩謝爾型異界體。
瀨戶內海星核（瀬戸內海ミール）
於西元2085年被發現的星核，亦是令“日本內的所有生命體喪失受孕能力”的元兇。於瀨戶內海海底的巨大隕石坑被發現，在之後的研究中更出現了主張存在超古代星核，且人類進化的主因是星核的影響的學說。其後星核被分成三份，交由艾貝利希機關、日本自衛隊及國際能源研究公社（皆城鞘的娘家）保管，之後因回響進行大屠殺的Festum而開始增殖。在從錯誤中學習“死”的概念後，為了從死亡中保護日本內的所有生命，便發生了基因障礙，令國內的日本人全部失去生育能力。恐防污染會擴大的新聯合國最終對日本實施核攻擊，使日本列島被消滅。之後為進行研究而被皆城公藏回收星核的碎片。
現時龍宮島的核心所使用的是瀨戶內海星核的碎片，並溶入島內的空氣中繼續存在。在與乙姬完全一體化後理解“生命的生死循環”，其結果使弓子與道生有了一名自然受孕的孩子。
新星核（新ミール）
於劇場版登場。是在蒼穹作戰後所誕生的小型星核之一。本打算理解生命的循環，但由於新聯合國的攻擊而理解到痛楚和憎恨。之後因此星核的干涉，而誕生了Festum亞種及艾奧羅斯型等新型Festum。最後因第二次蒼穹作戰中與日野美羽的對話和來主操的要求而理解“生命的生死循環”並誕生出一個和類似人類的胚胎。
牽牛星（アルタイル，Altair）
第2季第3話中首現的星核。人類軍曾嘗試與其通訊但無結果，軍方認為有著妨礙人類通訊的存在——阿撒瀉勒型異界體——並相信若牽牛星抵達地球同阿撒瀉勒型異界體相會，人類將陷入更深的絕望之中。
異界體（フェストゥム，Festum）
身體超過99%由矽元素所構成的生命體。以將其他生物同化為目的而行動。存在著不同的種類。透過每個核心，全體Festum能共有由星核所發出的情報及意志。Festum擁有基本的固有意志，而沒有個體的概念。各個Festum只是將被視為“腦”的星核的命令進行具現化的“手足”，一旦核心部分被完全破壞便會死亡。
在Festum並未實體化前無法由任何現象觀察到它們的存在，而它們亦需要藉由實體化來接觸地球上的物體。實體化後外表呈現金色，具有各式能力。起初無法于海中活動，之後在進化後便能活動。
人面獅身型（スフィンクス型）
於第1話初次襲擊龍宮島的Festum的類型。劇中最常出現的一型。經常會詢問“你，在那裡嗎？”，回答“YES”的人會被同化，而回答“NO”的人則會被攻擊。主要以小型黑洞和觸手進行攻擊。此形態的Festum被稱為“A型種”。
人面獅身B型種（スフィンクスB型種）
於第2季“EXODUS”登場。與其他的人面獅身型不同，此型擁有健壯的四肢。可以連續發射小型黑洞，使用昴宿星團型（母體）的光學迷彩，以及製造與本體持有同樣能力但沒有核心的分身等多項能力。
人面獅身C型種（スフィンクスC型種）
比A型種更大，在巡航形態下能以高速進行戰鬥。已確認於宇宙空間活動。
人面獅身D型種（スフィンクスD型種）
與C型種同樣大型，長的頭部及手部為其特徵。
人面獅身E型種（スフィンクスE型種）
於劇場版登場。與C型種擁有同樣的外表，背部搭載了類似無軌道炸彈的物質，能使用作轟炸。
格倫戴爾型（グレンデル型）
以三足步行的小型種Festum。擁有大量個體，以群體出擊，在機動性上擁有優勢，通常進行入侵建築物等行動。但檻反，單體的戰鬥能力較低，即使被步槍擊中亦會死亡，因此大多數是以數量取勝而非質量。
昴宿星團型（母體）（プレアデス型（親））
第16話引導小型Festum襲擊龍宮島的Festum。與其他Festum相比，此種具有較高的戰鬥能力。外表酷似大型魚類，其眼睛能放出光線，且能生出昴宿星團型（子體）進行自殺攻擊，而本體則會隱藏起來。
昴宿星團型（子體）（プレアデス型（子））
小型Festum，由昴宿星團型（母體）大量製造。為奪取目標，會以自爆（同化）給予目標傷害。單體的破壞力等於被戰車破壞的程度，密集的子體破壞力會飛躍性地增加。
相關CD
印象曲《fly me to the sky》 主唱：angela
分為普通版及DVD版。其中普通版收錄了TV第15話的特殊ED《Proof》及其off vocal ver.
