遊戲特色
遊戲UI界面與前作比較起來，《洛克人X5》用到了PS頗佳的硬體機能，遊戲的聲光效果均非常華麗，背景採用少見的多重捲軸處理，使爆炸更具震撼力，若喇叭開大聲一點或許還會產生置身其中的錯覺，不過可別因此就炸得很快樂，萬一不幸炸到自己可就欲哭無淚了。遊戲中的音樂也極盡熱血之能事，應該會讓玩家不自主地努力往前邁進，前往敵窟大鬧一番。
《洛克人X5》也繼承了系列遊戲的所有特色，而比較不同的是在本作里玩家必須到處收集與找尋組裝零件，因此可能會使得同一個關卡要重複通過數次才能夠完全達到目的，同時也讓遊戲的耐玩度加深不少，而主角X還可以一開場就以全副武裝的姿態登場。換言之，遊戲的難度也會因此大幅下降，這對於不擅長此類遊戲的玩家來說應該是個好訊息吧。
劇情簡介
主要劇情
21XX年，“Repliforce（改造軍團）大戰”（《洛克人X4》的劇情）結束後，地球受影響地區以及各太空殖民地的修復工作正在有條不紊地開展。異常者獵人部隊也迎來了新的總監Signas，能力優秀的機械工程研究員Alia、機械工程師Douglas也相繼加入。經過數月的努力，除了位於拉格朗日宙域地帶的殖民地歐拉西亞『ユーラシア(Eurasia)』外，其餘所有受影響地區的重建工作都已基本完成。由於歐拉西亞已經是非常老舊的殖民地了，因此有關部門經研究後決定對其進行翻新和改造。
太空殖民地──歐拉西亞突然某一天，神秘人物潛入了歐拉西亞並向它的中樞控制系統植入病毒，導致大規模的惡性爆炸及機器暴走事件發生。接報後，異常者獵人部隊馬上命令X和Zero緊急出擊，並於興建中的女神像附近將暴走的機器“Σ Head”擊倒──原來這一系列事件都是Σ策劃的，他又再次復活了。然而，令X和Zero沒有想到的是，Σ是故意讓X和Zero將“Σ Head”擊毀的，機器內部裝滿了Σ病毒，隨著機器的爆炸病毒也以非常快的速度散布至整個地球，令很多Repliroid產生異常化現象。另一方面，由於動力系統被病毒破壞，歐拉西亞已無法再在原來的軌道運行，受地球引力作用影響將於16小時內墜落地球。一旦它撞擊地面，產生的效應將與巨大隕石撞擊地球無異……
為了應對緊急事態並化解危機，異常獵人部隊司令部打算使用Repliforce廢棄的粒子大炮艾尼格瑪『エニグマ(Enigma)』將歐拉西亞擊毀，於是便派X和Zero去收集發射大炮所需的有關零配件，而這時候導致歐拉西亞墜落的直接兇手──Σ雇用的僱傭兵Dynamo又不時來異常者獵人部隊基地騷擾。與一眾異常者戰鬥的過程中，Zero逐漸開始覺察到自己身體出現的異常情況。到底Zero出了什麼問題？地球的命運將何去何從？X和Zero的結局又將如何……
分線劇情
除主要劇情的內容外，本作的後續劇情走向可以視玩家的遊戲情況或系統的隨機選擇而定。全作在歐拉西亞事件爆發後總共有兩大不同的劇情發展方向（細分又有不同的產生條件），但最後的敵人還是Σ：
一、 X和正常狀態的Zero決戰
艾尼格瑪成功將歐拉西亞完全擊毀。之後，零空間和Zero病毒突然在11F5646地點出現，Zero隨即前往調查並逐漸攻入零空間深處。但異常者獵人部隊擔心Zero在零空間作戰會有異常化的危險，便馬上派X和救援小組前往尋找Zero……
艾尼格瑪未能擊毀歐拉西亞，Zero駕駛太空梭進入歐拉西亞引爆並將其完全炸毀。任務完成後，Zero乘坐太空梭的逃生艙回到地球，降落在11F5646地點附近。然而，零空間和Zero病毒卻突然在該地點出現，於是Zero單槍匹馬闖入零空間一探究竟，而異常者獵人部隊則派X和救援小組前往該處營救Zero……
1.艾尼格瑪成功將歐拉西亞完全擊毀
2.艾尼格瑪未能擊毀歐拉西亞，Zero駕駛太空梭進入歐拉西亞引爆並將其完全炸毀。
艾尼格瑪完全擊毀歐拉西亞這兩條分支線都只有在歐拉西亞被完全擊毀時才會發生，其結果都是 Zero沒有覺醒。後續劇情是：Zero在零空間深處與X相遇，X要求Zero跟救援小組回異常者獵人部隊司令部接受檢查，零空間的戰鬥交由自己接手；而Zero反而擔心X和救援小組長時間留在零空間會被病毒感染，讓他們回去，自己繼續零空間的戰鬥。雙方談不攏的情況下，X只好跟Zero動手，結果兩敗俱傷，兩人均陷入昏迷。藏在暗處的Σ想趁機殺死X，但及時醒來的Zero阻止了他，剩下的任務就是打倒Σ……
二、 X和覺醒Zero決戰
艾尼格瑪未能擊毀歐拉西亞，Zero駕駛太空梭進入歐拉西亞引爆但未能將其完全炸毀，歐拉西亞殘骸中的幾個較大的碎塊墜落地球。異常者獵人部隊全體向地下基地撤退，地球表面受到重創但因為碰撞面較分散躲過了最壞的情況。應急通訊恢復後Signas隨即下令搜救Zero，但Alia突然截獲關於Zero下落的緊急通訊……
16個小時過去，異常者獵人部隊未能將歐拉西亞擊碎（要么是還沒有找齊發射艾尼格瑪的配件，要么是還沒有找齊太空梭的零件），整個歐拉西亞墜落在E區的5646點位。此時X和Zero還在世界各地收集零配件，異常者獵人部隊全體向地下基地撤退。撞擊發生幾小時後，X回到了異常者獵人部隊的地下基地，Signas下令開始搜救生還者。這時Alia報告，Σ病毒的反應已經消失。突然，一則緊急通訊被傳送到各人面前……
Zero在收集發射艾尼格瑪所需的配件或太空梭的零件期間被Σ病毒感染（即遊戲每個關卡流程界面左下角的角色病毒狀態變成紫色）的次數達到13次或以上。此時Zero會在完成當前關卡流程後隨即陷入覺醒狀態，在異常者獵人部隊司令部的Alia會接收到Zero發來的緊急通訊……
1.艾尼格瑪未能擊毀歐拉西亞，Zero駕駛太空梭進入歐拉西亞引爆但未能將其完全炸毀，歐拉西亞殘骸中的幾個較大的碎塊墜落地球。
2.16個小時過去，異常者獵人部隊未能將歐拉西亞擊碎（要么是還沒有找齊發射艾尼格瑪的配件，要么是還沒有找齊太空梭的零件），整個歐拉西亞墜落在E區的5646點位
3.Zero在收集發射艾尼格瑪所需的配件或太空梭的零件期間被Σ病毒感染（即遊戲每個關卡流程界面左下角的角色病毒狀態變成紫色）的次數達到13次或以上
Zero覺醒這三條分支線發生的基本條件都是歐拉西亞沒有被完全擊毀，其結果是 Zero在病毒作用下完全覺醒。後續劇情是：通訊畫面中，Zero懸浮在一塊岩石的懸崖上方，混身纏繞著紫色的火焰，並揚言要消滅X。X對好友的巨變倍感驚愕，但隨即意識到要救好友自己只能迎戰，而這也是命運的安排，所以當即表示接受Zero的宣戰。Alia很快根據通訊來源發現11F5646地點有很強的能量反應，X隨即動身前往該地區。經過一番激戰後，X終於遇上覺醒Zero，命運之戰開打，最終兩敗俱傷，兩人均陷入昏迷。藏在暗處的Σ想趁機殺死X，先清醒過來並恢復理智的Zero為救X擋下了Σ的攻擊，導致軀體嚴重損壞，最終因傷勢過重死去。X醒來後發現Zero不見了，此時Alia發來通訊稱在X所在的區域附近發現Σ的強烈能量反應。X馬上就意識到又是Σ在搞鬼，以為Zero一定是找Σ算帳去了，於是立即向Σ的所在地進發，既是為了打倒Σ，也是為了找回失散的好友……
