主要職責
（一）貫徹落實中央關於海防工作的方針政策、法律法規，以及國家邊海防委員會和自治區黨委、自治區人民政府和市委、市人民政府對海防工作的決定和指示。及時報告在執行海防政策中的情況。（二）根據國家對海防工作的要求，研究制訂海防工作規劃、計畫和具體措施及規定。組織對沿海邊民進行愛國主義教育和國防教育。
（三）組織協調有關職能部門及駐軍共同完成各項海防工作任務，處理海防地區發生的問題和重大事宜。
（四）開展調查研究，了解掌握全市海防工作情況，總結、推廣海防工作的經驗和做法，向市委、市人民政府和市海防委員會提出工作建議。
（五）根據上級的部署，規劃和組織海防基礎設施建設，完善提高管海控海能力。
（六）參與處理海防事務，防範海防重大事件發生，促進與鄰國的睦鄰友好關係的發展。
（七）組織協調有關部門，防範和打擊境內外敵對勢力的滲透、顛覆、分裂等活動，協調打私部門做好打擊走私工作；增進軍政、軍民團結和民族團結，保持海防地區穩定。
（八）支持沿海地區物質文明、精神文明和政治文明建設，發展經濟，提高人民民眾物質文化生活水平，指導、幫助沿海地區人民民眾發展生產，脫貧致富奔小康。
（九）檢查督促海防設施的維護保養。
內設機構
根據上述職責，市海防委員會辦公室設2個內設機構。秘書科
協助辦領導組織、協調處理日常工作；負責辦機關的行政事務，包括會議、人事、文秘、接待、信訪、信息、保衛、保密、檔案、財務、後勤服務及國有資產管理等工作，組織制訂機關內部規章制度。管控科
負責海防工作方針政策的貫徹執行，協調有關部門維護海上權益和資源生態管理；組織實施海防基礎設施建設項目；組織協調製訂海上護漁等安全生產措施，協調我沿海漁船、外籍船隻管理和社會治安管理，參與制訂沿海地區幹部民眾的政治思想教育和國防教育計畫實施；督促檢查海上聯防工作，協調有關部門打擊海上搶劫、外逃等犯罪分子，全面掌握海上情況，反映有關動態信息。協調、支持沿海地區抓好三個文明建設，積極協調駐欽部隊的生活保障工作，組織實施海防基礎設施建設及維護保養，參與海防地區軍政軍民團結、民族團結的宣傳推動工作。
