湘南新宿線這是一條以既存的路線所組合的列車，縱跨整個關東首都圈所運行的線路，在西日本旅客鐵道中，這種長距離的列車並不特別，但是在東日本旅客鐵道卻是屬於比較特殊的路線，並且是日本第一條經由新宿連結北關東與南關東的線路。開業以來至今都還在持續的擴展與變化，從新宿到橫濱原本所需要的時間約為40分鐘，這還不包含需要到品川轉車與等車的時間。湘南新宿線初開業時就將新宿到橫濱的時間縮短成29分鐘即可到達，大幅縮減了原本所需要的時間，2004年10月改正了特別快速的班次，相同區間的運行更是縮短到27分鐘。
概要
湘南新宿線車輛E231系電車新線開通初期每天只開行25對列車，其中宇都宮線・高崎線的直通列車有18對，並有運行東海道・橫須賀線方向至新宿站後折返的短途列車，但並無針對東京站與上野站為起點車次的輔助列車。隨著乘客量增加而開始增加班次，且因池袋站內軌道配置改良完成，大大提高了增班的能力，在2004年10月16日的時刻表修訂中，湘南新宿線開始所有列車直通南北，並大幅提高至每天64對列車。宇都宮線～橫須賀線系統與東海道線～高崎線系統兩者互動運行，大宮站～大船站之間運行數量大約毎小時4班、早上毎小時6班。停車站請參閱停車站一節。全部列車皆使用E231系電車，其中兩節為雙層綠色車廂（高級車廂）。
湘南新宿線的開通，大為影響與其競爭的私鐵路線，特別是在橫濱站～澀谷站區段競爭的東京急行電鐵以及新宿駅～藤澤站、小田原站間競爭的小田急電鐵造成很大的威脅。因此，各公司皆推出新的對抗政策。東急在2001年3月湘南新宿線運轉開始前之的調整時刻表中，增加了東橫線的特急列車，強化澀谷站～橫濱站（～元町・中華街站）間的快速運輸，此外也預計在2012年度與東京地下鐵副都心線互相直通運行，因此與湘南新宿線間的競爭也會延長為橫濱與池袋間。小田急則於2002年3月的時刻表調整時，新設藤澤站～新宿站間的“湘南急行”列車，又於2004年12月的時刻表調整中取消，改以新設江之島線與小田原線的“快速急行”來取代，以提升快速到達的能力。
另外，湘南新宿線的車資計算方法與實際行駛距離不同，在池袋～赤羽間是以經過埼京線（赤羽線）來計算，大崎～橫濱間與由東京方面駛來的橫須賀線列車相同，皆以經過品川來計算。
背景
湘南新宿線與民營鐵路公司間的競爭對策（參考記事）。
近年以來，JR東日本在首都圈在來線的運輸量有下滑的傾向，一方面是因為少子、高齡化的社會變化，另一方面則是東急目黒線、東京地下鐵南北線、埼玉高速鐵道線開始相互直通運轉連結成運輸網路，形成競爭的壓力，因此必須設立新的神奈川、東京、埼玉方面經由新宿直通的列車來面對競爭。
北關東、南關東間連結運輸之需要性存在
依照下表所示，由北關東（此處為栃木縣・群馬線）至東京都、神奈川線的旅客需求相當大，實施直通運轉可以對應此需求，同時也期望可藉此開拓新的客源。
各都縣間鐵道旅客流動狀況（2000年）
（單位：千人/年）
運輸省調查
車輛運用的合理化與都心車輛基地的活用
從JR東日本的經營面來看，包含湘南新宿線在內的南北直通運轉可以的到以下的好處：
共同運用車輛可以減少所需要的車輛數
透過車輛基地的共通使用，可以減少整備的費用
位於都心區的車輛基地可以移轉至郊外，可增加再開發的可能性。
因此JR東日本在東北縱貫線計畫完成後，計畫將廢除田町電車區，並整理品川車輛基地予以再開發。
經由路線
