藻體的形態結構
真核藻類的生活史----合子減數分裂（核相交替）形態：單細胞、各式群體、絲狀體、葉狀體、管狀體
大小：幾個微米——幾米(海帶)——百米(巨藻)
結構簡單，無明顯組織分化
少數種類有表皮層、皮層和髓的分化，如海帶
植物體通常稱為原植體(thallus)
細胞結構
真核藻類的生活史----配子減數分裂（核相交替）細胞壁：大多數具細胞壁，僅隱藻、裸藻、多數金藻無
細胞核：均具真核，有核膜、核仁，出現染色體
細胞器：具質體、線粒體、內質網、高爾基體、液泡等
光合器(載色體)：杯、盤、帶、星、塊、網狀等多種形態；綠藻和輪藻形成簡單的基粒，其餘藻類不形成基粒
光合色素：①葉綠素類：葉綠素a、b、c、d4種；
②類胡蘿蔔素類：5種胡蘿蔔素和多種葉黃素
③藻膽素類：紅藻、隱藻和甲藻中含藻膽素
葉綠體：含葉綠素a、b，呈綠色的光合器
色素體：含葉綠素c或d，呈褐、黃褐或紫紅色的光合器
生殖結構
單細胞（單室）
多細胞(多室)孢子囊或配子囊，無不育細胞壁層
藏精器和藏卵器（輪藻），有不育細胞壁層
鞭毛和眼點
除紅藻門外真核藻類的營養體或生殖細胞多具鞭毛
鞭毛的結構均為(9+2)型模式
尾鞭型鞭毛：鞭毛表面光滑
茸鞭型鞭毛：鞭毛表面有很多橫生的纖細茸毛
眼點：遊動細胞的光感受器，圓形或橢圓形，由類嗜鋨脂滴組成
繁殖
營養繁殖：細胞分裂、藻體斷離、繁殖小枝
無性生殖：產生無性孢子—遊動孢子、不動孢子等
有性生殖：①同配生殖
②異配生殖
③卵式生殖
合子或受精卵脫離母體，產生新藻體
合子或受精卵不發育成胚
真核藻類的生活史
合子減數分裂：合子萌發時進行減數分裂，具核相交替（圖9-1）
配子減數分裂：形成配子時進行減數分裂，具核相交替（圖9-2）
孢子減數分裂：形成孢子時進行減數分裂（圖9-3）
有孢子體和配子體兩種植物體，即具世代交替
同形世代交替；孢子體和配子體外形相似
異形世代交替：配子體和孢子體在外形上不同
生境與分布
真核藻類的生活史----孢子減數分裂（世代交替）絕大多數真核藻類生於淡水、海水、鹹淡水等各種水體中
也有生於潮濕的土表、岩面、樹皮、牆壁等處
有的種類生於高山積雪上，也有的與真菌等生物共生
生活型：浮游、附著、固著、底棲
主要門類及其分門依據
真核藻類通常分為10個門，即隱藻門、甲藻門、金藻門、黃藻門、硅藻門、褐藻門、紅藻門、裸藻門、綠藻門和輪藻門。
真核藻類的分門依據：
藻體的形態
細胞壁的成分和結構
光合器的結構和光合色素的種類
貯藏的光合產物
鞭毛的類型、數目和著生位置
生殖方式
生活史
綠藻門和輪藻門
綠藻門
8600餘種，分布廣
藻體：單細胞、群體、絲狀體、葉狀體、管狀體等
細胞壁由纖維素構成
含葉綠素a、b，葉綠體中有一至多個蛋白核
儲藏物質主要為澱粉
少數種類的營養體和多數種類的孢子或配子多具2條或4條頂生等長的鞭毛，少數1、8或多條，尾鞭型
90%分布於淡水或潮濕土表等處，10%海產
輪藻門
多細胞具分枝：主枝、短枝、刺狀突起，有假根固定植株，主枝和側枝分化成節和節間，頂端細胞、中央細胞和皮層。
卵式生殖：生殖器官為多細胞，卵囊：管細胞5、冠細胞5、卵細胞1；精子囊：盾細胞（桔紅色載色體）→盾柄細胞→頭細胞→次級頭細胞→精囊絲→精子（頂生兩個等長鞭毛）合子休眠後減數分裂後發育成新個體。
營養繁殖：藻體斷裂、珠芽繁殖
硅藻門
單細胞或彼此相連成各式群體。最突出特點是其細胞結構和繁殖方式。
