故事大綱
∑（Sigma，譯為西格瑪、釋瑪）在將太空殖民地“歐拉西亞”引下地球並墜落。 X 與Zero一同力戰∑，最後Zero和∑互相向對方放出致命一擊。大難不死的 X 手持好友的Zero劍，繼續守護地球的和平和幫助進行復興計畫。災難過後，地上的環境變得荒蕪，人類亦轉到地下居住，由思考型機器人和重工型機器人負責重建工作。“歐拉西亞”墜落處旁的沙漠上，站著一位穿著白袍的思考型機器人──基特，對這太空殖民地的廣大遺蹟感到好奇的同時，他發現了一塊與別不同旳碎片，決定把它帶回研究所分析。一星期後，基特在研究所中發現該碎片擁有巨大力量，並開始加以利用……
“歐拉西亞事件” 後三個星期，休息中的 X 被艾莉亞叫醒，到“歐拉西亞”墜落處阻止一部故障的重工型機械。該巨型作業機械被打敗後發生爆炸，說時遲那時快，一個與Zero極之相似的紫色身影降臨於 X 的面前，一劍將那機械的殘骸斬至粉碎，再一言不發地離開現場！“Ze……Zero？！” X 與艾莉亞不敢相信剛才發生的事，但危機又再次迫近──一名自稱 High Max 的神秘思考型機器人緊隨紫色的零到場， X 不滿他中傷Zero為一惡夢（Nightmare），並且挑起戰鬥。 High Max 的防禦力太強，他將 X 置儲不理，亦叫 X 不要插手。遊戲截圖及後不久，基特的助手艾索克發表公開演說，聲稱“惡夢”現象日益瀕繁，而Zero的出現是當中的因由，有見及此，基特將會建立一個脫離“惡夢”的國度，並且派出八位調查員去蒐集“惡夢Zero”的資料。 X 對基特的動機深感懷疑，決定闖進調查區域去“調查這場調查”……
遊戲系統
惡夢現象
關卡中的環境和路線會因為惡夢病毒的存在而產生改變。
求救者救助
八大關卡里，共分布了一百二十八位身上隔隨機擁有不同的增強角色資料的求救者。
傳送地區
在八大關卡中，放置了一些通往同一區域，但收不到艾莉亞訊息的地段的傳送點。這些路線的分支當中，隱藏著什麼新的事物？
獵人等級
玩家所用角色的獵人等級會依其所得的惡夢靈魂數目增加而提升。
多重結局
遊戲的結局會跟隨玩家所開拓的故事和最後使用的角色而改變。
“蹲下”和“吊繩”的動作仍然健在。
裝甲配備採用“程式制”：玩家需要將一套裝甲的四件配件集齊才能使用。
鎧甲 一定要的不可
洛克人X6裝甲介紹
FALCON (隼) ARMOR
這是在上次和SIGMA戰鬥時毀壞了的盔甲，用BACK UP DATA使之重新再現。可是，由於無法完全復元，所以威力不及以前。
特點：
可以給特殊武器儲能量。
跳躍時可以作出衝撞攻擊,對敵人可以減掉一點血
BLADE(劍聖) ARMOR
是適應Z光劍的盔甲，攻擊力強，移動性高。
特點：
可以給特殊武器儲能量。
可以使出CHARGE SABER。CHARGE SABER有消去敵彈的功能。
在跳躍時能以各方向疾沖。
SHADOW (影子)ARMOR
可以貼在天花板上行動。
特點：
令普通發射變成向3個方向發出的飛鏢。
JET SABER的揮舞速度加快。
可以使出必殺忍術“圓月輪”。BUSTER儲能量至第2階段時便可以使用。圓月輪有消去敵彈的功能。
可以在一定的時間內貼在天花板上行動，包括疾沖。這時候並可以向下面攻擊。 尖刺地形無效。
人物
非正規機器人獵人
xX/艾克斯（エックス/ X ）
（配音演員：森久保祥太郎）
原為非正規機器人獵人第十七隊（精銳部隊）的隊長，在“歐拉西亞事件”後，他全力投入世界復興的工作，並帶著親友零的遺物──零劍，一同行使正義。
