至弱冠應童子試,未幾游郡庠,食餼,歷試冠軍,三元名日起。然家窶亦日甚,紈絝之子,多口訕之。獨峴西馮宋臣與其為中表戚,傾心投契,延至家交面授子侄,旦夕討論推為畏友。
萬曆乙酉年(1585年)鄉舉薦,初署長洲縣教諭,訓迪有方,諸生得其品題者均能考就。時有沈璣者,方應殿撰,時家甚窘,三元則預為金華妙選引之課文,反覆講授,時時周貸。迨沈君及第,一時翕然服。時有知鑒秩,升翰林孔目,孔目於京職中為閒員。公觴詠不輟,詩兼鮑庚之長。相國王文肅公奇其才,每語同朝,以為文章經濟當為第一流,不宜久居閒散,尋升戶部主事,奉命管淮關稅務。公確政精詳,纖維畢燭,商人輸鏹必親蒞詢,有無奸婿包攬否,違例私派否。用是國課既豐,而舟航亦復,無阻滯績。最升南京戶部山東清吏司郎中,又升南京戶部司務廳司務。
萬曆四十二年(1614年),為表彰王三元父王學書教子有方,朝廷誥勅獎諭,贈其為南京戶部司務廳司務,登仕郎。