利用誘發突變所產生的有用性狀所進行的育種。突變育種就植物來說特別是瑞典在這方面進行了廣泛的研究。誘變所用的誘變劑主要為射線,即X射線和磷、鈷等放射性同位素以及Y射線和中子等,也有人使用作用類似射線的化學物質來進行誘變育種,其中對X射線作用曾進行了大量的研究。用鈷放射性同位素作為誘變劑時,在中心處裝置著放射性同位素鈷的特殊田間裡種植植物,就可長期地進行照射,這種田間稱為γ射線田間。誘變處理的方法也是多種多樣的,多數為處理種子,由於帶有被誘發出來的突變的細胞表現為嵌合體型,而且大部分突變是隱性的,為了有效的選擇這種變異,需要設計一定的育種方案。突變產生的大部分性狀是白化、矮小、細葉、不育等沒有實用價值的性狀,但在許多作物中比較容易得到早熟和短稈突變型。在水稻、大麥、花生中已育出了具有短稈、高產、抗病等有用性狀的品種。另一方面,動物育種,在利用相互移位的染色體突變是可能鑑別幼蠶雌雄性別的一個特殊的著名的例子。
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