湘南新宿線東北貨物線（大宮站～田端站間）：來自宇都宮線及高崎線的列車至大宮站後轉入東北貨物線（線籍屬東北本線），至赤羽站前與上野發車之中距離列車行走的東北本線旅客線還有京濱東北線（線籍屬東北本線）並行，因為貨物線沒有月台，並沒有停靠旅客線列車有停車的埼玉新市中心站與浦和站。浦和站現在正進行高架車站工程，日後預計新設月台增加停靠。赤羽站到站後，於京浜東北線王子站附近，轉往尾久車輛中心方面（尾久站）方向的旅客線，沿著東京新幹線車輛中心與京浜東北線並行，在田端站（操車場）附近鑽過京浜東北線於西側分離。
山手貨物線（田端站～大崎站間）：自田端站（操車場）附近開始至大崎站為止行駛在山手貨物線（線籍為山手線）上，中里隧道通過之後、駒込站附近～大崎站間與山手線平行。此區間有月台的站為池袋站、新宿站、澀谷站和惠比壽站。於池袋站與埼京線（赤羽站～池袋站間的正式路線名稱是赤羽線）合流，至大崎站與埼京線在同一線路上行駛，田端站並未停靠。現在停車站有大宮、赤羽、池袋。
大崎支線（大崎站～舊蛇窪信號場間）：自大崎站出來後，相對於與埼京線相互直通運轉的東京臨海高速鐵道臨海線直接進入地下，湘南新宿線進入有大彎道稱之為“大崎支線（蛇窪線）”的一個短聯絡線，此線與橫須賀線列車行駛的品鶴線立體交叉後，在西大井站前的舊蛇窪信號場與品鶴線合流，但大崎支線其實是在“大崎站設施內”，並沒有正式的路線名，舊蛇窪信號場現在其實也是大崎站設施一部份。
品鶴線～橫須賀線（舊蛇窪信號場～鶴見站～大船站間）：從舊蛇窪信號場至大船站（東海道線系統的列車是戶冢站）為止與橫須賀線列車同一路線行駛，此區間線籍上屬於東海道本線，到鶴見站為止與東海道旅客線合流的區間通稱品鶴線。此外，從新鶴見信號場到大船站的區間是1980年SM分離後橫須賀線列車的専用路線，一般在此為求簡便稱為橫須賀線（橫須賀線線籍上的區間是大船站～久里濱站）。舊蛇窪信號場～大船站間，由東京方面而來的橫須賀線列車停車站有西大井站、新川崎站、橫濱站、保土谷站、東戶冢站與戶冢站，湘南新宿線中東海道線～高崎線快速列車在西大井站、新川崎站、保土谷站、東戶冢站等4站為通過，而宇都宮線～橫須賀線（包含往大船）的普通列車則全站皆停。與東海道線直通的列車在戶冢站內南端的橫渡線上自橫須賀線轉線。
歷史
湘南新宿線東北貨物線、山手貨物線的旅客化：利用山手貨物線的旅客列車在1980年代前半以前多半僅限於不定期列車、臨時列車。
1959年9月起至1964年9月新宿站～日光站間運行不定期準急“中禪寺”。此外，在東北、上越新幹線開業以前，於歲末年終等探親交通尖峰季節，為了解決上野站發車列車不足的現象，東北本線、奧羽本線、上越線、信越本線方面的下行臨時列車中的一部份由品川站始發，經過山手貨物線～東北貨物線來運轉。由橫濱方面往日光方面的修學旅行列車（集約臨）等在品川站轉換方向經過山手貨物線、東北貨物線運轉。
1984年3月：東北貨物線的大宮站～赤羽站間旅客化，平日早上交通尖峰時段的東北本線（宇都宮線的稱呼是從1990年開始）、高崎線中距離列車之一部份運轉經過貨物線至赤羽站。
1985年9月30日：赤羽線的赤羽站～池袋站間做為埼京線運行開始。
1986年3月3日：前年開業的埼京線（大宮站～池袋站）往新宿站延長、山手貨物線的池袋站～新宿站間旅客化。
1988年3月13日：由池袋站發車的東北本線、高崎線中距離列車由東北貨物線經過山手貨物線列車整日毎小時1班運轉開始，。
1990年代：由高崎線、宇都宮線方面經過山手貨物線往橫須賀線、東海道線的直通臨時列車“假期快速”運行開始。
1991年3月19日：“成田特快”運行開始。往新宿、池袋列車自橫須賀線品川站開始經過品鶴線～山手貨物線運轉。
1995年12月1日：至池袋站為止的一部份宇都宮線、高崎線列車（主要為夜間）延長至新宿站發車，池袋站～新宿站間與埼京線同樣于山手貨物線上行駛。
