基本定義
能夠在體內控制時間、空間發生髮展的質和量就叫生物鐘。
生物鐘有四點功能
：提示時間、提示事件、維持狀態和禁止功能。
提示時間：是指你在一定的時間必須做謀事，到了這個時間，你就自動會想起這件事來，比如你想明天早上6點起床，到時你會自動起來。現實生活中有大部分事物都是時間提示起作用的，比如幾點上班、某時會見某人、愛人生日的獻花、愚人節、趕某趟車等等。
提示事件：是指當你遇到某事時，生物鐘可以自動提示另外一個事件的出現。比如有人拜託你將一件東西給甲，當你遇到甲時，生物鐘這一功能就會自動起作用，使你馬上想到這個託付的東西來。用得最多的是看到某事時，在你的大腦里所依次產生的那些憶塊，比如看到熊貓，你就會想到：它是中國的國寶、它喜歡吃竹子、它是中國作為友好象徵出使國外的使者等等憶塊。再比如當你看到一道難題時，你就會調動很多憶塊，在一些規則的組合下，去求解它，這一連串的事情必須啟動你過去很多年時間裡所學到的知識，這些知識是不會平白無故地出現在你的大腦的，它們必須在生物鐘的該功能作用下才可依次出現在你的大腦里。
維持狀態：是指人們在作某一事時，能夠使人一直做下去的力量。比如上8個小時的班，就是生物鐘這一功能的結果，又比如人的眼睛觀看某一事時，能夠聚精會神地看，也是它的結果，當注意力從視覺轉向聽覺時，也是生物鐘作用的結果，那是提示事件功能在起作用，但是，你要聽完一堂課，你就必須用生物鐘的該功能才能聽完，否則你就會瞌睡不已，甚至逃課。這種維持可以是連續的也可以是斷續的維持，比如你和你愛人的家庭的維繫就是斷續的，因為你不能長期呆在家裡無所事事，你必須去工作，去交結，去謀取。
禁止功能：是指機體某個功能或行為可以被生物鐘終止。比如說看到一個恐怖的事件（如地震），你無論在做什麼，都有可能產生逃跑，這種逃跑就是對前面所做事物的終止。再比如說你在專心專一上網，結果你老爸打來了，你對上網的終止就是生物鐘的功能在起作用。如果沒有這種作用，一個人就會出現永不停頓的做事，比如睡覺，如果沒有這種終止，這個人就會長期睡下去，成為植物人。植物人發生的原因可能與此功能的失控有關。
相對這四點功能，在人的大腦里有對應的四個中樞：時間中樞、空間中樞、功能中樞和終止中樞。
生物鐘充斥在生物的每個環節，無論人命還是生命過程都離不開它的作用。
母鍾、子鍾、孫鍾
生物鐘分為母鍾、子鍾和孫鍾。
母鍾是受精卵攜帶的那條染色體。
生物個體就是以母鍾為藍圖進行分解、合成的，該母鍾決定了一個人的一生。母鐘的分裂是一定的，不是無止境的分裂下去，母鍾在人類一般是分裂5次產生24條與母鍾一致的體染色體，以後人類的所有器官都在這24條子鐘下面分裂產生，母鍾在分裂時，就已經嚴格地將24條子鍾各自應該怎么釋放、怎么解碼、解哪些地方的碼等等都安排好了，24條子鍾就開始各行其是了，造肝的造肝，造腎的造腎，造心的造心，同時各自功能的發揮也開始進行，一個新的個體產生了。這就象一個母親生下幾個雙胞胎兒子，兒子們就各發展各的了，但是作為一個大家庭來說，雙胞胎們會有相互影響的一方面，直到長大在他們中都可以看到整個家庭的痕跡，但是他們又各有鞦韆、各不相同。