（註：除了歐拉西亞整體墜毀的劇情線以及Zero多次被病毒感染的劇情線可以由玩家控制獲得外，其餘三條劇情線會由系統隨機觸發其中之一）
遊戲人物
異常者獵人部隊
艾克斯 （エックス / X；CV：森久保祥太郎）
X洛克人X系列永遠的主角，萊特博士開發的第一代可以自主思考的Repliroid。身體的構造技術至今無人能夠完全破解，凱恩博士在他的幫助下以他為藍本開發出次世代Repliroid，因此他可以稱得上是“Repliroid之父”。異常者獵人部隊成立後，他便加入到第17精銳部隊成為B級異常者獵人。雖然初期戰鬥表現不佳，但他的上司Σ稱其“擁有無限的可能性”。Σ異常化叛變後，他頂替Σ的位置擔任異常者獵人第17精銳部隊的隊長。其身體機能各項平衡，可以進行蓄力式的充電攻擊，能將敵人的DNA轉換為自己的武器，還可裝備萊特博士為他製作的用以提升性能的各種強化裝甲。個人感情細膩，不喜歡以武力來解決問題，在本作主線中目睹了好友Zero覺醒成為自己的敵人但也沒有畏懼，反而表達了自己堅決的意志，最終在和Zero進行宿命對決時遭到Σ偷襲，但在Zero的保護下活了下來，並且帶著Zero留下的武器──Z光劍繼續為世界和平努力奮鬥。
Zero傑洛 （ゼロ / Zero；CV： 置鮎龍太郎 ）
洛克人X系列的第二主角，萊特博士的死對頭——邪惡的威利博士製造的第一代可以自主思考的Repliroid。和X一樣，其身體的構造技術也是至今無人能夠完全破解。原本生性暴戾，且擁有足以毀滅世界的戰鬥力，異常者獵人部隊俘獲他後將他的部分力量和記憶封印，現擔任異常者獵人第0特殊部隊的隊長。擁有極高的實力和身體機動性，同時有著把敵人的DNA轉化為自己招式的獨特學習能力，是一個極少表達個人情感的特A級獵人。他是X的同伴兼前輩，把異常者獵人這份工作看得很重，對待敵人從來不客氣，為了同伴甚至可以犧牲自己。在本作的故事主線中不僅獨力阻止殖民地撞擊地球，還在最終決戰中犧牲自己保護了X，與Σ同歸於盡；同時在劇情方面也揭示了Zero原本的使命──毀滅世界和打X。在遊戲中如果沒能成功擊毀殖民地歐拉西亞，那么Zero會因為感染病毒而覺醒，在遊戲中的剩餘流程玩家將無法再使用Zero。
西格納斯（シグナス / Signas）
Signas配備最高精度思考電路、擁有最強分析能力的非戰鬥型Repliroid，傳聞原是Repliforce參謀部的高級軍官，本作中調任異常者獵人部隊的總監。因為在未作調解的情況下將Repliforce全體認定為異常者，引發了“Repliforce大戰”，導致很多無辜的人和Repliroid喪生（《洛克人X4》的劇情），原來的總監因內疚而辭職；而他則憑敏銳的判斷力和傑出的領導能力被上級相中，繼任成為新的總監。在戰鬥中他都是負責作戰指揮，即便在非常危急的情況下也不會自亂陣腳；心思縝密，總能保持冷靜並作出非常專業和正確的判斷，且從來不會讓自己的情感影響決策。本作里在歐拉西亞事件爆發後，負責指揮發射艾尼格瑪大炮和太空梭引爆兩大作戰任務；期間收到關於Zero可能會異常化暴走的秘密報告，但從大局出發還是決定先對所有人保密並接受Zero的請求讓他負責太空梭引爆任務，而在Zero返回地球時也立即讓X和醫療小組去營救他。（註：官方並沒有公布過Signas的前任總監的名字，但根據現有的設定，凱恩博士是X1-X3時期的總監，而Repliforce是凱恩博士推動成立的，且截至“Repliforce大戰”前的劇情也沒有提及凱恩博士已經卸任，所以這個“Signas的前任”大機率還是凱恩博士）
艾莉雅（エイリア / Alia）
Alia女性科學家型Repliroid，異常者獵人部隊的新成員。金髮藍眼、戴著耳機以及粉白色的外觀是其經典形象，認真、幹練、責任心強，溫柔之餘又充滿知性。以前是一個機械工程領域的研究員，曾經和續作《洛克人X6》中出現的天才科學家蓋特『ゲイト(Gate)』一起工作，因此精於機械工程技術的分析和研發。在本作中調任異常者獵人部隊的領航員，同時兼任接線員和裝備分析師，負責為X、Zero以及其他異常者獵人提供戰場環境、敵人分布等的情報蒐集、分析和指引。因為精於機械研究，所以一來到就能憑殘缺的備份數據將X的Fourth Armor重製，雖然性能無法100%還原但應付一般的戰鬥已經綽綽有餘了（對於這點就連只剩電子影像的萊特博士也對她讚譽有加，所以本作中萊特博士給X的新裝甲都是由她幫X組裝的）。平日裡很關心團隊里的其他成員，絕不會因為自己的情感或私事影響工作，在執行任務時總是盡最大努力為同僚提供最優秀的服務，以免他們受到傷害。儘管如此她也有一段讓她感到內疚的過去，那就是曾經因為自己的無知及受人唆擺處決了一些無辜的Repliroid（本作中未提及，續作《洛克人X6》中會有介紹）。這段經歷曾經令她很受傷，加上她科學工作者的出身，在感性和理性交織之中她逐漸成為一名現實主義者，所以對奇蹟這類事情不太感冒。
Douglas道格拉斯（ダグラス / Douglas）
工程師型Repliroid，異常者獵人部隊的新成員。原本是個機械工程領域的工程師，精通各種機械的安裝和維修。如果說Alia是一個優秀的理論研究員，那他就是一個傑出的技師了。調任異常者獵人部隊之後還是從事自己擅長的工作，負責機械裝備的組裝和維修，本作中的艾尼格瑪大炮以及太空梭都是他修好的。另外，他還可以根據X和Zero的戰鬥特點為他們開發一些強化能力的晶片，比如提高行動速度、衝刺能力、射擊速度及Z劍威力等。為人是個積極向上的樂觀派，平時總是笑容掛在臉上，做起事來是既認真又高效，當遇到棘手的問題或緊急情況時也偶爾會流露出嚴肅的表情。總是對事情獲得解決充滿希望和自信，即便情況變壞時也從不逃避。
八大頭目
本作常規關卡的Boss絕大多數是不幸感染了Σ病毒的Repliroid，大多沒有橫向聯繫。回收他們持有的重要零件，是X和Zero在本作中的一項重要任務。這些Repliroid與X和Zero戰鬥的理由多種多樣，差異很大 。
另外，本作中的Boss引入Level概念，根據遊戲進行的具體情況（獵人級別、歐拉西亞墜落前的剩餘時間）增減級別。不同級別的Boss，血槽長度不一樣，等級越高血槽越長。而常規關卡中的八大頭目的等級更影響到強化晶片的開發，須在他們達到 8級或以上時再打敗他們才能開發出相應的強化晶片。最終關的Boss Rush里，所有Boss的級別會達到最高的96級，血槽長度驚人，從戰鬥場景天井一直拉長到地面。
新月灰熊（クレッセント・グリズリー / Crescent Grizzly）
獲得武器：新月射擊(Crescent Shot) / 三日月斬(Crescent Sword)
獲得晶片：受創緩衝(Shock Buffer) / 超級衝刺(Hyper Dash)
