規划走向
6號線起於潘墩站，該站位於潘墩路、林浦路交叉口，設站前單渡線、站後折返線。
線路出站後向東，沿林浦路行至原福泉高速公路收費口，於福泉連線線北半幅設林浦站，與軌道交通4號線同台換乘。結合北側地塊建設綜合交通樞紐。
線路沿福泉連線線東行至現狀蘆岐村附近設蘆岐站，站後設出入線接軌樟嵐停車場。然後線路繼續沿福泉連線線東行，至現狀梁厝村南側設梁厝站，與1 號線同台換乘。1、6 號線四線並行至下洋村設下洋站，與1 號線平行站廳換乘，車站北端設兩股道停車線，並與1 號線設聯絡線。
線路出站後下穿東部新城規劃軸線河道，過三江路後設峒口，之後上坡接道慶洲大橋。跨烏龍江段本線與道慶洲大橋共建（本項目不含道慶洲大橋土建部分）。共建段長約4.7km，橋樑採用分層布置，上層為道路路面，下層為軌交通道。過烏龍江後繼續結合大橋沿203省道敷設，隨後跨瀋海高速、三汊港，於省道S203、瀛洲路口東側設營前站，站台東側設單股道停車線，與規劃軌道交通9號線“L”型通道換乘。
線路繼續沿省道S203路中敷設，經長安路、長限村後於長樂環島設航城站。
之後繼續沿鄭和路東行，至奎橋路口設十洋站。
線路向東南轉向，至東鶴路、鰲山路口設鰲頭站。
出站後線路進入濱海新城，下穿嚴義山後至鶴梅線設鶴上站，站台東側設停車線。
線路過省道S203進入濱海新城，設沙京站、蓮花站、濱海新區站、壺井站、萬壽站，其中蓮花站西端設出入線接軌橫港車輛段，中間風井出一根八字線接軌橫港車輛段；萬壽站與規劃軌道交通7號線節點換乘，站台東側設兩股道折返線，線路轉向東北進入漳江大道走行，漳江大道上設尚遷站。
繼續沿漳江大道北行，於機場高速南側新塘埔附近設漳港站。
線路穿越機場高速路基段，轉至省道S201向東走行，再次向北轉向，沿機場高速北側轉入機場進場路，沿進場路西側綠化隔離帶走行，區間避讓規划進場路下立交，至T1 樓現狀停車場下設機場站，為全線終點站，站前設單渡線，站後設四股道折返線兼停車線，與遠期機場城際線換乘。
2018年7月19日，據市發改委本次發布的訊息，6號線東調段主要位於濱海CBD地區，西起在建萬壽站，沿途設花亭站、濱海CBD站、沙尾站、金濱路站、國際學校站。線路出站後沿規劃道慶路道路直行，至規劃道路交叉口設濱海北站，為地下二層車站，與規劃12號線通道換乘。線路出站後南拐至東西向規劃道路，並始終沿該規劃路直至終點。
東調段工程線路全長約5.29km，採用地下線敷設方式，設車站6座（含換乘站3座），平均站間距0.93km。最大站間距為1.51km（金濱路至國際學校站），最小站間距為0.60km（濱海CBD站至沙尾站）。
線路情況
車站列表
福州捷運6號線一期（潘墩—萬壽）沿線共設16個站點，車站最大站間距為6.427千米，最小站間距為0.628千米，平均站間距1.673千米，線路敷設方式為15座地下站和1個高架站。
| 車站名稱 | 車站類型 | 所屬區域 | 可換乘線路 |
| 潘墩 Pandun | 地下二層島式車站 | 倉山區 | 不適用 |
| 林浦 Linpu | 福州捷運4號線 （未開通） | ||
| 蘆岐 Luqi | 不適用 | ||
| 梁厝 Liangcuo | 地下二層雙島式車站 | 福州捷運1號線二期 （未開通） | |
| 下洋 Xiayang | 地下二層島式車站 | 福州捷運1號線二期 （未開通） | |
| 營前 Yingqian | 高架四層島式車站 | 長樂區 | 福州捷運9號線 （遠期規劃） |
| 航城 Hangcheng | 地下二層島式車站 | 不適用 | |
| 鄭和 Zhenghe | 福州捷運8號線 （遠期規劃） | ||
| 十洋 Shiyang | 不適用 | ||
| 鰲頭 Aotou | 不適用 | ||
| 鶴上 Heshang | 地下三層島式車站 | 不適用 | |
| 沙京 Shajing | 地下二層島式車站 | 不適用 | |
| 蓮花 Lianhua | 不適用 | ||
| 濱海新區 Binhai NewDistrict | 不適用 | ||
| 壺井 Hujing | 不適用 | ||
| 萬壽 Wanshou | 福州捷運7號線 （遠期規劃） |
東調段工程線路全長約5.29千米，採用地下線敷設方式，設車站6座（含換乘站3座），平均站間距0.93千米。最大站間距為1.51千米，最小站間距為0.60千米。
| 車站名稱 | 車站類型 | 所屬區域 | 可換乘線路 |
| 濱海北 Binhaibei | 地下二層島式車站 | 長樂區 | 福州捷運12號線 （遠期規劃） |
| 花亭 Huating | 不適用 | ||
| 濱海CBD Binhai CBD | 地下三層島式車站 | 福州捷運濱海快線 （遠期規劃） | |
| 沙尾 Shawei | 地下二層島式車站 | 不適用 | |
| 金濱路 Jinbin Road | 福州捷運12號線 （遠期規劃） | ||
| 國際學校 International School | 不適用 |
福州軌道交通6號線