母鍾分為以端點為主的信息部、以染色體外蛋白為主的標記部和在染色體某一段的基因控制的控制部，信息部負責接受外來刺激和對染色體外蛋白發放信息，標記部的外蛋白負責某些段基因的打開、複製、關閉等工作，控制部是專門控制生命個體在生長發育過程中的時間提示，如某年齡開始脫牙、某時間開始發情等。
母鍾在分裂時，每次分裂它都使一條子鐘的某些基因上的蛋白質被標記，這種標記使得在以後的歲月里該條染色體永遠只能打開這一段，也就是說，被標記的基因終生都可以產生複製信息，沒被標記的終生都被冷落，成了“冷段”。第N條如果是造肝的，那么在這條染色體上的有關造心造肺等器官的那些部位就全部被關閉，只有與肝有關的信息完全被打開，一個肝臟就是這樣造成了。有人會說人類是24條染色體，其他動物可不是呀，但是為什麼它們的器官和功能基本相同呢？那么它們是分裂多少次呢？一個總的原則是：母鍾都是按“體染色體”數分裂，無論什麼動物。
不要忘記了，現在談的母鍾，不是純的DNA的概念，應當時刻記著該母鐘的外面有細胞膜、細胞質和核膜，還應該記著細胞質里的高爾基體等物質。母鐘的分裂不是單一的，是連著細胞膜等等一起分裂的。精子所攜帶的XX或XY染色體進入卵細胞和卵細胞的染色體結合一般現在稱為“合子”，合子裡還只有一對染色體，在人類，它們開始參照這一對染色體進行複製，生成23對體染色體，這時的這個卵細胞本文稱為“母鍾”，母鍾開始分裂，每分裂一次，就產生一個新的“子鍾”，每個子鍾都是一個攜帶某方面遺傳信息的、完整的、與母鍾在個體、大小、功能上完全不同的新的細胞了。母鍾分裂5次，變成了23個體細胞，這23個體細胞成了新的“激活藍本”，所有組織器官依照這些激活藍本開始複製和分裂，在任何一個新的組織器官體，細胞的分裂不會超過12次，因為體細胞是按照2的n次方（n為1,2,3,……）分裂，第一代是2，第二代是4，第三代是8……，所以它們的再分裂，出來的分別是：心、肺、腎等等一個個活生生的器官，雖然這些器官不一定具有功能，就象男人的陰莖，在沒有發育時，是沒有性功能的，但是陽具卻在。按24個子鍾再分裂出來的所有細胞被稱為孫鍾，孫鍾組成一個個具體的器官。
母鍾存在人體於人體的腦垂體。據1972年美國科學家研究，下丘腦的視交叉上核（SCN）是生物鐘所在地，還有人發現，從視網膜有一條神經通路直接與視交叉上核相連，稱其為視網膜——下丘腦束（RHT），據研究，先天性視網膜退化毫無光感的盲人，其生物節律也受生物鐘調節。
改變子鐘的DNA，不能改變遺傳，必須改變母鐘的DNA，才能遺傳，癌症是子鐘的DNA失控的結果，所以它一般是不能遺傳的。這就是為什麼一個人的手或腳被截後，他的下一代手腳正常的原因。
現在認為染色體是通過合成蛋白質，蛋白質決定細胞來起作用的，但是，應當還有另外的途徑在控制系統的發育，比如骨骼系統是由鈣和磷按一定比例組成的，沒有蛋白質在裡面起作用，骨骼主要起支架作用，如果說染色體是通過合成蛋白質來決定組織器官的，那么骨骼系統怎么解釋呢？因此看來，染色體決定組織器官的形式、大小、功能和成分，它不是只決定蛋白質這一種東西，現在假設骨骼中的鈣是因為某種蛋白質攜帶來的，但是，骨骼的哪裡厚，哪裡薄，哪裡空，哪裡實等等該蛋白質就可以決定嗎？如果是這樣，那該蛋白質就會成“智慧蛋白”，本身就夠神的了。