Crescent Grizzly月輪熊型Repliroid，別名“暴走鐵爪”『暴走アイアンクロー(Bousou Iron Claw)』。以前一直以戰勝強大的對手並奪取其武器來感受自己生活的價值，喜歡使用自己的『ドリルアーム(Drill Arm)』戰鬥，背後的火箭噴射器讓他即便擁有巨大的身軀也能敏捷地活動。曾經和Zero交過手，但被Zero打敗且失去右眼，留下的疤痕讓他一直難以忘懷，因此對Zero懷恨在心，相反對X則比較尊敬。現在是一名非法販賣武器的中間商，專門把打鬥中得到的戰利品拿到黑市交易以牟取暴利，最近的生意更是非常紅火。雖然看上去很兇惡，但是並不暴戾，反而認為異常者獵人有時處事非常粗暴而且過度自信。手中持有零件“Crystal Ball”，內含稀有金屬奧利哈剛『オリハルコン(Orichalcum)』，可以使艾尼格瑪大炮在發射時能將能量高度集中以提升威力。歐拉西亞事件爆發後，他受到Σ病毒的感染。後來X和Zero來找他索要Crystal Ball，他向X申明想在被病毒徹底控制前和X好好比劃一下，同時也要向Zero報右眼的一箭之仇。
他的一隻手臂裝備金屬爪，另一隻手臂裝備鏇轉鑽頭，使得他在地底也可以馳騁縱橫，巨大金屬爪可以發射出切裂一切物體的『クレッセントショット(Crescent Shot)』。擁有3種攻擊模式，根據剩餘HP的數量改變攻擊模式。
電壓烏賊（ボルト・クラーケン/Volt Kraken）
獲得武器：三向閃電(Triple Thunder) / 電刃(Electric Blade)
獲得晶片：快速蓄力(Quick Charge) / Z劍攻擊距離加長(Z-Saber Extend)
Volt Kraken烏賊型Repliroid，別名“超電磁陷阱”『超電磁の罠(Choudenji No Wana)』。原本是異常者獵人部隊第6艦隊的成員，由於對異常者獵人總是以武力來解決問題抱有疑問，便放棄了獵人的職務，轉職為能量工學領域的研究員，過著遠離戰鬥的平穩生活，所管理的超電磁研究所擁有可以供艾尼格瑪大炮使用的能源匣『エネルギーカートリッジ(Energy Cartridge)』。還在第6艦隊任職時，與火箭章魚（《洛克人X1》中的Boss）關係親密，然而章魚卻因為參與Σ的叛亂而被X處決。儘管X曾向他表示對此事深感遺憾，而他也認為這純粹是章魚咎由自取，但內心深處仍然對X抱有戒心。烏賊是男性，說出的台詞卻是女性日本語（《洛克人X4》里的網路孔雀也是這種特徵），Zero表示自己無法忍受他這樣的說話口調。歐拉西亞事件爆發後，他受到Σ病毒的感染。X和Zero趕到研究所找Energy Cartridge時，他還剩下一點理智，但對X和Zero還是像以前那樣連招呼都不打就對自己呼來喚去的態度頗感不滿，說著說著話就突然完全異常化了，對X和Zero發起進攻（如果零空間出現後才去找他，他就會是已經完全異常化的狀態，徹底陷入暴走）。
他可以把實驗用觸手轉換成戰鬥用，產生特殊武器『トライサンダー(Tri Thunder)』，是一種超電磁能量彈。
閃光螢火蟲（シャイニング・ホタルニクス / Shining Hotarunicus）
獲得武器：意念鐳射(W Laser) / 滅閃光(Crush Flasher)
獲得晶片：爆裂射擊(Burst Shots) / 除彈器(Shot Eraser)
Shining Hotarunicus螢火蟲型Repliroid，別名“知性的光輝”『知性の輝き(Chisei No Kagayaki)』。姿態與口調都很老練，是鐳射工學領域的權威。由於擔心自己的技術被用來製造武器，所以他很少將研究成果公諸於眾。他把研究所建於千島群島附近，並根據自己的喜好改造成了城堡要塞的風格，內有可令艾尼格瑪大炮的火力引擎提升動力的鐳射裝置『レーザー裝置(Laser Souchi)』。此外，他對異常者獵人經常使用武力解決問題的做法抱有疑問，所以對異常者獵人部隊一直採取不合作的態度，但卻對無人能解析的X、Zero的身體構造抱有興趣。歐拉西亞事件爆發後，他受到Σ病毒的感染。X和Zero趕到研究所找他時，他已經意識到自己出現問題，為求解脫便請求X和Zero和自己一戰，同時也當成是進行最後一次研究實驗。
戰鬥武器是螢火蟲型誘導飛彈與尻尾發光器放出的極粗雷射等。Capcom官方頁面上說，螢火蟲可以在遠處遙控特殊武器『ウイルレーザー(Will Laser)』，以此掩護自身移動能力低的缺陷。
潮汐鯨魚（タイダル・マッコイーン / Tidal Makkoeen）
獲得武器：凝膠剃刮(Gel Shaver) / 飛水翔(Fly Splasher)
獲得晶片：超級恢復(Super Recover) / 節能器(W-Energy Saver)
Tidal Makkoeen抹香鯨型Repliroid，別名“大海的守護神”『大海の守護神(Daikai No Shugoshin)』。他是海洋博物館的館長，同時兼任海上警備隊隊長，很久前就已經認識X和Zero。他對自己守護的海域有著高度的責任感，有時候甚至不顧慮個人安危也要完成任務。不知是何原因，與Repliforce海軍的關係很差，時常發生摩擦，吵鬧不絕。他所負責的海域離異常者獵人部隊總部很近，該海域裡富含大量的『水素(Suiso)』，這既是能快速提取大量氫元素進行核融合的原料，也是艾尼格瑪大炮運作所需的主要燃料。歐拉西亞事件爆發後，他受到Σ病毒的感染。X和Zero趕到時，他感慨大海已經死了，病毒也已經快要讓他完全異常化，希望在還有自我意識時能與X和Zero比試一次，既是聚舊也是訣別，只求痛快一死後長眠於自己深愛的大海。
主力武器是口吐冰磚建材，頭部發射高水壓產生液狀特殊凝膠，同時還裝備著飛彈。特殊武器『ジェルシェイバー(Gel Shaver)』在地上以刮削之勢沿地面移動。
另外，他所在關卡的背景音樂是《洛克人X2》里的巨鉗泡蟹關卡BGM的重製版。本作的Sound Track里收錄了抹香鯨關卡原本預定使用但實際未使用的BGM。
疾風飛馬（スパイラル・ペガシオン / Spiral Pegacion）
獲得武器：螺鏇暴風(Wing Spiral) / 疾風(Wind Shredder)
獲得晶片：高大跳躍(Hi-Jump) / 加速移動(Speed Move)
Spiral Pegacion天馬型Repliroid，別名“空軍王子”『エアフォースプリンス(Air Force Prince)』。個性認真而又充滿正義感的Repliforce成員，但有時因為年少氣盛，在執行任務時也偶爾會犯一些錯誤。在前作《洛克人X4》里，原Repliforce空軍統帥暴風貓頭鷹在Repliforce大戰中被X消滅，於是他在戰爭結束後被擢升以填補空缺，擔任Repliforce空軍的新統帥。其所管轄的空軍基地位於挪威西海岸，內有可增強太空梭機動力的軌道翼『オービターウィング(Orbiter Wing)』。他把X4里戰死的Repliforce最高司令官傑乃拉爾和副司令官卡尼爾視作老師敬仰，至今無法忘卻；而且似乎也與卡尼爾的妹妹愛莉斯認識，所以即便事過境遷，但依舊無法完全諒解殺害了傑乃拉爾、卡尼爾和愛莉斯的X和Zero。雖然年輕卻不像某些人那樣說話直來直往，即便面對害死傑乃拉爾、卡尼爾和愛莉斯的X與Zero，至少表面上可以冷靜應對，仇恨不掛在嘴上，給人一種深謀遠慮的感覺。歐拉西亞事件爆發後，他受到Σ病毒的感染。當X和Zero找到他時，他坦言Repliforce空軍已經全體受到感染並即將毀滅，X是最後的希望，所以想在自己還沒失控時與X和Zero比試，以確信X能肩負起拯救世界的重任，同時也是為了卡尼爾與Zero一戰（若在零空間出現後才去找他，他便會是完全異常化的狀態，已經語無倫次了，發瘋地咆哮著要消滅害死傑乃拉爾和愛莉斯的X和Zero）。
