該寺相繼在西藏、四川、青海、雲南以及印度、尼泊爾等地方陸續建子寺一百多座，並曾培養出許多藏傳佛教高僧。直貢梯寺高僧在大明二年被封為“闡教王”，寺內珍藏有許多價值連城的文物古蹟，寺內主供覺巴·吉旦貢布佛，具有代表性活佛是切倉、瓊倉活佛。公元1290年（元世祖至元27年）遭薩迦派襲擊後，直貢梯寺被毀。1982年經自治區人民政府批准修復對外開放，國家投資13萬元用於直貢梯寺的修復。聞名全藏的馬年轉岡底斯山，猴年轉雜日神山，便是直貢噶舉派大師們創立的，並每屆都由止貢寺的高僧主持儀式，止貢堤寺的密室修禪（據說，修成拙火定的人能在冬天將剛從水口撈出的袈裟披在身上烤乾，如果下了雪，他在屋內發功後，屋頂上的雪即刻可以融化）、靈魂超度（佛教認為，人死後靈魂有可能進入三善趣。即轉生趨向天、人、阿修羅，也有可能進入三善趣。即轉生趨向為地獄、畜生、餓鬼道。如果通過直貢梯寺活佛灌頂，在死者頭上打一個小洞，靈魂就會從頭上出來，進入三惡趣。據說，灌頂師念完經，一拍掌，被灌頂的人頭上蓋的紙都會飛走，頭上會出現一個小洞。如果不灌頂，只有你到直貢天葬場用頭輕輕碰那裡的瑪尼石，死後也會進入三善趣）。
壇城天葬據說有一絲似牛尾細的陽光將它和印度的天葬台連著，死者的靈魂可以順著這一絲陽光活動於西藏和印度之間。天葬場中有一用黑色花崗岩石砌成的直徑約1公尺的圓台，這是天葬師主持天葬時的法台。散落在天葬場四周的小石頭，傳說是從印度飛來的神鷹，離天葬台不遠的六佛塔是圓寂止靈活佛的靈塔，還有許多刻有經文的小石片，這些都是人們為超度而刻寫的。獨有的靈魂出竅（灌頂）有名氣的壇城天葬，還有直貢梯寺的100多個喇嘛要為死者念經超度，系列文化的服務，使死者家屬願意將死者送到這裡，到這裡來天葬的人很多，除拉薩、江孜、日喀則的外，還有趕著氂牛來的藏北人呢）具有自己獨有的特點，從古至今對信徒香客有很大的吸引力。該寺在法主覺巴時代，舉行僧會時，僧侶人數最多時達十八萬，後逐漸減少，到1959年的前幾年，僧人只有五百左右，現在止貢寺有僧人160多人。經法主覺巴的近侍仁欽查巴加持過直貢“丹恰慶波”天葬場，享譽中外，是世界最著名的三大天葬場之一。