控制骨骼系統的染色體，決定了骨骼的一切必要的信息的釋放，染色體不能夠直接合成鈣和磷，它們只是在人體生長發育的過程中，將一些鈣磷按照需要，在遺傳圖譜的指導下，組合成尺骨、撓骨、頭骨等等，至於頭骨的哪兒有眼，哪兒大，哪兒厚等等也是一樣地被染色體所控制，不純粹是鈣磷的量的概念。人類的盲腸，如果以後科學發展了，可能人們會在馬的體內找到一種激活盲腸的激素，是這種或幾種激素導致馬的盲腸功能巨大的原因，如果將這些激素用於人，人的盲腸也會發達起來，只是在現實中沒有任何意義。如此看來，人類要具備獵豹一樣的速度、雄鷹一樣的眼睛等功能為時不遠了。
染色體是一種程式的解碼，就象電腦的程式一樣，這種解碼解哪裡、解多少、解多長的時間，被解的基因片段什麼時候終止，正好印著生物鐘的四點功能。那么控制人體的智慧型過程的生物鐘又在哪裡呢？應當在大腦內。大腦也是有子鐘的，也是按照子鐘的程式解碼生長發育成的，是它控制著人命過程，是它使人有了智慧和能力的。1860年，在奧地利布隆修道院（Byunn現在捷克）的四面高牆內，孟德爾開始了他偉大的遺傳育種試驗，他將高矮、紅白、光皺等性能不同的豌豆進行雜交試驗，發現了遺傳學第一（分離定律）和第二定律（組合定律），他用了“因子”的概念，就是現在所說的基因，其實他的因子也好、基因也好，都是染色體即生物鐘的單位，至於被孟說的隱性，是怎么隱的，到現在人們還是沒有搞清楚，現在只知道染色體解碼，按照不同的鹼基配對產生不同的蛋白質，構成人的軀體，至於孟的隱性基因為什麼不在雜交試驗中出現，為什麼要到第二代、三代回交時才出現，還是個謎，有可能是生物鐘控制著它們，使它們暫時不能被解碼的結果，回交試驗後，控制這個碼的生物鐘又被激活，產生生物鐘的功能，才使他們表現出特有的性狀。
脫氧核糖核酸（DNA）這條螺旋體包含了一切生命的信息，它的解碼事實上就是卵細胞和精細胞結合，激發生物鐘開始發揮它的功能，比如人的24對體染色體，先在哪裡開始解碼，後在哪裡解碼，解到什麼程度停止，再解哪裡等等，沒有生物鐘的控制，24對染色體就會亂套，就不可能產生生命個體。癌症就是控制局部地方的生物鐘的子鍾失控，使局部細胞無節制地繁殖的結果，這種子鍾失控，原因是子鐘的維持狀態功能失控，子鍾已經不受母鐘的控制，要根治癌症，就必須使子鍾維持狀態功能得到恢復。
大多數疾病都表現出生物鐘功能失調的徵兆：肺結核病人午後潮熱，一種小孩的無名高熱每天下午出現，失眠症睡眠時間不能入睡，相思病不思飲食，連一個小小的感冒都可以使人沒有胃口，這些都與人體生物鐘的功能有關。疾病的產生無論是對人體外形還是心理狀況都可以產生比較嚴重的影響，甲亢病人眼睛凸突，易汗，同時情緒難控。一個人三餐不能準時吃，如果時間一長（比如幾年內經常這樣）在飢餓這一源刺激上就會出現胃病，在出現胃病等症狀後，如果還是不能按時吃飯，就會出現胃潰瘍，胃穿孔、胃出血等重症。看來某些疾病的發生與生物鐘有很大關係。
注意力和意識