戰鬥手段是畫面外高速突進撞擊，攻擊模式類似於《洛克人X1》里的風暴雄鷹；本作公式頁面上遊戲開發者說明欄目里提到，這是故意模仿的（劇情上看的話，暴風貓頭鷹和風暴雄鷹私交甚篤，Repliforce早期也與異常者獵人部隊互動頻繁，飛馬有機會學習雄鷹的作戰方式也是情理之中）。特殊武器『ウィングスパイラル(Wing Spiral)』乃是強力的龍捲，把接觸到的物體一瞬間卷到上空（註：天馬是X5的8 Boss中唯一一個受到克制武器攻擊沒有特殊硬直的Boss，因為克制他的“黑暗定身”不存在攻擊判定）。
刺針薔薇（スパイク・ローズレッド / Spike Rosered）
獲得武器：輪釘鋼球(Spike Rope) / 雙夢幻(Twin Dream)
獲得晶片：究極爆擊(Ultimate Buster) / Z劍威力強化(Z-Saber Plus)
Spike Rosered薔薇型Repliroid，別名“真紅之幻術”『真紅の幻術(Shinku No Genjyacu)』。罕見的突然變異系Repliroid，由一般的Repliroid、烏克蘭密林里的自然環境控制單元及Σ病毒結合而成。變異的過程依舊被重重謎團所籠罩，所以出現異常化的機率極高，甚至有觀點認為這種變異可能比Σ病毒更具危險性。因此變異之後，他便躲到叢林裡的一處Repliforce廢棄軍事基地中，對裡面的設施進行修復和改造，並利用Σ病毒的力量操控這些設施慢慢地摧毀周邊的自然生態，手中持有的軌道引擎『オービターエンジン(Orbiter Engine)』可使太空梭在飛行過程中保持穩定。對X4里異常者獵人部隊將Repliforce全體認定為異常化一事很是不滿，因此對異常者獵人抱有強烈的敵意。歐拉西亞事件爆發後，X和Zero找到他並索要Orbiter Engine，他拒不合作的同時還當面指責X和Zero如傳聞一樣蠻橫無禮、咄咄逼人，並揚言要他們嘗嘗被處決者們的憤怒（若是零空間出現後才去找他，他則是以戲謔的方式拉攏X和自己合流去幹些偷雞摸狗、大發災難財的事）。
擁有豐富多彩的攻擊方式，例如分身、花瓣、荊鞭、茨塊（外觀像榴槤）等。特殊武器『スパイクロープ(Spike Rope)』是把荊棘束在一起投向敵人，攻擊力非常高，且可以連續輸出傷害。
黑暗蝙蝠（ダーク・ネクロバット / Dark Necrobat）
獲得武器：黑暗定身(Dark Hold)
獲得晶片：病毒護罩(Virus Barrier) / 除毒器(Virus Buster)
Dark Necrobat蝙蝠型Repliroid，別名“被忘卻的闇之戰士”『忘れ去られし闇の戦士(Wasuresarareshi Yami No Senshi)』。3年前經由Σ之手誕生的異常化Repliroid，但是卻因為畏懼戰鬥，趁著Σ不注意就逃走了，其後一直行蹤不明。不過，就連Σ自己都判斷出蝙蝠的戰力沒什麼大不了的，所以也沒太在意他逃跑的事，後來更把他忘了。而他逃跑之後便來到了放置天象儀的太空研究所藏身，該研究所內有修復太空梭所需要的燃料罐『燃料タンク(Nenryou Tank)』，這一待便是3年。歐拉西亞事件爆發後，與X和Zero在太空研究所短兵相接，雖然未知他是否已受Σ病毒感染，但言辭和行為如同暴民與土匪的他很快就被X和Zero判定為異常化，必須立即進行和諧。
技能方面，通過抱住對手齧咬以吸收對手的生命能量，可以召喚大量小型蝙蝠智慧型機械『バットンボーン(Battonbôn )』，並能發射難以迴避的巨大超音波攻擊。特殊武器『ダークホールド(Dark Hold)』是非常可怕的技能，一定時間內可以產生時間完全停止的效果並封住對手的行動。
（註：X和Zero習得的技能均是黑暗定身，這招對X來說無論蓄力與否效果都是一樣的，但X可以在空中使出這招，Zero則必須在地面上才行）
燃燒暴龍（バーン・ディノレックス / Burn Dinorex）
獲得武器：大地烈焰(Ground Fire) / 斷地炎(Quick Blazer)
獲得晶片：加速射擊(Speed Shot) / 手炮強化(Buster Plus)
Burn Dinorex恐龍型Repliroid，別名“侏羅紀地獄”『ジュラシックインフェルノ(Jurassic Inferno)』。原本是Repliforce災害預防小隊的一員，是以蠻勇而聞名的戰士，被派遣到非洲東北部管理火山地帶『サンハウスマウンテン(Sonhouse Mountain)』，監測火山活動情況。然而他卻瞞著上級在火山內秘密建造了自己的私人倉庫，利用岩漿能量非法製造武器，拿到黑市販賣牟取暴利。從劇情台詞中可以看出，他把異常者獵人稱為惡魔，在他眼裡，自己就像“走鬼”，異常者獵人如同“城管”，只要“城管”找上門來，準沒好事，勢同水火；加之好不容易才在Repliforce大戰中倖存下來，新仇舊恨之下更沒有商量餘地，只有大打出手。另外，由於歐拉西亞事件的爆發與零空間的出現，使得他感到地球末日將至，對未來絕望，覺得反正要不了多久橫豎都是死，與其在沉默中死亡，不如與“城管”轟轟烈烈地來個了斷。異常者獵人部隊通過偵測發現他持有可供太空梭使用的加速火箭『ブースターロケット(Booster Rocket)』，X和Zero隨即動身前往火山地帶找他。雖然未能判定他是否受到Σ病毒感染而異常化，但面對他誓死要與“城管”決一死戰的態度，X和Zero自然不用多說廢話，立即投入戰鬥。
戰鬥中，雖然身形龐大但卻行動敏捷，攻擊方式主要有口吐火炎、火柱，以及巨體產生的體當撞擊——炎背火尾襲，通過狙擊對手所在經緯度發動，撞擊速度很快，難以躲避。特殊武器『グランドファイア(Ground Fire)』可以吐出灼熱火焰，接觸地面後可造成大片火海，是破壞力非常恐怖的招式。
（註：Sonhouse Mountain為日語名稱的音譯，如果與官方英語名稱雷同，純屬巧合）
其他Boss人物
洛克人X5西格瑪頭部（シグマヘッド / Sigma Head）
序章Opening Stage的Boss。外觀上模仿Σ的臉，內部裝有難以數計的Σ病毒，潛伏在歐拉西亞建設中的女神像里。其目的是故意遭受破壞，把Σ病毒撒向地面到處散布。
攻擊手段有：眼中放出的黃色光球、口中能量發射器噴出的眾多藍色小球以及紫殤大炮。
暗影惡魔（シャドーデビル / Shadow Devil）
Shadow Devil『零空間1──「起源」』的Boss，以元祖洛克人初代登場的邪黃惡魔『イエローデビル(Yellow Devil)』為參考原型製作（由於零空間中存有崴利博士的有關數據，因此其存在可能是以舊有數據為基礎再結合Σ病毒製造出來的）。它可分裂成16個泥塊部件或變成其它形狀對敵人發動攻擊。HP低於50%的時候，分裂與合體攻擊稍有變化，還增加了新技能，變形成類似元祖洛克人6里登場的威利機體6號(Wily Machine 6)的樣子撞擊與砸擊對手。弱點是眼部，時隱時現，隨機出現在身體的幾個不同位置，受到傷害時，眼睛周圍露出電子迴路的模樣。
