簡介
機動新撰組時間設定在明治時期的新撰組。組員中的3個人都是女孩--性格大跳、男孩子氣、無厘頭卻有著悲傷往事的組長近藤勇子;為了討伐父親的敵人:山縣有朋而秘密加入新撰組的土方歲繪;性格外向，會使陰陽術和耍二刀流的高手沖田熏。
OVA劇情:一個為了為了還債而不得不加入新撰組的弓月·新太郎--自感正義但是脾氣溫順，身兼參謀和帳務的職務的人和機動新撰組的故事。
TV劇情:在明治的新京都，佩戴著[許可證]的妖怪也在四下飛奔，在得到由官方發放的許可證後，可以和人類一起生活。其中，有一個專門逮捕沒有得到許可證的妖怪人，以此來捍衛京都的治安的集團在奮鬥著。他的名字就是株式會社新撰組。另一方面，時代巨變下雜亂無章的京都中，和夥伴妖怪貓丸一起剛從上海回來的少年出現了。他名叫坂本龍之介，而他將馬上回到上海。為了完成收養她們的坂本夫人的願望，三人而一直努力著留住坂本龍之介。是一部描繪愛情和戰爭，悲傷卻搞笑科幻歷史劇。
主要人物
機動新撰組
坂本龍之介【CV橫山智佐】
坂本龍馬與坂本夫人的兒子。溫柔善良，有責任感。因為新撰組的三人想完成坂本夫人的願望，不讓龍之介回到上海，而正在撮合龍之介與小夜子，可惜龍之介一直一頭霧水。
近藤勇子【CV：折笠愛】
近藤勇子性格外向，大條，有種男孩子氣，經常無厘頭，卻也有著很強的責任感。但經常搞錯情況而弄出笑話。
新選組前組長近藤勇的遺孤，在嬰兒時代被戰敗的近藤夫婦放在了河邊，被一家貧苦人家收養。而勇子知道自己的身份後因憧憬著父親的武士道而努力成為了武士，開始了饑寒交迫的流浪生活，一直想買父親的【虎澈】刀卻沒有錢。在貧苦和願望的強大反差下偷了那把虎澈刀，被警視廳追捕。在被收押的時候被坂本夫人所救，以【成立新選組，為治安服務】的代價取消了罪行。現和土方、沖田一起住在坂本家。
一直思念著父母，想知道父母的模樣，以至於受到蠱惑，靈魂被妖怪帶走。在關鍵時候，坂本夫人那顆溫暖的母親之心把她喚了回來。勇子才發現，自己已經把坂本夫人當做親生母親般的存在。而坂本夫人也把她當親生女兒一般照顧著。
土方歲繪【CV：松井菜櫻子】
土方歲繪身著旗袍，性格冷淡的無表情少女，卻總是出其不意的弄出搞笑點。槍法高超，為討伐父親的敵人：山
縣有朋而秘密加入新撰組。因為太過思念沒有見過面卻去世母親，而拜託源內製造出來了一個作為自己母親的機器人，因不知母親長的什麼樣，所以機器人的面貌被設定為何自己一樣。
土方歲三的遺孤。三人組中唯一一個不會用劍的人，武器為手槍。總是在關鍵時刻出現。
沖田薰/沖田熏【CV：池澤春菜】
沖田薰性格外向，溫柔愛笑的藍黑髮少女，新選組中最正常的人。十分擅長劍術和陰陽術，可以召喚四位式神。 為了達成坂本夫人的心愿而一直努力撮合著小夜子和龍之介。而在中途卻發現自己對龍之介有了好
感。
平時是位身著和服，配著劍的少女。在執行正規任務【比如追捕食靈妖怪時】會穿上淡紫偏藍色羽織披風[和幕府末的新選組隊服相同，只不過沖田薰的隊服為粉藍色]，頭髮紮成單馬尾，腰上佩刀。
是沖田總司的遺孤，因幕府末期的新選組戰敗後，幼年的沖田薰沒有了生活依靠。在橋下饑寒交迫即將凍死之時，被坂本夫人所救，並親傳她劍術。