所謂注意力、意識等等都是生物鐘的一、二點功能的俗化，注意力和意識是人體對外界事務的一種感受程度，也就是身體的感覺過程。當原塊刺激人體感官，生物鐘就會自動將它的功能調整到這一刺激上來，以引起人的注意，保護生命個體，引起憶塊的出現和思塊的形成，並對此採取行動。比如，某人在深山遇到老虎，他就會產生一些行為來保護自己免被老虎傷害。又比如打牌，看到別人出了什麼牌，你應該出什麼，這都是生物鐘功能的發揮，當然它參與了思維。有一種小孩，到一定年齡就開始非常調皮，稱他們為兒童多動症，其實是他們的生物鐘功能比別的小孩差的結果，只要調整他們的生物鐘，就可治好他們的病。生物鐘除了產生憶塊、給人們回憶以外，主要參與思維過程，還參與整個智慧型過程，就象它參與整個生命過程一樣。有一種被稱為“大智若愚”的人，在他所研究的領域，誰也不能勝過他，他是一流的，但是他在常人所熟悉的領域，幾乎是個白痴，為什麼呢？這是因為他只有他所研究領域的記塊，也只能產生這方面的憶塊和思塊，他沒有或者不儲存其它方面的記塊，所以他不能產生其它方面的憶塊和思塊，就這么簡單。
毅力、耐力是生物鐘第三點功能的發揮程度。當然還必須有行為的參與。
多中樞溝通理論
人的大腦里存在兩個中樞，一個是生命中樞，一個是人命中樞。它們又包括：時間中樞、空間中樞、功能中樞、禁止中樞、感覺中樞、運動中樞、記塊中樞、語言中樞、思維中樞。要具體到哪箇中樞屬於生命中樞，哪個屬於人命中樞，那是很難的，因為有些中樞同時存在於兩個過程，比如時間中樞。
時間中樞是人體時間界定的一個比較特殊的中樞。該中樞由一團神經細胞組成，分泌很多種控制時間的“素”，總稱為“時間激素”，有的調整短時間的問題，有的調整長時間的問題，有的調整維持時間的問題等等。
空間中樞是人體可以通過感官產生各種各樣多維立體感的前提。你能夠輕易地在無數種聲音的刺激下找到遠近差別很大的聲源，你可以馬上感覺到冷和熱的高低區別等等，這些全是該中樞作用的結果。這箇中樞還有一個特點就是對人體可以實行自我保護，所以又叫自我保護中樞，比如你看到一個物體快速向你飛來，利用時間中樞和空間中樞的共同作用，你就會出現保護性行為：逃避或接住這個物體（如果可以的話）。
功能中樞略相當於巴甫洛夫的興奮中樞，也叫控制中樞。該中樞同任何一個中樞溝通，就會使得被溝通中樞發揮極大的作用，也可導致一種人類行為或感覺的出現或功能的發揮。比如功能中樞與語言中樞溝通的程度高，這個人的語言就發達無比，它可以是遺傳的，也可以是後天的，比如小女孩，因為遺傳的原因，其語言就比同齡的男孩強。長期的訓練可以使一個人成為說客。這種溝通一般是可以用次數計算的，它的功能發揮程度與年齡和次數有關，與其它（如大腦的神經細胞）關係很小，訓練的次數要看強度和大腦參與的程度，強度適中、大腦的功能中樞全線參與，這個人的被訓練項目就接收快，否則就慢，但是無論什麼訓練項目，要完善的話，至少要30次以上，才能說熟能生巧！
幾個中樞相溝通，人就會產生各種各樣的行為、感覺和疾病。功能中樞、思維中樞與某種行為中樞結合，就會使人產生愛好、嗜好，比如打牌，又如各類收藏家，都是這樣的人。再說那些科學家，他們終生都是將功能中樞永遠與腦內的思維中樞牢牢地結合在一起，所以說話時“三句話不離本行”，行動時專注於專業性思維，思考時重在感塊的產生和憶塊的調取。睡眠時“夢跟人走”，意思是所做的夢，長期與這個人白天的思維有關。