暗影惡魔的Boss戰場背景有一半呈現砂暴狀態，隱約浮現出“W”文字；背景音樂是元祖洛克人初代Wily Stage關卡Boss戰（其中有黃鬼Yellow Devil）BGM的Arrange版本。
另外，其所在關卡的雷射地帶，是以元祖洛克人2里Quickman關卡作為參考原型製作的。
混亂壁畫W（ランダ・バンダW / Rangda Bangda W）
Rangda Bangda W『零空間2──「哀愁」』的Boss，以《洛克人X1》中登場的『ランダ・バンダ(Rangda Bangda)』為參考原型製作（由於Σ藏身於零空間中，因此其存在可能是以舊有數據為基礎再結合Σ病毒製造出來的）。圖案以古代民族風格設計，鼻部分名稱為『ソルボーカ(Sorubôka)』，外觀上看起來像是太陽，眼部是三個具有不同攻擊方式的珠子。兩側牆壁合攏且HP低於50%時，牆壁不同位置會隨機出現一觸即死的尖刺。
這場Boss戰的背景音樂是《洛克人X1》中的Σ關卡Boss戰BGM的Arrange版本。而Boss戰前面的關卡，是以《洛克人X1》中的Σ Stage 1關卡作為參考原型製作的。
ゼロ (Zero)
Zero（NormalandAwakened）破壞歐拉西亞計畫成功狀態下，X前往『零空間3──「覚醒」』遇到這個未覺醒版本Zero。使用『バスター(Buster)』、『セイバー(Saber)』以及『電刃零(Denjin Zero)』、『真・滅閃光(Shin Messenkou)』發動攻擊。
這場戰鬥中，Zero使用的Buster與玩家操作版本Zero的『ゼットバスター(Z Buster)』不同，像是過去『ゼロバスター(Zero Buster)』的巨大版（請參考《洛克人X2》與《洛克人X3》里的Zero Buster）。
覚醒ゼロ (Kakusei Zero / Awakened Zero)
破壞歐拉西亞計畫失敗狀態下，X前往『零空間3「覚醒」』遇到這個覺醒版的Zero──病毒喚醒了Zero的真正力量與使命！其產生原理是：Zero體內的Zero病毒與空間內的Σ病毒混合後不斷壓縮，使得兩者強制結合併產生相互作用，但作用的過程失控導致Zero體內的“機器人破壞程式”啟動，令Zero完全衝破了原本施加在他身上的封印。
全身纏繞著赤色Aura，戰鬥力比一般狀態的Zero及黑Zero更強。在未覺醒基礎上，增加了專用技『真月輪(Shingetsurin)』，經過一定時間後必定發動即死攻擊『幻夢零(Genmu Zero)』，同時進入無敵狀態，X就算能躲過空隙極小的『幻夢零』，也無濟於事，必定戰敗喪生。
究極裝甲X（エックス - アルティメットアーマー / X - Ultimate Armor）
X（Ultimate Armor）Zero前往『零空間3──「覚醒」』將同時遇到穿究極裝甲的X與『ライフセーバー(Life Saver)』。基於Σ病毒與Zero有密切關係的事實，擔心Zero有異常化的危險，異常者獵人部隊總部要求X把Zero帶回去做精密檢查。然而，Zero卻擔心X與Life Saver在零空間深處受感染而異常化，要求他們趕快回去，自己繼續零空間的戰鬥。談不攏的情況下，雙方只能開打。
戰鬥開始時，X便立即裝備上究極裝甲『アルティメットアーマー(Ultimate Armor)』，除了普通子彈射擊以及等離子炮，還可以使用前作《洛克人X4》里的特殊武器『ソウルボディ(Soul Body)』、『フロストタワー(Frost Tower)』、『ダブルサイクロン(Double Cyclone)』的蓄力版發動攻擊，其中Soul Body、Frost Tower的蓄力版發生變化（Soul Body蓄力版由X4的產生可射擊的分身變為幻彩分身高速5連擊，Frost Tower蓄力版冰柱段數減至3段）。而且，究極裝甲的顏色與蓄力時的效果，與X4中的一樣，但不會使用Nova Attack。
這場Boss戰有時候會發生bug，Zero斬削X的等離子蓄力彈『プラズマチャージショット(Plasma Charge Shot)』時，Life Saver會意外登場。
Dynamo戴納摩 （ダイナモ / Dynamo；CV： 森久保祥太郎 ）
Σ雇用的Repliroid，身份和來歷都是謎一樣的存在，而且似乎不受Σ病毒影響。為人傲慢、馬虎、怕麻煩且不負責任，見錢眼開，只有在僱主給予豐厚報酬的時候才會稍為認真點工作，不過相對異常者而言沒那么兇殘。儘管有一大堆問題，但是戰鬥能力卻是不容忽視，既擅長使用手炮攻擊又精於使用光劍作戰，若以異常者獵人部隊的實力評級來算的話至少是特A級或以上，這讓他總是能完成僱主委託的任務。受Σ雇用後，奉命潛入殖民地歐拉西亞散布Σ病毒，導致歐拉西亞老舊的動力系統出現故障並停止運作，進而使整個殖民地向著地球墜落。在殖民地墜落前轉為對異常者獵人部隊總部進行騷擾，以拖延X和Zero收集發射艾尼格瑪大炮及太空梭所需零件的進度，確保歐拉西亞在完全墜落地球前不被擊毀。後來，X和Zero合力將Σ打倒，他便不知所蹤了，直至在續作《洛克人X6》中再度登場。
西格瑪 （シグマ / Sigma / Σ）
Sigma本作的最終Boss，X系列永遠的大反派，於『零空間4──「誕生」』正式登場。Σ很久以前曾經是異常者獵人第17精銳部隊的隊長，是X與Zero的前上司，凱恩博士的最高傑作，最強的Repliroid。兼具高強的戰鬥能力與優秀的頭腦，受到很多Repliroid的仰慕。但是，在捕獲原生Zero時不幸感染了病毒，從而成為最強的異常者，曾策劃或發動四次叛亂戰爭（Σ叛亂、反擊獵人叛亂、都卜勒博士叛亂、Repliforce大戰），但均被X和Zero擊退。他的異常化同時伴隨著Σ病毒的產生，這種病毒日後更成為Repliroid異常化的主要原因之一。在《洛克人X4》里被打倒，但於本作再次復活。先是雇用了戴納摩做自己的打手，派他破壞了殖民地歐拉西加的動力系統致其向地球方向墜落；同時將滿載Σ病毒的“Sigma Head”藏於建設中的女神像里，並引誘X和Zero將之擊毀，使得Σ病毒散布至整個地球。而自己則藏身於零空間中掌控全局，同時利用威利博士留下的數據為自己製作強大的戰鬥軀體。
第一型態身穿一套病毒裝甲，披著魔鬼似的披風，戰鬥手段為極速衝擊（發出衝擊時身後有病毒陰影）、藍色電球、病毒纏繞（Σ身邊產生3個Σ病毒）以及巨大衝擊波。
第二型態又稱為“最終西格瑪W”『ファイナルシグマW(Final Sigma W)』，是一個巨大機器人，敢夸是洛克人X系列屈指可數的巨體，一螢幕畫面只能顯示出胸以上部分。由於X與Zero快速趕來，巨體尚未全部完成，即便如此也已經相當厲害了：攻擊力異常驚人，防禦方面也特別優秀，可以在一段時間裡程式化進入無敵狀態，迴避所有攻擊；還能製造紫色的巨型病毒方塊撞擊或砸擊對手（傷害極高）。頭部的Σ水晶是唯一可以對其輸出傷害的部位（程式化時除外），巨體的手可以被擊毀，但會無限再生。
