2012年10月22日上午，秦萬軍在滬寧高速公路收費站入口匝道處處理一起事故中，被一輛蘇ECP250大型貨車從京滬高速往上海方向行駛時，遇前方情況採取制動過程中車輛右後側撞到正在正常勘察現場的秦萬軍身體，造成秦萬軍倒地受重傷，經醫院搶救無效於10時05分因公犧牲，年僅42歲。
多年來，秦萬軍無論是戰鬥在部隊邊防線上還是公安交通管理第一線，時時處處以自己的實際行動為黨旗和警徽增添光彩，他腳踏實地的勤奮工作、嚴謹細緻的工作作風、無私奉獻的敬業精神給戰友同事們留下了寶貴的財富。
作為黨員，他是一名優秀共產黨員，懷有遠大的抱負，對工作充滿激情，同志們稱他乾工作是“拚命三郎”。無論是烈日炎炎的夏天，還是大雪紛飛的隆冬，他冒酷暑、戰嚴寒，總是堅守在崗位上。他說，作為黨員在工作最困難時、環境最艱苦時、人民最需要時，都要衝鋒在前。他是這樣說的也是這樣做的。
作為警察，他是人民的好警察，始終堅持“立警為公、執法為民”，他對人民充滿了熱情，始終把人民的利益放在首位。在事故處理時，遇到脾氣暴躁和年老長者，他總是送上清茶，和風細雨地講法明理；在處理交通事故時，他總是第一時間到達，勘察現場、搶救傷員，從不怕苦怕髒；遇到高速公路有困難的民眾，他二話不說幫助送到車站，並主動墊付資金購買車票。
秦萬軍從警以來，十年如一日，工作兢兢業業、任勞任怨，舍小家顧大家，直至犧牲的最後一刻，他仍堅持幫助同事忙碌地處理著最後一起交通事故，充分體現了一名共產黨員、人民警察忠於黨、忠於人民、忠於法律的優秀思想品格。
