位置境域
菜子湖菜子湖，為桐城與樅陽共有水域，桐城占該湖水面的絕大部分。東西長22公里，南北平均寬約8公里。供水河流主要為大沙河。湖底海拔8米。相應水位14米時，水面積為225.35平方公里，平均水深4.3米，容水量9.26億立方米。1956、1967、1968年，該湖曾因大旱乾涸。
白兔湖，亦為桐城與樅陽共有水域。南北長16公里，東西寬4至5公里，過松山後與菜子湖水面相接。湖底海拔9米。相應水位14米時，水面積60平方公里，平均水深3.6米，容水量2.16億立方米。
嬉子湖，與白兔湖隔2至3公里寬的丘崗。湖面狹長，南北長14公里，東西寬2至3公里。湖底海拔9.5米。相應水位14米時，水面積33平方公里，平均水深3米，容水量約1億立方米。
主要支流
入湖河流
菜子湖嬉子湖的支流龍眠河，又名金神河，源自桐城縣的龍眠山，上有汪洋、鏡主廟兩個小水庫，自北向南經桐城縣縣城、金神至高墩入嬉子湖，長17.5公里。龍眠河1975年以前是桐城縣物資運輸的主要航線，20噸級船泊自桐城經嬉子湖直抵長江，從1958年起河道泥沙淤積嚴重，水源受上游水庫控制，金神以上河道每年都有4個月的時間處於乾涸狀態，現已不能通航。
掛車河，是嬉子湖最大的一條入湖河流，源自桐城縣范羅山，從北西流向東南，自牯牛背水庫經黃甲、掛鎮、許家渡，至許家嘴入嬉子湖，全長26公里，由於上游水土流失嚴重，中下遊河道逐漸淤高；同時牯牛背水庫經童鋪——新安——雙鋪引水渠道得以灌溉農田，因此掛車河每遇旱季已成為乾涸河道，沙灘外露。
孔城河，源自廬江縣西南部的金寨山，由北向南，自朱山沖水庫經孔城，至黃溝匯入白兔湖，全長44公里。據《桐城縣誌》載，明清時期，該河水運興旺，桐城、舒城、六安以及沿江各地均來孔城經商，進出口物資可用船排轉載接運。但自50年代以來，上游水土流失嚴重，河床淤高，河水難以滿足通航要求。
大沙河，是流入菜子湖最大的一條河流。上游水土流失極為嚴重，輸沙量每年都在增長，中下遊河段滿河泥沙，散灘密布，一遇洪水，支流頻繁改道，雨後即洪，晴天即旱，旱澇交替周期之短，居全省河流首位。據測算，現河床和已輸入菜子湖的泥沙儲量有0.7～1.0億立方米，每年淤積量在100～120萬立方米之間，民國22年（1933年）黃沙外運量僅3000噸，1984年已達20萬噸。沙害已成為旱、澇災同時的另一種自然災害。
高河，系菜子湖流域的一支流，起源於石鏡鄉的獨秀山北麓，沿途與楓林河、查灣河、泉水河等支流匯合，統入三鴉寺湖，再經馬踏石出口，入人形河匯入菜子湖，全長15公里，總流域面積176平方公里。高河鎮境內的河畈區歷史上河道彎曲，水系紊亂，兩岸多為隨潮田，俗有十年九不收之稱。1975年冬對該河進行了綜合治理，對高河大橋上(雙河口)至三鴉寺湖口9公里的乾河，在老河的基礎上裁彎取直，兩岸立堤，形成南北兩大圩(南圩萬畝)。河道按20年一遇洪水設計(現只達10年一遇)，河寬80～100米，縱坡1/10000，河底高程11.5～12.5米。堤頂高程17.0～18.0米，泄洪流量420立方米/秒。
下遊河流
長河，在樅陽縣境內，承菜子湖水，自鐵羅衝口至城關鎮，全長16.5公里，流域面積370.54平方公里。汛期流量472立方米/秒，經樅陽閘入江。
水文水質
水文特徵
菜子湖區的湖盆呈南北向傾斜，北高南低，嬉子湖湖底高程8.5～9.0米。菜子湖的水位在樅陽閘建成的前後有很大變化。1959年樅陽閘未建成之前，以1954年8月1日出現的17.96米水位為最高水位，一般的高水位14.50米，相應的湖水面積220平方公里；最低水位8.38米（1958年2月24日），相應湖水面積只有7.0平方公里可見菜子湖在未建樅陽閘之前湖面積的變化幅度是很大的，達33倍。多年平均水位多在11.0米，湖水面積176.5平方公里。從1959年樅陽閘建成之後，人工控制水位，最高水位是1980年8月26日的15.63米，湖水面積為225平方米。最低水位是1962年3月27日的8.37米，湖水面積僅5平方公里（7500畝），冬季湖底基本裸露，多年平均水位為10.63米，湖水面積160平方公里，蓄水量1.5億立方米。
