科室設定
河南省眼科研究所由臨床研究部和基礎研究部組成。臨床研究部包括：角膜病、青光眼、白內障、玻璃體視網膜病、眼底病內科、斜弱視與小兒眼科、眼科整形與美容、眼眶病與眼腫瘤、淚道病、葡萄膜病、神經眼科、黃斑病、低視力、眼遺傳病、準分子雷射治療中心、視光學中心。基礎研究部包括：眼科藥理、眼科藥劑、微生物、病理、分子生物、組織工程、遺傳及眼庫等研究室。
所創期刊
國內著名的眼科專業雜誌《角膜病雜誌》1980 年在我所創刊，是中國眼科早期的專業雜誌之一，於 1983 年更名為《眼科研究》，並於 1985 年正式在國內外發行，自 1992 年以來，《眼科研究》歷次被國家權威機構遴選為中國中文核心期刊 、中國科技論文統計源期刊，已被國內外多家著名資料庫收錄， 在我國眼科期刊界占有重要地位。
文化建設
河南省眼科研究所圖書資料室成立於 1962 年，現有各類圖書資料 13000 余冊，中外文圖書 5000 余冊，中外文期刊 8000 余冊，近 2/3 為外文原版書籍。外文期刊中有 25 種為與眼科及其相關專業有關的外文核心期刊，包括《角膜》、《視網膜》《英國眼科雜誌》、《美國眼科雜誌》、《格蘭弗眼科文獻》、《新眼科》等。並收集 19 種國內全部公開發表的眼科中文期刊。本室擁有中國醫院知識倉庫（ CHKD），萬方數據醫藥信息系統，CBM 醫藥資料庫（CBMdisc），美國國立醫學圖書館檢索系統（PubMed）。圖書資料室眼科學外文原版期刊訂購種數位居全國眼科專業機構前列。
科研平台
河南省眼科研究所擁有設備一流的檢查治療和科研設備。先進的臨床檢查治療儀器有：超聲生物顯微鏡（UBM）、光學相干斷層掃瞄器（時域OCT）、眼前後段光學相干斷層掃瞄器（頻域 OCT）、雷射共焦顯微鏡、角膜內皮細胞分析儀、角膜地形圖檢查儀、FFA 和 ICG 造影儀、淚膜分析儀、視神經纖維分析儀、多焦電生理儀、進口自動視野計、準分子雷射治療儀、YAG 雷射及多波長氪雷射治療儀、綜合驗光儀等。先進的基礎科研設備有：高效液相色譜儀、氣相色譜儀、超速冷凍離心機等，為進行眼科臨床科研提供了充分的保障和平台。
科研成果
此外，“河南省白內障復明指導中心”、“河南省防盲治盲辦公室”、“視覺第一，中國行動”河南省培訓基地也設在該所，負責全省的防盲治盲指導工作。 2007 年批准成立“河南省眼庫”， 2009 年國內第 12 個“健康快車眼科顯微手術培訓中心”也落戶該所。 近年來，河南省角膜病重點實驗室共承擔國家、省、部、廳級科研課題 80 餘項，獲得科研成果獎 40 餘項，獲國家技術專利 4 項，出版學術專著 20 部，在國內外專業期刊上發表高質量學術論文近千篇， 其中近兩年發表 SCI 收錄的科研論文 6 篇 。
河南省眼科研究所在對外交流、人才培養和技術引進方面非常重視。多年來，邀請 美國、日本、韓國、瑞典等多個國家的眼科專家數十人次來所進行學術交流 、講學和實驗室技術指導，並相繼派出相關專業的醫生到國外先進眼科機構研修。河南省眼科研究所於 2007 年與美國南加州大學 Keck 醫學院 Doheny 眼科研究所正式簽署長期科研合作協定。