zeroZero/傑洛（ゼロ/ Zero ）
（配音演員：置鮎龍太郎）
原為非正規機器人獵人第零隊（忍之部隊）的隊長，在“歐拉西亞事件”中犧牲自己的性命以毀滅釋瑪，陣亡。（嚴格來說是生死未明。）
（注意：在X6中，玩家不可以直接使用ZERO，如果在打完8個BOSS的時候還沒解鎖將不能在當前存檔使用。解鎖只是在當前存檔解鎖，當玩新存檔時還需解鎖）
（再次注意：如果解鎖了ZERO，那么在沒打完8個BOSS之前可以打一次海馬克斯）
（提示：X和ZERO均可以升級，升級後可使用強化零件，一開始不可以使用，當滿級時（滿級為QH,需要9999惡夢靈魂）可以解鎖4個普通強化和1個超級強化）
單擊本行顯示▼注意：框內為作品情節、結局或其他相關內容，可能降低欣賞原作時的興致。
SIGNAS西格納斯（シグナス/ Signas ）
（配音演員：鈴置洋孝）
繼續擔當非正規機器人獵人總監一職，監督和指揮獵人們的復興工作。
AEIRIA艾莉亞（エイリア/ Aeiria ）
（配音演員：笠原留美）
為獵人們提供重要資料的女性領航員，同時負責報告求救者狀況。
在過往成為思考型機器人工程研究員時，與基特是同僚。因為他的作品往往難以分析或理解，故此艾莉亞亦曾經將其認定為非正規機械，令他們被處決。
DAGRUS道格拉斯（ダグラス/ Douglas ）
（配音演員：高木涉）
獵人總部的機械技師，精通裝備配件、改良武器等工作。在今集負責整理裝甲及能力增強資料。
惡夢現象調查隊
基特為了追查和分析“惡夢現象”和“惡夢零”而所組成的隊伍，八位隊員分別駐守於八個和“惡夢現象”最為密切的地區。奇怪地，八位調查員也是基特在過往被處決的思考型機器人作品……
gate蓋特（ゲイト/ Gate ）
（配音演員：藤原啟治）
天才思考型機器人工程研究員，艾莉亞的舊同僚。作為科學家，他熱衷於開發思考型機器人，不過他的天才亦使其他人無法明了他的心意，最終更被人孤立 和鄙視，而他的作品亦逐一以不同的理由被處決。不甘才能被他人埋沒，反而使他心裡蘊釀著強烈的復仇心理。一次偶遇那塊埋在沙中的碎片，觸發了在一場惡夢中 的戰鬥。
蓋特的英文名 "Gate" 為大門之意，以人物個性和能力可以解釋為“令思考型機器人更進步的關口”或者“以大門來封閉自己的人”。
izoc艾索克（アイゾック/ Izoc ）
（配音演員：青野武）
基特的首席助手，非常踴躍地研究零，同時也好像很了解零。在“秘密研究所”中被發現已經“消魂”。
被不少擁躉猜想是另一個偉利的化身。
himax海馬克斯 （ハイマックス/ High Max ）
（配音演員：若本規夫）
惡夢現象調查隊的隊長，全身黑色的造型顯出他深不可測的一面，冷言冷語、目無表情，作為蓋特的最高傑作，他的任務是消除“惡夢零”。 High Max 的最不尋常之處，是他那強得過份的防禦力。他是傳送區域的第二位首領，打敗他後，“秘密研究所”的關卡便會開啟。
八大首領──惡夢現象調查隊隊員
揮令蜻蜓．亞馬克（コマンダー・ヤンマーク/ Commander Yammark ）
（配音演員：高木涉）
蜻蜓形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。作森林觀察及保護用，一次森林大火意外使也瑪傑被問罪，其後不了了之的死亡。在蓋特手上復活，負責調查阿瑪遜區域。