1996年3月16日：埼京線往惠比壽站延伸，于山手貨物線新設定澀谷站與惠比壽站。
1998年3月14日：假期快速“ビュー湘南”・“ビュー鎌倉”運行開始。
“ビュー湘南”是新宿站～平冢站・小田原站間、“ビュー鎌倉”是新宿站～鎌倉站間、1日1往復以215系運轉，自新宿站開始，經過線路為山手貨物線～大崎支線～橫須賀線。“ビュー湘南”是在橫濱站東海道線月台發車、往東京方向轉線。湘南新宿線開始後終止運行。
1998年12月8日：“成田特快”在池袋站發車列車的一部份經由東北貨物線改延長至大宮站發車。
湘南新宿線2001年12月1日：隨著時刻表的調整開始運轉，一天中25往復，為了將來可以在增加班次，開始進行池袋站北側山手貨物線與埼京線的立體交叉工程。
2002年5月：因為池袋站北側山手貨物線與埼京線立體交叉工程的影響，在工程結束以前，山手貨物線大冢～池袋間靠近池袋的一部份區間為單線，當時的湘南新宿線時刻表便是以此工程而單線化的前提，因而影響時刻表的編成。
2002年12月1日：隨著東京臨海高速鐵道臨海線全線開通與大崎站的埼京線、臨海線用月台的開始使用，全列車於大崎站靠站，同時以傍晚→夜間為中心湘南新宿線増發（計38往復），為了防止誤乘，“湘南線”早上上行列車名改為“おはようライナー新宿”、傍晚下行列車改為“ホームライナー小田原”。
2004年6月6日：池袋站北側山手貨物線與埼京線立體交叉化工程完工，池袋站南側與埼京線的平面交差消除，因此湘南新宿線列車可以大幅增班。
2004年10月16日：時刻表調整
湘南新宿線增發（38→64往復）以及全列車南北直通運轉開始，運轉時間帶擴大至全日。
廢止新宿站折返列車及宇都宮線、高崎線之池袋站、新宿站折返列車，同時削減一部份東海道線、橫須賀線於東京站、橫濱站發車列車及宇都宮線、高崎線於上野站發車列車，移往湘南新宿線。這樣的調整使以靜岡車輛區113系8輛編成（4輛x2連）運轉的普通列車（於橫浜靜岡方面折返）消失。早上・夜間的増發時刻表有許多沿襲改正前宇都宮線、高崎線的池袋站、新宿站折返運轉列車。
日間時段東海道線～高崎線系統列車中“特別快速”登場，在高崎線側停車站也包含替換高崎線於上野發車之日間快速列車“アーバン”，東海道線側則是為了確保東京發車電車中現況運轉列數6班（3班熱海發車普通電車・2班小田原發車普通電車・1本熱海發車快速アクティー），以追加東京發車列車的形式於湘南新宿線增發。
大船發至大宮但未與宇都宮線直通的普通列車同一時間廢止。
隨著特別快速的登場，一部高崎線內快速電車的快速運轉廢止。
統一為全列車E231系連結綠色車廂2輛共15輛編成或10輛編成，一部份區間開始以120km/h運轉。
2004年12月31日起至2005年1月1日實施限期的終夜運轉，運行於高崎線～橫須賀線直通系統，大崎站～大船站間全區間各站停車，但從此以後並沒有再度實施，具有實驗的性質，之後的終夜運轉是在系統宇都宮線～橫須賀線系統運行普通列車。
運行系統
湘南新宿線宇都宮線～橫須賀線系統
湘南新宿線普通（橫須賀線普通-≪大船-大宮：普通≫-宇都宮線普通）：2001年
湘南新宿線普通（橫須賀線普通-≪大船-大宮：普通≫-宇都宮線快速）：2004年※1
東海道線～高崎線系統
湘南新宿線快速（東海道線普通-≪大船-大宮：快速≫-高崎線普通）：2001年※2
湘南新宿線特別快速（東海道線特別快速-≪大船-大宮：特別快速≫-高崎線特別快速）：2004年
※1：南行在大宮以北、北行在大崎以北稱為“湘南新宿線快速”
※2：北行在大崎以北稱為“湘南新宿普通”