從吸毒者來分析，是鴉片中的一種成分類似於功能中樞大腦細胞上所具有的一種結合物，這種結合物一旦與該類細胞結合，人體就上癮。功能中樞通過禁止中樞與生命中樞相溝通就會出現碎死、假死和休克。功能中樞、生命中樞與感覺中樞聯繫在一起人就會出現害羞、緊張、大汗、害怕等等深部感覺，這種聯繫如果不可逆轉，這個人就是一個精神病患者，所謂不可逆轉，就是三者的聯繫再也沒有什麼可以阻斷（禁止中樞失控），使得它們長期聯繫在一起，源源不斷地指揮人產生特異性的行為或語言。功能中樞、禁止中樞與感覺中樞聯繫，人就會出現睡眠。功能中樞與某個感覺中樞溝通，人就會產生注意。一個人如果功能中樞、感覺中樞和記塊中樞聯繫得相當好，這個人就是個天才。一個人如果功能中樞、思維中樞和語言中樞聯繫得好，就是一個說客或外交家。一個人如果將功能中樞、禁止中樞和運動中樞聯繫在一起，他就產生懶惰。人體的一切特徵都是可以用這個“多中樞溝通理論”來概刮。無論是好強好勝、油腔滑調、刻薄、性慾強盛（好偷人）、懦弱或怪避成性等等一切的一切都可以用這種中樞結合理論來解釋。當然，這種多中樞結合產生人的一切行為和語言的理論，並不局限在功能中樞這一個中樞里，其它任何幾個中樞的結合，都可以產生對人定性的結果。好吃的人一般發生懶惰，愚蠢的人一般還和“兇惡”連在一起，這些也是多中樞結合所產生的功能的一種附帶產品。
禁止中樞它是專門實行禁止的，略相當於巴甫洛夫的“抑制中樞”。該中樞在一般情況下是靜止的，也是不與其它中樞聯繫的，一旦與某箇中樞聯繫在一起，那么這箇中樞的某個功能就會被禁止中樞所控制。比如本人曾經對很多不喜歡說話的人進行過調查，導致他們“沉默”的原因是他們體內的一種“抑制”，而不是其它，他們並不是不想說，而是當他們想說話時，就被自動抑制，大部分被常人看作不好講話的人都是這么說的。由此可以發現，禁止中樞就象其它大腦的中樞一樣是客觀存在的，雖然現在人們不知道它的具體位置。
以上多中樞溝通理論所司的對象不僅僅限於人體大腦內部，也可以發生於人體外部。當你出生以後，這個世界太強大了，你隨時都可能會被這種強大吞蝕，但是，一種更加巨大的力量在牢牢地保護你，這就是母愛！在以後的歲月里，另外一種愛也會加入其中，這就是父愛，母愛是無私的，是自動產生的，父愛是隨著歲月而產生的。也可以看到另外一種情形：你愛上了一個人或一種信念，你會為她而死，比如劉胡蘭。
生物鐘怎樣參與思維
外界刺激人體產生感覺（感塊），感覺使人產生記塊（去記），生物鐘提示功能使人產生憶塊（回憶），憶塊被放到思維中樞，通過“規則”進行組合產生思塊（思維），思塊進入行為中樞使人產生行塊（行為和語言）。
生物鐘的特徵
生物鐘的特徵
生物鐘有點象開汽車：人什麼時候上車，開車到哪裡，踩多久的油門，到達後的一腳剎車。
遺傳的實質是生物鐘上的記塊的釋放，進化的實質是染色體的變異，退化的實質是染色體功能的關閉。比如人的盲腸和人類的尾巴，都退化了，但是都有痕跡，它們的生物鐘的子鍾還是存在於那個部位，只是功能沒有了，被母鐘關閉了；所有器官，只要不用，其功能都會退化，不僅僅是盲腸，退化以後的器官，第一是器官縮小，第二是功能消失。由此看來染色體具有兩面性：器質性和功能性，器質性決定器官的性質，主要是決定器官的大小、形狀和細胞數量，功能性決定器官功能的發揮程度、功能的有無、分泌功能物（如各種酶和素）的多少。