樅陽閘的建設，有利於沿湖的圍墾。從1959年以來，已圍墾76.63平方公里，其中桐城縣圍墾49.89平方公里，樅陽縣圍墾23.74平方公里。圍湖造田已使菜子湖失去原來三分之一的水域。
水質特徵
菜子湖湖水的化學成份營養成份比較豐富，矽酸鹽5毫克/升，硝酸鹽0.08毫克/升，氨氮7毫克/升，總鐵0.54毫克/升，總鹼度48.7毫克/升，總硬度0.74毫克當量/升，鈣11.75毫克/升，PH值5.5～7，偏酸性，透明度51厘米。湖中氨氮偏高。
浮游植物平均20.08萬個/升，以硅藻和綠藻為優勢種群，兩者占種群總量的88.76%。
浮遊動物平均12236個/升，生物量平均0.021克/升，以原生動物的砂殼種為優勢種群，枝角類中的鼻蚤，橈足類的劍水蚤占絕對優勢。
底棲動物每平方米平均85個，重164.1克，含218.8斤/畝，以河蜆占絕對優勢，為總重量63%，合每畝138斤，其次為背角無齒蚌占13%，紋沼螺占11.6%，淡水殼菜占10%。
水生維管束植物，由於菜子湖的水位變化大，冬季湖底基本裸露，各年度的豐水季節水位差也很大，一般在3～4米，因此水生植物的生長受到很大影響。一般水位高於15.0米的年份，水面上難見有水生植物；水位在12～13米時，水生植物覆蓋度可達50%，以苦草、馬來眼子菜、輪葉黑藻為主。
水利概況
圩堤建設
菜子湖防洪閘門
1958年，桐城縣與樅陽縣聯合成立江堤興修指揮部，在菜子湖通江孔道白鶴峰興建大型節制閘——樅陽閘，次年8月竣工。閘身為條塊石拱頂結構，10孔，單孔淨寬4.5米，孔高5.3米，閘身長20米，閘底高程6.7米，閘頂高程19.3米。每孔均設有平面鋼閘門，由手搖、電動兩用卷揚式20噸啟閉機控制。閘上有公路橋溝通東西大堤。該閘控制菜子湖水系面積3960平方公里。設計長江水位17.02米，菜子湖水位13.42米，最大水位差3.60米，最大過閘流量1150立方米/秒。汛期控制江水倒灌，使18萬畝農田免受江水漫淹。長江水位低於內湖水位時，可泄洪排澇，有效面積10.7萬畝。乾旱年份，可控制湖水外泄或引江水入湖，有效灌溉面積5.7萬畝。
漁業生產
菜子湖樅陽閘的興建是影響菜子湖魚類資源的變化的重要原因。菜子湖是通江湖泊，冬季基本乾涸，鯉、鯽等定居性魚類難以形成優勢種群，洄游和半洄游性魚類在湖內占優勢。因此樅陽閘建成後切斷洄游和半洄游性魚類的通道，使全湖魚產量急劇下降。建閘後，每年1～8月份閘門的啟閉與湖內魚產量又有密切聯繫，1977年6月16日至7月17日，湖水位10.66米，江水位12.52米，因沿湖抗旱，開閘31天，江水倒灌，漁民曾一網捕2寸全長的鰣魚幼魚30斤。沿湖圍墾76.63平方公里，使全湖10餘處近10萬畝的產卵場所受到破壞。此外濫捕酷撈，掠奪性捕撈方法以及血吸蟲投藥過多（100噸以上）毒死大量產卵親魚等，都直接影響到魚產量的升降。
湖岸生態
菜子湖周邊形成的濕地，吸引了白頭鶴、東方白鸛、白鷺、鴻雁等眾多侯鳥和留鳥在此棲息，其中白頭鶴已被列為國家一級重點保護野生動物，在菜子湖越冬的白頭鶴數量約占全球該物種種群數量的3%。被列為IUCN瀕危物種東方白鸛，全球分布數量僅為3000隻左右，在菜子湖越冬的種群數量約占全球該物種數量的5%。在菜子湖分布的白琵鷺、鴻雁的數量分別約占全球該物種數量的19%和13%。此外，菜子湖還是內陸湖泊中黑腹濱鷸重要遷徒和越冬地。