此外，過去高崎線～東海道線系統在高崎線內快速運轉，東海道線內各站停車的“快速”是在2001年開業～2004年運行，高崎線內（大宮以北）的停車站與現在的特別快速相同，於惠比壽有停車。
在經由路線中記載，東海道線直通列車是在舊蛇窪信號場～戶冢站間與橫須賀線列車同一路線行駛，戶冢站～大船站間轉往東海道線，因此，東海道線系統的列車在大崎站～戶冢站間稱之為“快速”“特別快速”，橫須賀線停車站東戶冢站、保土谷站、新川崎站、西大井站等各站通過。
湘南新宿線的東海道線直通列車，於橫浜站～戶冢站間與橫須賀線列車同一路線行駛，於橫須賀線月台發車。因此，橫浜站與戶冢站間要搭乘湘南新宿線東海道線直通小田原方面（南行）列車時，要在橫須賀縣月台搭車而非東海道線月台。在戶冢站是在同一月台對側發車因此沒有問題產生，但是在橫浜站兩線是在不同月台，如果想要搭乘比較時間近的班次，首先得要先確認要搭乘東海道、橫須賀的哪一線再在到該列車月台搭車，如果遇到電車誤點，發布列車時刻變更時，必須在狹窄的月台與樓梯移動到別的月台。在大船站里逗子・大船發車與到站在橫須賀線月台，小田原・國府津・平冢發車與到站使用東海道線月台，因此在同站要搭乘往新宿・池袋方面（北行）列車，必須要依照列車而變更月台。
在戶冢駅因有東海道線與橫須賀線（湘南新宿線）的方向別月台，橫須賀線與東海道線、往東京方面列車與往新宿方面列車可以相互在同一月台轉乘，便利性相當高。但自湘南新宿線東海道線直通列車轉乘往橫須賀線大船以南時，在戶冢站轉乘會需要等待後續列車，需依據時間帶在大船站轉乘先於站內停車中的橫須賀線列車。
於首都圏年終年初時實施的終夜運轉，在湘南新宿線以往鎌倉市鶴岡八幡宮初詣的客人為對象，運行宇都宮線～橫須賀線系統的普通列車。
停車站
各直通區間內的停車站請參照各路線的條目。
往東海道本線小田原站、橫須賀線逗子站、宇都宮線（東北本線）宇都宮站、高崎線高崎站及兩毛線前橋站直通。但是觀光季節時，高崎線～東海道線系統的特別快速會延長運轉小田原～熱海間1往復。
※1：路線戶籍上屬東海道本線、行駛橫須賀線電車行駛的路線（通稱品鶴線）。
※2：預定2009年度開業
※3：預定2012年度開始使用月台
※4：一部份電車於大船站折返。
※5：北行於大崎～大宮間以“湘南新宿線宇都宮線直通快速”來標示與介紹
※6：北行於大崎～大宮間“湘南新宿線高崎線直通普通”來標示與介紹
列車編號
湘南新宿線千位數字
表示運轉系統種類別。
1:湘南新宿線普通（橫須賀線：普通～宇都宮線：普通）
2:湘南新宿線快速（東海道線：普通～高崎線：普通）
3:湘南新宿線特別快速（東海道線：特別快速～高崎線：特別快速）
4:湘南新宿線普通（橫須賀線：普通～宇都宮線：快速）
百位數字、十位數字
依據上述運轉系統，依發車時刻順序排列，南行（大船方面）由10開始、北行（大宮方面）60開始，但有一部份缺號。
個位數字
全列車列車編號個位數皆為0。
尾數英文字
表示進行方向。
Y:大船方面（東海道線方面、橫須賀線方面）
E:大宮方面（高崎線方面、宇都宮線方面）
廣播與指示
湘南新宿線在導入東京圏輸送管理系統(ATOS)的車站內之自動廣播，以同様的順序進行介紹「まもなく1番線に湘南新宿ライン東海道線直通特別快速小田原行きがまいります。危ないですから黃色い線までお下がり下さい。」〈“在1號線即將到達的是湘南新宿線直通東海道線開往小田原的特別快速列車。為了避免危險請於黃色線後等候。”〉（以新宿站為例）。但是因為內容很繁瑣，也有車站省略介紹“湘南新宿線”與“直通路線名”。