另外，零空間4關卡是以是以元祖洛克人2里Bubbleman關卡作為參考原型製作的，榴槤陷阱形狀方面的細節也是特別相似。
Magmard Dragoon熔岩火龍（マグマード・ドラグーン / Magmard Dragoon；CV： 長嶝高士 ）
龍型Repliroid，別名“爆炎的武道家”『爆炎の武道家』，練習模式『トレーニングモード(Training Mode)』的Boss。前作《洛克人X4》里常規選擇關卡的八大Boss之一，原本是異常者獵人第14特殊部隊的隊長，是一位精研各種徒手格鬥技的武道家，也是異常者獵人部隊中屈指可數的實力派。然而，在X4中他為了與X和Zero比試背叛了異常者獵人部隊，投靠了Σ，破壞了空中都市Sky Lagoon的浮遊動力裝置致使其墜落，害死很多無辜的人之餘更是導致了Repliforce大戰的爆發。最終在和X、Zero的決戰中兵敗身亡，其部分數據被異常者獵人部隊回收，製成程式以供獵人部隊的士兵進行模擬戰鬥訓練使用。
與原版相比，『昇龍拳』與『火山弾』停用，實力大幅弱體化，成為新手玩家的陪練。
中Boss
甚兵衛鮫（デスエベンジ / Death Avenge）
潮汐鯨魚關卡登場的中Boss，『甚兵衛鮫（ジンベエザメ）』型潛水艦，巨大智慧型機械，『顏面』、『尾鰭』、『背面』陸續與X和Zero發生戰鬥，總計3次。官方名字『デスエベンジ』里，『エベンジ』明顯是『甚兵衛』讀音『ジンベエ』的反寫，所以，這位中Boss的名字也可以翻譯成“死亡衛兵甚”。天幻網一命通關專題統一將其稱為“甚兵衛鮫”。
甚兵衛鮫原本是海洋博物館的展示品，受到Σ病毒感染暴走，數次破壞數次再生。
口中吐出小型智慧型機械與受傷被俘的Repliroid，還會發射光柱。尾鰭專門發射途中可以追尾1次的跟蹤飛彈。顏面與背面的突起部分發射光彈。
稜柱守衛（プリズムガーディアン / Prism Guardian）
閃光螢火蟲關卡的中Boss。沿3條豎直鋼索同時登場3個雷射炮台，赤色2個，黑色1個。主角只能破壞黑色雷射炮台。
機械翼龍（プテラノイド / Pteranoid）
燃燒暴龍關卡後半部分岩漿上方分支路線中登場的中Boss，翼龍型智慧型機械。跟在對手身後，一邊破壞路面一邊逼近對手，口吐火炎彈，還會用突進攻擊。
同樣是中Boss，與甚兵衛鮫、稜柱守衛相比，翼龍的HP雖然較少，但防禦力卻很高，X的蓄力彈只能對其造成微小傷害。
裝甲系統
| 裝甲名稱 | 簡介 | 圖冊 |
| X（無裝甲） | 可裝備 4 個強化晶片。若在開場選擇Zero進行遊戲，則在入手裝甲前X不得不使用這個形態。雖然防禦較差也沒有特殊能力，但可以裝備4個強化晶片，這使無裝甲X在特別的場合併不遜於穿上裝甲。 |  X（無裝甲） |
| Fourth Armor | 第四裝甲（又稱“武力裝甲”），可裝備 2 個強化晶片。若在開場選擇X（不輸入秘籍）進行遊戲，則自動獲得此裝甲。在X4的大戰中，原版裝甲損毀，Alia使用備份數據對其進行重製。外觀與X4基本相同，裝甲防禦、浮空能力以及特殊武器蓄力能力得到再現；但受限於備份數據的不完整，因此無法完全還原，性能有所下降──失去了新星突擊（Nova Strike），手炮蓄力只能選等離子炮，等離子蓄力炮留下的電漿球也減少至1個且無法傷害Boss，特殊武器非蓄力攻擊會消耗特殊武器能量槽。 |  Fourth Armor |
| Falcon Armor | 獵鷹裝甲（又稱“飛行裝甲”、“隼裝甲”），可裝備 2 個強化晶片。將機動力發揮到極致的裝甲，具備飛行能力，期間碰到敵人不會受傷，若搭配移動加速晶片可輕易通過大多數關卡。蓄力攻擊為形狀狹長的貫通彈，攻擊力較弱且特殊武器不能蓄力；Giga Attack是全螢幕流星雨。 |  Falcon Armor |
| Gaea Armor | 蓋亞裝甲（又稱“重裝裝甲”），不可裝備強化晶片。與飛行裝甲相反，犧牲機動力，將攻擊力發揮到極致的裝甲，也是X系列首套可以無視針刺地形傷害的裝甲。可在針刺上行走，掛牆不會下滑，蓄力速度非常快，蓄力彈射程雖短，但命中Boss造成的無敵時間短，傷害非常高；Giga Attack──蓄力能量波傷害也非常拔群。但衝刺速度和跳躍高度都受到限制，也不能使用特殊武器。根據設定，此裝甲為未完成品，若完成的話威力將大大超過究極裝甲。（註：有人認為此裝甲受到的傷害最低，實際上與其他裝甲一致） |  Gaea Armor |
| Ultimate Armor | 究極裝甲，可裝備 2 個強化晶片。初登場於X4里的裝甲，能力與Fourth Armor（等離子炮模式）基本一致，但性能和威力大幅度強化，可以無限次地施展新星突擊（Nova Strike）且威力比Fourth Armor的更強，因此這套裝甲可以說是Fourth Armor的強化版。本作中再次登場，可通過輸入秘籍或於零空間第3關的萊特博士膠囊處獲得（進膠囊時必須是無裝甲狀態）。根據萊特博士的說法，這套裝甲能極大地引發出X的潛在能力，但是強大的性能會對X的身體造成較大的負擔，長時間使用的話甚至可能令X陷入暴走。主要性能和X4基本一致，但特殊武器的非蓄力攻擊不再能無限使用、等離子蓄力炮留下的電漿球無法傷害Boss（可能是萊特博士有意為之以降低使用的風險），裸露的X身體部分和無裝甲狀態的X一樣（X4中會變成紫色）。設定上左臂可輸出大型光速刀進行攻擊，而且整套裝甲可轉換為飛行模式供X使用，不過本作中並沒體現。（註：若在開場選X時輸入了秘籍，則開場就會獲得此裝甲，但無法再在遊戲中使用Fourth Armor） |  Ultimate Armor |
| Black Zero | 黑Zero，可裝備 4 個強化晶片。初登場於X4，於本作中再次登場，可通過輸入秘籍或於零空間第3關的萊特博士膠囊處獲得。不同於X4里的僅是改變顏色，黑Zero在本作里是完全提升角色能力的形態。與通常的Zero相比，防禦力加強，所受傷害減半，攻擊力提升，自帶除彈器能力，且特殊武器消耗會下降。 （註：作為異常者獵人的Zero並不是原生的Zero，因為異常者獵人部隊的封印所以實力打了折扣。但為了戰鬥需要，萊特博士還是針對Zero開發了一套程式，可以讓Zero短暫恢復部分力量。其原理是將Zero體內的Zero病毒與空間內的Σ病毒混合後進行壓縮，使得兩者結合併產生相互作用，再對作用過程進行良好的控制後便能激發Zero體內的部分被封印的力量。不過，由於萊特博士也無法完全掌握Zero的技術細節，所以黑Zero恢復的力量也並非全部，也未覺醒其真正的使命，因而還是弱於原生Zero以及本作中出現的覺醒Zero） |  Black Zero |
克制系統
