領導班子
局長、黨組書記：陳如軍
副局長：劉自更、蘭雙萱、龐革新、汪葛平
省紀委派駐省地方稅務局紀檢組組長：楊劍華
總會計師：陳潔
副巡視員：鄧德海
機構歷史
1998年8月財稅分設。海南省地方稅務局升格為省政府直屬機構（正廳級）。海口市設立地方稅務局（正處級）；其他各市縣財政稅務局分設為財政局、地方稅務局，均為同級政府工作機構。全省地方稅務機構實行省局垂直管理體制。內設辦公室、計畫財務處、人事教育處（與機關黨委、工會合署辦公）、監察處、法規稅政處、徵收管理處、所得稅管理處、農業稅管理處（局）、信息處等9個處級職能機構和稽查局（處級直屬機構）。垂直管理海口20個直屬地稅局。
2000年5月，省政府根據中央、國務院機構改革方案，對省地方稅務局內設機構進行了調整。2000年11月，省政府決定將社會保險費改由地方稅務機關徵收，並批准設定海南省地方稅務局社會保險費征稽局。海南省地方稅務局內設辦公室、計畫財務處、人事教育處（與機關黨委、工會合署辦公）、紀檢監察室、法規稅政處、徵收管理處、所得稅管理處、農業稅管理處（農業稅徵收管理局）、社會保險費征稽局等9個處級職能機構，下設稽查局（處級直屬機構）和信息中心（處級附屬事業單位），2003年瓊山市併入海口市後，垂直管理海口等19個直屬地稅局。
2002年7月，海南省人民政府批准海南省地方稅務系統機構改革方案，再次明確了全省地方稅務系統機構設定、職能配備和人員編制。全省地方稅務系統實行省以下垂直管理；各市縣農稅局和社會保險費的征稽機構，實行省地方稅務局與市縣政府雙重管理，除海口、洋浦經濟開發區以省地方稅務局管理為主外，其他市縣以市縣政府管理為主的管理體制。
2006年4月，共青團海南省地方稅務局委員會成立。
2007年11月，為理順機構設定，建立健全管理機制，海南省地方稅務局內設機構進行了新調整，將局法規稅政
處分設為政策法規處和地方稅管理處。至此，海南省地方稅務局內設辦公室、計畫財務處、人事教育處（與機關黨委、工會、團委合署辦公）、紀檢監察室、政策法規處、地方稅管理處、徵收管理處、所得稅管理處、農業稅管理處（農業稅徵收管理局）、社會保險費征稽局等10個處級職能機構，下設稽查局（處級直屬機構）和信息中心（處級附屬事業單位）。
2008年，海南省地方稅務局內設機構進行了增設，新設立了營業稅管理處、規費管理處、行政審批辦公室，至此，海南省地方稅務局內設13個處級職能機構，下設稽查局（處級直屬機構）和信息中心（處級附屬事業單）。
2009年，海南省地方稅務局主要職責、內設機構、人員編制進行了調整，根據職責內設機構調整為辦公室、組織人事處（原人事教育處，機關黨委、工會、團委、老幹部工作處合署辦公）、政策法規處、督察內審處（新增機構）、徵收管理處、納稅服務處（大企業稅收管理處）（新增機構）、營業稅處、地方稅處、所得稅處、耕契稅處（原農業稅管理處）、社會保險征稽局、規費處、行政審批辦公室等14個處級職能機構，下設省局稽查局（處級直屬機構）、省局第一、二、三、四、五稽查局（副處級直屬機構）和信息中心（處級附屬事業單位）。 2009年，全省地稅稽查體制進行了改革，將全省原有的20個稽查局整合為6個，建立省級分片稽查體制，即：海南省地方稅務局稽查局、第一稽查局、第二稽查局、第三稽查局、第四稽查局、第五稽查局，海南省地方稅務局稽查局為直屬正處級機構，負責全省地方稅務稽查工作。
人員編制
全省地稅系統人員編制3556人，其中公務員編制3226人、事業人員編制245人、工勤人員編制85人。
內設機構
海南省地稅局機關內設辦公室（信訪處）、組織人事處（機關黨委、工會、團委、老幹部工作處合署辦公）、計畫財務處、政策法規處、督察內審處、征管和科技發展處、納稅服務處、大企業稅收管理局、營業稅處、財產和行為稅處（原地方稅處）、所得稅處、房地產稅收管理處（原耕契稅處）、社保規費征管處、行政審批辦公室等14個處級職能機構，下設省局稽查局（正處級直屬機構）和電子稅務管理中心（正處級附屬事業單位）。
直屬機構
海南省地方稅務局直管海口、三亞、瓊山、瓊海、儋州、萬寧、文昌、定安、屯昌、澄邁、臨高、東方、昌江、白沙、通什、保亭、陵水、樂東、瓊中、洋浦等19個直屬地稅局。海口、三亞、洋浦地稅局為正處級機構。
主要職能
職責調整
1、取消已由國務院、國家稅務總局公布取消的行政審批事項。
2、將省局機關紀檢監察職責劃給省紀委。
3、加強推進納稅服務體系建設，著力改進納稅服務的職責，構建和諧的稅收征納關係。
4、加強以大型企業為重點的稅源監控，不斷提高個性化、專業化服務水平。
5、強化內部審計職責，加強對稅收執法權、行政管理權的監督制約，推進依法行政，加強廉政建設。
主要職責
1、貫徹執行國家稅收法律法規、部門規章及規範性檔案，結合本省實際情況，制定具體的實施辦法。
2、貫徹執行稅收徵收管理法律法規、部門規章及規範性檔案，研究制定具體的實施辦法，組織實施本系統稅收徵收管理改革。
3、根據本地區經濟發展規劃，制定本系統稅收發展規劃和年度計畫並組織實施。
4、負責國家和省人民政府規定的地方各稅、費、基金的徵收管理、稅源管理、納稅評估、反避稅工作，力爭稅款應收盡收；負責普通發票和其他稅收票證管理工作。
5、監督檢查本系統的稅收執法活動和內部行政管理活動；負責稅務行政處罰聽證、行政複議和行政應訟工作。
6、負責規劃和組織實施納稅服務體系建設；制定和監督執行納稅服務管理制度；貫徹執行納稅人權益保障制度，制定具體的實施辦法。
7、組織實施對納稅人進行分類管理和專業化服務，組織實施對大型企業的納稅服務和稅源管理。
8、編制、分配本系統稅收計畫並組織實施；負責本系統的稅收會計、統計核算工作。
9、負責規劃和組織實施本系統稅收管理信息化建設；制定本系統稅收管理信息化制度。
10、組織開展本系統教育培訓、思想政治工作、精神文明建設及廉政建設、反腐敗工作、行風建設、內部審計等工作。
11、垂直管理本系統的機構、編制、人員等工作。
12、承辦國家稅務總局和海南省人民政府交辦的其他事項。
