死亡有機污染
它來源於未經處理的城市生活污水、造紙污水、農業污水及都市垃圾。死亡有機質能消耗水中溶解的氧氣，危及魚類的生存；還能導致水中缺氧，致使需要氧氣的微生物死亡。而正是這些需氧微生物能夠分解有機質，維持著河流、小溪的自我淨化能力。它們死亡的後果是：河流和溪流發黑、變臭，毒素積累，傷害人畜。
無機化學藥品
這些化學藥品來源於化工廠、藥廠、造紙廠、印染廠和製革廠的廢水，以及建築裝修、乾洗行業、化學洗劑、農用殺蟲劑、除草劑等。絕大部分有機化學藥品有毒性，它們進入江河湖泊會毒害或毒死水中生物引起生態破壞。一些有機化學藥品會積累在水生生物體內，致使人食用後中毒。被有機化學藥品污染的水難以得到淨化，人類的飲水安全和健康受到威脅。
磷污染
含磷洗衣粉、磷氮化肥的大量使用容易造成磷污染。磷能夠引起水中藻類瘋長。因為磷是所有的生物生長所需的重要元素；它還會導致湖中細菌大量繁殖。 磷也是魚類甚至湖泊的殺手。大量增殖得細菌消耗了水中的氧氣，使依賴氧氣生存的魚類死亡，隨後細菌也會因缺氧而死亡，最終是湖泊老化、死亡。磷還可對熱帶地區的海濱水域造成與上述情況相似的水體富營養化的威脅。
石油化工洗滌
大多數家庭和餐館大量使用的各種洗滌用品都是石油化工的產品，難以降解，排入江河中不僅會嚴重污染水體，而且會積累在水產物中，大量進入人體後會出現中毒現象。
重金屬污染
重金屬（汞、鉛、鎘、鎳、硒、砷、鉻、鉍、釩、金、鉑、銀等）污染 它們主要來源於採礦和冶煉過程、工業廢棄物、製革廢水、紡織廠廢水、生活垃圾（如電池、化妝品）。這些重金屬對人、畜有直接的生理毒性。
酸類污染
酸類主要來源於煤礦、金屬（銅、鉛、鋅等）礦山廢棄物以及向河流中排放酸的工廠。 酸類可毒害水中植物，引起魚類和其它水中生物死亡，嚴重破壞溪流、池塘和湖泊的生態系統。
懸浮物污染
土壤流失、向河流傾倒垃圾都會造成大量懸浮物。這些懸浮物大大降低了水質，增加了淨化水的難度和成本。
油類物質污染
從水上機動交通運輸工具中以及由於油船泄漏進入水中的油類物質能破壞水生生物的生態環境，使漁業減產，還會污染水產食品，危及人類健康。海洋上油船的泄漏會造成大批海洋動物死亡。
遠洋船舶污染
由於船舶配貨的需要，要從世界範圍內不同地區的不同港口進行排放或者打入壓載水來調節船舶的穩性，不同地區的水域中的微生物到達一個新的水域可能會造成食物鏈的破壞，會使一些生物過度繁殖，成為災害