在原作中被設定為有著半妖的血統，因此可以使用陰陽術並召喚式神。
貓丸【CV：田中真弓】
一隻無厘頭的貓妖。
坂本涼子
機動新撰組的社長，坂本龍馬的夫人，龍之介的母親。收養了近藤土方和沖田的人。性格溫柔慈愛，充滿著母性的光輝。因為龍之介要回香港的事而發愁著。
平賀源內【CV：三木真一郎】
擅長機械製作，擁有豐富的科學知識，經常製作各種檢測妖怪的機器人，土方的母親機器人就是出自他之手。
弓月新太郎【CV：野島健兒】
為了還債而不得不加入新撰組的弓月·新太郎——自感正義但是脾氣溫順，身兼參謀和帳務的職務。
飛燕組
機動新撰組的競爭對手。組內人員為早乙女美姬【組長】，田中右近和鈴木左近 。
燕組三人早乙女美姬【CV:笠原留美】
早乙女美姬，早乙女家的大小姐，也是與新撰組競爭著的燕組的組長。身邊的部下是田中右近和鈴木左近 。 性格傲嬌，熱愛吐槽，一副大小姐誒的模樣。而實力確實不可小覷。但也經常會被突發情況弄得忙手忙腳。
田中右近【CV：草尾毅】
早乙女家的從者。自稱“美姬的右手，同心一體”。經常吐機動新撰組的槽。
鈴木左近【CV:中嵨聡彥】
身材壯實，原相撲選手。服伺早乙女家的人。
式神
一共四個，全部為人類少兒的樣子，可以在空中飛的很小的類似於精靈的東西。有著特殊的能力。
青龍：安田美和
白虎：前田このみ
朱雀：今野宏美
玄武：金田朋子
其他
山崎小夜子【CV：滿仲由紀子】
西點廳的幫手少女，溫柔可愛，很受人們喜愛。對於新撰組撮合她和龍之介一事同樣感到一頭霧水。
神
主要出自第七集，是已經死去的被在神社供奉的人。
一共有四位，全部出自日本古典名著《源氏物語》，一部讓日本人驕傲了一千年的作品。但在本動畫中的這些人物是被修改後的搞笑化，並不是原作源氏物語中的形象。
六條和葵上【左為六條】六條御息所
被沖田所召喚出來的神少女，雙面性個人物，個性嬌蠻任性，把三人組耍的團團轉。而實際上是為了尋找曾經的愛人【光源式】才繼續留在人世，而尋找愛人的原因便是——懲罰背叛過她的愛人，追著冒充愛人的右近滿世界跑，並毀壞了城市的大半部分，使新撰組負債累累。
原形出自日本古典名著《源氏物語》，是東宮太子所寵愛的太子妃，但是她卻愛戀著比她小七歲的光源氏，也是光源氏的戀人（情婦）之一。最後幡然醒悟自己是得不到光源氏的愛的而心灰意冷脫身而出，但卻因為過於怨恨和她有過節的葵上（葵姬）而在睡夢中靈魂出竅騷擾葵上，導致葵上死亡。但她可以說是整部作品中最愛光源氏的女子，卻也是最悲哀的女子。
光源式
夕顏和葵上六條御息所的愛人，疑似花花公子。對六條御息所說了一句話而俘獲了她的歡心。在動畫中的經典名句是：美麗的少女，宛如悽美的樹。惜我愚鈍，不能留住曠世的容顏。
原形出自日本古典名著《源氏物語》，是天皇最寵愛的二皇子。有著如同仙人一般的美貌和才華，被稱為昭華公子。其母桐壺更衣是天皇唯一真心愛著的人。但其母因為父親已經去世，沒有強大的外戚保護，加上天皇只愛她，所以被其他人所嫉妒。最終在其他人的嫉妒和迫害中抑鬱而死。天皇為了保護沒有外戚幫助的光源氏而不得已把他削為臣籍。而光源氏也由於複雜的身世背景而導致人性複雜，因其美貌而且才華橫溢，一生得到眾多女子的青睞。但總體來說，光源氏愛著他的每個愛人。