細胞壁由兩個套合的矽質半片組成；套在外邊的稍大的半片稱上殼，套在裡邊的稍小的半片稱下殼。
繁殖方式：主要為細胞分裂，母細胞的上下殼均形成子細胞的上殼，而下殼則各自分泌形成。
褐藻門
褐藻植物體是多細胞的,有的有組織分化。細胞有壁，分為兩層，內層是纖維素的，外層是藻膠組成的。同時在細胞壁內還含有褐藻糖膠。載色體含有葉綠素a和c、β-胡蘿蔔素和6種葉黃素。葉黃素中有1種叫墨角藻黃素，使藻體呈褐色。細胞光合作用積累的貯藏食物，主要是褐藻澱粉和甘露醇。
褐藻的精子和遊動孢子一般具2條不等長側生鞭毛，向前方伸出的1條較長，是茸鞭型；向後方伸出的1條較短，是尾鞭型的。
褐藻紅藻門
植物體多數是多細胞的，少數是單細胞的。某些種類有一定的組織分化。
細胞壁內層為纖維素質的，外層是果膠質的。
載色體中含有葉綠素a和d、β-胡蘿蔔素和葉黃素類，此外，還有藻膽素和藻藍素，故藻體多呈紅色。
紅藻細胞中貯藏紅藻澱粉和紅藻糖。
紅藻地位及其經濟價值
真核藻類在水生生態系統中的地位
真核藻類是水生生態系統中的初級生產者
沒有真核藻類和原核藻類,水生生態系統將不能維持，其它一切生物將不能生存。
赤潮與水華
海水受到污染，使海水富營養化，在一定條件下浮游生物大量增殖，引起海水發生染色變化的現象——紅褐色、黃褐色等
赤潮主要由真核藻類的甲藻和硅藻形成——中國沿海有19種甲藻和18種硅藻能形成赤潮
水質監測和水質淨化
有些種類僅能生活在清潔水體中
如果水體受到某些重金屬或化學物質污染，絕大多數藻類均不能生存，僅有極少數種類可以生長
真核藻類的經濟價值
食用——海帶、紫菜等
藥用——小球藻、刺松藻等
工業原料——海帶、巨藻、昆布等。
病毒
國外文獻中對真核藻細胞中具有病毒特徵、尚未定性的活性粒子，一般用“病毒類似顆粒”(viruslikeparticles，VLPs)．除了近年來小球藻病毒(Chlorellaviruses)和褐藻類的長囊水雲(Ectocarpussiliculosus)及費氏藻(Feldmanniasp．)等病毒的研究比較詳細之外，真核藻類病毒和病毒類似顆粒的性質以及感染宿主的情況，遠不如藍藻病毒那么清楚．真核藻類病毒和病毒類似顆粒(VLPs)絕大多數是多角體粒子(polyhedralspatti—cles)，只有個別是例外，如CCV是桿狀．它們一般在宿主細胞中的部位不是固定的：有的病毒或者病毒類似顆粒出現在細胞核內，有的在細胞質中，有的在這兩處同時出現．大多數藻細胞中含有1種病毒或者病毒類似顆粒，但少數的細胞含有2種或3種；藻類病毒和病毒類似顆粒對藻細胞的感染情況也不同於藍藻病毒，絕大多數真核藻類的營養細胞不含有病毒或病毒類似顆粒，它們只存在於生殖細胞或由其萌發的植物幼體中，它們對宿主的感染大多數情況下只發生在藻的孢子時期，而且並非含有病毒或病毒類似顆粒的細胞都溶解，真正溶解的細胞只是極少數．現有證據表明，在兩種海水褐藻中發現潛伏感染和溶源現象。
各門真核藻類主要特徵比較
| 門 | 藻體形態 | 細胞壁 | 鞭毛 | 生殖結構 | 光合產物及分布 |
| 隱藻門 | 單細胞，縱扁 | 無細胞壁 | 兩條，略等或不等長，自腹側前連線埠溝伸出 | 單細胞（單室） | 澱粉、油滴，多淡水產，個別種類海產 |
| 甲藻門 | 絕大多數單細胞 | 纖維素板片構成，多具1縱、1橫溝 | 多2條，橫溝一條茸鞭型，縱溝一條尾鞭型 | 同上 | 澱粉、油滴，淡、海水產，主要赤潮產物，細胞核為間核（中核） |