DNA是指那條螺旋體，生物鐘是DNA和它周圍所附帶的蛋白質等物質。
DNA分兩種：一是“端點”，也就是DNA上分支的交叉連線部位，這個端點控制著基因的發生時間和順序，試構想一粒種子，放在土裡，沒有一定的原塊的刺激（所謂外界條件）是不會發芽生長的，一旦條件足夠，端點就被激活，端點指令DNA依次解碼，如果沒有這種控制，基因就會各自為戰。
人的生長發育行為的產生，都是染色體上的基因決定的，什麼時候停止生長，什麼時候產生性慾，什麼時候分娩，什麼時候停經等等這一切都是一個人按時按刻來完成的，沒有一個不是生物鐘的體現，所以DNA就是生物鐘，是它決定一個的人一切生理進程。如果DNA所決定的這些按時按刻出現的東西都不屬生物鐘的範疇，那就沒有人體生物鐘了。
無論是生命過程還是人命過程，都是生物鐘在起關鍵作用。先看看生命過程，當人的胃餓了時，生物鐘就會提醒你:“該吃了”，吃到一定程度，它又會提醒你:“可以了”。在這裡，生物鐘是通過一種胃壁的壓力感受器來實現功能的，胃壁壓力感受器感到胃內沒有東西了（這一數值每個人都應該有個可以測量出來的衡數），就開始分解一種能夠使大腦產生“胃痛”的“物質”，這一物質和胃神經結合，胃神經開始產生一種電傳導，該傳導到達大腦的“胃痛區”，就產生了“胃痛”，反過來，持續胃痛又可分離胃神經上的化學結合物，從而終止胃痛，過一陣，如果還是沒有進食，胃就開始下一輪疼痛，這就是所謂的陣痛。
再來看看人命過程生物鐘是怎么發揮作用的，老師或父母將你的名字告訴你並告訴你怎么寫，以後，在你的一生中，只要問及你的名字或必須簽上你的名字的地方，你都可以準確無誤的書寫或報上名來，這一過程中，你的名字首先是一種刺激，使你的感官接受了這一信息並被儲存在大腦里，在沒有必要的情況下，你的名字就是一種儲存在記庫的記塊，一旦有人呼叫你的名字，這種刺激就會將你的大腦和聽覺中樞等很多中樞溝通，生物鐘的提示事件功能馬上就會將你的名字從記庫中調出來，調出來的這個憶塊（實際上就是一塊僅僅包含你的名字信息的憶塊），被放到思維中樞，它的存在，使得思維中樞不可以產生其它思維，此時的思維中樞因為過去的習慣或其它原因，使你產生回答或看著呼叫者，產生回答不一定每次發生，但是在很多情況下必須發生，比喻你媽叫你，你的上級領導叫你，或在非常時期叫（如發生突發性事件，叫你趕快離開），這些情況下你都會不由自主地回答這種叫喚的，但是，很多場合下，你對這種叫名行為都是抱著報以微笑或目視對方來回答，以上情況的發生必定產生了四種思維規則：一種是習慣性回答，每叫必答，這種規則的產生是幼時形成的；一種是微笑規則對應叫名行為，這是一種比較成熟的規則；另一種是沉默規則，一般是應對無關緊要的人的叫喚；還有一種是突然叫喚規則，這種規則使人必須回答。生物鐘按照這四種規則去自動應對叫喚人。
生物鐘功能再偉大，也受制於感覺，比如生物鐘決定你是一個男孩，但是在長期的感覺演變過程中你可能停止男孩的一切決定性要素，使之具有女性心理特徵的假男孩。雖然生物鐘控制生物體的每一個過程，但是，它對感覺的控制微乎其微，一般都是感覺在控制生物鐘的發生髮展。
