矽質骨針是由氧化矽、錳、磷、鐵、鋁、鈉、鉀等構成，海綿質是由蛋白質構成的不溶性物質，具抗蛋白水解酶的特性。在角骨海綿的海綿質中，含有碘化合物。呈塊狀。骨針矽質，針與針間借海綿質(一種類似蠶絲的物質)互相粘著；某些種類的骨針包裹在海綿質內，另一些種類的骨針已全部消失，只有海綿質的纖維錯綜交叉構成網狀的骨胳。海綿動物骨骼
海綿動物除了個別的科沒有骨骼之外，其他所有的種類都是具有骨骼的，骨骼是海綿動物的一個典型特徵，是用以分類的重要依據之一。海綿動物的骨骼有骨針及海綿絲兩種類型，它們或散布在中膠層內，或突出到體表，或構成網架狀。骨骼具有支持及保護身體的功能。骨針的成分或是由碳酸鈣組成鈣質骨針，或是由SiO2·Nh2O組成矽質骨針，其中還都可能包括微量的銅、鎂、鋅等離子。骨針按其大小又可分為大骨針，構成支持身體的骨架；及小骨針，它散布在中膠層內，以支持體壁中的管道部分。小骨針僅存在於矽質海綿中。
從形態上骨針可以分為多種，其中常見的有：
單軸骨針：即沿一個軸生長形成的骨針，軸或直或彎，軸的兩端或相似或不相似，末端或尖或具有其他改變；
四軸骨針：也稱四放骨針，這種骨針在一個平面上有四個放射端，但常因丟失一些放射端而變成三放、二放或一放型，三放骨針是鈣質海綿綱動物中最普通的一種骨骼；
三軸骨針：它的三個軸相互以直角癒合，因而呈六放型），這種也常減少末端而改變放數，其末端可以彎曲、分枝、或具鈞、具結等變化而形成了多種形態；
多軸骨針：由中心向外伸出多射，形成星壯，這種類型多見於小骨針。不同種的海綿，各種骨針或彼此分離，或按一定結構形成疏鬆的或堅實的網架以支持身體，因此可根據骨針的類型、數量及排列而作為海綿動物分類的依據。
海綿絲
是一種纖維狀骨骼，它是由硬蛋白組成，它們或單獨的存在於海綿動物體壁內，或與矽質骨針同時存在。許多小的矽質骨針埋在海綿絲中，形成有效地支持物。許多大型群體海綿常同時存在著這兩種骨骼。海綿動物的骨針及海綿絲都是由中膠層中的變形細胞特化形成的造骨細胞所形成。單軸的鈣質骨針是由一個造骨細胞分泌形成，骨針形成時，造骨細胞核先分裂，並在雙核細胞的中心出現一個有機質的細絲，然後圍繞這一細絲沉積碳酸鈣，隨著骨針的逐漸增長，雙核細胞也分成兩個細胞，並分別加長骨針的兩端，最後形成一個單軸骨針。同樣，三軸骨針是由三個造骨細胞聚集在一起，每個細胞也隨著有機質細絲的形成而分裂一次，形成六個細胞，碳酸鈣圍繞有機質細絲沉積癒合的結果形成了一個三軸型骨針。海綿絲是由許多造骨細胞聯合形成，先是由少數細胞形成分離的小段，然後再癒合成長的海綿絲。在尋常海綿綱動物中，這些海綿絲再相互聯結形成網狀骨架。