沿用以往洛克人系列的傳統，X和Zero打敗常規關卡的八大頭目後可習得相應的特殊技能，而這些特殊技能對某些Boss有克製作用，可令其受攻擊時出現特殊硬直或扣減更多的血量（疾風飛馬則只能限制其活動）。不過，本作里的大部分Boss，其被相應的克制武器攻擊後的特殊硬直或無敵時間要比以往作品裡的更長（疾風飛馬除外），想玩速通的玩家就要留意了。
另外，與前作《洛克人X4》相比，Zero的特武克制系統更加完備，和X的已經沒太大區別了，不再像前作那樣部分技能不能產生特殊硬直或同一個Boss使用與X不同的特武。
八大常規關卡
1. 新月灰熊：用 刺針薔薇的武器（產生特殊硬直並加重傷害，Boss使用破牆和地下偷襲時只加重傷害）。
2. 電壓烏賊：用 潮汐鯨魚的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
八大常規關卡Boss3. 閃光螢火蟲：用 電壓烏賊的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
4. 潮汐鯨魚：用 新月灰熊的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
5. 疾風飛馬：用 黑暗蝙蝠的武器（只能停止其活動）。
6. 刺針薔薇：用 燃燒暴龍的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
7. 黑暗蝙蝠：用 閃光螢火蟲的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
8. 燃燒暴龍：用 疾風飛馬的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
特殊關卡
Boss克制系統1. 戴納摩：用 疾風飛馬的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
2. 暗影惡魔：用 電壓烏賊的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
3. 混亂壁畫W： 紅眼用 電壓烏賊的武器； 藍 眼用 燃燒暴龍的武器； 綠眼用 新月灰熊的武器； 火球用 潮汐鯨魚的武器。所有克制武器只加重傷害。
4. Zero（或覺醒Zero）：無可克制的特殊武器。
5. X（究極裝甲）：用 閃光螢火蟲的“滅閃光”或 燃燒暴龍的“斷地炎”（只加重傷害）。
6. 西格瑪（第一型態）：用 電壓烏賊的武器（產生特殊視覺效果並加重傷害）。
7. 最終西格瑪W：用 刺針薔薇的武器（產生特殊硬直並加重傷害）。
騎乘載具
本作延續自洛克人X系列開始以來的傳統，在某些關卡的特殊路段玩家操縱的角色可以駕駛一些載具攻關。本作中玩家可以使用的載具有兩種：
Riden Ride Armor萊登騎乘機甲（Riden Ride Armor）
前作《洛克人X4》中曾在熔岩火龍及切削狂獅所在關卡里出現過的騎乘載具，由具備超高硬度及極強耐熱能力的特殊材質製造而成，即便在高達幾千攝氏度的岩漿里運作也能毫髮無損；背部有噴射裝置，使得它可以進行短距離的高速衝刺及跳躍。非戰爭時期，一般被用於採礦或深入一些極為複雜的環境進行作業，能夠輕鬆鑿開堅硬的岩石或其它障礙物。用作戰鬥工具時，臂部的鑽頭不僅可以使出最高2段的連續攻擊，還可以進行蓄力使出強力的刺擊，其強大的破壞力足以破壞一整段的列車車廂；而強勁的腿力可壓碎踩到的物體，哪怕是同類機甲也不例外。本作中僅出現在燃燒暴龍所在關卡的末段分支路線里，X和Zero需要坐上它才能通過位於岩漿里的地下通道（走這條通道才能獲得Gaea Armor的腳部部件），而且不能在中途脫出或被擊毀，否則會被岩漿秒殺。另外，此裝甲在通過前述通道後就要強制脫出，無法帶到Boss房間。
Adion阿迪翁（アディオン / Adion）
前作《洛克人X4》中曾在噴射魟魚所在關卡里出現過的騎乘載具，是異常者獵人部隊司令部為應對Repliforce大戰下令開發的新式戰鬥用飛行器。機身前端裝有可發射雷射炮彈的機關炮，而後端則裝備了強力的等離子噴射裝置，使其能夠在短時間內作出極高速度的衝刺，並且衝刺過程中機身四周會產生強烈的切割氣流，可以如同利刃一般切碎撞上的敵人。本作僅出現在電壓烏賊所在關卡開始的路段，並於通道盡頭引爆開路（強制劇情）；而且是收集此關FalconArmor部件的必備工具之一，在駕駛過程中一個不漏地收集齊沿途的特殊能量粒子，便可在通道盡頭炸開部件所在隱藏房間的大門。
通關介紹
本作開頭的選人對後續角色使用有一定影響：若選X會多一套裝甲，也就是Fourth Armor（選Zero時無，會在序關戰鬥中損毀）；若選Zero，Zero就可以使用Z Buster （選X時無，會在序關戰鬥中受損）。
序關
選關界面此關既是劇情關也是練習關，讓大家可以儘快熟悉操作。難度較低，但在見Boss前的攀牆要小心，如果動作慢了便會被牆壓扁。Boss“西格瑪頭部”的攻擊模式有：眼睛放雷球、噴霰彈、發巨炮和突撞。第一招可用衝刺或跳躍躲開，第二，三招可用蹲下，而最後一招只要站在門邊就不會被打到。盡情對他攻擊吧！
在選關界面里，左邊的四個關卡中，每關各有Falcon Armor的部件及艾尼格瑪的配件一個；右邊的則是Gaea Armor和太空梭的。其中Gaea Armor有兩個部件受地形限制一定要先拿到Falcon Armor才可以拿。本作中的蓄血箱和蓄氣箱的位置一般都在通關道路的反向。
新月灰熊
物品：飛行裝甲腳部、愛心、生命庫
本關開始時在卡車上，擊毀三部火車後來到大車上。在一個大車敵人上方有一條通道，愛心就在上面，別急，沒有飛行裝甲或重裝裝甲拿不到的。通過此處後，有兩列火車是處於爆炸形態的，前一列好過，後一列有鑽頭一鑽即死，只要躲過第一個鑽頭後跳上柱子，後用沖跳即過。走之前別忘了車頭下的生命庫。撞車後飛到一處洞穴中，走幾步上面就有一個洞穴，可巴在牆上用沖跳或站在平台上用跳躍+黃金沖即可飛上，或者用艾克斯跳起用暴風。上面就是裝甲機。
潮汐鯨魚
物品：飛行裝甲身部、愛心
本關一開始便要和超大機械裝甲對打三次，只要攻擊其要害即可。用重裝裝甲打會容易很多。打完兩次後會看到有很多尖刺向上延伸，上面是愛心所在地，用飛行，重裝裝甲均可吃到。傑洛可使用雷刃擊破愛心下方的障礙直接跳上去。向下跳就會看到裝甲機，用冰飛刃即可打爆炸彈。
戴納摩
一進關就要和戴納摩打，他就會甩刀，防禦和跳躍斬，打幾下就掛了。
電壓烏賊
物品：飛行裝甲頭部、愛心
此關開始時在騎摩托，一定要在第一次打這關時吃完所有的能量球，這樣拿裝甲省力。吃完八個能量球並炸掉地面通道後發射完能量球右邊的門就會開，裝甲機就在裡面。向下跳，一路打開鎖，向前進。兩個鎖的地方可以用蓄力冰飛刃打開。有一處樓梯上去後左邊的路是通往愛心的路，用重裝裝甲這樣：打爛兩個箱子，推（衝刺）一個箱子，打開鎖即可。
閃光螢火蟲
物品：飛行裝甲手部、愛心、EX罐