夕顏、葵上
面容溫婉美麗的兩位少女，光源氏的愛人，六條的死敵，經常和六條打架、吵架。據葵上說，她們是被六條害死 。
原形出自日本古典名著《源氏物語》，都是被六條御息所的生靈所害死的。
夕顏出身貧寒，眉目清秀、善良且天真無邪，是頭中將的情人。後來被光源氏看上，成了光源氏的情人之一。後來被六條御息所的生靈害死，年僅19歲。她死後光源氏抑鬱而疾，思念不已。
葵上（葵姬）出身高貴，性格清冷穩重，極其美麗，是光源氏的正妻。是天皇和左大臣出於政治目的以及對光源氏的保護而指婚的。但或許是兩人沒有感情磨合期，而光源氏認為對正妻和情人的態度是不同的，導致兩人感情冷淡，並且互相抱怨對方不理睬自己。最後在葵上被六條的生靈纏繞而病，並且當時葵上正在懷孕，光源氏終於開始在意葵上，兩人有了真正的感情。在幸福來臨的前一刻，葵上最終去世了。
製作人員
企畫監修：レッド・エンタテインメント、Enterbrain
執行製作人：小林正樹、名越康晃（レッド・エンタテインメント）、山崎彰敘（Enterbrain）
製作人：大宮三郎、中西孝
動畫製作人：岩川広司、佐久間敏郎、岡田正和
系列構成：武上純希
動畫角色設定・作畫監督：滝川和男
美術指導：宮前光春
攝影指導：わたせとしひろ
色彩設計：のぼりはるこ
編輯：岡田輝満
音響監督：井上和彥
音響製作：トライネットエンタテインメント
音樂：上松范康
音樂製作：ランティス
音樂製作人：井上俊次
音響製作人：飯冢康一
3DCG製作：フレームワークス・エンターテインメント
動畫協力工作室：FRONTLINE
動畫製作協力：陸演隊
動畫工作室：TRINET ENTERTAINMENT、ピクチャーマジック
導演：所俊
製作：萌之劍製作委員會
動漫歌曲
片頭曲：佐藤裕美“時代の無雙花”
片尾曲：藤彌美里“始まりの風よ吹け”
播放標題
OVA版
登場!壬生狼的女兒們 （2003年11月19日）
激突!祇園祭的妖怪 （2003年11月19日）
冷汗!復仇的先斗町 （2004年1月21日）
復活!百鬼的首都 （2004年1月21日）
TV版
| 集數 | 標題 | 劇本 | 分鏡 | 導演 | 作畫監督 | 作畫輔助 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 歡迎回來 | 武上純希 | 所克俊 | 下田久人 | 村井孝司 | - |
| 2 | 試著觸摸少女的頭髮 | 谷田部勝義 | 原由美子 | |||
| 3 | 親親少女肌膚之芳澤 | 隅沢克之 | 冨田剛司 | 野田めぐみ | ||
| 4 | 為遊樂而生 | 靜谷伊佐夫 | 垂永士 | 下田久人 | 野口和男 | |
| 5 | 胸中的激情 | 武上純希 | 所克俊 | 西村大樹 | 華房泰堂 | |
| 6 | 夕陽底下的哀愁 | 隅沢克之 | 下田久人 | 村井孝司 原由美子 | ||
| 7 | 向神請求戀愛的前景 | 靜谷伊佐夫 | 所克俊 えんどうてつや | えんどうてつや | 君冢勝教 | |