降雨翠龜．瑞爾德（レイニー・タートロイド/ Rainy Turtloid ）
（配音演員：石川英郎）
龜形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。屬於水質改善部門，個性良善，尊敬努力守護世界的 X 和零，也對蓋特誓死效忠。背上的甲殼能抵抗酸雨，故此有能力進入 A 級受污染區域。受外間壓力影響，蓋特被迫將瑞爾德的防禦力降級，最後在失去甲殼保護下斃命。在蓋特手上復活，負責調查印南寺院。
雙殼貝蛤．希爾頓（シールドナー・シェルダン/ Shield Sheldon ）
（配音演員：鈴置洋孝）
貝形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。保護要人的保鏢，因表現良好而得到很高的評價。曾經在受命保護吉姆博士時，因為吉姆博士非正規化，連帶希爾頓亦被處分。在蓋特手上復活，負責調查雷射研究所。
暴雪銀狼．沃爾芳（ブリザード・ヴォルファング/ Blizzard Wolfang ）
（配音演員：石川英郎）
狼形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。極地開拓隊隊長，富有責任感，獲得隊友的信賴。有一次開拓隊受非正規機械所襲擊，只有霍夫宏一人生存，反基特的人將沃爾芳暗中處決。因艾莉亞亦曾參於其中，這次事件令她悔痛非常。在蓋特手上復活，負責調查北極區域。
火烈鳳凰．比尼克斯（ブレイズ・ヒートニックス/ Blaze Heatnix ）
（配音演員：三木真一郎）
鳳凰形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。探查火山熱點用，往往不顧命令和後果，使隊友們都無一倖免，也因而令他在地下深處被處決。在蓋特手上復活，負責調查熔岩區域。
無限水虱．米基尼昂（インフィニティー・ミジニオン/ Infinity Mijinion ）
（配音演員：高木涉）
水虱形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。有人駕駛型巨大兵器的測試員，擁有超高的資料處理能力。在蓋特手上復活，負責調查兵器開發所。
金屬斧鯊．浦雷亞（メタルシャーク・プレイヤー/ Metal Shark Player ）
（配音演員：麥人）
斧鯊形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。機械回收研究所官長，能夠回收機器人的殘骸，再以個人的 DNA 研究技術，將機器人復活。這行為在法律上的不容許的，但基特本人默許，最後浦雷亞被處決。在蓋特手上復活，負責調查機械回收研究所。
地滾聖甲蟲．塞庫萊史（グランド・スカラビッチ/ Ground Scaravich ）
（配音演員：青野武）
聖甲蟲形思考型機器人，曾被處決的蓋特作品之一。自稱寶藏獵人的考古學家，除了發掘珍寶之外也熱衷於研究工作。因為嘗試闖入X 和zero被發現的禁地而被處決。在蓋特手上復活，負責調查中央博物館。
敵人
釋瑪/西格瑪（シグマ/ Sigma ）
（配音演員：麥人）
有史以來最強的非正規思考型機器人，在“歐拉西亞事件”後繼的決戰中與零死斗而亡，在完全被消滅的情況下仍然被基特利用那塊碎片來復活。從外表看來力量不強，但實際上他不靠速度，攻擊力還是很強。第一型態為喪屍模樣，第二型態為一似木乃伊的金甲外骨骼的巨大機器人。