主題曲《Shangri-la》 主唱：angela
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原聲音樂集+Drama《FAFNER in the azure -NO WHERE-》
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角色歌單曲（均附DVD，內容為PV及聲優訪問）
石井真（真壁一騎）《Flugel》
喜安浩平（皆城總士）《terra》
松本真理香（遠見真矢）《azul》
OVA印象曲 《DEAD SET》 主唱：angela
OVA音樂集 《蒼穹のファフナー Right of Left Original soundtrack ~去り行くもの、受け続くものたちの記憶~》
OVA主題曲《 Peace of mind》主唱：angela
OVA插曲《果て無きモノローグ》（收錄於專輯《PRHYTHM》) 主唱：angela
Drama
《蒼穹のファフナー’ドラマCD 1 STAND BY ME》
《蒼穹のファフナー’ドラマCD 2 GONE/ARRIVE》
關聯年表
西元 事件
2085 在瀬戶內海的巨大隕石坑，武藏野帝都大學的芳村調查隊發現神秘的光子結晶體。光子結晶體被面定是智慧型生命，命名為瀨戶內海星核。
在宇宙生物學會發表之後，由日本政府直接負責分析工作。
2090 在瀨戶內海星核的經驗情報中，得知存在著許多高智慧型的生命體，為了抽取其中的科學技術，而展開尼貝海姆計畫。
2093 推測有超古代星核的存在，並且有學說主張這是人類進化的主因。
發現人類的染色體與星核的遺傳情報一致，不過這個事實遭到隱瞞，之後交由星核專屬研究機關艾貝利希接管。
2095 確定類似人猿之所以會進化成人類，是受到古代星核(光子結晶體)的影響。
也確認星核的情報已和人類的基因同化，並且一直遺傳到現代。
2098 瀨戶內海星核被分割成三份，分別由艾貝利希機關、日本自衛隊(JSDFY)研究機關、以及芳村研究財團「國際能源研究公社（'ERC）」保管。
2114 國際宇宙站「艾利亞2」失去聯繫，衛里軌道上的所有衛星被消滅、各國各設施機關的通訊網被斷絕、飛機等交通機關的被害程度擴大。
各自治團體向自衛隊申請災難救助。
巨大光子結晶體在北極降落、命名為北極海星核。
陸續出現異界體各國進入戰鬥狀態。
成為全世界規橫的戰備狀態。
在衛星軌道上的定點確認多數光子結晶體。
聯合國下令限期飛行超過七千公尺以上的高度。
2115 NATO軍被消滅 。
聯合國本部崩潰/歐洲·非洲戰線的指揮系統癱瘓 新聯合國在南非成立/人類軍成立（將殘存的部隊統一進行指揮）
2116 確認瀨戶內海星核開始增殖。
日本出生率急速下降。
日本政府宣布國內新生兒誕生數為零。
2117 確定因為瀨戶內海星核的影響，日本國內所有生物失去受孕能力。
艾貝利希機關確定可經由人工培養胎兒，並公開人工子宮設備。
2118 遭受異界體的攻擊，使得關東地區幾乎毀滅。
緊急召開世界安全保障會議，決議將日本連同星核一起破壞。
人類軍對日本實施核武攻擊，除了北海道部份區域及沖繩全部毀滅，
日本從此消失於世界上。
2119 艾貝利希機關、日本自衛軍、國際能源研究公杜的倖存者集合起來，首都遷至北海道旭川並重建日本政府。
日本開始進行桃花源計畫（Arcadian Project) ，真壁紅音編入日本自衛軍第二混編特種大隊。
2120 美利堅合眾國減亡。
各國軍隊與美軍及人類軍整合。
2121 日本以舊帶廣市為基地，開始在太平洋上建進巨大方舟。
麻木史彥編入日本自衛軍第二混編特種大隊，成為最前線的異界體對抗部隊。
2122 第一次F計畫實行，以西尾行美博士為中心，開始建造能與齊格飛系統一體化的原型法芙娜。
麻木史彥接受基本訓練後，繼入首席駕駛員真壁紅音的502站隊。
2123 各國分別進行自己的桃花源計畫（Arcadian Project)。
2125 載送法芙娜用的巨大潛水要塞艦完成，命名為亞爾維斯（Alvis）。
2126 於要塞艦上部建造人工島以供居住。
2127 開始選拔人工島的居民。
2128 開始讓居民住進人工島，島嶼命名為龍宮島。
2129 北海道遭受異界體攻擊而被破壞殆盡。
2130 異界體與龍宮島爆發海戰。
2131 真壁一騎誕生
日本自衛隊於北部的殘存部隊被消滅，組織形態縮小為亞爾維斯防衛隊。
2132 原型法芙娜通稱零式法芙娜（全高100m)啟動實驗失敗
測試駕駛員西尾巧（西尾行美的兒子·里奈的父親）死亡。
西尾行美退出計畫，之後的研究由光弘·巴特藍接掌。
2133 偽裝鏡面產生裝置完成。
皆城鞘死亡、真壁紅音被同化。
放棄將零式法芙娜用作戰鬥兵器，改裝為亞爾維斯的輔助系統。
(從水中展望室看見的巨大柱子便是零式的水平穩定裝置)
2134 偽裝鏡面展開的同時，亞爾維斯的戰鬥可能性也降低，因此亞爾維斯移動至南半球。
與齊格飛系較分離的法芙娜——神劍型法芙娜設計完成。
2135 在龍官島中學內設定駕駛員培育用的催眠系統。
2136 神劍型法芙娜第一次啟動實驗成功。
2137 確認免疫力可抵抗同化。
異界體的思念波進入龍宮島，孩子們予以回應。
2138 神劍型法芙娜第二次啟動實驗成功。
光弘·巴特蘭離開龍宮島。
2139 歐洲·北非戰線進入膠著狀態。
2140 神劍型芙娜第三次啟動實驗成功，進入實用階段。
2141 日野洋治、曰野道生離開龍宮島。
卡農·梅芬絲（9歲）在都柏林被新聯合國人類特戰旅 (NUNFF )所屬隊員日野道生（19歲）拾獲。
2144 神劍型法芙娜MarkⅠ、MarkⅡ編入實戰部隊。
2145 MarkⅢ駕駛員在M訓練時因意外喪生。
2146 人面獅身型異界體來襲。