| 8 | 少女神采上身 | 植田浩二 | 所克俊 | 鐮田祐輔 | 烏宏明 | 青木康哲 |
| 9 | 在月亮上照映著對母親的思念 | 長谷川勝己 | 關田修 | 服部憲知 原由美子 | ||
| 10 | 想啊 迷惘啊 憂愁啊 | 靜谷伊佐夫 | 菊池一仁 | 西村大樹 | 華房泰堂 | |
| 11 | 美麗錯誤的約定 | 隅沢克之 | えんどうてつや | 空流辺広子 | ||
| 12 | 恍惚 暴走 沉默 | 植田浩二 | 所克俊 | 下田久人 | 村井孝司 | |
| 13 | 珍重再會 | 武上純希 | 關田修 | 原由美子 滝川和男 | ||
分集劇情
第1集京都開始實施西化政策以來,不僅市容大幅改觀,最大的改變就是妖怪人名冊的建立使得妖怪可以合法的與人類和平共存,協助新政府維護人妖和平的就是機動新撰組,而從中搗亂企圖利用妖怪力量統治世界的是飛燕組.而突然出現在大家眼前的男孩龍之介…
第2集為了阻止龍之介回上海,包括阿涼在內竟想用美人計留住龍之介,於是跟源內商借戀愛藥,想不到近藤誤拿公妖怪用的藥,而且還噴到章魚道僧身上引發混亂,春意盎然的章魚妖怪到處抓美女,新撰組當然得出面阻止,雖然表現差強人意,但小夜子似乎是對龍之介產生了一些情愫
第3集在龍之介的建議下機動新撰組加上小夜子一行人前往有馬溫泉泡湯休息,除了近藤積極設計龍之介和小夜子變成一對的計畫之外,源內的溫泉挖掘機實驗也是這趟旅行的重點,想不到在湯泉池畔出現的紅蟾蜍妖怪打亂了所有計畫,還把有馬溫泉搞的一團亂
第4集近藤擔心龍之介對女人沒興趣會壞了她促成他和小夜子之間的好事,進而讓阿涼傷心,因此硬帶著龍之介到祇園去玩女人,也因此龍之介認識了小雪,小雪因為一直不得客人歡心而被老闆威脅要開除她,龍之介不忍心她那么擔憂因而拍胸脯表示一定會幫她,想不到…
第5集為了撮合龍之介和小夜子,近藤這次接受源內的建議,採用心跳加速墜入愛河的策略,然而陰錯陽差,龍之介和小夜子居然被美姬派出來的妖怪追殺,近藤帶著沖田和土方一起去拯救他們,想不到土方竟然在解決了牛妖之後大鬧京都,原來那是源內為土方特製的機器人…
第6集歌舞伎演員雪之丞讓小夜子著迷不已,於是近藤想利用他來刺激龍之介,想不到雪之丞竟然是九尾狐狸妖怪,巧合的是沖田的白狐母親也在此時出現,原來他們都是為了沖田口中母親遺物的那支笛子而來,沖田這次與母親的重逢也釐清了她的身世之謎…
第7集近藤屢次用計想讓龍之介和小夜子變成一對,可是每次總是失敗,於是她決心向神明求助,她請出了六條御息所,卻踫上六條御息所開出替她尋找光源氏才幫忙撮合龍之介與小夜子的條件,近藤和美姬為了實現願望使出各種方法討六條御息所歡心,然而卻因此引發了混亂
第8集不小心在澡堂枉死的龍之介,又再次藉助貓丸的力量起死回生,然而當他醒過來時卻驚覺自己居然成了女兒身,原來是貓丸錯置了女人靈魂到他體內,龍之介一心想再死一次以便換回男人的靈魂,然而這時近藤卻又對他展開逼婚行動,偏偏又遇上飛燕組火上加油…
