能源微生物功能基因組的整合分析資料庫

本資料庫系統是中國科學院青島生物能源與過程研究所為解決工業化利用能源微生物作為可再生生物質能源資源所面臨的科學問題,針對微藻等能源生物,而建立的一個允許協同分析與注釋,整合基因組、轉錄物組、蛋白組、代謝物組、相互作用組學等功能基因組學數據的信息系統。 基因與轉錄物信息平台中的基因數據來源於青島生物能源與過程研究所生物資源中心基因測序原始數據,以及基因序列分析過程中產生的中間數據,目前已收錄一個物種(Nann ochloropsis)的部分原始基因測序數據,約300GB;蛋白質與代謝物信息平台中的代謝物數據來源於中國科學院青島生物能源與過程研究所代謝物組學團隊通過實驗所獲得的各類標準譜數據,以及對其他資料庫中的信息二次加工所獲得的數據,約收集了超過2萬個小分子代謝物信息,包括別名,化學結構,涉及的生物學物種和代謝途徑等。

本資料庫系統是中國科學院青島生物能源與過程研究所為解決工業化利用能源微生物作為可再生生物質能源資源所面臨的科學問題,針對微藻等能源生物,而建立的一個允許協同分析與注釋,整合基因組、轉錄物組、蛋白組、代謝物組、相互作用組學等功能基因組學數據的信息系統。自2009年10月開始上線服務。本資料庫系統包含基因與轉錄物信息平台和蛋白質與代謝物信息平台兩個子庫。基因與轉錄物信息平台中的基因數據來源於青島生物能源與過程研究所生物資源中心基因測序原始數據,以及基因序列分析過程中產生的中間數據,目前已收錄一個物種(Nannochloropsis)的部分原始基因測序數據,約300GB;蛋白質與代謝物信息平台中的代謝物數據來源於中國科學院青島生物能源與過程研究所代謝物組學團隊通過實驗所獲得的各類標準譜數據,以及對其他資料庫中的信息二次加工所獲得的數據,約收集了超過2萬個小分子代謝物信息,包括別名,化學結構,涉及的生物學物種和代謝途徑等。

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