在前段的一個門（到達時艾利雅會說話，門要打倒）下有很多刺，右下方有愛心，用飛行或重裝裝甲即可拿到。而左下方有一個傷者。通過三個刺板後有一個EX能量器，用噴射火焰即可拿到，拿到後人數將可把小限度命變成5條。中佬要攻擊黑色的，若用Zero打會稍微難打一點（針對X）。有很多大炮攻擊的地方可用新月刃擊或三日月斬破壞大炮。一個向右上方的通道上將有一個小螢火蟲（easy模式沒有）和會有炮飄下來，上去破壞炮後裝甲機在裡面。
巨炮的零件都收集完了，所有人都希望可以破壞殖民地，但事與願違，攻擊失敗了。於是，太空梭計畫誕生了。 （插曲1：在擊敗以上4 Boss後，有幾率出現巨炮一擊轟碎殖民地，好像要先擊敗蝙蝠才行，關於蝙蝠，下面有說明。觸發此劇情，可不用在打以下Boss ，對於Zero的衝刺斬bug也可以保留，這樣打西格瑪就會輕鬆一點）
黑暗蝙蝠
物品：重裝裝甲頭部、愛心、生命庫
本關有一處地方要坐傳送板移動，所以看到星座顯現時一定要注意小蝙蝠和刺。有一個地塊下有刺，蹲下即可躲過。看到生命庫後可用沖跳，飛行或二段跳吃到。傳送後，會來到一個可以上下顛倒的地方。要用黃金沖或飛行才可吃到愛心，最簡單的方法是故意碰敵人利用自身無敵時間上去。在老大門前有一個洞，裡面就是裝甲機。控制螢火蟲飛彈穿過迷宮打爛牆壁即可。
疾風飛馬
物品：重裝裝甲身部、愛心、能量庫
本關推薦用飛行裝甲打，因為對付炸彈很好。在一個平台下降時將會壓爛下面的石頭，壓完兩次後要自己跳下去才能在石頭上吃到能量庫。出門後先不要上移動平台，飛上去就會看到裝甲機。至於愛心，在遊戲過程中肯定拿得到。
戴納摩
本次打戴納摩稍有變化，首先場景變成了太空梭發射基地，其次戴納摩的招式多了空流彈和地雷射。只要用暴風飛擊或分身斬即可輕易打敗（分身斬要在離他兩個Zero的位置用才行）。
燃燒暴龍
物品：重裝裝甲手部、愛心
本關開始時要巧妙地躲避噴火機，故建議用飛行裝甲打。到達一個有岩漿向右噴發的地方時先往左走，左邊坑洞裡有一條命和愛心。有三堵牆需要等岩漿衝破，要跳到旁邊石頭上等待。第三堵牆離石頭較遠，需要在牆上用沖跳或在小石頭上用二段跳，用飛行或跳+黃金沖更好。打爆門後有一個萊登機甲，初級玩家可用沖跳飛過大坑後脫出裝甲（上+跳）。高級玩家則可選擇跳下坑洞。（初級玩家）右走脫出機甲後中Boss跟了上來，一路逃跑（小心）後到了兩個傳送板，此處要PK中Boss。打完後進了門就到了有很多桿子的地方。（高級玩家）坐著萊登機甲向下走，打完一些小兵後有一處可看到有向上的通路可用沖跳跳上右邊再沖跳跳上左邊，接著跳+脫出即可到達桿子處。在老大門前先別進去，貼著牆滑下來後對著右邊用黃金沖或飛行可飛到一個小平台上，裝甲機就在那裡。如果沒有裝甲機就坐萊登機甲沖跳到左邊平台再跳回來即可。
刺針薔薇
物品：重裝裝甲腳部、愛心
本關開始有一個向上抓桿子走的地方有兩個箱子，用重裝裝甲打爆後進去。打完一堆箱子後發現愛心所在位置太高，重裝裝甲跳不上。別急，回來推一個箱子到小坑裡，再從它上面推一個箱子到大坑旁即可。吃完愛心就到了另一個桿子處。而之前走上面也會到這裡。抓著桿子走，到了一個桿子上方好象有路，用Zero的二段跳從右邊的牆上跳上去（我沒成功過）或用飛行飛上去，裝甲機就在上面，注意縫隙很小，不要碰到刺。
暗影惡魔（惡魔系列機器人 ）
本關的雷射要用時間停止器躲過，小心Zero病毒。老大一開始是從左邊以16個泥球飛過攻擊，第一層的可用跳躍躲過，二三四的用蹲下。注意攻擊其眼睛。老大變成骷髏車時小心撞擊，一撞即死，建議用飛行或超級裝甲打。他跳時不要被砸到，否則也死。猛打他眼睛就可以了。此外，如果安裝“病毒防護罩”晶片，受到boss攻擊時傷害會減少(弱點是電屬性，但其效果不佳，不會造成僵直狀態）。建議使用艾克斯安裝“超級聚氣”或者“終極爆擊”，也可使用傑洛直接砍。
這裡推薦一種高手玩法：選用Gaea Armor，關鍵是用無定身法過雷射，注意一定要用衝刺跳，要很迅速。完成這一部剩下的就簡單了，打Boss時利用裝甲特性貼在左上方或右上方的牆壁，然後等他完全融在地面時才跳下來，再攻擊，幾個回個就結束了。
混亂壁畫W
本關的大型機器人很討厭，可用飛行裝甲（超級裝甲更好）躲過。進老大門以前先跳上左邊平台，左邊有一個大補血和一條命。老大有紅，藍，綠三色球，紅色以閃光壁攻擊，藍色以本體撞擊，綠色發射跟蹤子彈。最好在牆壓過來之前解決掉一到兩個球。牆第二次壓過來時要先飛一段，免得被刺扎死。更簡單的話就用Gaea Armor，不怕尖刺，不用操心。
X/Zero（覺醒ZERO）
物品： 究極裝甲、黑Zero（兩個都可以拿，但必須死命換人再來）
本關若要拿究極裝甲則要用普通X（沒裝甲的）打。有一個大坑（兩個傳送板寬）左邊有一個傳送板（不動的），跳下去，究極裝甲的膠囊就在裡面。用Zero則黑Zero的膠囊就在裡面。打究極裝甲X（選Zero打這關）時他會用X4的影分身和大落冰還有鏇風，而打Zero（選X打這關）時他會不停發地波、飛刃和捶地。覺醒Zero則更難，如果在兩分鐘內沒有解決他，他會變為 無敵狀態且不斷使用 無死角的超大劍氣攻擊——幻夢零（ 即死技能），此時勝利已經無望，只能重新挑戰。用Ultimate Armor的天星擊可以 無限周鏇，但也 無法獲勝。
終極西格瑪W
本關要把以前的八關老大重新打一次，如果不是easy模式則每個老大都是LV96（還是很弱）！最終老大西格瑪有兩個形態，一個是人，另一個是超大裝甲。非easy模式則前者最高LV41，後者LV96。
結局方向
本作根據遊戲中玩家所經歷的不同劇情線，也有著不同的結局設定。根據製作人的說法，原來的計畫是讓Zero在本作中死去，洛克人X系列的主線劇情全部完結（當然後來因為其它原因有了往後的作品）。結合續作《洛克人X6》的劇情設定，本作有下面3種結局：
結局1： Zero沒有覺醒，玩家使用X打倒Σ。Σ被打倒後，X找到了陷入瀕死狀態的Zero，此時已半死不活的Σ發射雷射炮洞穿了X和Zero的胸部。X昏死過去，Zero用最後一口氣發射手炮徹底消滅了Σ，在叮囑完X在戰鬥中不要再有天真想法後失蹤。此時，萊特博士的全息影像出現，勸勉X和平已經不遠了，要繼續奮鬥下去，然後奇蹟般地將X修好。一眨眼3年過去，戰場上多了一個手拿Zero光劍、為守護世界和平努力奮戰的藍色身影……
結局2： Zero沒有覺醒，玩家使用Zero打倒Σ。前半段和結局1一樣，Zero用最後一口氣發射手炮徹底消滅了Σ。其後，Zero回憶起了種種往事，但始終還是沒法弄懂經常出現在自己夢境的人（威利博士）是誰，同時對愛莉斯感到抱歉。感到世界可以因為自己的犧牲而恢復和平，Zero和X說了聲“再見”，便閉上了眼睛……
《洛克人X5》結局結局3：Zero覺醒（系統強制最後由X打倒Σ）。殲滅Σ後，X重傷倒地不醒。萊特博士的全息影像出現，鼓勵X為了即將到來的和平繼續奮鬥下去並修好了他。但是為了不讓X回憶起與Zero的痛苦戰鬥，萊特博士便在修復過程中把X關於Zero的所有記憶數據刪除，並設定成即使重新輸入也不起作用的狀態……一周過去了，恢復後的X指揮著屬下們開展重建工作。儘管屬下們多次提起Zero，但X還是表示對其沒有印象，並鼓勵大家要共同努力建立一個沒有戰爭的理想世界……