| 金藻門 | 單細胞、群體或絲狀體 | 多無壁，有的表面具有矽質的小鱗片、小刺或囊殼 | 1條、2條或3條，頂生等長或不等長 | 同上 | 金藻昆布糖、油滴，多淡水產，海水中也常見 |
| 黃藻門 | 單細胞、群體，絲狀體或多核管狀體 | 單、絲型壁，由2片套成，纖維質 | 2頂生不等長，長茸鞭向前，短尾鞭向後 | 同上 | 金藻昆布糖、淡水產 |
| 硅藻門 | 單細胞或各式群體 | 矽質上、下殼套合而成，具各式花紋 | 有些種類的精子或小孢子具鞭毛，1或2條 | 同上 | 金藻昆布糖、油滴，淡、海水均多產，分布廣，主要赤潮產物 |
| 褐藻門 | 多細胞、絲、葉、管狀等，有的有一定組織分化 | 具細胞壁，含有纖維素和藻膠 | 多數種類生殖細胞具有2條側生不等長鞭毛 | 單細胞（單室），多細胞（多室） | 裸藻澱粉、甘露醇，絕大多數海產 |
| 裸藻門 | 絕大多數單細胞 | 無壁，有的具囊殼 | 多1或2條鞭毛，自端胞口伸出 | 僅以細胞分裂進行生殖 | 副澱粉（裸藻澱粉），多淡水產，極少海產 |
| 綠藻門 | 單細胞、群體、葉狀體、絲狀體等 | 具纖維素的胞壁 | 多為2、4，頂生、等長，尾鞭型 | 單細胞（單室） | 澱粉，多淡水產，一部分海產 |
| 輪藻門 | 藻體較大，有明顯的節和節間 | 同上 | 精子具2條等長鞭毛，尾鞭型 | 多細胞，具不育細胞，雄藏精氣，雌藏卵器 | 澱粉，多淡水產 |
| 紅藻門 | 極少單細胞，大多多細胞絲狀、葉狀、枝狀等 | 細胞壁由纖維素和藻膠構成 | 無 | 單細胞（單室） | 紅藻澱粉，多為海產 |
真核藻類光合器結構和光合色素比較
1層葉綠體內質網膜，3條類囊體形成一束裸藻門 Euglenophyta蝦青素，葉黃素，菜黃素等
| 門 | 光合器 | 葉綠素類 | 胡蘿蔔素類 | 葉黃素類 | 藻膽素類 |
| 隱藻門Cryptophyta | 2層葉綠體內質網膜，2條類囊體形成一束 | a,c | α、β、ε | 矽甲藻素，甲藻黃素 | 含有 |
| 甲藻門Pyrrophyta | 1層葉綠體內質網膜，3條類囊體形成一束 | a,c | β | 矽甲黃素、多甲藻素、甲藻黃素等 | 某些種類含有 |
| 金藻門Chrysophyta | 2層葉綠體內質網膜，3條類囊體形成一束 | a,c | β | 墨角藻黃素、硅藻黃素、矽甲藻黃素 | |
| 黃藻門Xanthophyta | 同上 | a,c | β | 矽甲藻素等 | |
| 硅藻門Bacillariophyta | 同上 | a,c | α、β、ε | 墨角藻黃素、硅藻黃素、矽甲藻黃素 | |
| 褐藻門 Phaeophyta | a,c | α、β | 墨角藻黃素，葉黃素等 | ||
| 裸藻門 Euglenophyta | a,b | β | 蝦青素，葉黃素等 | ||
| 綠藻門 Chlorophyta | a,b | α、β | 蝦青素，葉黃素，菜黃素等 | ||
| 輪藻門 Charophyta | 同上 | a,b | β、γ、番茄紅素 | 未知 | |
| 紅藻門 Rhodophyta | 無葉綠體內質網膜，類囊體單條，不成束 | a,d | α、β | 蒲公英黃素、葉黃素等 | 含有 |