惡夢零（ゼロナイトメア/ Zero Nightmare ）
（配音演員：置鮎龍太郎）
惡夢病毒所引起的現象之一，偽造的零，但擁有他部份記憶。個性好戰凶恨，是個危險人物。傳送區域的第一位首領，打敗他後，真正的零會再出現？
惡夢病毒（ナイトメアウイルス/ Nightmare Virus ）
惡夢現象的元兇，在“歐拉西亞事件”後三個星期突然浮現，引起恐慌。可惡意操控制思考型或重工型機器人，使他們失控、改變天氣、製造金屬巨塊、引起火山爆發、將熔岩染色（？！）、使部份地區停電等等。
洛克人X6戴拿摩（ダイナモ/ Dynamo ）
（配音演員：森久保祥太郎）
上集釋瑪的僱傭兵，引發“歐拉西亞事件”主謀。在上集多次阻撓 X 和零的行動，今集為傳送區域的第三位首領，善用烏龜的特殊武器的話，便能在他身上“賺取”不少惡夢靈魂。
遊戲秘籍
PC:在遊戲開始界面（就是按ENTER繼續之後的界面）按三次左(←)和一次右(→)可以使用X的超級鎧甲，按三次S一次B，解鎖ZERO之後可以獲得ZERO的黑色鎧甲。
關卡一覽
序章
太空殖民地“歐拉西亞”墜落處：已經變成一無人荒漠……時代的轉捩點……惡夢的開始……
八大首領
阿瑪遜區域：夜裡神秘的熱帶雨林，還是不少古代文明的遺址。
印南寺院：文化遺產重鎮之一，靠近水邊的寺廟建築群，受惡夢現象影響，天氣控制器會製造酸雨。
雷射研究所：雲上的大型建設，裝了很多發射雷射的儀器和只能靠雷射開啟的閘門。
北極地區：冰山的山洞中，常常有巨型冰塊從高處塌下，牆壁亦難以摩擦。
熔岩地區：火山活躍帶的其中一個熱點，受惡夢現象影響，熔岩變成了紫色（？！）。
兵器開發所：研究和開發武器之處，還有著已破壞的有人駕駛型巨大兵器 "Illumina" ，但受惡夢現象影響已經復活。
機械回收研究所：把破廢的機械加以處理並再造的設施，四處裝有巨型垂直式榨壓機和高低不一的平台。
中央博物館：記錄世界知識的匯聚，受惡夢現象影響，周圍隨時有圓形或方形岩石出現。
最後關卡
秘密研究所（兩段）：基特的研究所，位於太空殖民地“歐拉西亞”的墜落處附近，有著奇怪的抽象牆飾。
？？？？？？：西格瑪的所在地，環境酷似秘密研究所，但是氣氛猶如黑暗空間……
病毒現象的定義規律和運用：
"每進入一關後，這關的病毒便會侵入其他特定的幾關，使那幾關的病毒重新產生靈魂並發生特定的怪異現象。"這就是病毒想像的定義，接下來，就具體解釋各關所能產生的病毒現象。順序為從左到右從上到下。
第一關。受影響關：第三關，第五關。現象：飛蚊，會出現小蚊子，阻礙射擊武器攻擊敵人，阻礙衝刺，有時會攻擊我方。
第二關，受影響關：第一關，第八關。現象：暴風雨，減慢前進速度和跳越的距離。
第三關，受影響關：第二關，第四關。現象：影子，出現ZERO（ZERO的場合是X）的影子，攻擊我方。
第四關，受影響關：第七關。現象：結冰，地面結冰，走路打滑。
第五關，受影響關：第四關，第六關。現象：火球，天上掉火球。
第六關，受影響關：第一關，第二關。現象：黑暗，畫面變暗，影響可視範圍。
第七關，受影響關：第五關，第六關，第八關。現象：鋼塊，出現上下移動的鋼塊，阻礙前進。
第八關，受影響關：第三關，第七關。現象：障礙，出現討厭的障礙物。
病毒現象並不一定是壞事，其中第五關的病毒現象，關係到了能否進入第四關的分支，而第七關的病毒現象，也使在不會兩段跳或向上衝刺的情況下，進入第五關的分支成為可能。另外，第七關病毒現象的鋼塊可以用第七關的BOSS的武器暫時打掉，第八關的病毒顯現的障礙也可以用第八關的BOSS的武器對付，灰色的可以打掉，紫色的可以推走，黑色的可以推動。