第9集京都街上出現一個賣糖人專賣妖怪糖,非常受小朋友的喜愛,就在同時也出現許多小孩失神的事件,原來這賣糖人身旁的老婆婆是專吃小孩靈魂以維持美貌的鬼子母神,近藤看見妖怪糖想起來自己的身世,把改變她人生的阿涼視為母親,而這樣的心情,也讓她卷進這次的事件…
第10集沖田自從被假龍之介告白之後一直牽掛著這件事,對於龍之介始終沒有後續動作她也感到迷惑,近藤不顧自己也對龍之介開始心動的感覺鼓勵她向龍之介告白,然而就在此時飛燕組賣妖計畫打亂了一切,沖田在美姬的煽動下對自己是半妖人身份感到自卑,決定離開新撰組…
第11集天上突然出現一個餃子飛行船,從裡頭跳出來了一個可愛的女孩,原來這女孩名叫蘭蘭是龍之介在上海認識的未婚妻,就在不知該如何處理這個問題時,又出現一個燒賣飛行船,原來它的主人邪罵也和蘭蘭一樣來自中國,龍之介,新撰組,蘭蘭和邪罵之間的糾葛引發京都大亂…
第12集總是與新撰組作對的飛燕組一行人突然前來示好,表示希望未來能夠合作共同維護京都的安全,想不到這竟是吸血鬼蒙太酋伯爵在幕後操控的計畫,雖然龍之介被蘭蘭逼的暈頭轉向,近藤等人也因為蘭蘭搞的一團亂,但當他們發現蘭蘭被蒙太酋伯爵抓走時都非常著急
第13集吸血鬼蒙太酋伯爵利用飛燕組占領了新撰組,然而他真正的目的原來是文福藏在龍之介體內的皇帝之器,為了保護龍之介,近藤,土方,還有沖田都葬送了性命,所幸有貓丸幫助她們死而復生,然而龍之介卻還是無法保住皇帝之器命喪蒙太酋之手,最後蘭蘭為了保護大家決心…
不受歡迎的新撰組隊士
TV版・OVA版中都一樣、近藤・土方・沖田三人有著不受歡迎的設定。TV版第2集時，章魚妖怪對他們說“最好是和比你們還漂亮的姐姐在一起”、OVA版第4集中的鬼妖怪則對三人說“討厭男人婆的姐姐”（近藤）・“討厭貧乳的姐姐”（沖田）・“討厭三白眼的姐姐”（土方）。但是、TV版第8集時，化了妝的沖田反而被人家搭訕。
主角的變更
TV版以龍之介為主角、遊戲・OVA版的主角則是弓月新太郎（ゆづき しんたろう、配音演員：野島健兒（日本））、龍之介是準男主角。TV版中弓月並未登場。弓太郎出場之少，實質上會讓人覺得近藤才是主角。
武器變更
遊戲・OVA版中土方和近藤・沖田一樣以刀為武器（沖田主要是用式神）但是，TV版中土方的武器改為手槍。遊戲・OVA版中有著機動甲冑這種類似盔甲的裝備存在。
方言的不同
遊戲・OVA和TV版中的登場人物所講的方言會有所差異。
另外的其他人在兩個地方中都是講同樣的方言
土方是機器人的疑惑?
TV版第2集 - 第5集，近藤對於好幾次表現出態度冷默的土方說“難不成你是機器人?”而對土方抱持這種懷疑。然後在第5集時，表現出異常的怪力，還能發射飛彈的機械土方就此登場。當初、近藤和沖田真的認為土方是一台機器人、實際上是源內為了不知道母親長相的土方而隨便製造出來、不過土方真的不是機器人。這台機械土方後來被真正的土方打壞、但卻被源內拿回去修理而出現好幾次。
和解?
在遊戲・OVA版中近藤・土方有好幾次吵架過（在遊戲版特別明顯）、但在TV版中，卻沒見過2人有吵架的場面。特別是第5話集時，近藤在打倒土方後（實際上是機械土方，近藤沒注意到）而有流下眼淚的場景。最終話時、土方對於死亡的近藤、也能見到她對近藤說不要死的場面。
