歷史
據歷史記載，公元832年Athelstaneford附近發生了的一場戰役，這場戰役促使人們開始把聖安德魯十字旗作為蘇格蘭的國旗。在 阿爾巴國王安格斯·麥克·費格斯(Angus mac Fergus)的帶領下，皮克特和蘇格蘭聯軍入侵了 諾森伯里亞人的領地洛錫安區。在這場戰役中，安格斯的軍隊被人數更多的 盎格魯和薩克遜人的軍隊所包圍並面臨著失敗的危險，無奈 中國王讓僧侶祈求神意。不久，當安格斯在湛藍的天空中看到了如同聖安德魯十字般的景象時，他相信這是神給他的旨意。於是國王當即發誓，如果聖安德魯幫助他獲得勝利，那么從此以後聖安德魯將成為蘇格蘭的保護神，而他的十字將成為蘇格蘭的國旗。安格斯真的獲得了勝利，而聖安德魯十字旗也理所應當地成為了蘇格蘭的國旗。
無論是否是神意，14世紀時聖安德魯十字旗已經被廣泛使用，不過並非固定用藍色做底色。實際上，到16世紀時，藍底白十字的聖安德魯十字旗才最終成形。在整個17世紀，尤其是在陸軍和海軍中，聖安德魯十字旗一直是國家的象徵，在 英國統一時它還被加進了聯合王國的國旗。
儘管如此，1707年國會決定放棄使用聖安德魯十字旗，而且直到20世紀後半期，它才被重新使用。現在，它重新成為法定的 蘇格蘭國旗，在國際比賽中所有的蘇格蘭參賽隊都使用它，而且大部份公共建築前的旗桿上也飄揚著該旗，有時獨自懸掛，有時與聯合王國國旗共同飄揚。由於設計簡潔，許多私人和 公共團體也將它作為企業標識的元素。
色調
2003年，蘇格蘭的官員們規定了旗桿的顏色，並明確了聖安德魯十字藍的具體色調。自此以後，藍色要求以國際色彩標準體系中Pantone300為準，白色的聖安德魯十字映襯其上。儘管如此，該標準仍非強制性要求，聖安德魯十字旗可以繼續以各種各樣的色彩作為底色。
紀念館
1997年，在Athelstaneford教堂旁邊一座修復後的小樓里開了一個聖安德魯十字旗的紀念中心，在這裡，人們可以了解更多關於聖安德魯十字旗的知識，甚至可以從一個短小的視聽片斷中去了解它的由來。這一紀念中心在四月到九月的每天上午十點到下午五點免費對遊人開放。紀念館自1965年開館來，一直鼓勵人們去參觀。聖安德魯十字旗永遠在紀念館上空迎風招展，即使是在夜晚中它也會在燈光中繼續飄揚。