車站內的介紹標示：隨著湘南新宿線的増發，車站內的介紹標示也產生變化。在剛開始運行時的介紹標示是“東海道線橫濱・大船・小田原方面（湘南新宿線）”（以新宿站為例）等以直通方向為主，“湘南新宿線”的字樣為副，但是，最近山手線內各站（池袋站、新宿站、澀谷站等）及赤羽站的介紹是“湘南新宿線橫濱・大船・小田原・逗子方面”，以“湘南新宿線”表示直通路線名省略，此外，剪票口附近的發車時刻介紹指示器有設定湘南新宿線専用的部分。
路線圖示示：在車內的停車站介紹圖裡，小山車輛中心車輛標示為“湘南新宿線（宇都宮線系統、高崎線系統）・宇都宮線・高崎線”，國府津車輛中心車輛是“東海道線・伊東線・湘南新宿線（東海道線系統）・高崎線”。前者沒有東海道・橫須賀線東京口的標示線西端只到小田原為止，後者於高崎線上野口只有普通列車的標示線沒有“快速アーバン”與“通勤快速”的標示線。
一直以來在“東京近郊路線圖”里與東海道線路線色是同色（橘色）的線，描繪的方式是以橘色的線由新川崎方面往橫濱方面延伸，與東京發車的橘色線合流，然後這個橘色線由大船往逗子方面延伸，這會讓人誤以為自東京方面開始的橘色線（東海道線）也與橫須賀線是直通，之後於2004年10月16日時刻表調整更新的“東京近郊路線圖”里，湘南新宿線使用專用的線（紅色），與東京方面發車的東海道・橫須賀線及上野發車的高崎・宇都宮線並行描繪，這是為了在路線圖上與相鄰的線上顏色上方便區分所以使用紅色，湘南新宿線的公式路線色並非紅色，在車站內的搭乘簡介中是使用直通路線的顏色（橘色・藍色）。
“湘南新宿線”介紹的省略：經過新宿站之後，進入直通路線的北行列車在大宮站以北、南行列車在戶冢站以南，利用者已經不需要區分是湘南新宿線列車或東京、上野列車，所以在上述區間車站內的標示與列車目的地告示常常省略“湘南新宿線”。
在湘南新宿線運行開始以後，自宇都宮線・高崎線轉入的列車，在新宿・池袋・赤羽各站，北行列車標示中也有省略“湘南新宿線”的時候。
通過大宮～大船之後，在車站及車內的介紹與指示皆不再有“湘南新宿線”的字樣（例：北行的車內指示文字從赤羽出發後為“本電車、湘南新宿線直通宇都宮（高崎）線。”，到達大宮後改為“此一電車、宇都宮（高崎）線。”）。另一方面，車外LED式行先表示器通常在全區間皆有“湘南新宿線○○線直通”的字樣。其他內容如以下描述：
南行快速在戶冢～小田原區間、北行快速在大崎～前橋區間都是各站停車，通常會消去“快速”的標示，但是乘務員常常沒有消去“快速”，通常是與東京・上野方面來的普通列車切換同樣的標示（“東海道線”或“高崎線”⇔“○○（目的站名)”互動）。“特別快速”因為並非只有湘南新宿線，所以標示不會在途中消除。在快速方面，南行於宮原發車時還沒有標示“快速”，到達大宮前到於橫濱發車時會標示“快速”，到戶冢之前“快速”標示再消失。北行在橫濱發車前標示“快速”，到大崎前“快速”標示消失。這一部份與宇都宮線內快速運轉的普通同一時機切換（南行到達大宮前“快速”消失，北行大崎到達前標示“快速”）。
南行普通自西大井開始“湘南新宿線橫須賀線直通”的終點標示，多半會依乘務員的判斷只標示目的站名（“大船”或“逗子”）。“橫須賀線”並沒有載入E231系的行先表示器設定ROM中。
由新宿方面而來由E231系運行的15輛編成與東京・千葉方面而來由E217系運行的15輛編成在綠色車廂的停車位置不同，因此西大井～鎌倉的各站下行月台，湘南新宿線列車月台時刻表文字色會改變做區別，月台上LED的列車介紹標示也會有所不同。有的湘南新宿線的列車會標示“10輛4門”或“15輛4門”。
別
但東京急行電鐵與京王電鐵等車內或車站標示的路線途中，只寫山手線與埼京線，湘南新宿線常被省略。（因為並非正式名稱)
