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盒子理論假設某一天人們製造出了一種超智慧型的電腦，而剛好又有一個科學狂人研究出了另外一種程式，這種程式能夠精確的模仿人類的思維，並且他意識不到他只是一個程式，他認為他是一個人，而漸漸的這個電腦發展成為一個模擬世界的程式，各種人類和物種都在那裡面成型，並且擁有了獨立思維，然後其中的一種生物（也許是人類，也許是其他物種）製造出了電腦（或類似功能的東西）並且他們也開始研究思維程式和人工智慧（或其他智慧型），但他們始終是盒子（電腦）中的生物，他們也許不知道，也許知道他們只是一種程式。同樣，推理開來，我們呢？我們就真的真實存在嗎？我們之外（宇宙之外）又是什麼呢？也許是台電腦，也許我們整個宇宙只是另一個物種的黃粱一夢，我們也是某個“盒子”中的生物。這就是盒子理論。
說簡單點，就是我們有可能是一個電腦里一個程式或者物種，這個電腦就是一層盒子，而這個盒子也可以說成是我們的這個世界。
大意為人類的世界的操控者，也就是所謂的神創造了現今的世界，而我們就是這個世界盒子中的造物。之後大致演變為兩種說法。其中之一代表為MATRIX，就是黑客帝國，理論認為人類研究出了機器人，之後又開發出了智慧型機器人（AI-ROBOT），智慧型機器人反過來支配人類，將人類限制與一個幻境之中，五感全部模擬……這個就是盒子。
本人認為盒子理論來源於科學的不連續性和有極限性。經典理論認為自然界沒有極限的連續的，但存在速度的極限——光速，能量的傳遞也是不連續的，有最小單位——能量子。所以，就有一部分人猜想:我們只是生活在電腦中，自然界是連續並沒有極限的，但電腦的運算速度是有極限的，因此速度才有最大值，能量才有最小值。
概念理論
這種理論的另一種代表是鈴木光司的小說《七夜怪談》，也就是午夜凶鈴的小說版。人類為了預測今後發生的事情與從歷史中了解規律秘密創造了一個虛擬世界，但這個世界除了在量子位面，其他都與我們的世界完全相同，甚至歷史。於是我們便是那個世界的創造者，在小說《無限恐怖》中，鄭吒他們便是在那個世界裡。他們的世界在量子位面無限進化，速度比我們快了N倍，於是我們可以由觀察他們的世界來看清我們的未來，但出乎意料的是出現了聖人與修真者，他們漸漸達到了可以控制能量的層次。所以當他們即將掌握更高的量子能量，便可以突破世界的範疇，達到盒子外。於是盒子外的我們震撼了。如此這般，雖然我們的科技不如盒子內，但我們畢竟是掌控者，我們便通過修改程式強行抹殺那些人，當然，很多科技對我們來說還十分有用，這便是楚軒說的我們只會用防毒軟體殺病毒而不會砸電腦的意思了。
