古時駐軍，主帥或主將帳前樹牙旗以為軍門，稱“牙門”。
《後漢書·袁紹傳》：“ 麴義 追至 界橋 ， 瓚 斂兵還戰， 義 復破之，遂到 瓚 營，拔其牙門。” 李賢 註：“《真人水鏡經》曰：‘凡軍始出，立牙竿必令完堅；若有折，將軍不利。’牙門旗竿，軍之精也。”《國語·齊語》“執枹鼓立於軍門” 三國 吳 韋昭 註：“軍門，立旍為軍門，若今牙門矣。” 清 王抃 《揚州次梅村師韻》：“牙門置酒宴公卿，錦纛雕鞍命北征。”
指武將。
《三國志·魏志·鍾會傳》：“斯須，門外倚梯登城，或燒城屋，蟻附亂進，矢下如雨，牙門、郡守各緣屋出，與其卒兵相得。”《資治通鑑·漢獻帝建安九年》：“ 孫權 聞亂，從 椒丘 還。至 丹陽 ，悉族誅 覽 、 員 餘黨，擢 高 ， 嬰 為牙門，其餘賞賜有差。” 胡三省 註：“牙門，將也。”
用作將軍名號。
《資治通鑑·漢獻帝建安二十四年》：“拔牙門將軍 義陽 魏延 為鎮遠將軍，領 漢中 太守，以鎮 漢川 。” 胡三省 註：“牙門、鎮遠，皆 劉備 創置將軍號。”
官署。
《北史·宋世良傳》：“每日牙門虛寂，無復訴訟者，謂之神門。”
泛指辦事的機關。
魯迅 《書信集·致許壽裳》：“當枯坐牙門中時，懷想彌苦。”