裝甲和道具
X6中玩家可收集兩套裝甲，分別為劍聖裝甲和魅影裝甲。現在介紹獲得裝甲的地點。
劍聖裝甲：
頭部配件
於甲蟲這關。玩家會隨機進入不同的場景，要拿到得看運氣。一般是第三和第四個場景。
身體配件
於貝殼這關。在來到有兩個要用雷射開啟的場景時，利用雷射打開下面的門，到下面則有許多雷射炮和反射板。首先，要利用反射板射擊第一個紫色的雷射炮。然後，把紫色的雷射炮左邊的四個反射板依次調整為朝下，朝上，朝下，右上。讓第二個紫色的雷射炮被射擊。把第二個紫色的雷射炮左邊的三個反射板依次調整為朝上，左下，右下。則會打開另一個門。跳到門下面，會發現左下方的牆可通過。向左走，會有一些隱形的跳台，跳到左邊就會有裝甲機。
手部配件
於水蚤這關。進入傳送區域，在傳送區域的起點向左走就會發現裝甲機。
足部配件
於蜻蜓這關。在第一個場景中第一個跳下的洞的底部向右走就可找到。
魅影裝甲：
頭部配件
在鯊魚這關。到達第二個樓梯時，不要下去。一直向左走，會發現第三個樓梯。跳下去後向右走，會有一個要跳躍的地方，需要用“劍身裝甲”的衝刺才能跳到對岸的裝甲機那裡。
身體配件
在烏龜這關。到最後一個場景的右邊的最上方，需利用衝刺衝過尖刺地段，然後用同樣的方法衝過第二個尖刺地段就可找到裝甲機。
手部配件
於鳳凰這關。到達有兩個門的場景時，在最上方利用Zero的二段跳或“劍聖裝甲”的向上衝刺到達上面的平台。一直向上跳就可找到裝甲機。
足部配件
於雪狼這關。到達有連續幾個滑坡的場景時，在第一個滑坡的中段時跳到右上方的平台，則會找到裝甲機。
在每一關中都有增加生命的“心”。
蜻蜓關 在第二個場景中的尖刺地段的開始處左下角的洞中。
烏龜關 最後一個場景的最下方的左邊，利用暫時的無敵狀態衝過。
貝殼關 在進入傳送裝置的那條路的尖刺上。
雪狼關 在進入傳送裝置的那條路上。需要鳳凰關的惡夢現象才能找到這條路（就是裝甲機下方向右走）
鳳凰關 在找裝甲機的那條路可發現。
水蚤關 在裝甲機那裡。
鯊魚關 在第三個場景的路上可發現。
甲蟲關 在進入傳送裝置的那條路上可發現。
生命儲蓄器
在蜻蜓關 在第一個場景中的第二個跳下的洞的左上方，利用二段跳的到達。
在鳳凰關 在傳送區域的路上可發現。
能量儲蓄器
在貝殼關 在傳送區域的路上可發現。
EX道具
在雪狼關 在傳送裝置下方的尖刺上。
有關事實
故事內情
據稻船敬二所說，洛克人X系列原先在X5已經完滿結束，然而因為系列的可盈利性，結果還是製作了 X6 ，間接令本集和之後的故事連線不太穩當。
評價
洛克人X系列游 戲的關卡設定，是可以令玩家在沒有獲得所有隱藏部件（能量最大值增加器的“心”、後備能量儲存器“ E 罐”或裝甲配件等等），甚至沒有任何裝備的情況下，也能夠闖入最後關卡（當然難度比獲得所有部件時高），但在 X6 這集中的某些關卡，尤其是最後關卡“秘密研究所”的一些路段，沒有腳部裝甲作遠途空中衝刺的話，就不能深入前方路段。這種不良的設計使玩家被困在一關卡中 進退兩難，不得不花掉所有生命數目來返回“繼續”選項中離開關卡。
主題曲
開場
Moon Light
森久保祥太郎主唱
The Answer
森久保祥太郎主唱
尾場
I.D.E.A.～仆は每日、夢を見る～
RoST 主唱[1-2]
