醫院為保持與全球醫療發展同步，建設了高端化、尖端化的肝病特色科室，主要收治各種肝炎及肝硬化病人。肝病診療中心專家經過常期大量的臨床實踐，吸取國內外專家的眾家之長。刻苦研究，創立了三個治療肝病特色療法，專治各型病毒性肝炎、藥物性肝炎、中毒性肝炎、脂肪肝、酒精肝、肝硬化、肝腫瘤、肝膽結石、肝囊腫等各種肝病及傳染病。
醫院設定的26個科室配有各類設備總價值逾1.5億元，可針對各類疾病病菌的基因特性、變異性、活性水平等進行全面鑑定，為準確診斷和治療提供科學依據。重點建設科室——肝病科研創出舉世矚目的符合“抗病毒、增免疫、保肝護肝、抗纖維化、中醫辨證施治”的“免疫療法”，實現了B肝治療的巨大突破.
武警上海市總隊醫院，是全國“三級甲等”醫院，肝病診療中心歷來是醫院的核心科室。為今後抗B肝病毒的治療開闢了道路；同時醫院還多次被評為市衛生系統文明單位、文明規範服務達標單位，還連續多年被評為上海市“軍民共建先進單位”“綠化先進單位”、愛心助老特色基地、肝病防治典範！
1.“一站式”就診模式――避免了傳統肝病診療的繁瑣環節。
2.“一人一診室”，營造溫馨私密的肝病診療環境――有效地保護了患者隱私。
3.提供流暢、方便、體貼、快捷的人性化全程陪診服務。
4.秉承國際先進的“PPS（社會、生理、心理）”系統治療模式。
5.國際“3H”標準（即Hospital、Home、Hotel簡稱）。
6.實行“無假日診療”、“病人可選醫生”、“全程陪護溫馨服務”。
7. 嚴格執行世界衛生組織診療標準，國際標準層流淨化手術室等。
環境創新
環境創新是醫院創新的必要保障。環境是醫院的“名片”。在環境建設中我們充分體現以人為本的思想。
幾年來，我院共投入1億多元，加快推進內部設施的改造和建設。新建了放療中心、手術樓、醫技樓、科研樓、洗滌中心、地下停車庫，改建了餐飲中心、舊病棟樓、院內道路，先後添置了帶多葉光欄加速器、螺旋CT、ECT、MRI、數位化乳腺機、電視胸腹腔鏡、全身數字超聲影像系統等診療設備。為徹底改善病人的就醫環境，今年又新征地30畝，興建現代化的門診住院大樓。醫院基礎設施全面改善，整體升級，為病人創造良好的就醫環境。上海肝病專科醫院已成為上海地區重要的肝炎防治中心，吸引了來自大江南北、海峽兩岸的腫瘤患者。
在不斷改善硬環境的同時，不忘軟環境的改善。在全省首創“臨床支持中心”，免費用擔架或輪椅為行走不便的病人陪檢；為減少一線特別是臨床工作壓力，組建了物資配送中心；在病房開展肝炎防治知識的健康教育；加大院區綠化、美化力度，給病人提供一個舒適、幽雅的治療環境，綠化面積占總面積的約30%。給職工修建專門的停車場，為職工子弟開通學生交通車；實行職工免費午餐；在家屬區為職工鋪設了健身路，修建休閒亭，開放燈光球場；職工活動中心開設健身房、娛樂室等。工作之餘，大家齊聚一起，增進了職工之間的了解和友誼，增強了職工為醫院服務的凝聚力和向心力。
